Family 28 carbohydrate binding module, CBM28 family domain assignments
in
Uniprot 2018_03 genome

Assignment details

Uniprot 2018_03 genome has 52 significant domains in 52 proteins.

     

Sequence ID	Superfamily evalue	Family evalue	Region	Closest structure
A0A078KMD3	8.5e-64	0.00000819	565-749	1uww A:
A0A0C7P2G3	2.76e-66	0.00000352	561-746	1uww A:
A0A101HRN3	4.39e-67	0.00000105	551-732	1uww A:
A0A173MZR0	1.31e-53	0.0000149	567-753	1uww A:
A0A190U0T4	2.21e-63	0.00000489	617-803	1uww A:
A0A1H0L774	3.4e-56	0.00000324	561-746	1uww A:
A0A1M7QQ08	3.83e-66	0.000000716	564-746	1uww A:
A0A1S8L6F2	4.04e-54	0.0000129	570-755	1uww A:
A0A1S8LR11	1.28e-54	0.0000121	570-755	1uww A:
A0A1V4SNY5	7.82e-67	0.00000359	571-756	1uww A:
A0A1V5WNB2	5.31e-47	0.0000464	375-559	1uww A:
A0A1W1VGZ4	1.76e-57	0.0000176	595-780	1uww A:
A0A231RAL6	1.47e-61	0.00000455	619-805	1uww A:
A0A2K1NBF1	8.29e-66	0.00000129	551-732	1uww A:
A0A2K1P0C2	3.61e-68	0.00000253	566-751	1uww A:
A0A2K1P726	7.31e-68	0.000000947	551-732	1uww A:
A0A2K1PEV2	4.04e-31	0.0000742	3-101	1uww A:
A0A2K1PF85	9.57e-67	0.00000122	551-732	1uww A:
A4XHB2	2.98e-71	0.0000075	387-573	1uww A:
B8I5Z4	3.19e-69	0.00000409	567-753	1uww A:
B9MPF9	2.13e-67	0.00000945	388-572	1uww A:
D9ST59	1.31e-53	0.0000149	567-753	1uww A:
E4QEF5	1.49e-64	0.00000975	388-572	1uww A:
E4S4X9	1.11e-64	0.0000093	388-572	1uww A:
E4SGK4	2.55e-66	0.0000096	388-572	1uww A:
E6U1W5	1.11e-67	0.000000625	614-794	1uww A:
E6U1W6	1.3e-71	0.000000362	594-778	1uww A:
F1TFY6	2.98e-63	0.00000724	567-753	1uww A:
G2PXK0	1.11e-64	0.0000093	388-572	1uww A:
H2JGE7	1.98e-68	0.00000483	567-753	1uww A:
I1V1X7	2.98e-73	0.0000000525	579-760	1uww A:
I3VXL2	2.21e-67	0.00000329	568-753	1uww A:
I6MMS3	4.04e-66	0.00000945	388-572	1uww A:
I7CBM8	6.38e-71	0.0000075	387-573	1uww A:
L0A1E9	1.7e-61	0.00000325	235-421	1uww A:
P06564	7.44e-74	0.0000000268	578-760	1uww A:
P19424	2.13e-72	0.000000438	759-941	1uww A:
P19570	8.71e-68	0.000000625	615-795	1uww A:
Q45554	7.44e-72	0.0000000671	580-761	1uww A:
Q59154	2.13e-67	0.00000945	388-572	1uww A:
Q59241	2.08e-74	0.0000000253	577-759	1uww A:
Q59290	7.23e-67	0.00000759	567-753	1uww A:
Q5D5C5	8.29e-71	0.00000184	356-540	1uww A:
Q68NH6	4.25e-74	0.000000037	578-759	1uww A:
Q68PJ1	1.4e-71	0.0000054	540-724	1uww A:
Q8RLT7	3.19e-69	0.00000409	567-753	1uww A:
Q9F216	1.04e-74	0.0000000265	580-762	1uww A:
S0FFR1	5.95e-62	0.00000586	567-752	1uww A:
U4R0N4	5.1e-68	0.00000568	567-753	1uww A:
W4Q6Q7	2.13e-72	0.000000438	759-941	1uww A:
W4R0M6	2.1e-74	0.0000000253	578-760	1uww A:
W9E8G4	2.21e-67	0.00000329	568-753	1uww A:
Weak hits:
A0A010Q1A6	0.0283	0.051	671-840	1uww A:
A0A010QEC7	0.0179	0.076	25-174	1uww A:
A0A059ALJ3	9.35e-19	0.05	500-615	1uww A:
A0A059BKN3	0.0000000000000187	0.056	493-569	1uww A:
A0A059BL97	0.00000000000000145	0.083	464-543	1uww A:
A0A060BU32	0.0000000000000319	0.006	3-69	1uww A:
A0A066YNG5	0.00000215	0.087	423-569	1uww A:
