SUPERFAMILY 1.75 HMM library and genome assignments server

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MIT domain superfamily domain assignments
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STRING v9.0.5

Assignment details

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STRING v9.0.5 (STRING) has 617 significant domains in 546 proteins.

     

Sequence ID   Evalue   Region   Family  
10090.ENSMUSP00000001402   0.0000327   82-113   MIT domain  
10090.ENSMUSP00000019379   4.71e-21   46-141   MIT domain  
10090.ENSMUSP00000019929   0.0000903   8-72   MIT domain  
10090.ENSMUSP00000022451   1.05e-18   87-180   MIT domain  
  0.000000000000196   5-81   MIT domain  
10090.ENSMUSP00000025702   2.35e-18   266-336   MIT domain  
10090.ENSMUSP00000027257   4.19e-24   7-91   MIT domain  
10090.ENSMUSP00000034388   1.83e-29   2-92   MIT domain  
10090.ENSMUSP00000042367   0.000000275   17-95   MIT domain  
10090.ENSMUSP00000059947   3.27e-23   274-357   MIT domain  
  0.0000000000000183   366-445   MIT domain  
10090.ENSMUSP00000061769   1.83e-23   234-332   MIT domain  
10090.ENSMUSP00000108356   8.78e-30   2-93   MIT domain  
10090.ENSMUSP00000113748   0.000051   13-76   MIT domain  
10116.ENSRNOP00000003715   7.59e-30   2-93   MIT domain  
10116.ENSRNOP00000005032   9.29e-22   234-332   MIT domain  
10116.ENSRNOP00000007350   2.88e-20   44-141   MIT domain  
10116.ENSRNOP00000010961   0.0000301   80-111   MIT domain  
10116.ENSRNOP00000018978   0.000000432   17-95   MIT domain  
10116.ENSRNOP00000024959   3.27e-24   7-91   MIT domain  
10116.ENSRNOP00000025885   9.29e-24   274-363   MIT domain  
  0.000000000000012   366-445   MIT domain  
10116.ENSRNOP00000026323   1.57e-18   87-180   MIT domain  
  0.000000000000222   5-81   MIT domain  
10116.ENSRNOP00000028511   4.45e-19   267-337   MIT domain  
10116.ENSRNOP00000046690   1.83e-29   2-92   MIT domain  
10141.ENSCPOP00000000258   0.00000353   17-92   MIT domain  
10141.ENSCPOP00000001277   0.0000327   81-112   MIT domain  
10141.ENSCPOP00000003340   6.15e-30   2-92   MIT domain  
10141.ENSCPOP00000003421   5.62e-23   270-358   MIT domain  
  0.000000000000366   362-443   MIT domain  
10141.ENSCPOP00000006241   3.53e-18   262-337   MIT domain  
10141.ENSCPOP00000007219   0.0000353   796-875   MIT domain  
10141.ENSCPOP00000008518   2.22e-21   234-332   MIT domain  
10141.ENSCPOP00000009858   1.02e-23   6-91   MIT domain  
10141.ENSCPOP00000010591   2.35e-21   44-141   MIT domain  
10141.ENSCPOP00000014051   3.4e-19   87-179   MIT domain  
  0.0000000000000536   4-80   MIT domain  
10141.ENSCPOP00000015690   0.00000432   4-61   MIT domain  
10141.ENSCPOP00000019995   1.26e-28   9-95   MIT domain  
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  0.0000379   84-144   MIT domain  
10228.JGI52816   0.0000000000000484   447-521   MIT domain  
10228.JGI54606   1.06e-19   266-349   MIT domain  
  0.0000000249   364-420   MIT domain  
10228.JGI55791   0.00000262   18-102   MIT domain  
10228.JGI63201   7.98e-27   5-84   MIT domain  
10228.JGI63941   0.000000000000183   5-83   MIT domain  
103690.all3838   0.00000719   646-693   MIT domain  
104341.JGI127819   7.19e-23   558-635   MIT domain  
104341.JGI52282   0.0000126   94-131   MIT domain  
104341.JGI94821   0.00000876   102-138   MIT domain  
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121224.XP_002426134   0.0000000000249   172-244   MIT domain  
121224.XP_002429053   4.05e-20   442-530   MIT domain  
  0.000000000196   553-630   MIT domain  
121224.XP_002430220   0.00000000131   3-85   MIT domain  
  0.0000000523   86-156   MIT domain  
121224.XP_002431178   0.00000968   116-186   MIT domain  
121224.XP_002431625   8.37e-28   1-80   MIT domain  
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135651.CBN14790   0.0000000000000115   3-80   MIT domain  
135651.CBN17814   1.24e-27   21-100   MIT domain  
135651.CBN25886   6.15e-16   248-318   MIT domain  
13616.ENSMODP00000001609   1.29e-24   6-91   MIT domain  
13616.ENSMODP00000003796   6.93e-28   13-97   MIT domain  
13616.ENSMODP00000003878   1.44e-23   189-284   MIT domain  
13616.ENSMODP00000006515   7.06e-29   7-95   MIT domain  
13616.ENSMODP00000007554   7.72e-22   46-142   MIT domain  
13616.ENSMODP00000011596   3.27e-23   264-348   MIT domain  
  0.0000000000000301   356-440   MIT domain  
13616.ENSMODP00000012496   0.00000131   17-68   MIT domain  
13616.ENSMODP00000018149   2.75e-21   87-181   MIT domain  
  0.000000000000301   6-81   MIT domain  
13616.ENSMODP00000023455   0.0000327   145-180   MIT domain  
13616.ENSMODP00000032836   5.36e-18   264-337   MIT domain  
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148305.A4QZC1   2.75e-20   7-93   MIT domain  
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164328.JGI84041   0.00000000000114   119-191   MIT domain  
