SUPERFAMILY 1.75 HMM library and genome assignments server

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Plakin repeat superfamily domain assignments
in
NCBI 2017_08 genome

Assignment details

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Showing sequences 1 to 3000 of 7301
  1 2 3   Next Last

NCBI 2017_08 genome has 49554 significant domains in 7301 proteins.

     

Sequence ID   Evalue   Region   Family  
NP_000436.2.87134   1.7e-87   3911-4149   Plakin repeat  
  3.79e-86   3332-3570   Plakin repeat  
  7.85e-86   2673-2913   Plakin repeat  
  6.67e-76   3669-3906   Plakin repeat  
  8.89e-76   3001-3240   Plakin repeat  
  3.75e-70   4222-4263,4298-4492   Plakin repeat  
  0.00000000023   4169-4217   Plakin repeat  
NP_000436.2.92137   1.7e-87   3911-4149   Plakin repeat  
  3.79e-86   3332-3570   Plakin repeat  
  7.85e-86   2673-2913   Plakin repeat  
  6.67e-76   3669-3906   Plakin repeat  
  8.89e-76   3001-3240   Plakin repeat  
  3.75e-70   4222-4263,4298-4492   Plakin repeat  
  0.00000000023   4169-4217   Plakin repeat  
NP_001008844.1.87134   1.57e-84   1611-1848   Plakin repeat  
  4.01e-76   1369-1604   Plakin repeat  
  2.79e-68   1922-1962,2011-2205   Plakin repeat  
  0.0000000000445   1861-1915   Plakin repeat  
NP_001008844.1.92137   1.57e-84   1611-1848   Plakin repeat  
  4.01e-76   1369-1604   Plakin repeat  
  2.79e-68   1922-1962,2011-2205   Plakin repeat  
  0.0000000000445   1861-1915   Plakin repeat  
NP_001021853.1.50509   6.41e-28   1483-1691   Plakin repeat  
  1.13e-27   2864-3032   Plakin repeat  
  1.4e-24   2466-2630   Plakin repeat  
  2.44e-22   2216-2279,2336-2418   Plakin repeat  
  7.98e-22   1815-1957   Plakin repeat  
  2.88e-18   2711-2892   Plakin repeat  
  6.02e-18   3008-3158   Plakin repeat  
  8.02e-18   1921-2058,2102-2123   Plakin repeat  
  0.000000000000811   1719-1832   Plakin repeat  
  0.0000000000288   3250-3346   Plakin repeat  
NP_001021856.1.50509   1.44e-33   1783-1928,1970-2027,2071-2092   Plakin repeat  
  6.28e-28   1452-1660   Plakin repeat  
  1.13e-27   2833-3001   Plakin repeat  
  1.4e-24   2435-2599   Plakin repeat  
  2.44e-22   2185-2248,2305-2387   Plakin repeat  
  2.88e-18   2680-2861   Plakin repeat  
  6.02e-18   2977-3127   Plakin repeat  
  0.000000000000458   1688-1802   Plakin repeat  
  0.0000000000288   3219-3315   Plakin repeat  
NP_001021857.1.50509   6.15e-28   1370-1578   Plakin repeat  
  1.05e-27   2751-2919   Plakin repeat  
  1.4e-24   2353-2517   Plakin repeat  
  2.35e-22   2103-2166,2223-2305   Plakin repeat  
  7.72e-22   1702-1844   Plakin repeat  
  2.88e-18   2598-2779   Plakin repeat  
  5.82e-18   1808-1945,1989-2010   Plakin repeat  
  5.89e-18   2895-3045   Plakin repeat  
  0.000000000000615   1606-1719   Plakin repeat  
  0.0000000000275   3137-3233   Plakin repeat  
NP_001021858.1.50509   6.15e-28   1369-1577   Plakin repeat  
