SUPERFAMILY 1.75 HMM library and genome assignments server

SUPERFAMILY 2 can be accessed from supfam.org. Please contact us if you experience any problems.

Domain assignment for APC26329 from TargetDB

Domain architecture


Domain assignment details

(
show help)
Strong hits

Sequence:  APC26329
Domain Number 1 Region: 5-335
Classification Level Classification E-value
Superfamily P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases 2.85e-76
Family RecA protein-like (ATPase-domain) 0.0000522
Further Details:      
 

Gene Ontology term assignment details

The top 10 most specific Gene Ontology terms for each namespace assigned to this domain architecture as determined by dcGO Predictor

(show help)

Molecular Function IC (bits) H-Score
Biological Process IC (bits) H-Score
Cellular Component IC (bits) H-Score

Protein sequence

External link(s) APC26329
Sequence length 345
Comment $ MCSG $ SQ20134 $ PDBT65700 $
Sequence
MDIAELLEFSVKHNASDLHLSAGVPPMVRIDGEVRKLGVPAFTHSDVHRLIFEIMNDAQR
SEYEEKLEVDFSFELPNVGRFRVNAFHQARGCSAVFRTIPTVIPTLEQLDAPEIFSKIAN
YEKGLVLVTGPTGSGKSTTLAAMVNYVNAHHNKHILTIEDPIEFVHSNNKCLINQREVHR
DTHSFKNALRSALREDPDVILVGELRDQETISLALTAAETGHLVFGTLHTSSAAKTIDRI
IDVFPGSDKDMVRSMLSESLRAVIAQKLLKRVGGGRVACHEIMLATPAIRNLIREDKVAQ
MYSIIQTGAAHGMQTMEQNAKQLIARGVVDAQEVQSKIELDLKAF
Download sequence
Identical sequences A0A085PNN8 A0A0H3AK69 A0A0H3Q6J6 Q9KUQ3
gi|147674559|ref|YP_001215988.1| NP_230116.1.72393 WP_000350195.1.100264 WP_000350195.1.100388 WP_000350195.1.100440 WP_000350195.1.100659 WP_000350195.1.10071 WP_000350195.1.100976 WP_000350195.1.101051 WP_000350195.1.10121 WP_000350195.1.101220 WP_000350195.1.101314 WP_000350195.1.101507 WP_000350195.1.101677 WP_000350195.1.101933 WP_000350195.1.102054 WP_000350195.1.1024 WP_000350195.1.10453 WP_000350195.1.10626 WP_000350195.1.10834 WP_000350195.1.10874 WP_000350195.1.11270 WP_000350195.1.11351 WP_000350195.1.11879 WP_000350195.1.11885 WP_000350195.1.11965 WP_000350195.1.11987 WP_000350195.1.12252 WP_000350195.1.12262 WP_000350195.1.12332 WP_000350195.1.12486 WP_000350195.1.12525 WP_000350195.1.12527 WP_000350195.1.12548 WP_000350195.1.12590 WP_000350195.1.12686 WP_000350195.1.12828 WP_000350195.1.12902 WP_000350195.1.13053 WP_000350195.1.13155 WP_000350195.1.13156 WP_000350195.1.13395 WP_000350195.1.13454 WP_000350195.1.13652 WP_000350195.1.13725 WP_000350195.1.14080 WP_000350195.1.14179 WP_000350195.1.14257 WP_000350195.1.14263 WP_000350195.1.14353 WP_000350195.1.14553 WP_000350195.1.14904 WP_000350195.1.14995 WP_000350195.1.15109 WP_000350195.1.15134 WP_000350195.1.15179 WP_000350195.1.15200 WP_000350195.1.15786 WP_000350195.1.15919 WP_000350195.1.15997 WP_000350195.1.16115 WP_000350195.1.16351 WP_000350195.1.16382 WP_000350195.1.17001 WP_000350195.1.17232 