SUPERFAMILY 1.75 HMM library and genome assignments server

SUPERFAMILY 2 can be accessed from supfam.org. Please contact us if you experience any problems.

Domain assignment for 4u26_DO from Protein Data Bank

Domain architecture


Domain assignment details

(
show help)
Strong hits

Sequence:  4u26_DO
Domain Number 1 Region: 2-114
Classification Level Classification E-value
Superfamily Translational machinery components 6.3e-54
Family Ribosomal protein L18 and S11 0.00000082
Further Details:      
 

Gene Ontology term assignment details

The top 10 most specific Gene Ontology terms for each namespace assigned to this domain architecture as determined by dcGO Predictor

(show help)

Cellular Component IC (bits) H-Score
Molecular Function IC (bits) H-Score
Biological Process IC (bits) H-Score

Protein sequence

External link(s) 4u26_DO
Sequence length 116
Comment mol:protein length:116 50S ribosomal protein L18
Sequence
dkksarirratrarrklqelgatrlvvhrtprhiyaqviapngsevlvaastvekaiaeq
lkytgnkdaaaavgkavaeralekgikdvsfdrsgfqyhgrvqaladaareaglqf
Download sequence
Identical sequences 3j5l_O 4csu_O 4u1u_BO 4u1u_DO 4u1v_BO 4u1v_DO 4u20_BO 4u20_DO 4u24_BO 4u24_DO 4u25_BO 4u25_DO 4u26_BO 4u26_DO 4u27_BO 4u27_DO 4uy8_O 4v5h_BO 4v69_BO 4v6t_BO 4v7s_BO 4v7s_DO 4v7t_BO 4v7t_DO 4v7u_BO 4v7u_DO 4v7v_BO 4v7v_DO 4v9d_CO 4v9d_DO 4wf1_BO 4wf1_DO 4www_RO 4www_YO 5lza_O 5lzb_O 5lzc_O 5lzd_O 5lze_O 5lzf_O 5mgp_O 5np6_m 5o2r_O 5uyk_17 5uyl_17 5uym_17 5uyn_17 5uyp_17 5uyq_17 5wdt_O 5we4_O 5we6_O 5wf0_O 5wfk_O 5wfs_O 6bu8_17 6enf_O 6enj_O 6enu_O 6gbz_O 6gc0_O 6gc4_O 6gc8_O 6gwt_O 6gxm_O 6gxn_O 6gxo_O 6gxp_O 6h4n_O 6h58_O 6h58_OO 000140876|e1vt2O1|2484.1.1.47|O:2-117 000147210|e3sgfS1|2484.1.1.47|S:2-117 000149808|e3j19O1|2484.1.1.47|O:1-116 000152264|e4garO1|2484.1.1.47|O:2-117 000357989|e3fikO1|2484.1.1.47|O:1-116 000371387|e3i1nO1|2484.1.1.47|O:2-117 000371440|e3i1pO1|2484.1.1.47|O:2-117 000371493|e3i1rO1|2484.1.1.47|O:2-117 000371546|e3i1tO1|2484.1.1.47|O:2-117 000371599|e3i20O1|2484.1.1.47|O:2-117 000371652|e3i22O1|2484.1.1.47|O:2-117 000385505|e3kcrO1|2484.1.1.47|O:2-117 000388728|e2wwqO1|2484.1.1.47|O:1-116 000402217|e3orbO1|2484.1.1.47|O:2-117 000402642|e3ofqO1|2484.1.1.47|O:1-116 000402675|e3ofrO1|2484.1.1.47|O:1-116 000403149|e3ofcO1|2484.1.1.47|O:1-116 000403180|e3ofdO1|2484.1.1.47|O:1-116 000403255|e3ofzO1|2484.1.1.47|O:1-116 000403286|e3og0O1|2484.1.1.47|O:1-116 000408167|e3oasO1|2484.1.1.47|O:1-116 000408200|e3oatO1|2484.1.1.47|O:1-116 000420933|e3r8sO1|2484.1.1.47|O:1-116 