SUPERFAMILY 1.75 HMM library and genome assignments server

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Domain assignment for 257313.BP0239 from STRING v9.0.5

Domain architecture


Domain assignment details

(
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Strong hits

Sequence:  257313.BP0239
Domain Number 1 Region: 178-410
Classification Level Classification E-value
Superfamily Poly A polymerase C-terminal region-like 3.4e-51
Family Poly A polymerase C-terminal region-like 0.0012
Further Details:      
 
Domain Number 2 Region: 29-176
Classification Level Classification E-value
Superfamily Nucleotidyltransferase 2.83e-41
Family Poly A polymerase head domain-like 0.00031
Further Details:      
 

Gene Ontology term assignment details

The top 10 most specific Gene Ontology terms for each namespace assigned to this domain architecture as determined by dcGO Predictor

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Cellular Component IC (bits) H-Score
Molecular Function IC (bits) H-Score
Biological Process IC (bits) H-Score

Protein sequence

External link(s) 257313.BP0239
Sequence length 451
Comment (Bordetella pertussis)
Sequence
MITETIRKFVGRLFAPALRGPQRIGAERHGIDRRNVSRHAIKVCDVLRQHGYEAYIVGGA
VRDLIVGLEPKDFDVATNATPEQIRPLFRRARIIGRRFQLVHVVFGQEIIETSTFRAPAS
DDQETDEHGRILRDNVFGSQEEDAARRDFTMNALYYDPHTEEVIDYHQGVQDLKKRQVRI
IGDPVKRYREDPVRMLRAVRFAAKLNGSIDTATRQPIRTMASLIENVPASRLFDEMLKLL
TCGHAMDCLRQLRNDGLHHGLLPLLDVVLEQPGGENFVELALERTDARVRAGKTISPSFL
FAALLWQLVDVRWKQLRAQGEHNIPALVQAADSVLDEQTEKLAIQRRFSSDMREIWFMQP
RFERRAGKTIYRMLEQPRFRAACDFLQLRAAAGEFDSVLAQWWMDLANGDDATRAEMIEE
TAHLPRETGDAPAQKRRRPRRRPSNRPREPQ
Download sequence
Identical sequences A0A0A0XFR2 A0A0E8D0P8 A0A0N2QPQ8 A0A0T7CKG4 A0A171JXU4 Q7W0B0
257313.BP0239 gi|408414596|ref|YP_006625303.1| gi|33591480|ref|NP_879124.1| gi|384202817|ref|YP_005588556.1| NP_879124.1.91861 WP_010929702.1.100022 WP_010929702.1.100434 WP_010929702.1.100555 WP_010929702.1.100619 WP_010929702.1.100675 WP_010929702.1.100759 WP_010929702.1.100989 WP_010929702.1.101082 WP_010929702.1.101128 WP_010929702.1.101132 WP_010929702.1.10115 WP_010929702.1.101264 WP_010929702.1.101372 WP_010929702.1.10149 WP_010929702.1.101703 WP_010929702.1.10189 WP_010929702.1.101955 WP_010929702.1.10527 WP_010929702.1.10899 WP_010929702.1.11100 WP_010929702.1.11718 WP_010929702.1.12242 WP_010929702.1.12615 WP_010929702.1.12628 WP_010929702.1.12642 WP_010929702.1.12812 WP_010929702.1.12848 WP_010929702.1.12960 WP_010929702.1.12961 WP_010929702.1.12998 WP_010929702.1.13010 WP_010929702.1.13337 WP_010929702.1.13387 WP_010929702.1.13571 WP_010929702.1.13878 WP_010929702.1.13976 WP_010929702.1.1435 WP_010929702.1.14857 WP_010929702.1.14969 WP_010929702.1.15153 WP_010929702.1.15298 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