WP_000350195.1.17295 WP_000350195.1.17621 WP_000350195.1.17738 WP_000350195.1.18375 WP_000350195.1.18392 WP_000350195.1.18447 WP_000350195.1.18484 WP_000350195.1.18577 WP_000350195.1.18845 WP_000350195.1.18862 WP_000350195.1.18916 WP_000350195.1.19126 WP_000350195.1.19128 WP_000350195.1.19428 WP_000350195.1.19442 WP_000350195.1.19503 WP_000350195.1.19597 WP_000350195.1.20065 WP_000350195.1.20107 WP_000350195.1.20336 WP_000350195.1.20379 WP_000350195.1.20404 WP_000350195.1.20602 WP_000350195.1.20669 WP_000350195.1.20699 WP_000350195.1.20758 WP_000350195.1.21073 WP_000350195.1.21179 WP_000350195.1.21279 WP_000350195.1.21281 WP_000350195.1.21558 WP_000350195.1.21671 WP_000350195.1.21717 WP_000350195.1.21764 WP_000350195.1.21815 WP_000350195.1.21866 WP_000350195.1.22521 WP_000350195.1.22770 WP_000350195.1.22773 WP_000350195.1.229 WP_000350195.1.22953 WP_000350195.1.2304 WP_000350195.1.23134 WP_000350195.1.2316 WP_000350195.1.23333 WP_000350195.1.23361 WP_000350195.1.2341 WP_000350195.1.23416 WP_000350195.1.23424 WP_000350195.1.23532 WP_000350195.1.23538 WP_000350195.1.2354 WP_000350195.1.23751 WP_000350195.1.23808 WP_000350195.1.23955 WP_000350195.1.240 WP_000350195.1.2401 WP_000350195.1.24106 WP_000350195.1.24280 WP_000350195.1.24399 WP_000350195.1.2496 WP_000350195.1.24980 WP_000350195.1.25386 WP_000350195.1.25649 WP_000350195.1.26020 WP_000350195.1.26156 WP_000350195.1.26223 WP_000350195.1.2627 WP_000350195.1.26326 WP_000350195.1.26508 WP_000350195.1.26580 WP_000350195.1.27186 WP_000350195.1.27435 WP_000350195.1.27458 WP_000350195.1.27532 WP_000350195.1.27639 WP_000350195.1.27863 WP_000350195.1.28431 WP_000350195.1.2849 WP_000350195.1.28508 WP_000350195.1.29095 WP_000350195.1.29535 WP_000350195.1.29708 WP_000350195.1.29889 WP_000350195.1.30045 WP_000350195.1.30107 WP_000350195.1.30292 WP_000350195.1.3032 WP_000350195.1.30360 WP_000350195.1.3054 WP_000350195.1.30927 WP_000350195.1.31396 WP_000350195.1.31718 WP_000350195.1.31853 WP_000350195.1.31964 WP_000350195.1.32111 WP_000350195.1.32264 WP_000350195.1.32271 WP_000350195.1.32395 WP_000350195.1.32814 WP_000350195.1.32942 WP_000350195.1.32955 WP_000350195.1.33019 WP_000350195.1.33093 WP_000350195.1.33625 WP_000350195.1.33811 WP_000350195.1.33819 WP_000350195.1.34108 WP_000350195.1.34133 WP_000350195.1.34195 WP_000350195.1.34261 WP_000350195.1.34634 WP_000350195.1.34643 WP_000350195.1.34663 WP_000350195.1.3514 WP_000350195.1.35201 WP_000350195.1.35266 WP_000350195.1.35630 WP_000350195.1.35881 WP_000350195.1.36322 WP_000350195.1.3635 WP_000350195.1.36364 WP_000350195.1.36384 WP_000350195.1.36513 WP_000350195.1.36668 WP_000350195.1.36686 WP_000350195.1.36956 WP_000350195.1.36973 WP_000350195.1.37054 WP_000350195.1.37262 WP_000350195.1.37537 WP_000350195.1.37676 