  1.05e-27   2750-2918   Plakin repeat  
  1.4e-24   2352-2516   Plakin repeat  
  2.35e-22   2102-2165,2222-2304   Plakin repeat  
  7.72e-22   1701-1843   Plakin repeat  
  2.88e-18   2597-2778   Plakin repeat  
  5.82e-18   1807-1944,1988-2009   Plakin repeat  
  5.89e-18   2894-3044   Plakin repeat  
  0.000000000000602   1605-1718   Plakin repeat  
  0.0000000000275   3136-3232   Plakin repeat  
NP_001040721.1.50509   6.41e-28   1471-1679   Plakin repeat  
  1.13e-27   2852-3020   Plakin repeat  
  1.4e-24   2454-2618   Plakin repeat  
  2.44e-22   2204-2267,2324-2406   Plakin repeat  
  7.98e-22   1803-1945   Plakin repeat  
  2.88e-18   2699-2880   Plakin repeat  
  6.02e-18   2996-3146   Plakin repeat  
  8.02e-18   1909-2046,2090-2111   Plakin repeat  
  0.000000000000497   1707-1821   Plakin repeat  
  0.0000000000288   3238-3334   Plakin repeat  
NP_001088143.1.7800   7.72e-62   37-230   Plakin repeat  
NP_001093502.1.45394   1.44e-82   3886-4120   Plakin repeat  
  5.36e-82   3310-3547   Plakin repeat  
  3.79e-80   2981-3220   Plakin repeat  
  1.13e-75   3645-3879   Plakin repeat  
  1.02e-74   2655-2893   Plakin repeat  
  3.49e-69   4196-4237,4273-4468   Plakin repeat  
  0.000000000102   4143-4201   Plakin repeat  
NP_001100446.1.100692   1.31e-18   1654-1753   Plakin repeat  
NP_001100446.1.4139   1.31e-18   1654-1753   Plakin repeat  
NP_001100536.1.100692   4.1e-66   1735-1775,1813-2008   Plakin repeat  
  0.0000000000000126   1634-1764   Plakin repeat  
NP_001100536.1.4139   4.1e-66   1735-1775,1813-2008   Plakin repeat  
  0.0000000000000126   1634-1764   Plakin repeat  
NP_001112369.1.45394   3.84e-66   1717-1970   Plakin repeat  
  0.00000000000471   1617-1716   Plakin repeat  
NP_001128291.1.99540   6.45e-66   1763-1803,1841-2037   Plakin repeat  
  0.000000000000314   1663-1761   Plakin repeat  
NP_001129230.2.100692   8.11e-50   1513-1735   Plakin repeat  
  3.31e-46   2351-2558   Plakin repeat  
  1.57e-44   1739-1917   Plakin repeat  
  2.35e-24   2642-2746   Plakin repeat  
  6.93e-23   2272-2389   Plakin repeat  
  0.000000000288   2535-2638   Plakin repeat  
NP_001129230.2.4139   8.11e-50   1513-1735   Plakin repeat  
  3.31e-46   2351-2558   Plakin repeat  
  1.57e-44   1739-1917   Plakin repeat  
  2.35e-24   2642-2746   Plakin repeat  
  6.93e-23   2272-2389   Plakin repeat  
  0.000000000288   2535-2638   Plakin repeat  
NP_001131138.1.45394   1.07e-16   1651-1750   Plakin repeat  
NP_001137657.1.81976   8.24e-17   1394-1523   Plakin repeat  
NP_001137658.1.81976   8.24e-17   1394-1523   Plakin repeat  
NP_001137659.1.81976   8.24e-17   1394-1523   Plakin repeat  
NP_001137660.1.81976   8.37e-17   1505-1634   Plakin repeat  
NP_001137661.1.81976   8.37e-17   1505-1634   Plakin repeat  
NP_001157012.1.92730   9.68e-88   3449-3687   Plakin repeat  
  1.22e-87   4028-4266   Plakin repeat  
