DNA-binding protein LAG-1 (CSL) family domain assignments
in
Uniprot 2018_03 genome

Assignment details

Uniprot 2018_03 genome has 788 significant domains in 787 proteins.

     

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D8PP94	8.95e-31	0.0024	107-242	1ttu A:196-380
D8QC14	7.21e-38	0.00038	220-391	1ttu A:196-380
E2LII2	3.98e-18	0.0015	88-134	1ttu A:196-380
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E3L113	1.69e-28	0.0028	381-529	1ttu A:196-380
E3L8Y9	4.22e-33	0.00058	434-608	1ttu A:196-380
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	0.00000000348	0.0058	714-775	1ttu A:196-380
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	1.49e-21	0.00038	196-260	1ttu A:196-380
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M3S5H1	0.0522	0.037	113-187	1ttu A:196-380
M3U1Q0	0.0646	0.034	95-144	1ttu A:196-380
M3X9E3	2.73e-33	0.00026	6-99	1ttu A:196-380
M5BUE2	2.73e-30	0.0015	86-215	1ttu A:196-380
M5C0L9	2.01e-35	0.0014	247-420	1ttu A:196-380
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M7P8F4	6.21e-26	0.0019	395-568	1ttu A:196-380
M7W1U0	0.0646	0.034	95-144	1ttu A:196-380
M7WBZ1	0.0522	0.037	113-187	1ttu A:196-380
M7XKS1	4.72e-20	0.0033	789-987	1ttu A:196-380
M9MCB8	7.95e-48	0.00036	833-1019	1ttu A:196-380
M9MD45	1.04e-36	0.0059	338-472,520-543	1ttu A:196-380
N9TEP1	0.0646	0.034	95-144	1ttu A:196-380
N9UKI7	0.0522	0.037	113-187	1ttu A:196-380
O74412	4.22e-50	0.0011	452-630	1ttu A:196-380
O74954	2.48e-36	0.0024	171-303	1ttu A:196-380
Q14663	2.98e-26	0.00038	1-99	1ttu A:196-380
Q24859	0.0422	0.037	113-187	1ttu A:196-380
Q560Q8	7.21e-42	0.019	97-269,371-394	1ttu A:196-380
Q5DVJ0	0.0000000000472	0.003	1-36	1ttu A:196-380
Q5KIH1	6.71e-45	0.0025	320-513	1ttu A:196-380
Q5KPQ7	7.45e-42	0.019	97-269,371-394	1ttu A:196-380
R0LD88	5.47e-43	0.00038	13-159	1ttu A:196-380
R2PTM2	0.0422	0.039	5-67	1ttu A:196-380
R4XE64	0.00000000000000944	0.011	186-320	1ttu A:196-380
R9AN04	6.96e-18	0.0012	169-365	1ttu A:196-380
R9P1H0	5.22e-50	0.00031	818-1007	1ttu A:196-380
R9PCF6	3.23e-35	0.0063	352-483,531-554	1ttu A:196-380
S2J2C1	5.47e-30	0.0026	148-305	1ttu A:196-380
S2J5V0	2.44e-36	0.00043	450-623	1ttu A:196-380
S2J8E0	1.12e-33	0.00063	361-536	1ttu A:196-380
S2JHQ1	3.23e-28	0.0041	84-212	1ttu A:196-380
S2K0N6	4.97e-37	0.00049	321-496	1ttu A:196-380
S2K9N0	1.27e-36	0.00041	319-479	1ttu A:196-380
S7QD93	1.09e-37	0.00074	293-465	1ttu A:196-380
S7S428	3.73e-31	0.0021	51-185	1ttu A:196-380
S8EFX7	7.95e-32	0.0022	157-290	1ttu A:196-380
S8FV28	2.73e-38	0.00085	213-384	1ttu A:196-380
S9PWF6	1.34e-27	0.0028	151-285	1ttu A:196-380
S9R0V3	1.59e-27	0.0019	434-602	1ttu A:196-380
S9VVB3	1.69e-26	0.0029	156-286	1ttu A:196-380
S9WS76	7.45e-36	0.00019	1-103	1ttu A:196-380
T1KI08	2.73e-23	0.0006	12-71	1ttu A:196-380
U5H606	4.22e-26	0.008	409-517,544-568	1ttu A:196-380
U6F177	0.0721	0.012	31-65	1ttu A:196-380
U9TJB4	4.22e-25	0.0023	1-130	1ttu A:196-380
U9TVK8	0.00000226	0.0077	567-605	1ttu A:196-380
U9UEH1	0.00671	0.0049	131-196	1ttu A:196-380
U9UP20	1.22e-30	0.0027	294-423	1ttu A:196-380