WP_000350195.1.37999 WP_000350195.1.38420 WP_000350195.1.38590 WP_000350195.1.39208 WP_000350195.1.39460 WP_000350195.1.39514 WP_000350195.1.39675 WP_000350195.1.39853 WP_000350195.1.39933 WP_000350195.1.40039 WP_000350195.1.40152 WP_000350195.1.40346 WP_000350195.1.40433 WP_000350195.1.40459 WP_000350195.1.40470 WP_000350195.1.40484 WP_000350195.1.40491 WP_000350195.1.40542 WP_000350195.1.40740 WP_000350195.1.40782 WP_000350195.1.41284 WP_000350195.1.41538 WP_000350195.1.41569 WP_000350195.1.41573 WP_000350195.1.4175 WP_000350195.1.41883 WP_000350195.1.42128 WP_000350195.1.42152 WP_000350195.1.42441 WP_000350195.1.42498 WP_000350195.1.42617 WP_000350195.1.4272 WP_000350195.1.42853 WP_000350195.1.42865 WP_000350195.1.43222 WP_000350195.1.43335 WP_000350195.1.43407 WP_000350195.1.43428 WP_000350195.1.4365 WP_000350195.1.43884 WP_000350195.1.439 WP_000350195.1.44136 WP_000350195.1.44555 WP_000350195.1.44569 WP_000350195.1.44709 WP_000350195.1.44730 WP_000350195.1.45055 WP_000350195.1.45127 WP_000350195.1.45155 WP_000350195.1.45206 WP_000350195.1.45264 WP_000350195.1.45704 WP_000350195.1.45842 WP_000350195.1.45903 WP_000350195.1.45958 WP_000350195.1.46118 WP_000350195.1.46146 WP_000350195.1.46486 WP_000350195.1.46540 WP_000350195.1.4661 WP_000350195.1.4701 WP_000350195.1.47202 WP_000350195.1.4730 WP_000350195.1.4731 WP_000350195.1.47417 WP_000350195.1.47428 WP_000350195.1.47794 WP_000350195.1.47796 WP_000350195.1.47846 WP_000350195.1.47942 WP_000350195.1.48128 WP_000350195.1.48305 WP_000350195.1.48659 WP_000350195.1.48715 WP_000350195.1.48742 WP_000350195.1.488 WP_000350195.1.48874 WP_000350195.1.48927 WP_000350195.1.48984 WP_000350195.1.49238 WP_000350195.1.49317 WP_000350195.1.49593 WP_000350195.1.50254 WP_000350195.1.50277 WP_000350195.1.5028 WP_000350195.1.50577 WP_000350195.1.50625 WP_000350195.1.50813 WP_000350195.1.50822 WP_000350195.1.50980 WP_000350195.1.51160 WP_000350195.1.51163 WP_000350195.1.51177 WP_000350195.1.51661 WP_000350195.1.5201 WP_000350195.1.52391 WP_000350195.1.52676 WP_000350195.1.53085 WP_000350195.1.5320 WP_000350195.1.53214 WP_000350195.1.53823 WP_000350195.1.5397 WP_000350195.1.54191 WP_000350195.1.54398 WP_000350195.1.5450 WP_000350195.1.54706 WP_000350195.1.54831 WP_000350195.1.54901 WP_000350195.1.55092 WP_000350195.1.55208 WP_000350195.1.55665 WP_000350195.1.55917 WP_000350195.1.55929 WP_000350195.1.55932 WP_000350195.1.56429 WP_000350195.1.56785 WP_000350195.1.56807 WP_000350195.1.57098 WP_000350195.1.57148 WP_000350195.1.57300 WP_000350195.1.57518 WP_000350195.1.57546 WP_000350195.1.57678 WP_000350195.1.57945 WP_000350195.1.58295 WP_000350195.1.58596 WP_000350195.1.58844 WP_000350195.1.58975 WP_000350195.1.59010 WP_000350195.1.59194 WP_000350195.1.59378 WP_000350195.1.59394 