A0A089RZ94	0.00000000323	0.08	1209-1363	1uww A:
A0A090RRK1	0.0000000298	0.08	574-681	1uww A:
A0A095C5V8	0.000000000323	0.08	460-648	1uww A:
A0A098DHM9	0.000113	0.045	1029-1181	1uww A:
A0A0C3FAH2	0.0272	0.048	78-171	1uww A:
A0A0C4DYL1	0.000213	0.057	467-593	1uww A:
A0A0D0SXI2	0.000017	0.067	460-531	1uww A:
A0A0D0VDY6	0.0000000000383	0.08	389-602	1uww A:
A0A0D0YJ34	0.0000000000187	0.086	389-602	1uww A:
A0A0D0YLV1	0.0000000000374	0.08	389-602	1uww A:
A0A0D2NMT5	0.0000255	0.059	441-479	1uww A:
A0A0D2Q611	0.00000000000000383	0.076	441-514	1uww A:
A0A0D6R077	0.0000408	0.071	434-472	1uww A:
A0A0E0JDR4	3.95e-16	0.087	10-173	1uww A:
A0A0E0MJA4	0.0000000000000289	0.063	431-536	1uww A:
A0A0J8GHZ8	0.0000108	0.094	41-163	1uww A:
A0A0M0K5G8	1.02e-17	0.064	1-158	1uww A:
A0A0M8XTV4	0.0000000202	0.092	43-174	1uww A:
A0A0Q7S5E1	0.0000567	0.058	452-583	1uww A:
A0A0S8J072	0.0000000638	0.084	847-974	1uww A:
A0A0U4GJP5	0.0000578	0.096	709-848	1uww A:
A0A0U5G071	0.0000122	0.077	40-192	1uww A:
A0A0U5GP12	0.000000194	0.079	742-879	1uww A:
A0A0U5GPC1	9.64e-16	0.086	447-664	1uww A:
A0A0W7VLG1	0.0000833	0.093	22-127	1uww A:
A0A139TGQ6	0.000000816	0.074	47-197	1uww A:
A0A143XUA8	1.06e-20	0.072	43-207	1uww A:
A0A151RHX4	0.0000000145	0.063	275-346	1uww A:
A0A154M6B1	0.00000000196	0.069	33-162	1uww A:
A0A176J5D3	0.0000935	0.094	578-731	1uww A:
A0A193C5U0	0.000000000425	0.052	33-162	1uww A:
A0A194XBH0	0.00000595	0.066	237-364	1uww A:
A0A1B9BI74	0.00000096	0.051	651-786	1uww A:
A0A1C1A7V6	0.0000000000000306	0.046	721-918	1uww A:
	0.000000000000251	0.026	1140-1336	1uww A:
	0.0000000000238	0.052	922-1116	1uww A:
A0A1C1XD06	0.0000000791	0.059	27-193	1uww A:
A0A1C7IAS4	0.00000000000194	0.038	115-261	1uww A:
A0A1D6D2T3	0.0000000000000068	0.076	462-538	1uww A:
A0A1D6PTI9	7.74e-23	0.068	322-451	1uww A:
A0A1E3C388	0.00000578	0.066	135-288	1uww A:
A0A1E5UWF2	0.000000000111	0.083	478-553	1uww A:
A0A1F6M9K1	0.000095	0.076	990-1111	1uww A:
A0A1F6NAC3	0.000095	0.076	990-1111	1uww A:
A0A1G1JWQ4	0.0000000000383	0.042	63-197	1uww A:
A0A1G1K463	0.0000000000383	0.042	63-197	1uww A:
A0A1G1KX98	0.0000000000907	0.059	72-196	1uww A:
A0A1G1KXP3	0.000000000204	0.083	38-199	1uww A:
A0A1G2Y650	0.0000264	0.062	191-370	1uww A:
A0A1G4SZ44	8.29e-19	0.042	31-196	1uww A:
A0A1G4VH11	0.00000283	0.075	1205-1326	1uww A:
A0A1G8Y3C8	0.0000612	0.059	725-872	1uww A:
A0A1H2EU84	0.00000000000298	0.096	343-460	1uww A:
A0A1H2IHC5	0.000000000468	0.074	33-162	1uww A:
A0A1H2XV62	2e-18	0.048	31-196	1uww A:
A0A1H7UN41	0.00000663	0.054	39-171	1uww A:
A0A1H9ZBZ2	4.42e-18	0.061	400-562	1uww A:
A0A1I3NGK4	0.00000312	0.052	669-827	1uww A:
A0A1I6EJU8	0.000000139	0.069	32-169	1uww A:
A0A1I6JYX9	0.00000000000000374	0.026	417-559	1uww A:
A0A1J4WE19	0.000000306	0.031	755-893	1uww A:
A0A1J5A2T1	0.0000215	0.09	17-167	1uww A:
A0A1J5B6F9	0.0000111	0.083	28-170	1uww A:
A0A1J5EKH3	0.000000332	0.073	45-164	1uww A:
A0A1J6L9R0	4.59e-18	0.084	473-593	1uww A:
