SUPERFAMILY 1.75 HMM library and genome assignments server

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Fibritin superfamily domain assignments
in
NCBI 2017_08 genome

Network of domain occurrence in all genomes


Assignment details

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NCBI 2017_08 genome has 463 significant domains in 388 proteins.

     

Sequence ID   Evalue   Region   Family  
NP_049771.1.34590   2.78e-40   372-484   Fibritin  
  1.54e-37   4-108   Fibritin  
NP_861864.1.41520   7.85e-38   369-479   Fibritin  
  1.96e-36   2-107   Fibritin  
NP_891719.1.85104   2.94e-35   5-110   Fibritin  
  0.000785   373-449   Fibritin  
NP_899595.1.10495   1.29e-27   8-110   Fibritin  
NP_932503.1.7886   2.94e-37   5-110   Fibritin  
NP_944095.1.33347   6.47e-27   7-93   Fibritin  
WP_005495371.1.100143   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_005495371.1.100951   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_005495371.1.101108   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_005495371.1.102109   0.0000902   157-196   Fibritin  
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WP_010762087.1.202   0.0000118   130-166   Fibritin  
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WP_010770316.1.11153   0.0000667   131-170   Fibritin  
WP_010770316.1.48525   0.0000667   131-170   Fibritin  
WP_010770316.1.93241   0.0000667   131-170   Fibritin  
WP_012529591.1.31571   0.00000314   345-371   Fibritin  
WP_014529182.1.30341   0.0000157   328-361   Fibritin  
  0.000235   282-319   Fibritin  
  0.0103   51-74   Fibritin  
  0.0353   222-244   Fibritin  
WP_014529182.1.48083   0.0000157   328-361   Fibritin  
  0.000235   282-319   Fibritin  
  0.0103   51-74   Fibritin  
  0.0353   222-244   Fibritin  
WP_014529182.1.50755   0.0000157   328-361   Fibritin  
  0.000235   282-319   Fibritin  
  0.0103   51-74   Fibritin  
  0.0353   222-244   Fibritin  
WP_014529182.1.80755   0.0000157   328-361   Fibritin  
  0.000235   282-319   Fibritin  
  0.0103   51-74   Fibritin  
  0.0353   222-244   Fibritin  
WP_014529182.1.99158   0.0000157   328-361   Fibritin  
  0.000235   282-319   Fibritin  
  0.0103   51-74   Fibritin  
  0.0353   222-244   Fibritin  
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WP_021453772.1.12658   0.0000902   157-196   Fibritin  
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WP_021453772.1.13548   0.0000902   157-196   Fibritin  
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WP_021453772.1.32180   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_021453772.1.32616   0.0000902   157-196   Fibritin  
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WP_021453772.1.36072   0.0000902   157-196   Fibritin  
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No Yes Geobacter bemidjiensis Bem   1 1
No Yes Sinorhizobium meliloti SM11   1 1
No Yes Activated sludge plasmid pool Morges-2009 (Newbler) (meta-genome)   1 1
No Yes Dendroctonus ponderosae beetle community (MPB hybrid beetle) (Lodgepole pine) (meta-genome)   1 1
No Yes Dump bottom (Dump bottom) (meta-genome)   2 2
No Yes Fungus garden microbial communities from Atta colombica in Panama, sample from fungus garden bottom (Fungus garden bottom) (meta-genome)   2 2
No Yes Macropus eugenii forestomach microbiome from Canberra, Australia, sample Macropus_eugenii_combined (meta-genome)   1 1
No Yes NCBI 2017_08 genome   463 388
No Yes STRING v9.0.5 (STRING)   1 1
No Yes Uniprot 2018_03 genome   357 232
No Yes Global Ocean Sampling Expedition (GOS)   5 5
No Yes NCBI viral sequences (Viral)   84 57
No Yes PDB chains (SCOP 1.75) (PDB)   7 7
No Yes Protein Data Bank (all PDB sequenc)   152 143
No Yes SCOP2 SCOPe CATH ECOD (all domain sequ)   65 65
No Yes UniProt viral sequences (Viral)   47 28

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