WP_000350195.1.5943 WP_000350195.1.59554 WP_000350195.1.59633 WP_000350195.1.59741 WP_000350195.1.59916 WP_000350195.1.60216 WP_000350195.1.60386 WP_000350195.1.60694 WP_000350195.1.60955 WP_000350195.1.61169 WP_000350195.1.61523 WP_000350195.1.61624 WP_000350195.1.61644 WP_000350195.1.61753 WP_000350195.1.61869 WP_000350195.1.61875 WP_000350195.1.61935 WP_000350195.1.62165 WP_000350195.1.62324 WP_000350195.1.62425 WP_000350195.1.63347 WP_000350195.1.63546 WP_000350195.1.63655 WP_000350195.1.6366 WP_000350195.1.63723 WP_000350195.1.63749 WP_000350195.1.63779 WP_000350195.1.63911 WP_000350195.1.64253 WP_000350195.1.64315 WP_000350195.1.64382 WP_000350195.1.64441 WP_000350195.1.6455 WP_000350195.1.65007 WP_000350195.1.65051 WP_000350195.1.65086 WP_000350195.1.65469 WP_000350195.1.65528 WP_000350195.1.66329 WP_000350195.1.66633 WP_000350195.1.66696 WP_000350195.1.67770 WP_000350195.1.67839 WP_000350195.1.68424 WP_000350195.1.68506 WP_000350195.1.68723 WP_000350195.1.68863 WP_000350195.1.68925 WP_000350195.1.69049 WP_000350195.1.69157 WP_000350195.1.69843 WP_000350195.1.69857 WP_000350195.1.70069 WP_000350195.1.70176 WP_000350195.1.70247 WP_000350195.1.7049 WP_000350195.1.70813 WP_000350195.1.70892 WP_000350195.1.71129 WP_000350195.1.72106 WP_000350195.1.72241 WP_000350195.1.72326 WP_000350195.1.72361 WP_000350195.1.72369 WP_000350195.1.7238 WP_000350195.1.72480 WP_000350195.1.72856 WP_000350195.1.72964 WP_000350195.1.73148 WP_000350195.1.73429 WP_000350195.1.73555 WP_000350195.1.73855 WP_000350195.1.73929 WP_000350195.1.74111 WP_000350195.1.74666 WP_000350195.1.74991 WP_000350195.1.75012 WP_000350195.1.75326 WP_000350195.1.75378 WP_000350195.1.755 WP_000350195.1.75778 WP_000350195.1.75796 WP_000350195.1.76320 WP_000350195.1.76425 WP_000350195.1.76486 WP_000350195.1.7654 WP_000350195.1.76645 WP_000350195.1.77029 WP_000350195.1.7717 WP_000350195.1.77355 WP_000350195.1.77397 WP_000350195.1.77445 WP_000350195.1.77703 WP_000350195.1.77794 WP_000350195.1.77830 WP_000350195.1.77914 WP_000350195.1.78157 WP_000350195.1.78172 WP_000350195.1.78428 WP_000350195.1.78531 WP_000350195.1.78740 WP_000350195.1.79044 WP_000350195.1.79776 WP_000350195.1.79943 WP_000350195.1.8023 WP_000350195.1.80339 WP_000350195.1.80628 WP_000350195.1.80702 WP_000350195.1.80744 WP_000350195.1.80808 WP_000350195.1.8117 WP_000350195.1.81563 WP_000350195.1.81871 WP_000350195.1.81917 WP_000350195.1.82030 WP_000350195.1.82119 WP_000350195.1.82193 WP_000350195.1.82248 WP_000350195.1.82262 WP_000350195.1.82413 WP_000350195.1.82583 WP_000350195.1.83040 WP_000350195.1.83073 WP_000350195.1.83082 WP_000350195.1.83109 WP_000350195.1.83703 WP_000350195.1.83761 WP_000350195.1.84385 WP_000350195.1.84519 WP_000350195.1.84610 WP_000350195.1.8480 WP_000350195.1.85007 