SUPERFAMILY 1.75 HMM library and genome assignments server

Superfamily is undergoing a server migration - you are now browsing on the new server. Please contact us if you experience any problems.


Amb V allergen superfamily domain assignments
in
all genomes

Network of domain occurrence in all genomes


Assignment details

(show help)

4 selected genomes have 17 significant domains in 17 proteins.


Uniprot 2018_03 genome has 4 significant domains in 4 proteins.

     

Sequence ID   Evalue   Region   Family  
P02878   0.00000458   5-43   Amb V allergen  
P10414   5.89e-24   34-73   Amb V allergen  
P43174   0.0000183   27-65   Amb V allergen  
P43175   0.0000379   29-65   Amb V allergen  
 
Weak hits:
A0A016RVL5   0.0301   273-288   Amb V allergen  
A0A016RVU0   0.0314   286-301   Amb V allergen  
A0A016RWF7   0.0314   298-313   Amb V allergen  
A0A016TS75   0.0327   30-55   Amb V allergen  
A0A016TSA1   0.0301   28-53   Amb V allergen  
A0A022R8P9   0.0745   44-62   Amb V allergen  
A0A059APT0   0.0275   124-157   Amb V allergen  
A0A059B5F4   0.0157   45-72   Amb V allergen  
A0A067DNP5   0.0811   158-190   Amb V allergen  
A0A081ATE4   0.085   448-474   Amb V allergen  
A0A081ATE5   0.0837   448-474   Amb V allergen  
A0A081ATE7   0.0785   403-429   Amb V allergen  
A0A081ATE9   0.0772   403-429   Amb V allergen  
A0A081ATF1   0.0719   357-383   Amb V allergen  
A0A081ATF2   0.0615   291-317   Amb V allergen  
A0A081ATF4   0.0602   291-317   Amb V allergen  
A0A081ATF7   0.0589   271-297   Amb V allergen  
A0A081ATG0   0.0575   271-297   Amb V allergen  
A0A081AVY1   0.0144   123-147   Amb V allergen  
A0A081AVY2   0.00902   71-95   Amb V allergen  
A0A0C2Z152   0.0209   43-66   Amb V allergen  
A0A0C3CCG2   0.00275   73-100   Amb V allergen  
A0A0C9UL17   0.0248   10-28   Amb V allergen  
A0A0D2M3N6   0.0641   129-161   Amb V allergen  
A0A0D2TAN1   0.0876   36-63   Amb V allergen  
A0A0E3ELR3   0.0837   39-65   Amb V allergen  
A0A0F2M4E0   0.0327   81-108   Amb V allergen  
A0A0F7QHU7   0.051   7-31   Amb V allergen  
A0A0H3QSI8   0.051   7-31   Amb V allergen  
A0A0S2FPX3   0.0128   31-62   Amb V allergen  
A0A0W8DMF6   0.00902   71-95   Amb V allergen  
A0A125MMG7   0.0128   31-62   Amb V allergen  
A0A178WA36   0.0575   40-69   Amb V allergen  
A0A1C6CQ89   0.0301   8-23   Amb V allergen  
A0A1L9U154   0.0968   86-110   Amb V allergen  
A0A1U9YIK5   0.0745   46-68   Amb V allergen  
A0A1X1L1L0   0.0471   41-58   Amb V allergen  
A0A1Y2WY76   0.0549   68-90   Amb V allergen  
A0A2A9NKM4   0.0706   240-254   Amb V allergen  
A2G376   0.0667   379-407   Amb V allergen  
A2YY47   0.0157   4-20   Amb V allergen  
B0V2H2   0.0693   9-28   Amb V allergen  
B2AA62   0.0122   77-98   Amb V allergen  
B5G510   0.0876   36-63   Amb V allergen  
D0N167   0.0128   127-151   Amb V allergen  
D0N168   0.00824   104-128   Amb V allergen  
D2QWV1   0.0353   24-42   Amb V allergen  
D7KF84   0.0562   40-69   Amb V allergen  
D8Q5R9   0.00536   44-70   Amb V allergen  
D8QEZ5   0.0589   34-55   Amb V allergen  
E2A9G9   0.0497   1-22   Amb V allergen  
E3JWH9   0.0497   30-47   Amb V allergen  
E3M0E4   0.0445   258-287   Amb V allergen  
E9SH32   0.00275   9-31   Amb V allergen  
F1LK12   0.0288   59-86   Amb V allergen  
F1LK47   0.0955   49-81   Amb V allergen  
F2EEY2   0.0667   34-54   Amb V allergen  