V2XVG4	7.95e-38	0.00059	194-365	1ttu A:196-380
V2XYN6	4.97e-31	0.0024	107-243	1ttu A:196-380
V3YZK3	0.00226	0.0086	52-80	1ttu A:196-380
V5EL25	2.19e-35	0.0069	296-419,464-487	1ttu A:196-380
V5EX98	5.96e-49	0.00035	42-231	1ttu A:196-380
W2TQX0	0.0000000000206	0.00061	59-98	1ttu A:196-380
W3VIR9	1.04e-36	0.0059	338-472,520-543	1ttu A:196-380
W4K509	1.76e-37	0.0005	224-395	1ttu A:196-380
W4KNV3	0.000000000234	0.022	21-98	1ttu A:196-380
W5JU81	2.19e-30	0.00017	7-98	1ttu A:196-380
W6UMA8	4.97e-23	0.00051	6-79	1ttu A:196-380
X8JN25	1.22e-35	0.0015	267-440	1ttu A:196-380
X8JNP9	3.98e-30	0.0015	91-220	1ttu A:196-380

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Add assignments from individual genomes

Genome		Domains	Proteins
ALL		2787	2787
Homo sapiens 76_38	Human	16	16
Pan troglodytes 76_2.1.4	Chimpanzee	2	2
Gorilla gorilla 76_3.1	Western gorilla	2	2
Pongo abelii 76_2	Sumatran orangutan	2	2
Nomascus leucogenys 76_1.0	Northern white-cheeked gibbon	1	1
Papio anubis 76	Olive baboon	1	1
Macaca mulatta 76_1	Rhesus monkey	4	4
Callithrix jacchus 76_3.2.1	White-tufted-ear marmoset	6	6
Otolemur garnettii 76_3	Small-eared galago	2	2
Microcebus murinus 76_1	Gray mouse lemur	2	2
Rattus norvegicus 76_5.0	Norway rat	3	3
Mus musculus 76_38	House mouse	4	4
Dipodomys ordii 76_1	Ord's kangaroo rat	1	1
Ictidomys tridecemlineatus 76_2	Thirteen-lined ground squirrel	2	2
Heterocephalus glaber v1.7-2	Naked mole-rat	2	2
Cavia porcellus 76_3	Domestic guinea pig	2	2
Oryctolagus cuniculus 76_2	Rabbit	2	2
Tupaia belangeri 76	Northern tree shrew	1	1
Sus scrofa 76_10.2	Pig	1	1
Bos taurus 76_3.1	Cattle	2	2
Ovis aries 76_3.1	Sheep	2	2
Tursiops truncatus 76_1	Bottlenose dolphin	2	2
Mustela putorius furo 76_1.0	Domestic ferret	2	2
Ailuropoda melanoleuca 76_1	Giant panda	2	2
Canis familiaris 76_3.1	Dog	2	2
Felis catus 76_6.2	Domestic cat	1	1
Equus caballus 76_2	Horse	2	2
Myotis lucifugus 76_2.0	Little brown bat	2	2
Pteropus vampyrus 76_1	Large flying fox	2	2
Sorex araneus 76_1	European shrew	1	1
Erinaceus europaeus 76	Western European hedgehog	2	2
Loxodonta africana 76_3	African savanna elephant	3	3
Echinops telfairi 76	Small Madagascar hedgehog	1	1
Dasypus novemcinctus 76_2	Nine-banded armadillo	3	3
Choloepus hoffmanni 76_1	Hoffmann's two-fingered sloth	2	2
Sarcophilus harrisii 76_7.0	Tasmanian devil	2	2
Monodelphis domestica 76_5	Gray short-tailed opossum	2	2
Ornithorhynchus anatinus 76_5	Platypus	1	1
Saccoglossus kowalevskii v3.0		4	4
Meleagris gallopavo 76_2	Turkey	2	2
Gallus gallus 76_4	Chicken	2	2
Anas platyrhynchos 76_1.0	Mallard	2	2
Taeniopygia guttata 76_3.2.4	Zebra finch	2	2
Ficedula albicollis 76_1.0	Collared flycatcher	2	2
Pelodiscus sinensis 76_1.0	Chinese soft-shelled turtle	3	3
Anolis carolinensis 76_2.0	Green anole	2	2
Xenopus laevis	African clawed frog	5	5
Xenopus tropicalis 76_4.2	Tropical clawed frog	1	1
Latimeria chalumnae 76_1	Coelacanth	3	3
Lepisosteus oculatus 76	Spotted gar	3	3
Gadus morhua 76_1	Atlantic cod	2	2
Tetraodon nigroviridis 76_8	Spotted green pufferfish	1	1