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222929.C5PFC4   2.09e-27   1-89   MIT domain  
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28377.ENSACAP00000002621   1.83e-17   78-162   MIT domain  
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28377.ENSACAP00000003316   1.57e-27   6-91   MIT domain  
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  0.00000144   363-412   MIT domain  
31033.ENSTRUP00000010491   0.0000000000000484   89-167   MIT domain  
  0.000000000000392   1-81   MIT domain  
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31033.ENSTRUP00000020364   0.000000419   18-73   MIT domain  
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31033.ENSTRUP00000038396   0.0000209   60-96   MIT domain  
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3218.JGI193580   4.71e-25   2-83   MIT domain  
3218.JGI233323   4.19e-25   2-83   MIT domain  
330779.Saci_1372   0.00000000000000602   7-85   MIT domain  
33169.AGOS_AEL265W   1.03e-25   1-83   MIT domain  
33178.CADATEAP00001668   0.00000000000863   212-285   MIT domain  
33178.CADATEAP00002440   5.89e-28   1-85   MIT domain  
33178.CADATEAP00003774   0.00000157   26-80   MIT domain  
332648.A6S2Q3   0.00000000000000157   288-363   MIT domain  
35128.JGI821   1.12e-20   3-76   MIT domain  
35128.JGI8959   1.12e-20   3-76   MIT domain  
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36630.CADNFIAP00008396   0.00000000000445   189-262   MIT domain  
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3694.estExt_Genewise1_v1.C_LG_XIV0856   0.00000379   12-75   MIT domain  
3694.estExt_fgenesh4_pg.C_LG_X2287   2.22e-20   2-78   MIT domain  
3694.eugene3.00041444   3.01e-26   2-81   MIT domain  
3694.fgenesh4_pg.C_LG_IX000235   9.42e-26   2-81   MIT domain  
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99883.ENSTNIP00000011823   0.0549   332-358   MIT domain  

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Select to display   Genome       Domains   Proteins
No Yes ALL   20874 20874
No Yes Homo sapiens 76_38 Human 38 34
No Yes Pan troglodytes 76_2.1.4 Chimpanzee 14 11
No Yes Gorilla gorilla 76_3.1 Western gorilla 12 10
No Yes Pongo abelii 76_2 Sumatran orangutan 12 10
No Yes Nomascus leucogenys 76_1.0 Northern white-cheeked gibbon 12 10
No Yes Papio anubis 76 Olive baboon 16 13
No Yes Macaca mulatta 76_1 Rhesus monkey 16 15
No Yes Callithrix jacchus 76_3.2.1 White-tufted-ear marmoset 16 14
No Yes Otolemur garnettii 76_3 Small-eared galago 12 10
No Yes Microcebus murinus 76_1 Gray mouse lemur 8 8
No Yes Rattus norvegicus 76_5.0 Norway rat 17 14
No Yes Mus musculus 76_38 House mouse 35 31
No Yes Dipodomys ordii 76_1 Ord's kangaroo rat 9 8
No Yes Ictidomys tridecemlineatus 76_2 Thirteen-lined ground squirrel 10 9
No Yes Heterocephalus glaber v1.7-2 Naked mole-rat 17 16
No Yes Cavia porcellus 76_3 Domestic guinea pig 15 13
No Yes Oryctolagus cuniculus 76_2 Rabbit 12 10
No Yes Ochotona princeps 76 American pika 6 6
No Yes Tupaia belangeri 76 Northern tree shrew 7 7
No Yes Sus scrofa 76_10.2 Pig 14 12
No Yes Bos taurus 76_3.1 Cattle 14 12
No Yes Ovis aries 76_3.1 Sheep 11 10
No Yes Vicugna pacos 76_1 Alpaca 8 7
No Yes Tursiops truncatus 76_1 Bottlenose dolphin 9 9
No Yes Mustela putorius furo 76_1.0 Domestic ferret 12 10
No Yes Ailuropoda melanoleuca 76_1 Giant panda 13 11
No Yes Canis familiaris 76_3.1 Dog 14 12
No Yes Felis catus 76_6.2 Domestic cat 12 10
No Yes Equus caballus 76_2 Horse 13 11
No Yes Myotis lucifugus 76_2.0 Little brown bat 10 8
No Yes Pteropus vampyrus 76_1 Large flying fox 10 9
No Yes Sorex araneus 76_1 European shrew 4 4
No Yes Erinaceus europaeus 76 Western European hedgehog 7 6
No Yes Procavia capensis 76_1 Cape rock hyrax 7 7
No Yes Loxodonta africana 76_3 African savanna elephant 14 12
No Yes Echinops telfairi 76 Small Madagascar hedgehog 8 8
No Yes Dasypus novemcinctus 76_2 Nine-banded armadillo 17 15
No Yes Choloepus hoffmanni 76_1 Hoffmann's two-fingered sloth 8 7
No Yes Macropus eugenii 76_1.0 Tammar wallaby 6 6
No Yes Sarcophilus harrisii 76_7.0 Tasmanian devil 13 11
No Yes Monodelphis domestica 76_5 Gray short-tailed opossum 14 12
No Yes Ornithorhynchus anatinus 76_5 Platypus 8 7
No Yes Saccoglossus kowalevskii v3.0   5 4
No Yes Petromyzon marinus 76_7.0 Sea lamprey 5 5
No Yes Meleagris gallopavo 76_2 Turkey 7 7
No Yes Gallus gallus 76_4 Chicken 11 9
No Yes Anas platyrhynchos 76_1.0 Mallard 5 5
No Yes Taeniopygia guttata 76_3.2.4 Zebra finch 8 7
No Yes Ficedula albicollis 76_1.0 Collared flycatcher 8 7
No Yes Pelodiscus sinensis 76_1.0 Chinese soft-shelled turtle 13 12
No Yes Anolis carolinensis 76_2.0 Green anole 11 10
No Yes Xenopus laevis African clawed frog 19 16
No Yes Xenopus tropicalis 76_4.2 Tropical clawed frog 15 14
No Yes Latimeria chalumnae 76_1 Coelacanth 16 14
No Yes Lepisosteus oculatus 76 Spotted gar 21 17