F5MX46   0.0366   75-94   Amb V allergen  
F7NKA8   0.0392   13-34   Amb V allergen  
G5A7S8   0.0144   156-181   Amb V allergen  
G5A7S9   0.0106   71-95   Amb V allergen  
G9R6Q7   0.00929   16-41   Amb V allergen  
H1BIL2   0.0301   8-23   Amb V allergen  
H1QKZ8   0.0615   4-25   Amb V allergen  
H2B476   0.0693   98-123   Amb V allergen  
H3H033   0.0105   71-95   Amb V allergen  
H3H034   0.00942   71-95   Amb V allergen  
I1CDB1   0.034   335-365   Amb V allergen  
I2DZT8   0.0523   20-37   Amb V allergen  
I3YNS8   0.0445   632-656   Amb V allergen  
J3L0I9   0.0051   44-73   Amb V allergen  
K0A7T9   0.0602   213-235   Amb V allergen  
K3X1F5   0.0275   478-504   Amb V allergen  
M2T8Z9   0.0248   21-44   Amb V allergen  
M3AWE7   0.0732   14-36   Amb V allergen  
M4BBK2   0.0575   446-472   Amb V allergen  
M4BCJ6   0.0811   71-95   Amb V allergen  
M4QFB0   0.0759   41-67   Amb V allergen  
M4SLW5   0.0719   37-63   Amb V allergen  
M4SNP3   0.0759   39-65   Amb V allergen  
M5G5Z0   0.0615   73-98   Amb V allergen  
M5PVT0   0.085   25-44   Amb V allergen  
N0DTQ1   0.0615   12-43   Amb V allergen  
N0DTQ2   0.0615   12-43   Amb V allergen  
N0DTQ7   0.0615   12-43   Amb V allergen  
N0DTR0   0.0615   12-43   Amb V allergen  
N0DTR2   0.0615   12-43   Amb V allergen  
N0DTY8   0.0615   12-43   Amb V allergen  
N0DTZ1   0.0615   12-43   Amb V allergen  
N0DTZ4   0.0615   12-43   Amb V allergen  
N0DTZ8   0.0615   12-43   Amb V allergen  
N0DU01   0.0615   12-43   Amb V allergen  
N0DUV3   0.0615   12-43   Amb V allergen  
N0DUV4   0.0615   12-43   Amb V allergen  
N0DUV7   0.0615   12-43   Amb V allergen  
N0DUV8   0.0615   12-43   Amb V allergen  
N0DVL2   0.0615   12-43   Amb V allergen  
N0DVL3   0.0615   12-43   Amb V allergen  
N0DVL4   0.0615   12-43   Amb V allergen  
N0DVL6   0.0615   12-43   Amb V allergen  
N0DW23   0.0615   12-43   Amb V allergen  
N0DW24   0.0615   12-43   Amb V allergen  
N0DW25   0.0615   12-43   Amb V allergen  
N0DW26   0.0615   12-43   Amb V allergen  
N0DW27   0.0615   12-43   Amb V allergen  
Q3KTF0   0.0876   2-15   Amb V allergen  
Q5JVB9   0.0183   9-24   Amb V allergen  
Q6JX03   0.0876   36-63   Amb V allergen  
Q6R7K6   0.0183   15-35   Amb V allergen  
Q9L220   0.0085   4-25   Amb V allergen  
Q9MA41   0.0575   40-69   Amb V allergen  
R0GR60   0.0562   40-69   Amb V allergen  
R5PVS7   0.0379   38-55   Amb V allergen  
R9TLW9   0.0497   83-107   Amb V allergen  
R9TM26   0.0706   37-63   Amb V allergen  
T1KN56   0.0366   126-158   Amb V allergen  
U2BM15   0.0589   23-37   Amb V allergen  
U5F5Y9   0.0301   8-23   Amb V allergen  
U6NTH6   0.0785   157-172   Amb V allergen  
U7Q5J1   0.0327   81-108   Amb V allergen  
V4N1L6   0.0314   22-57   Amb V allergen  
V4TAA7   0.0589   117-149   Amb V allergen  
V5URE5   0.0772   41-67   Amb V allergen  
V5US02   0.0837   39-65   Amb V allergen  
V5V7U2   0.0889   51-70   Amb V allergen  
V5V893   0.0889   51-70   Amb V allergen  
V9FPM3   0.0876   468-494   Amb V allergen  
V9FPN2   0.0602   291-317   Amb V allergen  
V9FPN7   0.0562   271-297   Amb V allergen  
V9FPQ5   0.0785   403-429   Amb V allergen  
V9FQV4   0.085   448-474   Amb V allergen  
V9FRP5   0.0811   423-449   Amb V allergen  
V9FRP9   0.0615   291-317   Amb V allergen  
V9FS12   0.0144   123-147   Amb V allergen  
V9FSS5   0.0824   448-474   Amb V allergen  