000420964|e3r8tO1|2484.1.1.47|O:1-116 001067033|e4kixO1|2484.1.1.47|O:2-117 001067093|e4kizO1|2484.1.1.47|O:2-117 001067151|e4kj1O1|2484.1.1.47|O:2-117 001067209|e4kj3O1|2484.1.1.47|O:2-117 001067266|e4kj5O1|2484.1.1.47|O:2-117 001067324|e4kj7O1|2484.1.1.47|O:2-117 001067381|e4kj9O1|2484.1.1.47|O:2-117 001067439|e4kjbO1|2484.1.1.47|O:2-117 001109807|e3j4xO1|2484.1.1.47|O:2-117 001109891|e3j50O1|2484.1.1.47|O:2-117 001109926|e3j51O1|2484.1.1.47|O:2-117 001109961|e3j52O1|2484.1.1.47|O:2-117 001110019|e3j54O1|2484.1.1.47|O:2-117 001110077|e3j56O1|2484.1.1.47|O:2-117 001110135|e3j58O1|2484.1.1.47|O:2-117 001110193|e3j5aO1|2484.1.1.47|O:2-117 001110251|e3j5cO1|2484.1.1.47|O:2-117 001110309|e3j5eO1|2484.1.1.47|O:2-117 001110367|e3j5gO1|2484.1.1.47|O:2-117 001110425|e3j5iO1|2484.1.1.47|O:2-117 001110483|e3j5kO1|2484.1.1.47|O:2-117 001124403|e3j5oO1|2484.1.1.47|O:2-117 001124987|e3j5uQ1|2484.1.1.47|Q:2-117 001125022|e3j5wR1|2484.1.1.47|R:2-117 001147853|e3j5lO1|2484.1.1.47|O:1-116 001187580|e3uosS2|2484.1.1.47|S:2-117 001187603|e4gauO2|2484.1.1.47|O:2-117 001294238|e4csuO1|2484.1.1.47|O:1-116 001317008|e4pebO1|2484.1.1.47|O:1-116 001317043|e4pecO1|2484.1.1.47|O:1-116 001317261|e4tomO1|2484.1.1.47|O:1-116 001317319|e4tooO1|2484.1.1.47|O:1-116 001317375|e4tovO1|2484.1.1.47|O:1-116 001317433|e4toxO1|2484.1.1.47|O:1-116 001317489|e4tp1O1|2484.1.1.47|O:1-116 001317547|e4tp3O1|2484.1.1.47|O:1-116 001317603|e4tp5O1|2484.1.1.47|O:1-116 001317661|e4tp7O1|2484.1.1.47|O:1-116 001317717|e4tp9O1|2484.1.1.47|O:1-116 001317775|e4tpbO1|2484.1.1.47|O:1-116 001317831|e4tpdO1|2484.1.1.47|O:1-116 001317889|e4tpfO1|2484.1.1.47|O:1-116 001401553|e3j7zO1|2484.1.1.47|O:2-117 001405773|e4uy8O1|2484.1.1.47|O:1-116 001406393|e4wapO1|2484.1.1.47|O:1-116 001406451|e4warO1|2484.1.1.47|O:1-116 001411857|e3j8gO1|2484.1.1.47|O:2-117 001423777|e4u1uBO1|2484.1.1.47|BO:1-116 001423778|e4u1uDO1|2484.1.1.47|DO:1-116 001423891|e4u1vBO1|2484.1.1.47|BO:1-116 001423892|e4u1vDO1|2484.1.1.47|DO:1-116 001424005|e4u20BO1|2484.1.1.47|BO:1-116 001424006|e4u20DO1|2484.1.1.47|DO:1-116 001424119|e4u24BO1|2484.1.1.47|BO:1-116 001424120|e4u24DO1|2484.1.1.47|DO:1-116 001424233|e4u25BO1|2484.1.1.47|BO:1-116 001424234|e4u25DO1|2484.1.1.47|DO:1-116 001424347|e4u26BO1|2484.1.1.47|BO:1-116 001424348|e4u26DO1|2484.1.1.47|DO:1-116 001424461|e4u27BO1|2484.1.1.47|BO:1-116 001424462|e4u27DO1|2484.1.1.47|DO:1-116 001430440|e4v50BO1|2484.1.1.47|BO:2-117 001430441|e4v50DO1|2484.1.1.47|DO:2-117 001430676|e4v52BO1|2484.1.1.47|BO:2-117 