No Yes Gadus morhua 76_1 Atlantic cod 13 11
No Yes Tetraodon nigroviridis 76_8 Spotted green pufferfish 19 15
No Yes Takifugu rubripes 76_4 Torafugu 33 30
No Yes Gasterosteus aculeatus 76_1 Three-spined stickleback 16 14
No Yes Oryzias latipes 76_1 Japanese medaka 15 13
No Yes Xiphophorus maculatus 76_4.4.2 Southern platyfish 14 12
No Yes Poecilia formosa 76 Amazon molly 15 12
No Yes Oreochromis niloticus 76_1.0 Nile tilapia 18 14
No Yes Astyanax mexicanus 76 Mexican tetra 16 14
No Yes Danio rerio 76_9 Zebrafish 19 17
No Yes Oikopleura dioica   2 2
No Yes Ciona savignyi 76_2.0 Pacific transparent sea squirt 10 6
No Yes Ciona intestinalis 76 Vase tunicate 7 6
No Yes Strongylocentrotus purpuratus v3.1 Purple sea urchin 10 8
No Yes Adineta vaga   26 21
No Yes Octopus bimaculoides 280   8 6
No Yes Crassostrea gigas 22 Pacific oyster 9 7
No Yes Lottia gigantea Owl limpet 7 5
No Yes Helobdella robusta   7 6
No Yes Capitella sp. I   10 8
No Yes Danaus plexippus OGS1.0 Monarch butterfly 7 6
No Yes Heliconius melpomene Postman butterfly 6 6
No Yes Bombyx mori Domestic silkworm 3 3
No Yes Nasonia vitripennis Jewel wasp 8 6
No Yes Apis mellifera 38.2d (Not maintained) Honey bee 9 9
No Yes Harpegnathos saltator v3.3 Jerdon's jumping ant 8 6
No Yes Linepithema humile v1.1 Argentine ant 8 6
No Yes Pogonomyrmex barbatus v1.2 Red harvester ant 8 6
No Yes Solenopsis invicta v.2.2.3 Red fire ant 6 4
No Yes Acromyrmex echinatior v3.8 Panamanian leafcutter ant 7 5
No Yes Atta cephalotes v1.1   7 6
No Yes Camponotus floridanus v3.3 Florida carpenter ant 8 6
No Yes Lucilia cuprina Australian sheep blowfly 6 5
No Yes Drosophila grimshawi 1.3   5 4
No Yes Drosophila willistoni 1.3   7 6
No Yes Drosophila pseudoobscura 2.13   8 6
No Yes Drosophila persimilis 1.3   3 3
No Yes Drosophila suzukii   11 7
No Yes Drosophila yakuba 1.3   7 6
No Yes Drosophila simulans 1.3   7 6
No Yes Drosophila sechellia 1.3   7 6
No Yes Drosophila melanogaster 76_5 Fruit fly 12 10
No Yes Drosophila erecta 1.3   7 6
No Yes Drosophila ananassae 1.3   6 5
No Yes Drosophila virilis 1.2   7 6
No Yes Drosophila mojavensis 1.3   7 6
No Yes Megaselia scalaris 22   3 3
No Yes Aedes aegypti 55 (Not maintained) Yellow fever mosquito 9 9
No Yes Culex pipiens quinquefasciatus Southern house mosquito 6 5
No Yes Anopheles darlingi 22 American malaria mosquito 5 5
No Yes Anopheles gambiae 49_3j African malaria mosquito 6 5
No Yes Tribolium castaneum 3.0 Red flour beetle 5 4
No Yes Pediculus humanus corporis (Early assembly) Human body louse 8 6
No Yes Acyrthosiphon pisum Pea aphid 6 5
No Yes Rhodnius prolixus 22   5 3
No Yes Daphnia pulex Common water flea 5 4
No Yes Strigamia maritima 22   9 7
No Yes Sarcoptes scabiei   4 3
No Yes Tetranychus urticae Two-spotted spider mite 1 1
No Yes Ixodes scapularis (Preliminary) Black-legged tick 8 7
No Yes Pristionchus pacificus   3 3
No Yes Meloidogyne incognita Southern root-knot nematode 5 5
No Yes Meloidogyne hapla   4 3
No Yes Onchocerca volvulus 22   7 5
No Yes Brugia malayi WS250 Agent of lymphatic filariasis 6 4
No Yes Caenorhabditis japonica   4 4
No Yes Caenorhabditis brenneri   4 4
No Yes Caenorhabditis remanei   4 4
No Yes Caenorhabditis elegans 76_235 Roundworm 4 4
No Yes Caenorhabditis briggsae 2   4 4
No Yes Trichinella spiralis 22   1 1
No Yes Hymenolepis microstoma   2 2
No Yes Echinococcus multilocularis   4 3
No Yes Echinococcus granulosus   4 3
No Yes Taenia solium Pork tapeworm 6 5
No Yes Schistosoma mansoni   3 3
No Yes Mnemiopsis leidyi Sea walnut 4 3
No Yes Thelohanellus kitauei   2 2
No Yes Acropora digitifera v1.0   5 4
No Yes Nematostella vectensis 1.0 Starlet sea anemone 7 6
No Yes Hydra vulgaris   8 6
No Yes Amphimedon queenslandica   13 11
No Yes Trichoplax adhaerens   8 6
No Yes Proterospongia sp. ATCC 50818   10 8
No Yes Monosiga brevicollis   6 6
No Yes Sphaeroforma arctica JP610   1 1
No Yes Capsaspora owczarzaki ATCC 30864   2 2
No Yes Conidiobolus coronatus NRRL28638 v1.0   3 3
No Yes Mortierella verticillata NRRL 6337   10 9
No Yes Phycomyces blakesleeanus   10 9
No Yes Rhizopus oryzae RA 99-880   8 8
No Yes Mucor circinelloides   6 6
No Yes Rhizomucor miehei CAU432   8 7
No Yes Malassezia globosa CBS 7966   4 4
No Yes Sporisorium reilianum 22   3 3
No Yes Ustilago maydis   3 3
No Yes Mixia osmundae IAM 14324 v1.0   4 4
No Yes Cronartium quercuum f. sp. fusiforme G11 v1.0   3 3
No Yes Puccinia graminis f. sp. tritici CRL 75-36-700-3   5 5
No Yes Melampsora laricis-populina   2 2
No Yes Rhodotorula graminis WP1 v1.0   1 1
No Yes Sporobolomyces roseus IAM 13481   2 2
No Yes Microbotryum violaceum 22   4 4
No Yes Wallemia sebi v1.0   4 4
No Yes Sphaerobolus stellatus v1.0   2 2
No Yes Piloderma croceum F 1598 v1.0   2 2
No Yes Serpula lacrymans var. lacrymans S7.9   2 2
No Yes Coniophora puteana   4 4
No Yes Hydnomerulius pinastri v2.0   11 7