V9FST0   0.0759   403-429   Amb V allergen  
V9FST4   0.0589   271-297   Amb V allergen  
V9FT81   0.00902   71-95   Amb V allergen  
V9QLF2   0.0183   15-35   Amb V allergen  
V9QN25   0.0183   15-35   Amb V allergen  
W2E7H5   0.0745   46-68   Amb V allergen  
W2HDD8   0.0785   403-429   Amb V allergen  
W2HDE8   0.0863   448-474   Amb V allergen  
W2HDQ8   0.0719   357-383   Amb V allergen  
W2HDR3   0.0615   291-317   Amb V allergen  
W2HFB8   0.0602   271-297   Amb V allergen  
W2HFL1   0.0798   403-429   Amb V allergen  
W2HG85   0.00902   71-95   Amb V allergen  
W2JJU0   0.085   448-474   Amb V allergen  
W2JJY0   0.0641   291-317   Amb V allergen  
W2JMB9   0.0144   123-147   Amb V allergen  
W2JP91   0.00902   71-95   Amb V allergen  
W2LQQ4   0.085   448-474   Amb V allergen  
W2LQQ7   0.0772   403-429   Amb V allergen  
W2LQR2   0.0602   291-317   Amb V allergen  
W2LQX5   0.0589   271-297   Amb V allergen  
W2LQY8   0.0785   403-429   Amb V allergen  
W2LQZ2   0.0615   291-317   Amb V allergen  
W2LT09   0.0837   448-474   Amb V allergen  
W2LT15   0.0719   357-383   Amb V allergen  
W2LT24   0.0575   271-297   Amb V allergen  
W2LTF4   0.00902   71-95   Amb V allergen  
W2LVJ8   0.0144   123-147   Amb V allergen  
W2NW68   0.0837   448-474   Amb V allergen  
W2NW72   0.0719   357-383   Amb V allergen  
W2NW76   0.0602   291-317   Amb V allergen  
W2NWN1   0.085   448-474   Amb V allergen  
W2NWP6   0.0575   271-297   Amb V allergen  
W2NWW5   0.0772   403-429   Amb V allergen  
W2NYE6   0.0785   403-429   Amb V allergen  
W2NYF5   0.0589   271-297   Amb V allergen  
W2NZ90   0.0615   291-317   Amb V allergen  
W2QKQ6   0.0837   448-474   Amb V allergen  
W2QKT3   0.0785   403-429   Amb V allergen  
W2QKU7   0.0719   357-383   Amb V allergen  
W2QLH0   0.085   448-474   Amb V allergen  
W2QLI7   0.0602   291-317   Amb V allergen  
W2QLK5   0.0575   271-297   Amb V allergen  
W2QMP7   0.0615   291-317   Amb V allergen  
W2QNE2   0.0772   403-429   Amb V allergen  
W2QNF4   0.00902   71-95   Amb V allergen  
W2QNH4   0.0589   271-297   Amb V allergen  
W2QQF7   0.0144   123-147   Amb V allergen  
W2XK45   0.0863   448-474   Amb V allergen  
W2XK55   0.0628   289-315   Amb V allergen  
W2XKR5   0.085   448-474   Amb V allergen  
W2XKR9   0.0719   357-383   Amb V allergen  
W2XKS6   0.0615   289-315   Amb V allergen  
W2XLF3   0.0798   403-429   Amb V allergen  
W2XMR9   0.0785   403-429   Amb V allergen  
W2XMS4   0.0641   291-317   Amb V allergen  
W2XMS8   0.0615   291-317   Amb V allergen  
W2XNQ8   0.0144   123-147   Amb V allergen  
W2XNY8   0.00902   71-95   Amb V allergen  
W2ZV83   0.0719   357-383   Amb V allergen  
W2ZVC0   0.0785   403-429   Amb V allergen  
W2ZVC3   0.0615   291-317   Amb V allergen  
W2ZW46   0.085   448-474   Amb V allergen  
W2ZW49   0.0772   403-429   Amb V allergen  
W2ZW99   0.0837   448-474   Amb V allergen  
W2ZWA8   0.0602   291-317   Amb V allergen  
W2ZWB1   0.0575   271-297   Amb V allergen  
W2ZXJ8   0.0144   123-147   Amb V allergen  
W2ZXU6   0.00902   71-95   Amb V allergen  
W2ZYC7   0.0589   271-297   Amb V allergen  
W4P365   0.051   23-47   Amb V allergen  
W4PC04   0.051   23-47   Amb V allergen  
W4QRR5   0.0719   97-121   Amb V allergen  
X0ZZX8   0.085   57-85   Amb V allergen  
X1KUK4   0.0562   37-61   Amb V allergen  
X2GVJ8   0.085   138-166   Amb V allergen  