001430677|e4v52DO1|2484.1.1.47|DO:2-117 001430788|e4v53BO1|2484.1.1.47|BO:2-117 001430789|e4v53DO1|2484.1.1.47|DO:2-117 001430900|e4v54BO1|2484.1.1.47|BO:2-117 001430901|e4v54DO1|2484.1.1.47|DO:2-117 001431014|e4v55BO1|2484.1.1.47|BO:2-117 001431015|e4v55DO1|2484.1.1.47|DO:2-117 001431128|e4v56BO1|2484.1.1.47|BO:2-117 001431129|e4v56DO1|2484.1.1.47|DO:2-117 001431240|e4v57BO1|2484.1.1.47|BO:2-117 001431241|e4v57DO1|2484.1.1.47|DO:2-117 001432296|e4v5hBO1|2484.1.1.47|BO:1-116 001434042|e4v5yBO1|2484.1.1.47|BO:2-117 001434043|e4v5yDO1|2484.1.1.47|DO:2-117 001434835|e4v64BO1|2484.1.1.47|BO:2-117 001434836|e4v64DO1|2484.1.1.47|DO:2-117 001435204|e4v69BO1|2484.1.1.47|BO:1-116 001435572|e4v6cBO1|2484.1.1.47|BO:2-117 001435573|e4v6cDO1|2484.1.1.47|DO:2-117 001435684|e4v6dBO1|2484.1.1.47|BO:2-117 001435685|e4v6dDO1|2484.1.1.47|DO:2-117 001435796|e4v6eBO1|2484.1.1.47|BO:2-117 001435797|e4v6eDO1|2484.1.1.47|DO:2-117 001436735|e4v6tBO1|2484.1.1.47|BO:1-116 001437126|e4v6yBO1|2484.1.1.47|BO:2-117 001437184|e4v6zBO1|2484.1.1.47|BO:2-117 001437242|e4v70BO1|2484.1.1.47|BO:2-117 001437300|e4v71BO1|2484.1.1.47|BO:2-117 001437358|e4v72BO1|2484.1.1.47|BO:2-117 001437416|e4v73BO1|2484.1.1.47|BO:2-117 001437474|e4v74BO1|2484.1.1.47|BO:2-117 001437532|e4v75BO1|2484.1.1.47|BO:2-117 001437590|e4v76BO1|2484.1.1.47|BO:2-117 001437648|e4v77BO1|2484.1.1.47|BO:2-117 001437706|e4v78BO1|2484.1.1.47|BO:2-117 001437764|e4v79BO1|2484.1.1.47|BO:2-117 001437822|e4v7aBO1|2484.1.1.47|BO:2-117 001437884|e4v7bBO1|2484.1.1.47|BO:2-117 001437944|e4v7cBQ1|2484.1.1.47|BQ:2-117 001437980|e4v7dAR1|2484.1.1.47|AR:2-117 001438342|e4v7iAO1|2484.1.1.47|AO:2-117 001439355|e4v7sBO1|2484.1.1.47|BO:1-116 001439356|e4v7sDO1|2484.1.1.47|DO:1-116 001439467|e4v7tBO1|2484.1.1.47|BO:1-116 001439468|e4v7tDO1|2484.1.1.47|DO:1-116 001439583|e4v7uBO1|2484.1.1.47|BO:1-116 001439584|e4v7uDO1|2484.1.1.47|DO:1-116 001439691|e4v7vBO1|2484.1.1.47|BO:1-116 001439692|e4v7vDO1|2484.1.1.47|DO:1-116 001440239|e4v80BO1|2484.1.1.47|BO:2-117 001440240|e4v80DO1|2484.1.1.47|DO:2-117 001440679|e4v85BS1|2484.1.1.47|BS:2-117 001441082|e4v89BS1|2484.1.1.47|BS:2-117 001445184|e4v9cBO1|2484.1.1.47|BO:2-117 001445185|e4v9cDO1|2484.1.1.47|DO:2-117 001445298|e4v9dCO1|2484.1.1.47|CO:1-116 001445299|e4v9dDO1|2484.1.1.47|DO:1-116 001446317|e4v9oAO1|2484.1.1.47|AO:2-117 001446318|e4v9oCO1|2484.1.1.47|CO:2-117 001446319|e4v9oEO1|2484.1.1.47|EO:2-117 001446320|e4v9oGO1|2484.1.1.47|GO:2-117 001446561|e4v9pAO1|2484.1.1.47|AO:2-117 