SUPERFAMILY 1.75 HMM library and genome assignments server

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Domain assignment for 4u25_BX from Protein Data Bank

Domain architecture


Domain assignment details

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Strong hits

Sequence:  4u25_BX
Domain Number 1 Region: 1-76
Classification Level Classification E-value
Superfamily L28p-like 5.93e-30
Family Ribosomal protein L28 0.00000763
Further Details:      
 

Gene Ontology term assignment details

The top 10 most specific Gene Ontology terms for each namespace assigned to this domain architecture as determined by dcGO Predictor

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Molecular Function IC (bits) H-Score
Cellular Component IC (bits) H-Score
Biological Process IC (bits) H-Score

Protein sequence

External link(s) 4u25_BX
Sequence length 77
Comment mol:protein length:77 50S ribosomal protein L28
Sequence
srvcqvtgkrpvtgnnrshalnatkrrflpnlhshrfwvesekrfvtlrvsakgmrvidk
kgidtvlaelrargeky
Download sequence
Identical sequences ER84S 3j5l_X 3j9z_LV 3ja1_LZ 4csu_0 4u1u_BX 4u1u_DX 4u1v_BX 4u1v_DX 4u20_BX 4u20_DX 4u24_BX 4u24_DX 4u25_BX 4u25_DX 4u26_BX 4u26_DX 4u27_BX 4u27_DX 4uy8_X 4v50_BX 4v50_DX 4v5h_B0 4v69_BX 4v6m_BX 4v6n_AZ 4v6o_BZ 4v6p_BZ 4v6q_BZ 4v6r_BZ 4v6s_AZ 4v6t_BX 4v6v_B1 4v7c_BZ 4v7d_A1 4v7s_BX 4v7s_DX 4v7t_BX 4v7t_DX 4v7u_BX 4v7u_DX 4v7v_BX 4v7v_DX 4v9d_CX 4v9d_DX 4wf1_BX 4wf1_DX 4www_RX 4www_YX 4ybb_CY 4ybb_DY 5gaf_Y 5h5u_Y 5it8_CY 5it8_DY 5j5b_CY 5j5b_DY 5j7l_CY 5j7l_DY 5j88_CY 5j88_DY 5j8a_CY 5j8a_DY 5j91_CY 5j91_DY 5jc9_CY 5jc9_DY 5lza_X 5lzb_X 5lzc_X 5lzd_X 5lze_X 5lzf_X 5mgp_X 5nco_Y 5np6_v 5o2r_X 5uyk_26 5uyl_26 5uym_26 5uyn_26 5uyp_26 5uyq_26 5wdt_X 5we4_X 5we6_X 5wf0_X 5wfk_X 5wfs_X 6bu8_26 6enf_X 6enj_X 6enu_X 6gbz_X 6gc0_X 6gc4_X 6gc8_X 6gwt_X 6gxm_X 6gxn_X 6gxo_X 6gxp_X 6h4n_X 6h58_X 6h58_XX 000008226|e2qamZ1|4232.1.1.6|Z:2-78 000089824|e2qozZ1|4232.1.1.6|Z:2-78 000089825|e2qoxZ1|4232.1.1.6|Z:2-78 000089826|e2qovZ1|4232.1.1.6|Z:2-78 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