SUPERFAMILY 1.75 HMM library and genome assignments server

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Domain assignment for WP_002210384.1.61689 from NCBI 2017_08 genome

Domain architecture


Domain assignment details

(
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Strong hits

Sequence:  WP_002210384.1.61689
Domain Number 1 Region: 63-327
Classification Level Classification E-value
Superfamily Periplasmic binding protein-like I 5.65e-72
Family L-arabinose binding protein-like 0.0000431
Further Details:      
 
Domain Number 2 Region: 2-60
Classification Level Classification E-value
Superfamily lambda repressor-like DNA-binding domains 4.22e-17
Family GalR/LacI-like bacterial regulator 0.0054
Further Details:      
 

Gene Ontology term assignment details

The top 10 most specific Gene Ontology terms for each namespace assigned to this domain architecture as determined by dcGO Predictor

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Molecular Function IC (bits) H-Score
Biological Process IC (bits) H-Score
Cellular Component IC (bits) H-Score

Protein sequence

External link(s) WP_002210384.1.61689
Sequence length 328
Comment LacI family transcriptional regulator [Yersinia pestis]; AA=GCF_000325445.1; RF=na; TAX=755971; STAX=632; NAME=Yersinia pestis YN2588; strain=YN2588; AL=Contig; RT=Major
Sequence
MSVTIKDVAKRAKVSISTVSYAINGSPKITEETRLRVLKIAQEMNYTANNNAKMLKAKKS
GAIGLFFNSWFGPVYSELVRGIEERVHREHYDLVACSLYGGEQSTAHKYLRDRSVDGAII
LTSSFDDRFLQSVASDVLPIVVLDRELKSPHIYNVLIDNFGGAFKAVNALLAKGCRDIYF
FSGPEQSYDNQKRLDGFIAALGYHNIQLNRDFIIHSNFTEADAYLKMQALIAAGRVPSAI
FSANDEMAIGILRAAKEHNIRVPDDLKVVGFDNIYASSVLTPSLTTINHHKYEMGVISAN
TLLRAIKEETNIDAVTLLPTELIERETL
Download sequence
Identical sequences A0A0E1P2P0 A0A0M1V843 A0A208SCJ4 Q0WJ58 Q7CGE6
gi|218927805|ref|YP_002345680.1| gi|384121125|ref|YP_005503745.1| 187410.y3567 214092.YPO0611 229193.YP_2929 360102.YPA_3179 386656.YPDSF_0396 gi|384137401|ref|YP_005520103.1| gi|384125004|ref|YP_005507618.1| gi|108809170|ref|YP_653086.1| gi|384416324|ref|YP_005625686.1| gi|22127441|ref|NP_670864.1| WP_002210384.1.100083 WP_002210384.1.100246 WP_002210384.1.100921 WP_002210384.1.100931 WP_002210384.1.10105 WP_002210384.1.101305 WP_002210384.1.101382 WP_002210384.1.101928 WP_002210384.1.102012 WP_002210384.1.102067 WP_002210384.1.10736 WP_002210384.1.10935 WP_002210384.1.10955 WP_002210384.1.11693 WP_002210384.1.12463 WP_002210384.1.12736 WP_002210384.1.12857 WP_002210384.1.1388 WP_002210384.1.14063 WP_002210384.1.14804 WP_002210384.1.15321 WP_002210384.1.15555 WP_002210384.1.15605 WP_002210384.1.15689 WP_002210384.1.16243 WP_002210384.1.16333 WP_002210384.1.17135 WP_002210384.1.17141 WP_002210384.1.17608 WP_002210384.1.17873 WP_002210384.1.17983 WP_002210384.1.18208 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