SUPERFAMILY 1.75 HMM library and genome assignments server

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Domain assignment for NP_001157934.1.87134 from NCBI 2017_08 genome

Domain architecture


Domain assignment details

(
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Strong hits

Sequence:  NP_001157934.1.87134
Domain Number 1 Region: 5032-5117
Classification Level Classification E-value
Superfamily SEA domain 0.0000693
Family SEA domain 0.018
Further Details:      
 
Weak hits

Sequence:  NP_001157934.1.87134
Domain Number - Region: 4985-5010
Classification Level Classification E-value
Superfamily EGF/Laminin 0.0135
Family EGF-type module 0.036
Further Details:      
 
Domain Number - Region: 4988-5013,5176-5228
Classification Level Classification E-value
Superfamily Growth factor receptor domain 0.0392
Family Growth factor receptor domain 0.01
Further Details:      
 

Gene Ontology term assignment details

The top 10 most specific Gene Ontology terms for each namespace assigned to this domain architecture as determined by dcGO Predictor

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Biological Process IC (bits) H-Score
Molecular Function IC (bits) H-Score
Cellular Component IC (bits) H-Score

Protein sequence

External link(s) NP_001157934.1.87134
Sequence length 5335
Comment mucin-12 precursor [Homo sapiens]; AA=GCF_000306695.2; RF=na; TAX=9606; STAX=9606; NAME=Homo sapiens; AL=Chromosome; RT=Major
Sequence
MLVIWILTLALRLCASVTTVTPGSTVNTSIGGNTTSASTPSSSDPFTTFSDYGVSVTFIT
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PGSTETTLSPGSITTSSFAQEFTTPHSQPGSALSTVSPASTTVPGLSEESTTFYSSPGST
ETTAFSHSNTMSIHSQQSTPFPDSPGFTHTVLPATLTTTDIGQESTAFHSSSDATGTTPL
PARSTASDLVGEPTTFYISPSPTYTTLFPASSSTSGLTEESTTFHTSPSFTSTIVSTESL
ETLAPGLCQEGQIWNGKQCVCPQGYVGYQCLSPLESFPVETPEKLNATLGMTVKVTYRNF
TEKMNDASSQEYQNFSTLFKNRMDVVLKGDNLPQYRGVNIRRLLNGSIVVKNDVILEADY
TLEYEELFENLAEIVKAKIMNETRTTLLDPDSCRKAILCYSEEDTFVDSSVTPGFDFQEQ
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Download sequence
Identical sequences ENSP00000441929 NP_001157934.1.87134 NP_001157934.1.92137 gi|256600257|ref|NP_001157934.1| ENSP00000441929

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