SUPERFAMILY 1.75 HMM library and genome assignments server

SUPERFAMILY 2 can be accessed from supfam.org. Please contact us if you experience any problems.

Domain combinations for _gap_,54928,_gap_ superfamilies in Eucalyptus grandis v201

The selected domain combination is the occurrence of the following superfamily domains in N- to C-Terminal order:

54928 - RNA-binding domain, RBD

Phylogenetic distribution

Other domain architectures with a similar genomic distribution.
See the phylogenetic distribution for this domain architecture.


Domain combination graphics and links

81 sequences contain the _gap_,54928,_gap_ domain architecture in Eucalyptus grandis v201.

Add higher domain architectures which include the chosen architecture.

Click on a domain architecture to see the domain assignment details.
The key to the domain colours is at the bottom of the page.


Eucgr.L03635.1|PACid:23607960

Eucgr.F04002.1|PACid:23585234

Eucgr.F02258.1|PACid:23583064

Eucgr.F02258.2|PACid:23583065

Eucgr.F03691.1|PACid:23584846

Eucgr.F01820.1|PACid:23582565

Eucgr.F01820.2|PACid:23582566

Eucgr.F02940.1|PACid:23583870

Eucgr.F03123.1|PACid:23584119

Eucgr.F03179.1|PACid:23584203

Eucgr.F03179.2|PACid:23584204

Eucgr.F03613.1|PACid:23584743

Eucgr.D02212.2|PACid:23576064

Eucgr.I01752.1|PACid:23596432

Eucgr.I02201.1|PACid:23596922

Eucgr.I02201.2|PACid:23596923

Eucgr.I02201.3|PACid:23596924

Eucgr.I02201.4|PACid:23596925

Eucgr.I02201.5|PACid:23596926

Eucgr.I02641.1|PACid:23597418

Eucgr.I00343.1|PACid:23594887

Eucgr.I00520.1|PACid:23595049

Eucgr.I00520.2|PACid:23595050

Eucgr.I02311.1|PACid:23597037

Eucgr.K02078.1|PACid:23603591

Eucgr.K02078.2|PACid:23603592

Eucgr.K02078.3|PACid:23603593

Eucgr.K03474.1|PACid:23605224

Eucgr.K03474.2|PACid:23605225

Eucgr.K01050.1|PACid:23602513

Eucgr.K03491.1|PACid:23605246

Eucgr.G03273.1|PACid:23589139

Eucgr.G03273.2|PACid:23589140

Eucgr.G03273.3|PACid:23589141

Eucgr.G02798.1|PACid:23588533

Eucgr.G02919.1|PACid:23588690

Eucgr.G02430.1|PACid:23588043

Eucgr.G00080.1|PACid:23585855

Eucgr.B04011.1|PACid:23569464

Eucgr.B03777.1|PACid:23569186

Eucgr.B01229.1|PACid:23566353

Eucgr.B01229.2|PACid:23566354

Eucgr.B01229.3|PACid:23566355

Eucgr.B02389.1|PACid:23567523

Eucgr.B02389.2|PACid:23567524

Eucgr.B02389.3|PACid:23567525

Eucgr.B03897.1|PACid:23569322

Eucgr.B01911.1|PACid:23567010

Eucgr.B01911.2|PACid:23567011

Eucgr.B01911.3|PACid:23567012

Eucgr.B01911.4|PACid:23567013

Eucgr.B01911.5|PACid:23567014

Eucgr.E00030.1|PACid:23576659

Eucgr.E00636.1|PACid:23577367

Eucgr.L01383.1|PACid:23606359

Eucgr.C01577.2|PACid:23571120

Eucgr.C01577.3|PACid:23571121

Eucgr.A01412.1|PACid:23563171

Eucgr.A02076.1|PACid:23563915

Eucgr.A02940.1|PACid:23564966

Eucgr.A02940.2|PACid:23564967

Eucgr.A02940.3|PACid:23564968

Eucgr.J02495.1|PACid:23600631

Eucgr.J01261.1|PACid:23599231

Eucgr.J01600.1|PACid:23599574

Eucgr.J01600.2|PACid:23599575

Eucgr.J01600.3|PACid:23599576

Eucgr.J01600.4|PACid:23599577

Eucgr.J02948.1|PACid:23601065

Eucgr.H01267.1|PACid:23590700

Eucgr.H00409.1|PACid:23589759

Eucgr.H00408.1|PACid:23589758

Eucgr.H00407.1|PACid:23589757

Eucgr.H00411.1|PACid:23589761

Eucgr.H02095.1|PACid:23591448

Eucgr.H02095.2|PACid:23591449

Eucgr.H02772.1|PACid:23592082

Eucgr.H04537.1|PACid:23593863

Eucgr.H04537.2|PACid:23593864

Eucgr.H04537.3|PACid:23593865

Eucgr.H04231.1|PACid:23593528