SUPERFAMILY 1.75 HMM library and genome assignments server

SUPERFAMILY 2 can be accessed from supfam.org. Please contact us if you experience any problems.

Domain combinations for _gap_,56502,56502,_gap_ superfamilies in UniProt viral sequences

The selected domain combination is the occurrence of the following superfamily domains in N- to C-Terminal order:

56502 - gp120 core
56502 - gp120 core

Phylogenetic distribution

Other domain architectures with a similar genomic distribution.
See the phylogenetic distribution for this domain architecture.


Domain combination graphics and links

184 sequences contain the _gap_,56502,56502,_gap_ domain architecture in UniProt viral sequences.

Add higher domain architectures which include the chosen architecture.

Click on a domain architecture to see the domain assignment details.
The key to the domain colours is at the bottom of the page.


A1Z0E0_9HIV1

A5JP18_9HIV1

A8TUM8_9HIV1

B2LVH4_9HIV1

B2LVH5_9HIV1

B2LVH6_9HIV1

B2LVI3_9HIV1

B2LVI6_9HIV1

B2LVI7_9HIV1

B2LVH7_9HIV1

B2LVH8_9HIV1

B2LVH9_9HIV1

B2LVI0_9HIV1

B2LVI1_9HIV1

B2LVI2_9HIV1

B2LVI4_9HIV1

B2LVI8_9HIV1

B2LVI9_9HIV1

B2LVJ3_9HIV1

B2LVJ4_9HIV1

B2LVJ8_9HIV1

B2LVJ9_9HIV1

B2LVK0_9HIV1

B2LVW2_9HIV1

B2LVW3_9HIV1

B2LVW4_9HIV1

B2LVW5_9HIV1

B2LVW6_9HIV1

B2LVW7_9HIV1

B2LVW8_9HIV1

B2LVW9_9HIV1

B2LVX0_9HIV1

B2LVX1_9HIV1

B2LVX3_9HIV1

B2LVX4_9HIV1

B2LVX5_9HIV1

B2LVX6_9HIV1

B2LVX7_9HIV1

B2LVX8_9HIV1

B2LVY0_9HIV1

B2LVY1_9HIV1

B2LVY4_9HIV1

B2LVY5_9HIV1

B2LVY6_9HIV1

B2LVY7_9HIV1

B2LVY8_9HIV1

B2LW28_9HIV1

B2LW29_9HIV1

B2LW32_9HIV1

B2LW36_9HIV1

B5LW07_9HIV1

B5LW10_9HIV1

B5LW11_9HIV1

B5LW17_9HIV1

B5LW20_9HIV1

B5LW21_9HIV1

D6NUJ5_9HIV1

D6NUY8_9HIV1

D6NVD9_9HIV1

O72605_9HIV1

Q003J8_9HIV1

Q07132_9HIV1

Q08342_9HIV1

Q08343_9HIV1

Q09FD1_9HIV1

Q09FD2_9HIV1

Q09FD3_9HIV1

Q09FD4_9HIV1

Q09FD5_9HIV1

Q09FD6_9HIV1

Q09FD7_9HIV1

Q09FD8_9HIV1

Q09FD9_9HIV1

Q09FE0_9HIV1

Q09FE1_9HIV1

Q09FE2_9HIV1

Q09FE3_9HIV1

Q09FE4_9HIV1

Q09FE5_9HIV1

Q09FE6_9HIV1

Q09FE7_9HIV1

Q09FE8_9HIV1

Q09FE9_9HIV1

Q09FF0_9HIV1

Q09FF1_9HIV1

Q09FF2_9HIV1

Q09FF3_9HIV1

Q09FF4_9HIV1

Q09FF5_9HIV1

Q09FF6_9HIV1

Q09FF7_9HIV1

Q09FF8_9HIV1

Q09FF9_9HIV1

Q09FG0_9HIV1

Q09FG1_9HIV1

Q09FG2_9HIV1

Q09FG3_9HIV1

Q09FG4_9HIV1

Q09FG5_9HIV1

Q09FG6_9HIV1

Q09FG7_9HIV1

Q09FG8_9HIV1

Q09FG9_9HIV1

Q09FH0_9HIV1

Q09FH1_9HIV1

Q09FH2_9HIV1

Q09FH3_9HIV1

Q09FH4_9HIV1

Q09FH5_9HIV1

Q09FH6_9HIV1

Q09FH7_9HIV1

Q09FH8_9HIV1

Q09FH9_9HIV1

Q09FI0_9HIV1

Q09FI1_9HIV1

Q09FI2_9HIV1

Q09FI3_9HIV1

Q09FI4_9HIV1

Q09FI5_9HIV1

Q09FI6_9HIV1

Q09FI7_9HIV1

Q09FI8_9HIV1

Q09FI9_9HIV1

Q09FJ0_9HIV1

Q09FJ1_9HIV1

Q09FJ2_9HIV1

Q09FJ3_9HIV1

Q09FJ4_9HIV1

Q09FJ5_9HIV1

Q09FJ6_9HIV1

Q09FJ7_9HIV1

Q09FJ8_9HIV1

Q09FJ9_9HIV1

Q09FK0_9HIV1

Q09FK1_9HIV1

Q09FK2_9HIV1

Q09FK4_9HIV1

Q09FK6_9HIV1

Q09FK7_9HIV1

Q09FK8_9HIV1

Q09FK9_9HIV1

Q09FL0_9HIV1

Q09FL1_9HIV1

Q09FL2_9HIV1

Q09FL3_9HIV1

Q09FL4_9HIV1

Q09FL5_9HIV1

Q09FL6_9HIV1

Q1WEU4_9HIV1

Q38JU9_9HIV1

Q69968_9HIV1

Q6PU35_9HIV1

Q6RUY7_9HIV1

Q70147_9HIV1

Q70148_9HIV1

Q70149_9HIV1

Q70158_9HIV1

Q71381_9HIV1

Q71383_9HIV1

Q71384_9HIV1

Q71385_9HIV1

Q71386_9HIV1

Q71387_9HIV1

Q71388_9HIV1

Q74304_9HIV1

Q75597_9HIV1

Q75598_9HIV1

Q75599_9HIV1

Q75600_9HIV1

Q75601_9HIV1

Q75602_9HIV1

Q76127_9HIV1

Q7SSZ8_9HIV1

Q7SSZ9_9HIV1

Q7ST01_9HIV1

Q7ST03_9HIV1

Q7ST04_9HIV1

Q7ST05_9HIV1

Q8J3U3_9HIV1

Q8Q3D1_9HIV1

Q9WRH9_9HIV1

Q9WRI3_9HIV1

Q9WRI7_9HIV1

Q9WRJ2_9HIV1