SUPERFAMILY 1.75 HMM library and genome assignments server

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Spectrin repeat superfamily domain assignments
in
NCBI 2017_08 genome

Assignment details

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Showing sequences 1 to 3000 of 34306
  1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11   Next Last

NCBI 2017_08 genome has 387404 significant domains in 34306 proteins.

     

Sequence ID   Evalue   Region   Family  
NP_000100.2.87134   1.94e-23   2043-2200   Spectrin repeat  
  3.28e-23   991-1144   Spectrin repeat  
  1.07e-21   2151-2308   Spectrin repeat  
  8.92e-20   2517-2672   Spectrin repeat  
  1.38e-19   1095-1255   Spectrin repeat  
  6.02e-18   328-438   Spectrin repeat  
  1.7e-17   1205-1359   Spectrin repeat  
  5.97e-17   2744-2870   Spectrin repeat  
  7.2e-17   2893-3031   Spectrin repeat  
  5.76e-16   514-652   Spectrin repeat  
  7.13e-16   1511-1666   Spectrin repeat  
  0.0000000000000936   1620-1764   Spectrin repeat  
  0.0000000000022   1815-1959   Spectrin repeat  
  0.00000000000738   447-548   Spectrin repeat  
  0.0000000000391   768-923   Spectrin repeat  
  0.0000000225   2276-2413   Spectrin repeat  
  0.00000575   2463-2531   Spectrin repeat  
  0.000827   908-1000   Spectrin repeat  
  0.00216   1419-1545   Spectrin repeat  
NP_000100.2.92137   1.94e-23   2043-2200   Spectrin repeat  
  3.28e-23   991-1144   Spectrin repeat  
  1.07e-21   2151-2308   Spectrin repeat  
  8.92e-20   2517-2672   Spectrin repeat  
  1.38e-19   1095-1255   Spectrin repeat  
  6.02e-18   328-438   Spectrin repeat  
  1.7e-17   1205-1359   Spectrin repeat  
  5.97e-17   2744-2870   Spectrin repeat  
  7.2e-17   2893-3031   Spectrin repeat  
  5.76e-16   514-652   Spectrin repeat  
  7.13e-16   1511-1666   Spectrin repeat  
  0.0000000000000936   1620-1764   Spectrin repeat  
  0.0000000000022   1815-1959   Spectrin repeat  
  0.00000000000738   447-548   Spectrin repeat  
  0.0000000000391   768-923   Spectrin repeat  
  0.0000000225   2276-2413   Spectrin repeat  
  0.00000575   2463-2531   Spectrin repeat  
  0.000827   908-1000   Spectrin repeat  
  0.00216   1419-1545   Spectrin repeat  
NP_000338.3.87134   6.54e-34   295-416   Spectrin repeat  
  1.55e-28   601-741   Spectrin repeat  
  1.06e-27   1010-1164   Spectrin repeat  
  2.42e-27   1851-2005   Spectrin repeat  
  3.54e-25   1532-1675   Spectrin repeat  
  4.08e-25   815-950   Spectrin repeat  
  1.08e-23   1229-1375   Spectrin repeat  
  2.28e-22   1690-1797   Spectrin repeat  
  3.27e-22   425-526   Spectrin repeat  
  1.76e-19   745-849   Spectrin repeat  
  1.04e-18   529-635   Spectrin repeat  
  0.00000000000144   1351-1447   Spectrin repeat  
  0.0000000000158   2011-2070   Spectrin repeat  
  0.0273   1170-1253   Spectrin repeat  
NP_000338.3.92137   6.54e-34   295-416   Spectrin repeat  
  1.55e-28   601-741   Spectrin repeat  
  1.06e-27   1010-1164   Spectrin repeat  
  2.42e-27   1851-2005   Spectrin repeat  
  3.54e-25   1532-1675   Spectrin repeat  
  4.08e-25   815-950   Spectrin repeat  