  1.2e-86   2789-3030   Plakin repeat  
  1.57e-78   3118-3357   Plakin repeat  
  6.93e-75   3786-4021   Plakin repeat  
  1.31e-70   4339-4380,4415-4609   Plakin repeat  
  0.000000000238   4286-4334   Plakin repeat  
NP_001157014.1.92730   9.42e-88   3347-3585   Plakin repeat  
  1.22e-87   3926-4164   Plakin repeat  
  1.18e-86   2687-2928   Plakin repeat  
  1.57e-78   3016-3255   Plakin repeat  
  6.67e-75   3684-3919   Plakin repeat  
  1.31e-70   4237-4278,4313-4507   Plakin repeat  
  0.000000000233   4184-4232   Plakin repeat  
NP_001157021.1.92730   9.42e-88   3306-3544   Plakin repeat  
  1.22e-87   3885-4123   Plakin repeat  
  1.16e-86   2646-2887   Plakin repeat  
  1.57e-78   2975-3214   Plakin repeat  
  6.67e-75   3643-3878   Plakin repeat  
  1.31e-70   4196-4237,4272-4466   Plakin repeat  
  0.00000000023   4143-4191   Plakin repeat  
NP_001157675.1.92730   9.02e-88   3144-3382   Plakin repeat  
  1.13e-87   3723-3961   Plakin repeat  
  1.11e-86   2484-2725   Plakin repeat  
  1.44e-78   2813-3052   Plakin repeat  
  6.41e-75   3481-3716   Plakin repeat  
  1.22e-70   4034-4075,4110-4304   Plakin repeat  
  0.00000000022   3981-4029   Plakin repeat  
NP_001157768.1.100692   1.22e-87   3910-4148   Plakin repeat  
  3.4e-87   3331-3570   Plakin repeat  
  3.4e-86   2671-2912   Plakin repeat  
  9.29e-79   3000-3239   Plakin repeat  
  7.46e-77   3668-3905   Plakin repeat  
  1.31e-70   4221-4262,4297-4491   Plakin repeat  
  0.00000000023   4168-4216   Plakin repeat  
NP_001157768.1.4139   1.22e-87   3910-4148   Plakin repeat  
  3.4e-87   3331-3570   Plakin repeat  
  3.4e-86   2671-2912   Plakin repeat  
  9.29e-79   3000-3239   Plakin repeat  
  7.46e-77   3668-3905   Plakin repeat  
  1.31e-70   4221-4262,4297-4491   Plakin repeat  
  0.00000000023   4168-4216   Plakin repeat  
NP_001157769.1.100692   1.22e-87   3872-4110   Plakin repeat  
  3.4e-87   3293-3532   Plakin repeat  
  3.27e-86   2633-2874   Plakin repeat  
  9.29e-79   2962-3201   Plakin repeat  
  7.32e-77   3630-3867   Plakin repeat  
  1.31e-70   4183-4224,4259-4453   Plakin repeat  
  0.000000000228   4130-4178   Plakin repeat  
NP_001157769.1.4139   1.22e-87   3872-4110   Plakin repeat  
  3.4e-87   3293-3532   Plakin repeat  
  3.27e-86   2633-2874   Plakin repeat  
  9.29e-79   2962-3201   Plakin repeat  
  7.32e-77   3630-3867   Plakin repeat  
  1.31e-70   4183-4224,4259-4453   Plakin repeat  
  0.000000000228   4130-4178   Plakin repeat  
NP_001157770.1.100692   1.22e-87   3859-4097   Plakin repeat  
  3.4e-87   3280-3519   Plakin repeat  
  3.27e-86   2620-2861   Plakin repeat  
  9.16e-79   2949-3188   Plakin repeat  
  7.32e-77   3617-3854   Plakin repeat  
  1.31e-70   4170-4211,4246-4440   Plakin repeat  
  0.000000000228   4117-4165   Plakin repeat  
NP_001157770.1.4139   1.22e-87   3859-4097   Plakin repeat  