WP_000350195.1.85498 WP_000350195.1.85822 WP_000350195.1.85961 WP_000350195.1.85972 WP_000350195.1.85998 WP_000350195.1.86192 WP_000350195.1.86269 WP_000350195.1.86879 WP_000350195.1.87274 WP_000350195.1.87286 WP_000350195.1.87301 WP_000350195.1.87335 WP_000350195.1.87355 WP_000350195.1.87573 WP_000350195.1.87602 WP_000350195.1.87625 WP_000350195.1.87804 WP_000350195.1.88057 WP_000350195.1.88230 WP_000350195.1.88283 WP_000350195.1.88350 WP_000350195.1.88556 WP_000350195.1.8867 WP_000350195.1.89144 WP_000350195.1.89441 WP_000350195.1.89447 WP_000350195.1.89719 WP_000350195.1.89822 WP_000350195.1.89889 WP_000350195.1.8997 WP_000350195.1.89995 WP_000350195.1.90120 WP_000350195.1.90133 WP_000350195.1.90227 WP_000350195.1.9040 WP_000350195.1.90437 WP_000350195.1.90675 WP_000350195.1.91247 WP_000350195.1.91262 WP_000350195.1.91274 WP_000350195.1.91539 WP_000350195.1.91747 WP_000350195.1.91794 WP_000350195.1.91841 WP_000350195.1.92022 WP_000350195.1.92038 WP_000350195.1.92063 WP_000350195.1.92069 WP_000350195.1.92157 WP_000350195.1.92401 WP_000350195.1.92412 WP_000350195.1.92516 WP_000350195.1.92559 WP_000350195.1.92632 WP_000350195.1.92696 WP_000350195.1.92703 WP_000350195.1.92952 WP_000350195.1.92993 WP_000350195.1.9302 WP_000350195.1.93060 WP_000350195.1.93399 WP_000350195.1.93441 WP_000350195.1.93836 WP_000350195.1.93945 WP_000350195.1.94255 WP_000350195.1.94426 WP_000350195.1.94441 WP_000350195.1.94481 WP_000350195.1.94827 WP_000350195.1.94887 WP_000350195.1.95204 WP_000350195.1.95516 WP_000350195.1.95549 WP_000350195.1.9561 WP_000350195.1.95662 WP_000350195.1.95733 WP_000350195.1.95818 WP_000350195.1.95976 WP_000350195.1.9607 WP_000350195.1.96089 WP_000350195.1.96187 WP_000350195.1.96311 WP_000350195.1.96471 WP_000350195.1.9660 WP_000350195.1.96687 WP_000350195.1.96693 WP_000350195.1.96704 WP_000350195.1.96980 WP_000350195.1.97144 WP_000350195.1.97288 WP_000350195.1.97516 WP_000350195.1.97552 WP_000350195.1.97562 WP_000350195.1.97650 WP_000350195.1.97799 WP_000350195.1.97832 WP_000350195.1.9787 WP_000350195.1.98021 WP_000350195.1.98116 WP_000350195.1.98172 WP_000350195.1.98246 WP_000350195.1.98280 WP_000350195.1.98373 WP_000350195.1.98624 WP_000350195.1.98642 WP_000350195.1.99128 WP_000350195.1.99204 WP_000350195.1.9939 WP_000350195.1.99417 WP_000350195.1.99452 WP_000350195.1.995 WP_000350195.1.99861 WP_000350195.1.99872 WP_000350195.1.99992 gi|384423763|ref|YP_005633121.1| APC26329 IDP00114 gi|379740335|ref|YP_005332304.1| gi|229606244|ref|YP_002876892.1| 243277.VC0462 345073.VC0395_A0014 593588.VCD_001145 gi|147674559|ref|YP_001215988.1| gi|360037103|ref|YP_004938866.1| gi|15640489|ref|NP_230116.1|

Jump to [ Top of page · Domain architecture · Domain assignment details · Most Informative Gene Ontologies ]