Takifugu rubripes 76_4	Torafugu	1	1
Gasterosteus aculeatus 76_1	Three-spined stickleback	1	1
Oryzias latipes 76_1	Japanese medaka	4	4
Xiphophorus maculatus 76_4.4.2	Southern platyfish	3	3
Poecilia formosa 76	Amazon molly	3	3
Oreochromis niloticus 76_1.0	Nile tilapia	5	5
Astyanax mexicanus 76	Mexican tetra	4	4
Danio rerio 76_9	Zebrafish	4	4
Ciona savignyi 76_2.0	Pacific transparent sea squirt	6	6
Ciona intestinalis 76	Vase tunicate	2	2
Adineta vaga		4	4
Octopus bimaculoides 280		7	7
Crassostrea gigas 22	Pacific oyster	1	1
Lottia gigantea	Owl limpet	1	1
Helobdella robusta		2	2
Capitella sp. I		1	1
Danaus plexippus OGS1.0	Monarch butterfly	1	1
Heliconius melpomene	Postman butterfly	1	1
Bombyx mori	Domestic silkworm	1	1
Nasonia vitripennis	Jewel wasp	2	2
Apis mellifera 38.2d (Not maintained)	Honey bee	1	1
Harpegnathos saltator v3.3	Jerdon's jumping ant	1	1
Linepithema humile v1.1	Argentine ant	1	1
Pogonomyrmex barbatus v1.2	Red harvester ant	1	1
Solenopsis invicta v.2.2.3	Red fire ant	1	1
Acromyrmex echinatior v3.8	Panamanian leafcutter ant	1	1
Atta cephalotes v1.1		1	1
Camponotus floridanus v3.3	Florida carpenter ant	1	1
Lucilia cuprina	Australian sheep blowfly	1	1
Drosophila grimshawi 1.3		1	1
Drosophila willistoni 1.3		1	1
Drosophila pseudoobscura 2.13		2	2
Drosophila persimilis 1.3		1	1
Drosophila suzukii		1	1
Drosophila yakuba 1.3		1	1
Drosophila simulans 1.3		1	1
Drosophila sechellia 1.3		1	1
Drosophila melanogaster 76_5	Fruit fly	1	1
Drosophila erecta 1.3		1	1
Drosophila ananassae 1.3		1	1
Drosophila virilis 1.2		1	1
Drosophila mojavensis 1.3		1	1
Megaselia scalaris 22		1	1
Aedes aegypti 55 (Not maintained)	Yellow fever mosquito	1	1
Culex pipiens quinquefasciatus	Southern house mosquito	1	1
Anopheles gambiae 49_3j	African malaria mosquito	1	1
Tribolium castaneum 3.0	Red flour beetle	1	1
Pediculus humanus corporis (Early assembly)	Human body louse	1	1
Acyrthosiphon pisum	Pea aphid	2	2
Rhodnius prolixus 22		1	1
Daphnia pulex	Common water flea	1	1
Strigamia maritima 22		1	1
Sarcoptes scabiei		1	1
Tetranychus urticae	Two-spotted spider mite	3	3
Ixodes scapularis (Preliminary)	Black-legged tick	1	1
Pristionchus pacificus		1	1
Meloidogyne incognita	Southern root-knot nematode	1	1
Meloidogyne hapla		1	1
Onchocerca volvulus 22		1	1
Brugia malayi WS250	Agent of lymphatic filariasis	3	3
Caenorhabditis japonica		1	1
Caenorhabditis brenneri		7	7
Caenorhabditis remanei		2	2
Caenorhabditis elegans 76_235	Roundworm	2	2
Caenorhabditis briggsae 2		1	1
Trichinella spiralis 22		1	1
Hymenolepis microstoma		1	1
Echinococcus multilocularis		1	1
Echinococcus granulosus		1	1
Taenia solium	Pork tapeworm	1	1
Schistosoma mansoni		1	1
Mnemiopsis leidyi	Sea walnut	1	1
Nematostella vectensis 1.0	Starlet sea anemone	1	1
Hydra vulgaris		1	1
Amphimedon queenslandica		1	1
Trichoplax adhaerens		1	1
Xenopus (Silurana) tropicalis v7.1 (annotation v7.2)	Tropical clawed frog	1	1
Drosophila melanogaster FlyBase 5.12 (FlyBase)	Fruit fly	1	1
Anopheles gambiae VectorBase AgamP3.6 (VectorBase)	African malaria mosquito	1	1