No Yes Paxillus rubicundulus Ve08.2h10 v1.0   3 3
No Yes Pisolithus microcarpus 441 v1.0   2 2
No Yes Pisolithus tinctorius Marx 270 v1.0   3 3
No Yes Scleroderma citrinum Foug A v1.0   2 2
No Yes Coprinopsis cinerea okayama7 130 v3   4 4
No Yes Pleurotus ostreatus Oyster mushroom 4 4
No Yes Amanita thiersii Skay4041 v1.0   2 2
No Yes Amanita muscaria Koide v1.0 Fly agaric 4 4
No Yes Galerina marginata v1.0   2 2
No Yes Hebeloma cylindrosporum h7 v2.0   3 3
No Yes Laccaria bicolor S238N-H82   2 2
No Yes Agaricus bisporus var. bisporus   2 2
No Yes Schizophyllum commune   2 2
No Yes Stereum hirsutum FP-91666 SS1 v1.0   3 3
No Yes Heterobasidion annosum   2 2
No Yes Gloeophyllum trabeumv1.0   2 2
No Yes Punctularia strigosozonata v1.0   2 2
No Yes Sebacina vermifera MAFF 305830 v1.0   4 4
No Yes Fomitiporia mediterranea v1.0   2 2
No Yes Tulasnella calospora AL13/4D v1.0   2 2
No Yes Postia placenta   3 3
No Yes Wolfiporia cocos MD-104 SS10 v1.0   2 2
No Yes Fomitopsis pinicolav1.0   2 2
No Yes Fomitopsis pinicola FP-58527 SS1 v3.0   2 2
No Yes Phanerochaete chrysosporium RP-78 2.1   2 2
No Yes Dichomitus squalens   2 2
No Yes Trametes versicolor v1.0   2 2
No Yes Tremella mesenterica Witches' butter 2 2
No Yes Daldinia eschscholzii EC12 v1.0   2 2
No Yes Apiospora montagnei NRRL 25634 v1.0   2 2
No Yes Magnaporthe poae ATCC 64411 22   3 3
No Yes Magnaporthe grisea 70-15   2 2
No Yes Podospora anserina   2 2
No Yes Sporotrichum thermophile ATCC 42464   2 2
No Yes Thielavia terrestris NRRL 8126   2 2
No Yes Chaetomium globosum CBS 148.51   2 2
No Yes Neurospora tetrasperma   2 2
No Yes Neurospora discreta FGSC 8579   2 2
No Yes Neurospora crassa OR74A   2 2
No Yes Cryphonectria parasitica Chestnut blight fungus 2 2
No Yes Verticillium albo-atrum VaMs.102   1 1
No Yes Verticillium dahliae VdLs.17   2 2
No Yes Acremonium alcalophilumv 1.0   2 2
No Yes Glomerella graminicola 22   2 2
No Yes Fusarium graminearum   3 3
No Yes Nectria haematococca mpVI   3 3
No Yes Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici 4286   2 2
No Yes Fusarium verticillioides 7600   1 1
No Yes Trichoderma asperellum CBS 433.97 v1.0   2 2
No Yes Trichoderma atroviride   2 2
No Yes Trichoderma citrinoviride v1.0   2 2
No Yes Trichoderma reesei 1.2   2 2
No Yes Trichoderma virens Gv29-8   2 2
No Yes Trichoderma longibrachiatum ATCC 18648 v1.0   1 1
No Yes Trichoderma harzianum CBS 226.95 v1.0   2 2
No Yes Amorphotheca resinae v1.0 Creosote fungus 4 4
No Yes Botrytis cinerea B05.10   1 1
No Yes Sclerotinia sclerotiorum   2 2
No Yes Blumeria graminis 22   2 2
No Yes Didymella exigua CBS 183.55 v1.0   2 2
No Yes Leptosphaeria maculans 22   2 2
No Yes Setosphaeria turcica v1.0   2 2
No Yes Cochliobolus miyabeanus ATCC 44560 v1.0   3 3
No Yes Cochliobolus victoriae FI3 v1.0   3 3
No Yes Cochliobolus carbonum 26-R-13 v1.0   3 3
No Yes Cochliobolus heterostrophus Southern corn leaf blight pathogen 2 2
No Yes Alternaria brassicicola   1 1
No Yes Cochliobolus lunatus m118 v2.0   3 3
No Yes Pyrenophora teres f. teres 22   3 3
No Yes Pyrenophora tritici-repentis   1 1
No Yes Stagonospora nodorum   2 2
No Yes Mycosphaerella graminicola IPO323   2 2
No Yes Zasmidium cellare ATCC 36951 v1.0   3 3
No Yes Dothistroma septosporum   2 2
No Yes Septoria musiva v1.0   3 3
No Yes Mycosphaerella fijiensis CIRAD86   2 2
No Yes Aureobasidium pullulans var. subglaciale EXF-2481 v1.0   2 2
No Yes Paracoccidioides brasiliensis Pb18   2 2
No Yes Coccidioides posadasii RMSCC 3488   3 3
No Yes Coccidioides immitis RS   3 3
No Yes Ajellomyces dermatitidis SLH14081   2 2
No Yes Histoplasma capsulatum class NAmI strain WU24   2 2
No Yes Microsporum canis CBS 113480   2 2
No Yes Trichophyton equinum CBS 127.97   2 2
No Yes Trichophyton verrucosum HKI 0517   2 2
No Yes Arthroderma benhamiae CBS 112371   2 2
No Yes Trichophyton tonsurans CBS 112818   2 2
No Yes Trichophyton rubrum CBS 118892   2 2
No Yes Uncinocarpus reesii 1704   2 2
No Yes Aspergillus zonatus v1.0   3 3
No Yes Penicillium chrysogenum Wisconsin 54-1255   2 2
No Yes Penicillium chrysogenum v1.0   2 2
No Yes Aspergillus acidus v1.0   3 3
No Yes Aspergillus fumigatus Af293   2 2
No Yes Aspergillus brasiliensis v1.0   3 3
No Yes Aspergillus nidulans FGSC A4   3 3
No Yes Aspergillus sydowii v1.0   3 3
No Yes Aspergillus versicolor v1.0   3 3
No Yes Aspergillus glaucus   3 3
No Yes Aspergillus carbonarius ITEM 5010   3 3
No Yes Neosartorya fischeri NRRL 181   2 2
No Yes Aspergillus terreus NIH2624   3 3
No Yes Aspergillus tubingensis v1.0   3 3
No Yes Aspergillus wentii v1.0   3 3
No Yes Aspergillus oryzae RIB40   3 3
No Yes Aspergillus niger 22   3 3
No Yes Aspergillus niger ATCC 1015   2 2
No Yes Aspergillus flavus NRRL3357   3 3
No Yes Aspergillus clavatus NRRL 1   3 3
No Yes Penicillium marneffei ATCC 18224   3 3
No Yes Tuber melanosporum Mel28 22   2 2
