SUPERFAMILY 1.75 HMM library and genome assignments server

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Domain assignment for 243277.VC0587 from STRING v9.0.5

Domain architecture


Domain assignment details

(
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Strong hits

Sequence:  243277.VC0587
Domain Number 1 Region: 439-541
Classification Level Classification E-value
Superfamily SpoIIaa-like 0.0000000000235
Family Anti-sigma factor antagonist SpoIIaa 0.035
Further Details:      
 

Gene Ontology term assignment details

The top 10 most specific Gene Ontology terms for each namespace assigned to this domain architecture as determined by dcGO Predictor

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Cellular Component IC (bits) H-Score
Molecular Function IC (bits) H-Score
Biological Process IC (bits) H-Score

Protein sequence

External link(s) 243277.VC0587
Sequence length 548
Comment (Vibrio cholerae)
Sequence
MFQARFADLNLRCDLFGGVTTAIISLPLALAFGVASGAGAEAGLWGAILVGFFAALFGGS
STLISEPTGPMTVIMTAILTAMVARYPESGAAIAFTVVMMAGAFQILLGTLKLGKYITLM
PYSVVSGFMSGIGVILIILQLSPLLGHPSPGGGVLGTLSALPDLLANLKFSELFLGLLTL
GILFFLPQKYRKQVPAQLVALVVVTLFSVIFFDTDDIRRIGEIPAGLPSIVVPTFTGDIV
VTMVIDALVLGTLGCIDTLLTAVIGDSLTRKEHDSDRELQGQGIANMVAGLFGALPGAGA
TMGTVTNIQVGARSPLSGVTRALMLALVVLVAGGLTEPIPMAVLAGIAVYVGVNILDWAF
IQRAHKISLQGMAIMYGVMLLTVFVDLIVAVGLGVFISNILVIERLSREQARQVKAISDA
DDDDVPLTESERKLLDKANGKVLFFYLSGPMIFSVSKAITRQHSSVDQYQAMILDLTDVP
MIDVTVGLALENAIRDAQEAHCEVYLLCPNEKTRAELEKFKVIDLVPDQNMFTFRYEALN
AAVKQVNT
Download sequence
Identical sequences A0A0H3AI78 A0A0H3Q5U9 A0A0H6UWL6 A0A0K9UGE8 A0A0X1L334 C3LS77 Q9KUD5
gi|147673337|ref|YP_001216084.1| gi|147673337|ref|YP_001216084.1| 243277.VC0587 345073.VC0395_A0119 579112.VCM66_0545 593588.VCD_001022 gi|360037209|ref|YP_004938972.1| gi|229606127|ref|YP_002876775.1| gi|227080770|ref|YP_002809321.1| NP_230237.1.72393 WP_000484911.1.100264 WP_000484911.1.100388 WP_000484911.1.100440 WP_000484911.1.10071 WP_000484911.1.100976 WP_000484911.1.101117 WP_000484911.1.10121 WP_000484911.1.101220 WP_000484911.1.101314 WP_000484911.1.101507 WP_000484911.1.101933 WP_000484911.1.102054 WP_000484911.1.1024 WP_000484911.1.10626 WP_000484911.1.10834 WP_000484911.1.10887 WP_000484911.1.11270 WP_000484911.1.11351 WP_000484911.1.11879 WP_000484911.1.11885 WP_000484911.1.11965 WP_000484911.1.12252 WP_000484911.1.12262 WP_000484911.1.12332 WP_000484911.1.12525 WP_000484911.1.12527 WP_000484911.1.12548 WP_000484911.1.12590 WP_000484911.1.12686 WP_000484911.1.13053 WP_000484911.1.13155 WP_000484911.1.13156 WP_000484911.1.13454 WP_000484911.1.13652 WP_000484911.1.13725 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