  3.4e-87   3280-3519   Plakin repeat  
  3.27e-86   2620-2861   Plakin repeat  
  9.16e-79   2949-3188   Plakin repeat  
  7.32e-77   3617-3854   Plakin repeat  
  1.31e-70   4170-4211,4246-4440   Plakin repeat  
  0.000000000228   4117-4165   Plakin repeat  
NP_001157771.1.100692   1.13e-87   3724-3962   Plakin repeat  
  3.27e-87   3145-3384   Plakin repeat  
  3.14e-86   2485-2726   Plakin repeat  
  8.89e-79   2814-3053   Plakin repeat  
  7.06e-77   3482-3719   Plakin repeat  
  1.22e-70   4035-4076,4111-4305   Plakin repeat  
  0.00000000022   3982-4030   Plakin repeat  
NP_001157771.1.4139   1.13e-87   3724-3962   Plakin repeat  
  3.27e-87   3145-3384   Plakin repeat  
  3.14e-86   2485-2726   Plakin repeat  
  8.89e-79   2814-3053   Plakin repeat  
  7.06e-77   3482-3719   Plakin repeat  
  1.22e-70   4035-4076,4111-4305   Plakin repeat  
  0.00000000022   3982-4030   Plakin repeat  
NP_001157774.1.100692   1.13e-87   3724-3962   Plakin repeat  
  3.27e-87   3145-3384   Plakin repeat  
  3.14e-86   2485-2726   Plakin repeat  
  8.89e-79   2814-3053   Plakin repeat  
  7.06e-77   3482-3719   Plakin repeat  
  1.22e-70   4035-4076,4111-4305   Plakin repeat  
  0.00000000022   3982-4030   Plakin repeat  
NP_001157774.1.4139   1.13e-87   3724-3962   Plakin repeat  
  3.27e-87   3145-3384   Plakin repeat  
  3.14e-86   2485-2726   Plakin repeat  
  8.89e-79   2814-3053   Plakin repeat  
  7.06e-77   3482-3719   Plakin repeat  
  1.22e-70   4035-4076,4111-4305   Plakin repeat  
  0.00000000022   3982-4030   Plakin repeat  
NP_001157775.1.100692   1.13e-87   3849-4087   Plakin repeat  
  3.4e-87   3270-3509   Plakin repeat  
  3.27e-86   2610-2851   Plakin repeat  
  9.16e-79   2939-3178   Plakin repeat  
  7.32e-77   3607-3844   Plakin repeat  
  1.31e-70   4160-4201,4236-4430   Plakin repeat  
  0.000000000228   4107-4155   Plakin repeat  
NP_001157775.1.4139   1.13e-87   3849-4087   Plakin repeat  
  3.4e-87   3270-3509   Plakin repeat  
  3.27e-86   2610-2851   Plakin repeat  
  9.16e-79   2939-3178   Plakin repeat  
  7.32e-77   3607-3844   Plakin repeat  
  1.31e-70   4160-4201,4236-4430   Plakin repeat  
  0.000000000228   4107-4155   Plakin repeat  
NP_001157776.1.100692   1.22e-87   3881-4119   Plakin repeat  
  3.4e-87   3302-3541   Plakin repeat  
  3.27e-86   2642-2883   Plakin repeat  
  9.29e-79   2971-3210   Plakin repeat  
  7.32e-77   3639-3876   Plakin repeat  
  1.31e-70   4192-4233,4268-4462   Plakin repeat  
  0.00000000023   4139-4187   Plakin repeat  
NP_001157776.1.4139   1.22e-87   3881-4119   Plakin repeat  
  3.4e-87   3302-3541   Plakin repeat  
  3.27e-86   2642-2883   Plakin repeat  
  9.29e-79   2971-3210   Plakin repeat  
  7.32e-77   3639-3876   Plakin repeat  
  1.31e-70   4192-4233,4268-4462   Plakin repeat  
  0.00000000023   4139-4187   Plakin repeat  
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