SUPERFAMILY 1.75 HMM library and genome assignments server

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Domain combinations for _gap_,57756,50630,56672,53098,_gap_ superfamilies

The selected domain combination is the occurrence of the following superfamily domains in N- to C-Terminal order:

57756 - Retrovirus zinc finger-like domains
50630 - Acid proteases
56672 - DNA/RNA polymerases
53098 - Ribonuclease H-like

Phylogenetic distribution

Other domain architectures with a similar genomic distribution.
See the phylogenetic distribution for this domain architecture.


Domain combination graphics and links

63 sequences contain the _gap_,57756,50630,56672,53098,_gap_ domain architecture in Oryza sativa v193.

Add higher domain architectures which include the chosen architecture.

Click on a domain architecture to see the domain assignment details.
The key to the domain colours is at the bottom of the page.


Oryza sativa v193: LOC_Os03g44360.1|PACid:21911802

Oryza sativa v193: LOC_Os03g39330.1|PACid:21912613

Oryza sativa v193: LOC_Os03g23200.1|PACid:21911324

Oryza sativa v193: LOC_Os12g43050.1|PACid:21937456

Oryza sativa v193: LOC_Os12g40030.1|PACid:21936179

Oryza sativa v193: LOC_Os12g35130.1|PACid:21935194

Oryza sativa v193: LOC_Os12g33910.1|PACid:21937067

Oryza sativa v193: LOC_Os12g04830.1|PACid:21934381

Oryza sativa v193: LOC_Os11g10900.1|PACid:21946559

Oryza sativa v193: LOC_Os11g22540.1|PACid:21945039

Oryza sativa v193: LOC_Os11g24000.1|PACid:21948504

Oryza sativa v193: LOC_Os11g24012.1|PACid:21944614

Oryza sativa v193: LOC_Os11g14580.1|PACid:21948132

Oryza sativa v193: LOC_Os11g14650.1|PACid:21948323

Oryza sativa v193: LOC_Os11g24270.1|PACid:21948541

Oryza sativa v193: LOC_Os05g17470.1|PACid:21941731

Oryza sativa v193: LOC_Os05g15030.1|PACid:21941599

Oryza sativa v193: LOC_Os05g19560.1|PACid:21940223

Oryza sativa v193: LOC_Os04g01030.1|PACid:21893696

Oryza sativa v193: LOC_Os04g26660.1|PACid:21895574

Oryza sativa v193: LOC_Os08g20770.1|PACid:21889752

Oryza sativa v193: LOC_Os10g10920.1|PACid:21885149

Oryza sativa v193: LOC_Os04g38180.1|PACid:21893098

Oryza sativa v193: LOC_Os04g12310.1|PACid:21896553

Oryza sativa v193: LOC_Os04g06130.1|PACid:21893856

Oryza sativa v193: LOC_Os04g06110.1|PACid:21893604

Oryza sativa v193: LOC_Os04g45400.1|PACid:21895621

Oryza sativa v193: LOC_Os04g03110.1|PACid:21896953

Oryza sativa v193: LOC_Os03g45550.1|PACid:21913046

Oryza sativa v193: LOC_Os03g48990.1|PACid:21913740

Oryza sativa v193: LOC_Os10g25720.1|PACid:21885423

Oryza sativa v193: LOC_Os10g06830.1|PACid:21883373

Oryza sativa v193: LOC_Os01g63120.1|PACid:21909938

Oryza sativa v193: LOC_Os02g02060.1|PACid:21921874

Oryza sativa v193: LOC_Os02g28010.1|PACid:21918202

Oryza sativa v193: LOC_Os02g46240.1|PACid:21921130

Oryza sativa v193: LOC_Os05g17830.1|PACid:21941262

Oryza sativa v193: LOC_Os05g18340.1|PACid:21943219

Oryza sativa v193: LOC_Os05g24680.1|PACid:21938937

Oryza sativa v193: LOC_Os05g35390.1|PACid:21942350

Oryza sativa v193: LOC_Os06g32490.1|PACid:21933143

Oryza sativa v193: LOC_Os06g36540.1|PACid:21931050

Oryza sativa v193: LOC_Os07g13420.1|PACid:21900682

Oryza sativa v193: LOC_Os07g16240.1|PACid:21900355

Oryza sativa v193: LOC_Os07g20460.1|PACid:21899741

Oryza sativa v193: LOC_Os07g28200.1|PACid:21897726

Oryza sativa v193: LOC_Os08g08550.1|PACid:21889142

Oryza sativa v193: LOC_Os08g11800.1|PACid:21888669

Oryza sativa v193: LOC_Os08g12080.1|PACid:21890729

Oryza sativa v193: LOC_Os08g12210.1|PACid:21887604

Oryza sativa v193: LOC_Os08g20170.1|PACid:21889762

Oryza sativa v193: LOC_Os08g21280.1|PACid:21889336

Oryza sativa v193: LOC_Os09g02110.1|PACid:21925110

Oryza sativa v193: LOC_Os09g09400.1|PACid:21927263

Oryza sativa v193: LOC_Os09g12890.1|PACid:21926594

Oryza sativa v193: LOC_Os10g06520.1|PACid:21883763

Oryza sativa v193: LOC_Os04g14890.1|PACid:21893585

Oryza sativa v193: LOC_Os07g28510.1|PACid:21898220

Oryza sativa v193: LOC_Os07g16000.1|PACid:21900695

Oryza sativa v193: LOC_Os02g47690.1|PACid:21924071

Oryza sativa v193: LOC_Os09g03420.1|PACid:21927394

Oryza sativa v193: LOC_Os12g04810.1|PACid:21938617

Oryza sativa v193: LOC_Os11g39790.1|PACid:21946727