No Yes Tuber melanosporum Vittad Perigord truffle 2 2
No Yes Hansenula polymorpha v2.0   1 1
No Yes Dekkera bruxellensis CBS 2499 v2.0   1 1
No Yes Pichia membranifaciensv1.0   1 1
No Yes Candida tanzawaensis NRRL Y-17324 v1.0   1 1
No Yes Candida dubliniensis CD36   1 1
No Yes Candida tropicalis MYA-3404   1 1
No Yes Candida parapsilosis   1 1
No Yes Candida albicans SC5314   1 1
No Yes Lodderomyces elongisporus NRRL YB-4239   1 1
No Yes Babjeviella inositovora NRRL Y-12698 v1.0   1 1
No Yes Pichia stipitis CBS 6054   1 1
No Yes Candida guilliermondii ATCC 6260   1 1
No Yes Hyphopichia burtonii NRRL Y-1933 v1.0   1 1
No Yes Debaromyces hansenii   1 1
No Yes Wickerhamomyces anomalus   2 2
No Yes Pichia pastoris GS115   1 1
No Yes Hanseniaspora valbyensis NRRL Y-1626 v1.1   2 2
No Yes Yarrowia lipolytica CLIB122   2 2
No Yes Candida lusitaniae ATCC 42720   1 1
No Yes Metschnikowia bicuspidata NRRL YB-4993 v1.0   1 1
No Yes Vanderwaltozyma polyspora DSM 70294   1 1
No Yes Candida glabrata CBS138   1 1
No Yes Kluyveromyces thermotolerans CBS 6340   1 1
No Yes Lachancea kluyveri   1 1
No Yes Kluyveromyces waltii   1 1
No Yes Ashbya gossypii ATCC 10895   1 1
No Yes Zygosaccharomyces rouxii   1 1
No Yes Saccharomyces paradoxus MIT   1 1
No Yes Saccharomyces cerevisiae 76 Baker's yeast 1 1
No Yes Saccharomyces bayanus MIT   1 1
No Yes Kluyveromyces lactis   1 1
No Yes Schizosaccharomyces cryophilus OY26 22   1 1
No Yes Schizosaccharomyces octosporus yFS286   1 1
No Yes Schizosaccharomyces japonicus yFS275   2 2
No Yes Schizosaccharomyces pombe Fission yeast 1 1
No Yes Catenaria anguillulae PL171 v1.0   1 1
No Yes Allomyces macrogynus ATCC 38327   7 7
No Yes Spizellomyces punctatus DAOM BR117   5 4
No Yes Dictyostelium discoideum   10 7
No Yes Dictyostelium purpureum   10 8
No Yes Entamoeba dispar 1.2   4 3
No Yes Entamoeba invadens 1.2   4 3
No Yes Entamoeba histolytica 1   4 3
No Yes Selaginella moellendorffii   2 2
No Yes Pinus taeda Loblolly pine 2 2
No Yes Picea abies Norway spruce 2 2
No Yes Eucalyptus grandis v201 Rose gum 1 1
No Yes Theobroma cacao B97-61/B2 v1 Cacao 2 2
No Yes Gossypium raimondii v221   12 12
No Yes Citrus clementina v165   2 2
No Yes Citrus sinensis v154 Sweet orange 1 1
No Yes Thellungiella halophila v173   2 2
No Yes Brassica rapa Chiifu-401 1.2 Field mustard 3 3
No Yes Capsella rubella v183   1 1
No Yes Arabidopsis lyrata Lyrate rockcress 2 2
No Yes Arabidopsis thaliana 10 Thale cress 3 3
No Yes Carica papaya Papaya 1 1
No Yes Medicago truncatula Barrel medic 7 6
No Yes Phaseolus vulgaris v186 French bean 2 2
No Yes Glycine max v109 Soybean 5 5
No Yes Cucumis sativus v122 Cucumber 4 4
No Yes Fragaria vesca Wild strawberry 1 1
No Yes Malus domestica v196 Apple 3 3
No Yes Prunus persica v139 Peach 1 1
No Yes Linum usitatissimum v200 Flax 4 4
No Yes Manihot esculenta v147 Cassava 3 3
No Yes Populus trichocarpa v156 Black cottonwood 7 7
No Yes Vitis vinifera Wine grape 3 3
No Yes Mimulus guttatus v140 Spotted monkey flower 2 2
No Yes Solanum lycopersicum v.2.3 Tomato 3 3
No Yes Solanum tuberosum Potato 5 5
No Yes Actinidia chinensis Hongyang   4 4
No Yes Aquilegia coerulea v195   5 5
No Yes Triticum urartu 22   1 1
No Yes Triticum aestivum 22 Bread wheat 1 1
No Yes Aegilops tauschii 22   1 1
No Yes Brachypodium distachyon Stiff brome 1 1
No Yes Oryza barthii 22 African wild rice 3 2
No Yes Oryza meridionalis 22   6 4
No Yes Oryza glumaepatula 22   4 3
No Yes Oryza glaberrima African rice 3 3
No Yes Oryza punctata 22   4 4
No Yes Oryza nivara 22   5 4
No Yes Oryza brachyantha 22 Malo sina 2 2
No Yes Oryza sativa ssp. japonica 5.0 Japanese rice 5 5
No Yes Oryza sativa v193 Rice 5 5
No Yes Phyllostachys heterocyclavar. pubescens Kikko-chiku 3 3
No Yes Panicum virgatum v202 Switchgrass 1 1
No Yes Setaria italica v164 Foxtail millet 1 1
No Yes Zea mays subsp. mays Maize 2 2
No Yes Zea mays v181 Maize 2 2
No Yes Sorghum bicolor Sorghum 1 1
No Yes Musa balbisiana Balbis banana 4 4
No Yes Musa acuminata 22 Wild Malaysian banana 4 4
No Yes Amborella trichopoda 22   1 1
No Yes Physcomitrella patens   2 2
No Yes Coccomyxa subellipsoidea sp. C-169 v2   1 1
No Yes Asterochloris sp. Cgr/DA1pho v1.0   1 1
No Yes Chlorella variabilis sp. NC64A   1 1
No Yes Chlorella vulgaris   1 1
No Yes Volvox carteri f. nagariensis   1 1
No Yes Volvox carteri v199   1 1
No Yes Chlamydomonas reinhardtii 4.0   1 1
No Yes Ostreococcus sp. RCC809   2 2
No Yes Ostreococcus lucimarinus CCE9901   2 2
No Yes Bathycoccus prasinos   3 3
No Yes Micromonas sp. RCC299   4 4
No Yes Micromonas pusilla CCMP1545 v3.0   3 3
No Yes Cyanidioschyzon merolae strain 10D 22   1 1
No Yes Cyanidioschyzon merolae   1 1
No Yes Porphyridium purpureum 02_2012   2 2
No Yes Thecamonas trahens ATCC 50062   7 6
No Yes Bigelowiella natans CCMP2755 22   3 3
No Yes Giardia lamblia 2.3   2 2
No Yes Cyanophora paradoxa   2 2