  1.08e-23   1229-1375   Spectrin repeat  
  2.28e-22   1690-1797   Spectrin repeat  
  3.27e-22   425-526   Spectrin repeat  
  1.76e-19   745-849   Spectrin repeat  
  1.04e-18   529-635   Spectrin repeat  
  0.00000000000144   1351-1447   Spectrin repeat  
  0.0000000000158   2011-2070   Spectrin repeat  
  0.0273   1170-1253   Spectrin repeat  
NP_000436.2.87134   5.61e-22   302-418   Spectrin repeat  
  9.6e-20   1179-1364   Spectrin repeat  
  6.6e-17   645-747   Spectrin repeat  
  0.000000000602   551-644   Spectrin repeat  
  0.000152   752-834   Spectrin repeat  
  0.000196   1069-1178   Spectrin repeat  
NP_000436.2.92137   5.61e-22   302-418   Spectrin repeat  
  9.6e-20   1179-1364   Spectrin repeat  
  6.6e-17   645-747   Spectrin repeat  
  0.000000000602   551-644   Spectrin repeat  
  0.000152   752-834   Spectrin repeat  
  0.000196   1069-1178   Spectrin repeat  
NP_001003343.1.84170   5.21e-24   2056-2210   Spectrin repeat  
  4.32e-23   997-1154   Spectrin repeat  
  1.37e-19   2520-2681   Spectrin repeat  
  2.57e-19   523-661   Spectrin repeat  
  3.91e-18   2746-2873   Spectrin repeat  
  4.66e-18   1215-1369   Spectrin repeat  
  6.41e-18   2896-3034   Spectrin repeat  
  9.42e-18   340-448   Spectrin repeat  
  0.00000000000000106   1521-1676   Spectrin repeat  
  0.000000000000119   1630-1774   Spectrin repeat  
  0.000000000000224   2203-2319   Spectrin repeat  
  0.0000000000081   416-515   Spectrin repeat  
  0.00000000000864   1825-1969   Spectrin repeat  
  0.0000000000196   777-933   Spectrin repeat  
  0.000000000979   2286-2416   Spectrin repeat  
  0.00000273   2462-2537   Spectrin repeat  
  0.000227   917-1009   Spectrin repeat  
  0.00132   1430-1557   Spectrin repeat  
NP_001005053.1.99540   1.87e-32   274-396   Spectrin repeat  
  1.96e-29   510-631   Spectrin repeat  
  9.55e-25   397-505   Spectrin repeat  
  1.12e-19   634-746   Spectrin repeat  
NP_001005510.2.92730   1.7e-18   6179-6334   Spectrin repeat  
  9.48e-18   5959-6085   Spectrin repeat  
  0.0000000000000168   6603-6749   Spectrin repeat  
  0.0000000000000256   6088-6198   Spectrin repeat  
  0.000000000000484   4901-5038   Spectrin repeat  
  0.000000000224   5049-5154   Spectrin repeat  
  0.000000000738   5852-5971   Spectrin repeat  
  0.00000000374   5120-5222   Spectrin repeat  
  0.00000000475   2687-2820   Spectrin repeat  
  0.0000000547   1492-1631   Spectrin repeat  
  0.0000000756   6501-6630   Spectrin repeat  
  0.000000158   5239-5363   Spectrin repeat  
  0.000000719   2091-2213   Spectrin repeat  
  0.000000777   2028-2124   Spectrin repeat  
  0.00000202   5547-5669   Spectrin repeat  
  0.00000236   5645-5793   Spectrin repeat  
  0.00000677   3299-3453   Spectrin repeat  
  0.0000169   3723-3871   Spectrin repeat  
  0.0000216   1883-2022   Spectrin repeat  
  0.0000811   4818-4932   Spectrin repeat  
  0.000121   338-458   Spectrin repeat  
  0.000175   4584-4687   Spectrin repeat  
  0.000288   5330-5446   Spectrin repeat  
  0.000512   2215-2339   Spectrin repeat  
  0.00112   537-666   Spectrin repeat  
  0.00324   2788-2928   Spectrin repeat  
