SUPERFAMILY 1.75 HMM library and genome assignments server

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Domain assignment for ABFG01000001|CDS_153357-154319 from The Salmonella enterica Pan-genome

Domain architecture


Domain assignment details

(
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Strong hits

Sequence:  ABFG01000001|CDS_153357-154319
Domain Number 1 Region: 5-207
Classification Level Classification E-value
Superfamily Nucleotide-diphospho-sugar transferases 3.28e-30
Family Spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsA 0.011
Further Details:      
 
Weak hits

Sequence:  ABFG01000001|CDS_153357-154319
Domain Number - Region: 223-299
Classification Level Classification E-value
Superfamily TPR-like 0.0102
Family PrgX C-terminal domain-like 0.072
Further Details:      
 

Gene Ontology term assignment details

The top 10 most specific Gene Ontology terms for each namespace assigned to this domain architecture as determined by dcGO Predictor

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Molecular Function IC (bits) H-Score
Biological Process IC (bits) H-Score
Cellular Component IC (bits) H-Score

Protein sequence

External link(s) ABFG01000001|CDS_153357-154319
Sequence length 320
Comment /sourcefile="Salmonella_annika.proteins.fsa.dir/20593.proteins.fsa" /gene_family="7838" /family_size="5" /organism="S. enterica Hadar str. RI_05P066"
Sequence
MSKKPLLTIAIPTYNRSSCLARLLDSIIQQENYCHDELEVIVCDNASTDETARIAKSGLD
KIRNSTYHLNEENLGMDGNFQKCFELSNGKYLWMIGDDDLIVKNGISKVFSILKSRPALD
MVYVNSAAKTELNYNADVRTSFYTNDVDFISDVKVMFTFISGMICKKTDAIVKAVGIFSP
QTTGKYLMHLTWQLPLLKQGGEFAVIHNNIIEAEPDNSGGYHLYKVFSNNLATIFDVFYP
REHRVSKRVRASACLFLLNFIGDEDKTKNFATNNYLRDCDSAFIDLIIYKYGLRFFYLYP
KTVPLFRKIKYIIKTVLMRK
Download sequence
Identical sequences A0A0H3BLA8 A0A0R9NCE7 A0A0T7RR55 Q00337 V1X0D7
ABFG01000001|CDS_153357-154319 CP001113|CDS_2180137-2179175 WP_000038917.1.100266 WP_000038917.1.100288 WP_000038917.1.100502 WP_000038917.1.100521 WP_000038917.1.100711 WP_000038917.1.101612 WP_000038917.1.101741 WP_000038917.1.10675 WP_000038917.1.10720 WP_000038917.1.11254 WP_000038917.1.11362 WP_000038917.1.11565 WP_000038917.1.11875 WP_000038917.1.12280 WP_000038917.1.12397 WP_000038917.1.1326 WP_000038917.1.13446 WP_000038917.1.14505 WP_000038917.1.14789 WP_000038917.1.14936 WP_000038917.1.15102 WP_000038917.1.15483 WP_000038917.1.15625 WP_000038917.1.15708 WP_000038917.1.15995 WP_000038917.1.16028 WP_000038917.1.16172 WP_000038917.1.16331 WP_000038917.1.16941 WP_000038917.1.17285 WP_000038917.1.1737 WP_000038917.1.17447 WP_000038917.1.17693 WP_000038917.1.17991 WP_000038917.1.18089 WP_000038917.1.18178 WP_000038917.1.18281 WP_000038917.1.18692 WP_000038917.1.1897 WP_000038917.1.19851 WP_000038917.1.20089 WP_000038917.1.20119 WP_000038917.1.20391 WP_000038917.1.20425 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