No Yes Leishmania mexicana 2.4   3 3
No Yes Leishmania major strain Friedlin   3 3
No Yes Leishmania infantum JPCM5 2.4   3 3
No Yes Leishmania braziliensis MHOM/BR/75/M2904 2.4   3 3
No Yes Trypanosoma vivax   1 1
No Yes Trypanosoma cruzi strain CL Brener   2 2
No Yes Trypanosoma congolense 2.4   2 2
No Yes Trypanosoma brucei gambiense v4.1   1 1
No Yes Trypanosoma brucei TREU927 v4.1   1 1
No Yes Ectocarpus siliculosus   5 5
No Yes Aureococcus anophagefferens   2 2
No Yes Albugo laibachii 22   3 3
No Yes Pythium iwayamai DAOM BR242034 22   3 3
No Yes Pythium arrhenomanes ATCC 12531 22   1 1
No Yes Pythium ultimum v1.7-2   3 3
No Yes Pythium aphanidermatum DAOM BR444 22   5 5
No Yes Pythium irregulare DAOM BR486 22   3 3
No Yes Pythium vexans DAOM BR484 22   4 4
No Yes Phytophthora ramorum 1.1 Sudden oak death agent 2 2
No Yes Phytophthora sojae 1.1   3 3
No Yes Phytophthora infestans T30-4   4 4
No Yes Phytophthora capsici   2 2
No Yes Hyaloperonospora arabidopsidis 22   3 3
No Yes Phaeodactylum tricornutumCCAP 1055/1   1 1
No Yes Fragilariopsis cylindrus   3 3
No Yes Thalassiosira pseudonana CCMP1335   2 2
No Yes Perkinsus marinus ATCC 50983   4 4
No Yes Tetrahymena thermophila SB210 1   2 2
No Yes Cryptosporidium hominis   1 1
No Yes Cryptosporidium muris   1 1
No Yes Cryptosporidium parvum Iowa II   1 1
No Yes Neospora caninum   1 1
No Yes Toxoplasma gondii VEG   1 1
No Yes Toxoplasma gondii ME49   1 1
No Yes Toxoplasma gondii GT1   1 1
No Yes Babesia bovis T2Bo   2 2
No Yes Theileria parva   1 1
No Yes Theileria annulata   1 1
No Yes Plasmodium falciparum 3D7   2 2
No Yes Plasmodium vivax SaI-1 7.0   2 2
No Yes Plasmodium knowlesi strain H   2 2
No Yes Plasmodium yoelii ssp. yoelii 1   1 1
No Yes Plasmodium chabaudi   1 1
No Yes Plasmodium berghei ANKA   1 1
No Yes Symbiodinium minutum clade B1 v1.2   9 6
No Yes Naegleria gruberi   1 1
No Yes Trichomonas vaginalis   3 3
No Yes Guillardia theta CCMP2712 v1.0   3 3
No Yes Emiliania huxleyi CCMP1516   4 4
No Yes Cyanothece sp. PCC 8802   1 1
No Yes Nostoc sp. PCC 7120   1 1
No Yes Caldicellulosiruptor kronotskyensis 2002   1 1
No Yes Caldicellulosiruptor kristjanssonii 177R1B   1 1
No Yes Caldicellulosiruptor bescii DSM 6725   1 1
No Yes Niastella koreensis GR20-10   1 1
No Yes Syntrophus aciditrophicus SB   1 1
No Yes Moraxella catarrhalis RH4   1 1
No Yes Candidatus Caldiarchaeum subterraneum   1 1
No Yes Cenarchaeum symbiosum A   1 1
No Yes Candidatus Nitrosopumilus sp. AR2   1 1
No Yes Nitrosopumilus maritimus SCM1   1 1
No Yes Acidilobus saccharovorans 345-15   1 1
No Yes Fervidicoccus fontis Kam940   1 1
No Yes Pyrolobus fumarii 1A   1 1
No Yes Hyperthermus butylicus DSM 5456   1 1
No Yes Thermogladius cellulolyticus 1633   1 1
No Yes Ignisphaera aggregans DSM 17230   1 1
No Yes Aeropyrum pernix K1   1 1
No Yes Ignicoccus hospitalis KIN4/I   1 1
No Yes Thermosphaera aggregans DSM 11486   1 1
No Yes Staphylothermus hellenicus DSM 12710   1 1
No Yes Staphylothermus marinus F1   1 1
No Yes Desulfurococcus fermentans DSM 16532   1 1
No Yes Desulfurococcus kamchatkensis 1221n   1 1
No Yes Desulfurococcus mucosus DSM 2162   1 1
No Yes Metallosphaera cuprina Ar-4   1 1
No Yes Metallosphaera sedula DSM 5348   1 1
No Yes Acidianus hospitalis W1   1 1
No Yes Sulfolobus tokodaii str. 7   1 1
No Yes Sulfolobus islandicus Y.N.15.51   1 1
No Yes Sulfolobus solfataricus P2   1 1
No Yes Sulfolobus acidocaldarius DSM 639   1 1
No Yes Methanosalsum zhilinae DSM 4017   1 1
No Yes Thermoplasma volcanium GSS1   1 1
No Yes Thermoplasma acidophilum DSM 1728   1 1
No Yes Xenopus (Silurana) tropicalis v7.1 (annotation v7.2) Tropical clawed frog 27 27
No Yes Drosophila melanogaster FlyBase 5.12 (FlyBase) Fruit fly 10 8
No Yes Anopheles gambiae VectorBase AgamP3.6 (VectorBase) African malaria mosquito 6 5
No Yes Ascaris suum Victoria/Ghent Pig roundworm 5 4
No Yes Caenorhabditis elegans WormBase WS218 (WormBase) Roundworm 4 4
No Yes Cryptococcus neoformans var. grubii H99   2 2
No Yes Cryptococcus neoformans B-3501A   3 3
No Yes Cryptococcus neoformans JEC21   3 3
No Yes Paracoccidioides brasiliensis Pb01   2 2
No Yes Paracoccidioides brasiliensis Pb03   2 2
No Yes Coccidioides posadasii str. Silveira   2 2
No Yes Coccidioides immitis RMSCC 3703   2 2
No Yes Coccidioides immitis RMSCC 2394   3 3
No Yes Coccidioides immitis H538.4   2 2
No Yes Ajellomyces dermatitidis ER-3   2 2
No Yes Histoplasma capsulatum H143   2 2
No Yes Histoplasma capsulatum H88   2 2
No Yes Histoplasma capsulatum G186AR   2 2
No Yes Aspergillus fumigatus A1163   2 2
No Yes Candida albicans WO-1   1 1
No Yes Saccharomyces cerevisiae UC5   1 1
No Yes Saccharomyces cerevisiae PW5   1 1
No Yes Saccharomyces cerevisiae CLIB324   1 1
No Yes Saccharomyces cerevisiae CBS7960   1 1
No Yes Saccharomyces cerevisiae YJM269   1 1
No Yes Saccharomyces cerevisiae T7   1 1
