SUPERFAMILY 1.75 HMM library and genome assignments server

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Domain assignment for 243277.VC2472 from STRING v9.0.5

Domain architecture


Domain assignment details

(
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Strong hits

Sequence:  243277.VC2472
Domain Number 1 Region: 16-235
Classification Level Classification E-value
Superfamily Folate-binding domain 4.87e-55
Family Aminomethyltransferase folate-binding domain 0.00000889
Further Details:      
 
Domain Number 2 Region: 237-320
Classification Level Classification E-value
Superfamily Aminomethyltransferase beta-barrel domain 2.48e-19
Family Aminomethyltransferase beta-barrel domain 0.0006
Further Details:      
 

Gene Ontology term assignment details

The top 10 most specific Gene Ontology terms for each namespace assigned to this domain architecture as determined by dcGO Predictor

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Biological Process IC (bits) H-Score
Cellular Component IC (bits) H-Score
Molecular Function IC (bits) H-Score

Protein sequence

External link(s) 243277.VC2472
Sequence length 323
Comment (Vibrio cholerae)
Sequence
MDWQNRFSVLNLSSHDPLPELMLTHLTGWGAITLVGADKKAYLQGQVTCNVVSLQEQQVT
FGAHCDAKGKVWSVFRLFHHHDGYAMFQPQSAMEVELRELKKYAIFSKVTIAESSDIALG
VMGSQADAWIDTVSETTGDVRRIAGGTAVRMSPQRWLLLVNAEQAEQYVNAWQGLHVEQS
LWTRMDIEEAVPVVTQTAQNEHIPQALNVQAVDGISFTKGCYTGQETVARAKYRGINKRA
MYIVKGNLSAPLSQDEPVVLERAVGENWRSAGALLTHYRFTDSIAIGLIVLPNDLEHDVK
LRLAAQPDTRWHIQPLPYSLSDE
Download sequence
Identical sequences A0A0H6GE05 A0A0K9URH0 A0A0X1KZC9 C3LR15 Q9KPA1
gi|15642468|ref|NP_232101.1| 243277.VC2472 579112.VCM66_2395 gi|360036345|ref|YP_004938108.1| NP_232101.1.72393 WP_000384066.1.100264 WP_000384066.1.100388 WP_000384066.1.100440 WP_000384066.1.10071 WP_000384066.1.100976 WP_000384066.1.101117 WP_000384066.1.10121 WP_000384066.1.101220 WP_000384066.1.101314 WP_000384066.1.101507 WP_000384066.1.101933 WP_000384066.1.102054 WP_000384066.1.1024 WP_000384066.1.10626 WP_000384066.1.10834 WP_000384066.1.10887 WP_000384066.1.11270 WP_000384066.1.11351 WP_000384066.1.11879 WP_000384066.1.11885 WP_000384066.1.11965 WP_000384066.1.12252 WP_000384066.1.12262 WP_000384066.1.12332 WP_000384066.1.12525 WP_000384066.1.12527 WP_000384066.1.12548 WP_000384066.1.12590 WP_000384066.1.12686 WP_000384066.1.13053 WP_000384066.1.13155 WP_000384066.1.13156 WP_000384066.1.13454 WP_000384066.1.13652 WP_000384066.1.13725 WP_000384066.1.14080 WP_000384066.1.14257 WP_000384066.1.14263 WP_000384066.1.14995 WP_000384066.1.15109 WP_000384066.1.15179 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