001446562|e4v9pCO1|2484.1.1.47|CO:2-117 001446563|e4v9pEO1|2484.1.1.47|EO:2-117 001446564|e4v9pGO1|2484.1.1.47|GO:2-117 001447791|e4wf1BO1|2484.1.1.47|BO:1-116 001447792|e4wf1DO1|2484.1.1.47|DO:1-116 001482248|e4wwwRO1|2484.1.1.47|RO:1-116 001482249|e4wwwYO1|2484.1.1.47|YO:1-116 001504092|e5afiO1|2484.1.1.47|O:2-117 001514492|e4ybbCP1|2484.1.1.47|CP:2-117 001546930|e3j9yO1|2484.1.1.47|O:2-117 001675090|e4woiBO1|2484.1.1.47|BO:2-117 001675091|e4woiCO1|2484.1.1.47|CO:2-117 001697138|e5adyO1|2484.1.1.47|O:2-117 001724353|e3jcdO1|2484.1.1.47|O:2-117 001724411|e3jceO1|2484.1.1.47|O:2-117 001732381|e3jbuo1|2484.1.1.47|o:2-117 001732437|e3jbvo1|2484.1.1.47|o:2-117 001781019|e3jcjN1|2484.1.1.47|N:2-117 001781079|e3jcnO1|2484.1.1.47|O:2-117 001828011|e5iqrO1|2484.1.1.47|O:2-117 001859935|e5j88CP1|2484.1.1.47|CP:2-117 001860048|e5j8aCP1|2484.1.1.47|CP:2-117 001860161|e5j91CP1|2484.1.1.47|CP:2-117 001860274|e5jc9CP1|2484.1.1.47|CP:2-117 001867518|e5jteBO1|2484.1.1.47|BO:2-117 001867573|e5ju8BO1|2484.1.1.47|BO:2-117 001867604|e5l3pS1|2484.1.1.47|S:2-117 001868968|e5it8CP1|2484.1.1.47|CP:2-117 001869081|e5j5bCP1|2484.1.1.47|CP:2-117 001869194|e5j7lCP1|2484.1.1.47|CP:2-117 001872221|e5kcs1S1|2484.1.1.47|1S:2-117 001888210|e5kpsO1|2484.1.1.47|O:2-117 001888268|e5kpvN1|2484.1.1.47|N:2-117 001888326|e5kpwN1|2484.1.1.47|N:2-117 001888384|e5kpxN1|2484.1.1.47|N:2-117 001921123|e5lzaO1|2484.1.1.47|O:1-116 001921184|e5lzbO1|2484.1.1.47|O:1-116 001921245|e5lzcO1|2484.1.1.47|O:1-116 001921306|e5lzdO1|2484.1.1.47|O:1-116 001921360|e5lzeO1|2484.1.1.47|O:1-116 001921414|e5lzfO1|2484.1.1.47|O:1-116 001934399|e5mdvO1|2484.1.1.47|O:2-117 001934461|e5mdwO1|2484.1.1.47|O:2-117 001934519|e5mdzO1|2484.1.1.47|O:2-117 001934574|e5mgpO1|2484.1.1.47|O:1-116 001935689|e5mdyO1|2484.1.1.47|O:2-117 001943653|e5u4iP1|2484.1.1.47|P:2-117 002047161|e5u9f171|2484.1.1.47|17:2-117 002047225|e5u9g171|2484.1.1.47|17:2-117 002081683|e5uyk171|2484.1.1.47|17:1-116 002081746|e5uym171|2484.1.1.47|17:1-116 002081808|e5uyn171|2484.1.1.47|17:1-116 002081870|e5uyp171|2484.1.1.47|17:1-116 002081932|e5uyq171|2484.1.1.47|17:1-116 002083702|e5np6m1|2484.1.1.47|m:1-116 002083738|e5uyl171|2484.1.1.47|17:1-116 002094203|e5nwyb1|2484.1.1.47|b:2-117 002096195|e5o2rO1|2484.1.1.47|O:1-116 d2i2to1 d2i2vo1 d2qamo1 d2qaoo1 d2qbao1 d2qbco1 d2qbeo1 d2qbgo1 d2qbio1 d2qbko1 d2qovo1 d2qoxo1 d2qozo1 d2qp1o1 d2z4lo1 d2z4no1 d3df2o1 d3df4o1

Jump to [ Top of page · Domain architecture · Domain assignment details · Most Informative Gene Ontologies ]