No Yes Saccharomyces cerevisiae FostersO   1 1
No Yes Saccharomyces cerevisiae Vin13   1 1
No Yes Saccharomyces cerevisiae LalvinQA23   1 1
No Yes Saccharomyces cerevisiae AWRI796   1 1
No Yes Saccharomyces cerevisiae Sigma1278b   1 1
No Yes Saccharomyces cerevisiae W303   1 1
No Yes Saccharomyces cerevisiae JAY291   1 1
No Yes Saccharomyces cerevisiae AWRI1631   1 1
No Yes Saccharomyces cerevisiae YPS163   1 1
No Yes Saccharomyces cerevisiae M22   1 1
No Yes Saccharomyces cerevisiae T73   1 1
No Yes Saccharomyces cerevisiae CLIB215   1 1
No Yes Saccharomyces cerevisiae Y10   1 1
No Yes Saccharomyces cerevisiae YJM789   1 1
No Yes Saccharomyces cerevisiae YJM789   1 1
No Yes Saccharomyces cerevisiae RM11-1a   1 1
No Yes Saccharomyces cerevisiae RM11-1a   1 1
No Yes Saccharomyces cerevisiae SGD (SGD) Baker's yeast 1 1
No Yes Schizosaccharomyces pombe 972h-   1 1
No Yes Batrachochytrium dendrobatidis JEL423   1 1
No Yes Batrachochytrium dendrobatidis JAM81   1 1
No Yes Theobroma cacao Matina 1-6 v0.9 Cacao 2 2
No Yes Oryza sativa ssp. Indica (Subspecies) Long-grained rice 3 3
No Yes Trypanosoma brucei Lister 427 v4.1   1 1
No Yes Neospora caninum Nc-Liverpool 6.2   1 1
No Yes Plasmodium falciparum HB3   2 2
No Yes Plasmodium falciparum Dd2   1 1
No Yes Cyanothece sp. PCC 8801   1 1
No Yes Candidatus Nitrososphaera gargensis Ga9.2   1 1
No Yes Candidatus Nitrosoarchaeum koreensis Candidatus Nitrosopumilus koreensis AR1   1 1
No Yes Caldisphaera lagunensis DSM 15908   1 1
No Yes Aeropyrum camini SY1 = JCM 12091   1 1
No Yes Sulfolobus islandicus LAL14/1   1 1
No Yes Sulfolobus islandicus REY15A   1 1
No Yes Sulfolobus islandicus HVE10/4   1 1
No Yes Sulfolobus islandicus Y.G.57.14   1 1
No Yes Sulfolobus islandicus L.S.2.15   1 1
No Yes Sulfolobus islandicus M.16.27   1 1
No Yes Sulfolobus islandicus M.14.25   1 1
No Yes Sulfolobus islandicus M.16.4   1 1
No Yes Sulfolobus islandicus L.D.8.5   1 1
No Yes Sulfolobus solfataricus 98/2   1 1
No Yes Sulfolobus acidocaldarius SUSAZ   1 1
No Yes Sulfolobus acidocaldarius Ron12/I   1 1
No Yes Sulfolobus acidocaldarius N8   1 1
No Yes Homo sapiens 75_37 (old version GRC) Human 37 33
No Yes Homo sapiens (NCBI version) Human 18 16
No Yes Mus musculus 63_37 (longest transcript per gene) (Duplicate) House mouse 14 12
No Yes Heliconius numata (Incomplete)   1 1
No Yes Loa loa v3.3 (Request) Eye worm 5 4
No Yes Wuchereria bancrofti v1.0 (Request) Agent of lymphatic filariasis 4 3
No Yes Brugia malayi v1.0 (Duplicate) Agent of lymphatic filariasis 5 4
No Yes Moniliophthora perniciosa FA553 (Genome survey)   1 1
No Yes Picea sitchensis (Incomplete) Sitka spruce 1 1
No Yes Lotus japonicus (Early assembly)   3 3
No Yes Malus x domestica (Duplicate) Apple 3 3
No Yes Ricinus communis (Early assembly) Castor bean 2 2
No Yes Nicotiana benthamiana 0.4.4 (Early draft)   11 8
No Yes Solanum pimpinellifolium A-1.0 (Early draft) Currant tomato 3 3
No Yes Solanum lycopersicum v2.3 (Early assembly) Tomato 3 3
No Yes Phoenix dactylifera (Early draft) Date palm 1 1
No Yes Homo sapiens 69_37 Human 13 11
No Yes Pan troglodytes 69_2.1.4 Chimpanzee 12 10
No Yes Gorilla gorilla 69_3.1 Western gorilla 10 9
No Yes Pongo abelii 69_2 Sumatran orangutan 12 10
No Yes Nomascus leucogenys 69_1.0 Northern white-cheeked gibbon 12 10
No Yes Macaca mulatta 69_1 Rhesus monkey 10 9
No Yes Callithrix jacchus 69_3.2.1 White-tufted-ear marmoset 12 10
No Yes Otolemur garnettii 69_3 Small-eared galago 12 10
No Yes Microcebus murinus 69_1 Gray mouse lemur 8 8
No Yes Rattus norvegicus 69_3.4 Norway rat 12 10
No Yes Mus musculus 69_38 House mouse 14 12
No Yes Dipodomys ordii 69_1 Ord's kangaroo rat 9 8
No Yes Ictidomys tridecemlineatus 69_2 Thirteen-lined ground squirrel 10 9
No Yes Cavia porcellus 69_3 Domestic guinea pig 14 12
No Yes Oryctolagus cuniculus 69_2 Rabbit 12 10
No Yes Ochotona princeps 69 American pika 6 6
No Yes Tupaia belangeri 69 Northern tree shrew 7 7
No Yes Sus scrofa 69_10.2 Pig 14 12
No Yes Bos taurus 69_3.1 Cattle 12 10
No Yes Vicugna pacos 69_1 Alpaca 8 7
No Yes Tursiops truncatus 69_1 Bottlenose dolphin 9 9
No Yes Mustela putorius furo 69_1.0 Domestic ferret 12 10
No Yes Ailuropoda melanoleuca 69_1 Giant panda 12 10
No Yes Canis familiaris 69_3.1 Dog 13 11
No Yes Felis catus 69 Domestic cat 7 7
No Yes Equus caballus 69_2 Horse 13 11
No Yes Myotis lucifugus 69_2.0 Little brown bat 10 8
No Yes Pteropus vampyrus 69_1 Large flying fox 10 9
No Yes Sorex araneus 69_1 European shrew 4 4
No Yes Erinaceus europaeus 69 Western European hedgehog 7 6
No Yes Procavia capensis 69_1 Cape rock hyrax 7 7
No Yes Loxodonta africana 69_3 African savanna elephant 14 12
No Yes Echinops telfairi 69 Small Madagascar hedgehog 8 8
No Yes Dasypus novemcinctus 69_2 Nine-banded armadillo 6 5
No Yes Choloepus hoffmanni 69_1 Hoffmann's two-fingered sloth 8 7
No Yes Macropus eugenii 69_1.0 Tammar wallaby 6 6