  0.0345   2493-2606   Spectrin repeat  
  0.054   3208-3307   Spectrin repeat  
NP_001006810.1.99540   2.4e-34   279-401   Spectrin repeat  
  2.36e-29   515-633   Spectrin repeat  
  8.38e-25   402-510   Spectrin repeat  
  4.46e-22   639-751   Spectrin repeat  
NP_001007172.1.45394   0.00000000000406   556-634   Spectrin repeat  
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  0.00000000000072   326-455   Spectrin repeat  
  0.00000547   189-272   Spectrin repeat  
NP_001008844.1.92137   6.9e-16   836-964,991-1018   Spectrin repeat  
  0.00000000000072   326-455   Spectrin repeat  
  0.00000547   189-272   Spectrin repeat  
NP_001009283.1.100692   0.0000374   75-149   Spectrin repeat  
NP_001011359.1.99540   0.00000000000156   454-602   Spectrin repeat  
  0.00036   244-360   Spectrin repeat  
  0.0152   334-443   Spectrin repeat  
NP_001011908.2.100692   8.51e-35   1660-1814   Spectrin repeat  
  2.36e-33   739-893   Spectrin repeat  
  2.03e-32   635-787   Spectrin repeat  
  2.49e-30   422-576   Spectrin repeat  
  3.66e-30   316-468   Spectrin repeat  
  3.17e-26   1235-1378   Spectrin repeat  
  1.32e-25   224-353   Spectrin repeat  
  7.2e-25   1341-1487   Spectrin repeat  
  7.34e-25   155-258   Spectrin repeat  
  1.7e-24   2035-2147   Spectrin repeat  
  2.22e-23   1784-1905   Spectrin repeat  
  3.4e-22   1873-2028   Spectrin repeat  
  4.19e-22   1447-1571   Spectrin repeat  
  6.48e-22   18-152   Spectrin repeat  
  4.71e-20   862-969   Spectrin repeat  
  3.27e-18   2154-2261   Spectrin repeat  
  2.45e-16   1155-1255   Spectrin repeat  
  0.0000000000055   1086-1180   Spectrin repeat  
NP_001011908.2.4139   8.51e-35   1660-1814   Spectrin repeat  
  2.36e-33   739-893   Spectrin repeat  
  2.03e-32   635-787   Spectrin repeat  
  2.49e-30   422-576   Spectrin repeat  
  3.66e-30   316-468   Spectrin repeat  
  3.17e-26   1235-1378   Spectrin repeat  
  1.32e-25   224-353   Spectrin repeat  
  7.2e-25   1341-1487   Spectrin repeat  
  7.34e-25   155-258   Spectrin repeat  
  1.7e-24   2035-2147   Spectrin repeat  
  2.22e-23   1784-1905   Spectrin repeat  
  3.4e-22   1873-2028   Spectrin repeat  
  4.19e-22   1447-1571   Spectrin repeat  
  6.48e-22   18-152   Spectrin repeat  
  4.71e-20   862-969   Spectrin repeat  
  3.27e-18   2154-2261   Spectrin repeat  
  2.45e-16   1155-1255   Spectrin repeat  
  0.0000000000055   1086-1180   Spectrin repeat  
NP_001012395.1.84170   2.52e-28   1923-2079   Spectrin repeat  
  1.57e-19   311-418   Spectrin repeat  
  3.55e-19   2505-2636   Spectrin repeat  
  9.5e-17   494-631   Spectrin repeat  
  0.00000000000000118   963-1120   Spectrin repeat  
  0.0000000000000348   2233-2334   Spectrin repeat  
  0.0000000000000523   2658-2797   Spectrin repeat  
  0.0000000000000637   1181-1332   Spectrin repeat  
  0.0000000000000838   426-526   Spectrin repeat  
  0.00000000000176   1491-1646   Spectrin repeat  
  0.00000000009   2394-2518   Spectrin repeat  
  0.000000000892   866-1000   Spectrin repeat  
  0.0000000338   743-862   Spectrin repeat  
  0.00000004   1619-1743   Spectrin repeat  