PDB chains (SCOP 1.75) (PDB) has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Evalue   Region   Family  
2bbgA   7.32e-25   1-40   Amb V allergen  

Protein Data Bank (all PDB sequenc) has 3 significant domains in 3 proteins.

     

Sequence ID   Evalue   Region   Family  
1bbg_A   7.32e-25   1-40   Amb V allergen  
2bbg_A   7.32e-25   1-40   Amb V allergen  
3bbg_A   7.32e-25   1-40   Amb V allergen  

SCOP2 SCOPe CATH ECOD (all domain sequ) has 9 significant domains in 9 proteins.

     

Sequence ID   Evalue   Region   Family  
000008587|e2bbgA1|902.1.1.1|A:1-40   7.32e-25   1-40   Amb V allergen  
000092018|e1bbgA1|902.1.1.1|A:1-40   7.32e-25   1-40   Amb V allergen  
000092019|e3bbgA1|902.1.1.1|A:1-40   7.32e-25   1-40   Amb V allergen  
cath|current|1bbgA00/1-40   7.32e-25   1-40   Amb V allergen  
cath|current|2bbgA00/1-40   7.32e-25   1-40   Amb V allergen  
cath|current|3bbgA00/1-40   7.32e-25   1-40   Amb V allergen  
d1bbga_   7.32e-25   1-40   Amb V allergen  
d2bbga_   7.32e-25   1-40   Amb V allergen  
d3bbga_   7.32e-25   1-40   Amb V allergen  

Jump to [ Top of page · Assignment details · Add assignments from individual genomes ]


Add assignments from groups of genomes

View all assignments containing a Amb V allergen domain in each group of genomes.

Jump to [ Top of page · Assignment details · Add assignments from groups of genomes ]


Add assignments from individual genomes

Select additional genomes you would like to see domain assignments for, then click 'Submit'.

Select to display   Genome       Domains   Proteins
No Yes ALL   17 17
No Yes Uniprot 2018_03 genome   4 4
No Yes PDB chains (SCOP 1.75) (PDB)   1 1
No Yes Protein Data Bank (all PDB sequenc)   3 3
No Yes SCOP2 SCOPe CATH ECOD (all domain sequ)   9 9

Jump to [ Top of page · Assignment details · Add assignments from groups of genomes · Add assignments from individual genomes ]