No Yes Sarcophilus harrisii 69_7.0 Tasmanian devil 12 10
No Yes Monodelphis domestica 69_5 Gray short-tailed opossum 13 11
No Yes Ornithorhynchus anatinus 69_5 Platypus 8 7
No Yes Petromyzon marinus 69_7.0 Sea lamprey 5 5
No Yes Meleagris gallopavo 69_2 Turkey 7 7
No Yes Gallus gallus 69_2 Chicken 7 6
No Yes Taeniopygia guttata 69_3.2.4 Zebra finch 8 7
No Yes Pelodiscus sinensis 69_1.0 Chinese soft-shelled turtle 11 10
No Yes Anolis carolinensis 69_2.0 Green anole 10 9
No Yes Xenopus tropicalis 69_4.2 Tropical clawed frog 12 11
No Yes Latimeria chalumnae 69_1 Coelacanth 12 10
No Yes Gadus morhua 69_1 Atlantic cod 13 11
No Yes Tetraodon nigroviridis 69_8 Spotted green pufferfish 14 12
No Yes Takifugu rubripes 69_4 Torafugu 14 12
No Yes Gasterosteus aculeatus 69_1 Three-spined stickleback 14 12
No Yes Oryzias latipes 69_1 Japanese medaka 14 12
No Yes Xiphophorus maculatus 69_4.4.2 Southern platyfish 14 12
No Yes Oreochromis niloticus 69_1.0 Nile tilapia 15 12
No Yes Danio rerio 69_9 Zebrafish 13 11
No Yes Ciona savignyi 69_2.0 Pacific transparent sea squirt 5 3
No Yes Ciona intestinalis 69 Vase tunicate 6 5
No Yes Drosophila melanogaster 69_5 Fruit fly 7 6
No Yes Caenorhabditis elegans 69_215 Roundworm 4 4
No Yes Saccharomyces cerevisiae 69_4 Baker's yeast 1 1
No Yes Arabidopsis thaliana 10 Thale cress 2 2
No Yes 1_050719N (meta-genome)   2 2
No Yes 2_050719S (meta-genome)   3 3
No Yes 5_050719P (meta-genome)   1 1
No Yes Atta cephalotes fungus garden (ACEF) (meta-genome)   1 1
No Yes Bath Hot Springs, filamentous community (meta-genome)   1 1
No Yes Bath Hot Springs, planktonic community (meta-genome)   1 1
No Yes Guerrero Negro salt ponds hypersaline mat 09(Y) (meta-genome)   1 1
No Yes Hot Spring microbial communities from Yellowstone Obsidian Hot Spring, Sample 10594 (meta-genome)   1 1
No Yes Hot spring microbial community from Yellowstone Hot Springs, sample YNP8 from OSP Spring (meta-genome)   6 6
No Yes Hot spring microbial community from Yellowstone Hot Springs, sample YNP1 from Alice Springs, Crater Hills (meta-genome)   5 5
No Yes Hot spring microbial community from Yellowstone Hot Springs, sample YNP11 from Octopus Springs (meta-genome)   3 3
No Yes Hot spring microbial community from Yellowstone Hot Springs, sample YNP13 from Bechler Spring (meta-genome)   1 1
No Yes Hot spring microbial community from Yellowstone Hot Springs, sample YNP14 from OSP Spring (meta-genome)   2 2
No Yes Hot spring microbial community from Yellowstone Hot Springs, sample YNP15 from Mushroom Spring (meta-genome)   2 2
No Yes Hot spring microbial community from Yellowstone Hot Springs, sample YNP17 from Obsidian Pool Prime (meta-genome)   1 1
No Yes Hot spring microbial community from Yellowstone Hot Springs, sample YNP18 from Washburn Springs #1 (meta-genome)   4 4
No Yes Hot spring microbial community from Yellowstone Hot Springs, sample YNP19 from Cistern Spring (meta-genome)   4 4
No Yes Hot spring microbial community from Yellowstone Hot Springs, sample YNP2 from Nymph Lake 10 (meta-genome)   1 1
No Yes Hot spring microbial community from Yellowstone Hot Springs, sample YNP3 from Monarch Geyser, Norris Geyser Basin (meta-genome)   1 1
No Yes Hot spring microbial community from Yellowstone Hot Springs, sample YNP4 from Joseph's Coat Springs (meta-genome)   3 3
No Yes Hot spring microbial community from Yellowstone Hot Springs, sample YNP7 from Chocolate Pots (meta-genome)   1 1
No Yes Hot spring microbial community from Yellowstone Hot Springs, sample YNP9 from Dragon Spring, Norris Geyser Basin (meta-genome)   2 2
No Yes NCBI 2017_08 genome   8236 7154
No Yes Oak Ridge Pristine Groundwater FRC FW301 (meta-genome)   2 2
No Yes Protozoadb 2010_08 (Protozoadb)   66 62
No Yes simLC - Simulated Low Complexity Metagenome (meta-genome)   1 1
No Yes Soil microbial communities from sample at FACE Site 5 Oak Ridge CO2+ (Oak Ridge elevated CO2) (meta-genome)   3 3
No Yes Soil microbial communities from sample at FACE Site 5 Oak Ridge CO2- (Oak Ridge ambient) (meta-genome)   1 1
No Yes Soil microbial community from bioreactor at Alameda Naval Air Station, CA, contaminated with Chloroethene, Sample 196 (meta-genome)   1 1
No Yes STRING v9.0.5 (STRING)   617 546
No Yes Switchgrass rhizosphere microbial community from Michigan, US, sample from East Lansing bulk soil (meta-genome)   1 1
No Yes Uniprot 2018_03 genome   6974 6272
No Yes Wastewater Terephthalate-degrading communities from Bioreactor (meta-genome)   2 2
No Yes Global Ocean Sampling Expedition (GOS)   78 78
No Yes NCBI viral sequences (Viral)   5 5
No Yes PDB chains (SCOP 1.75) (PDB)   6 6
No Yes Protein Data Bank (all PDB sequenc)   58 58
No Yes SCOP2 SCOPe CATH ECOD (all domain sequ)   70 70
No Yes TargetDB (Targets)   32 31
No Yes UniProt viral sequences (Viral)   4 4

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