  0.000000183   2084-2179   Spectrin repeat  
  0.0115   1305-1437   Spectrin repeat  
NP_001012408.1.46622   1.65e-23   2048-2204   Spectrin repeat  
  3.67e-23   992-1148   Spectrin repeat  
  4.47e-20   2514-2675   Spectrin repeat  
  1.92e-18   1209-1363   Spectrin repeat  
  2.09e-18   330-443   Spectrin repeat  
  2.52e-18   518-656   Spectrin repeat  
  4.84e-18   2626-2778   Spectrin repeat  
  5.23e-17   2740-2867   Spectrin repeat  
  5.89e-16   2890-3028   Spectrin repeat  
  0.000000000000106   1624-1768   Spectrin repeat  
  0.000000000000446   2200-2316   Spectrin repeat  
  0.00000000000209   1456-1566   Spectrin repeat  
  0.00000000000614   772-893   Spectrin repeat  
  0.00000000000758   1819-1959   Spectrin repeat  
  0.0000000000103   451-551   Spectrin repeat  
  0.00000338   2459-2531   Spectrin repeat  
  0.0000518   2308-2410   Spectrin repeat  
  0.00453   935-1006   Spectrin repeat  
NP_001013148.1.100692   7.72e-36   295-416   Spectrin repeat  
  3.67e-29   1011-1166   Spectrin repeat  
  3.84e-28   639-743   Spectrin repeat  
  6.04e-28   1223-1376   Spectrin repeat  
  2.88e-27   1854-2008   Spectrin repeat  
  7.2e-27   811-951   Spectrin repeat  
  8.77e-25   1454-1585   Spectrin repeat  
  2.75e-23   425-528   Spectrin repeat  
  9.03e-23   1695-1798   Spectrin repeat  
  2.4e-22   1590-1691   Spectrin repeat  
  3.8e-22   529-637   Spectrin repeat  
  0.00000000000317   2013-2074   Spectrin repeat  
  0.00288   1384-1414   Spectrin repeat  
  0.0122   1169-1242   Spectrin repeat  
NP_001013148.1.4139   7.72e-36   295-416   Spectrin repeat  
  3.67e-29   1011-1166   Spectrin repeat  
  3.84e-28   639-743   Spectrin repeat  
  6.04e-28   1223-1376   Spectrin repeat  
  2.88e-27   1854-2008   Spectrin repeat  
  7.2e-27   811-951   Spectrin repeat  
  8.77e-25   1454-1585   Spectrin repeat  
  2.75e-23   425-528   Spectrin repeat  
  9.03e-23   1695-1798   Spectrin repeat  
  2.4e-22   1590-1691   Spectrin repeat  
  3.8e-22   529-637   Spectrin repeat  
  0.00000000000317   2013-2074   Spectrin repeat  
  0.00288   1384-1414   Spectrin repeat  
  0.0122   1169-1242   Spectrin repeat  
NP_001019831.2.87134   1.92e-18   278-414   Spectrin repeat  
  8.9e-18   1098-1235   Spectrin repeat  
  2.16e-17   500-641   Spectrin repeat  
  0.0000000000000408   840-1001   Spectrin repeat  
  0.0000000183   191-309   Spectrin repeat  
  0.0000089   646-766   Spectrin repeat  
NP_001019831.2.92137   1.92e-18   278-414   Spectrin repeat  
  8.9e-18   1098-1235   Spectrin repeat  
  2.16e-17   500-641   Spectrin repeat  
  0.0000000000000408   840-1001   Spectrin repeat  
  0.0000000183   191-309   Spectrin repeat  
  0.0000089   646-766   Spectrin repeat  
NP_001020029.1.87134   7.33e-34   295-416   Spectrin repeat  
  1.99e-28   601-741   Spectrin repeat  
  1.38e-27   1010-1164   Spectrin repeat  
  2.49e-27   1851-2005   Spectrin repeat  
  4.8e-25   815-950   Spectrin repeat  
  5.17e-25   1532-1675   Spectrin repeat  
  1.17e-23   1229-1375   Spectrin repeat  
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