Ascaris suum Victoria/Ghent	Pig roundworm	1	1
Caenorhabditis elegans WormBase WS218 (WormBase)	Roundworm	2	2
Homo sapiens 75_37 (old version GRC)	Human	16	16
Homo sapiens (NCBI version)	Human	5	5
Mus musculus 63_37 (longest transcript per gene) (Duplicate)	House mouse	3	3
Loa loa v3.3 (Request)	Eye worm	1	1
Wuchereria bancrofti v1.0 (Request)	Agent of lymphatic filariasis	1	1
Brugia malayi v1.0 (Duplicate)	Agent of lymphatic filariasis	1	1
Homo sapiens 69_37	Human	2	2
Pan troglodytes 69_2.1.4	Chimpanzee	2	2
Gorilla gorilla 69_3.1	Western gorilla	1	1
Pongo abelii 69_2	Sumatran orangutan	2	2
Nomascus leucogenys 69_1.0	Northern white-cheeked gibbon	1	1
Macaca mulatta 69_1	Rhesus monkey	2	2
Callithrix jacchus 69_3.2.1	White-tufted-ear marmoset	2	2
Otolemur garnettii 69_3	Small-eared galago	2	2
Microcebus murinus 69_1	Gray mouse lemur	2	2
Rattus norvegicus 69_3.4	Norway rat	2	2
Mus musculus 69_38	House mouse	3	3
Dipodomys ordii 69_1	Ord's kangaroo rat	1	1
Ictidomys tridecemlineatus 69_2	Thirteen-lined ground squirrel	2	2
Cavia porcellus 69_3	Domestic guinea pig	2	2
Oryctolagus cuniculus 69_2	Rabbit	2	2
Tupaia belangeri 69	Northern tree shrew	1	1
Sus scrofa 69_10.2	Pig	1	1
Bos taurus 69_3.1	Cattle	2	2
Tursiops truncatus 69_1	Bottlenose dolphin	2	2
Mustela putorius furo 69_1.0	Domestic ferret	2	2
Ailuropoda melanoleuca 69_1	Giant panda	2	2
Canis familiaris 69_3.1	Dog	2	2
Equus caballus 69_2	Horse	2	2
Myotis lucifugus 69_2.0	Little brown bat	2	2
Pteropus vampyrus 69_1	Large flying fox	2	2
Sorex araneus 69_1	European shrew	1	1
Erinaceus europaeus 69	Western European hedgehog	2	2
Loxodonta africana 69_3	African savanna elephant	2	2
Echinops telfairi 69	Small Madagascar hedgehog	1	1
Choloepus hoffmanni 69_1	Hoffmann's two-fingered sloth	2	2
Sarcophilus harrisii 69_7.0	Tasmanian devil	2	2
Monodelphis domestica 69_5	Gray short-tailed opossum	2	2
Ornithorhynchus anatinus 69_5	Platypus	1	1
Meleagris gallopavo 69_2	Turkey	2	2
Gallus gallus 69_2	Chicken	1	1
Taeniopygia guttata 69_3.2.4	Zebra finch	2	2
Pelodiscus sinensis 69_1.0	Chinese soft-shelled turtle	2	2
Anolis carolinensis 69_2.0	Green anole	2	2
Xenopus tropicalis 69_4.2	Tropical clawed frog	1	1
Latimeria chalumnae 69_1	Coelacanth	2	2
Gadus morhua 69_1	Atlantic cod	2	2
Tetraodon nigroviridis 69_8	Spotted green pufferfish	1	1
Takifugu rubripes 69_4	Torafugu	1	1
Gasterosteus aculeatus 69_1	Three-spined stickleback	1	1
Oryzias latipes 69_1	Japanese medaka	2	2
Xiphophorus maculatus 69_4.4.2	Southern platyfish	3	3
Oreochromis niloticus 69_1.0	Nile tilapia	3	3
Danio rerio 69_9	Zebrafish	3	3
Ciona savignyi 69_2.0	Pacific transparent sea squirt	2	2
Ciona intestinalis 69	Vase tunicate	2	2
Drosophila melanogaster 69_5	Fruit fly	1	1
Caenorhabditis elegans 69_215	Roundworm	1	1
NCBI 2017_08 genome		1297	1297
STRING v9.0.5 (STRING)		83	83
Uniprot 2018_03 genome		788	787
PDB chains (SCOP 1.75) (PDB)		2	2
Protein Data Bank (all PDB sequenc)		15	15
SCOP2 SCOPe CATH ECOD (all domain sequ)		31	31
TargetDB (Targets)		1	1