A0A1M6TBE4	1.68e-18	0.066	203-372	1uww A:
A0A1M7LAK8	0.0000000000000142	0.023	207-372	1uww A:
A0A1N6D5H7	0.0000264	0.083	508-619	1uww A:
A0A1P8AQ50	0.00000000000000417	0.067	463-541	1uww A:
A0A1P8B357	0.000000000000204	0.076	480-557	1uww A:
A0A1Q4YFX4	0.00000000652	0.092	33-162	1uww A:
A0A1R0WN78	0.0000935	0.08	438-598	1uww A:
A0A1R1GAY6	1.59e-27	0.082	1058-1201	1uww A:
A0A1R3GHL1	0.00000442	0.056	442-483	1uww A:
A0A1S2IMI7	0.0000162	0.038	269-412	1uww A:
A0A1S4BB76	0.00000000000136	0.067	440-515	1uww A:
A0A1S8PEZ7	0.000000643	0.054	651-786	1uww A:
A0A1S8R973	0.000000964	0.054	651-786	1uww A:
A0A1S9NB96	0.000000643	0.054	651-786	1uww A:
A0A1T4Z4K8	0.000000142	0.078	32-173	1uww A:
A0A1U6Y2N5	0.0000867	0.069	1434-1573	1uww A:
A0A1U7Y9J9	0.0000000000000128	0.063	442-518	1uww A:
A0A1U7YAV1	0.0000000000000111	0.063	442-518	1uww A:
A0A1U8LDA8	0.00000000000153	0.063	485-565	1uww A:
A0A1U8LHD3	0.00000000000145	0.063	484-564	1uww A:
A0A1V4IKK4	0.00000737	0.067	642-778	1uww A:
A0A1V6FHS7	0.00000187	0.086	29-155	1uww A:
A0A1W2GAZ4	0.0000000000000368	0.098	530-665	1uww A:
A0A1W2LWI7	0.000000000468	0.074	33-162	1uww A:
A0A1W9QGE5	0.0000000000298	0.094	69-196	1uww A:
A0A1Y0CTH5	0.0000196	0.079	599-745	1uww A:
A0A231R4C5	0.0000000000000259	0.038	243-442	1uww A:
A0A231RGT5	0.00000000000207	0.078	39-165	1uww A:
A0A239HFU3	0.0000000181	0.087	32-160	1uww A:
A0A249D1W8	0.0000326	0.086	1433-1573	1uww A:
A0A257HW92	0.000000706	0.094	45-172	1uww A:
A0A257X185	0.0000538	0.029	29-87	1uww A:
A0A287NLV6	0.000000000119	0.053	444-521	1uww A:
A0A287NLX6	0.0000000000825	0.053	383-460	1uww A:
A0A287TAA3	0.0000000000697	0.063	388-463	1uww A:
A0A287TAC0	0.0000000000612	0.063	352-427	1uww A:
A0A287TAD4	0.0000000000587	0.063	331-406	1uww A:
A0A287THX8	0.00000000085	0.083	448-522	1uww A:
A0A287THY3	0.0000000000459	0.083	471-548	1uww A:
A0A287WM53	0.000000000000119	0.076	160-237	1uww A:
A0A287WM62	0.0000604	0.053	174-211	1uww A:
A0A2A2R573	0.0000116	0.076	713-856	1uww A:
A0A2A7MEA4	0.00000306	0.071	651-788	1uww A:
A0A2C9UQC6	0.000000000247	0.071	418-494	1uww A:
A0A2E4GKT9	0.000000397	0.054	215-319	1uww A:
A0A2E7RVB8	0.000000179	0.092	672-808	1uww A:
A0A2E9TH49	0.000000000156	0.094	463-597	1uww A:
A0A2G2VCJ7	0.00000000000162	0.084	19-117	1uww A:
A0A2G2VDE9	0.000000298	0.063	279-349	1uww A:
A0A2G2VWP3	1.36e-24	0.08	63-182	1uww A:
A0A2G2Y588	0.000000000162	0.043	347-426	1uww A:
A0A2G5DCJ7	0.0000000000145	0.043	282-356	1uww A:
A0A2H0LPD4	0.000000000164	0.059	17-152	1uww A:
A0A2H3H884	0.000051	0.047	635-787	1uww A:
A0A2H3ZKA0	0.00000000000434	0.092	458-538	1uww A:
A0A2H9ZX19	0.00000000000000111	0.048	416-492	1uww A:
A0A2I0WPU3	1.02e-24	0.046	416-530	1uww A:
A0A2I1TBH7	0.0000000000000714	0.06	400-555	1uww A:
A0A2I4HAG7	0.00000000000000544	0.056	443-517	1uww A:
A0A2J8B209	0.0000057	0.043	221-362	1uww A:
A0A2K0SZ70	0.0000655	0.093	22-127	1uww A:
A0A2K1PF35	0.00000000000361	0.0024	551-589	1uww A:
A0A2K1XNE9	0.000000000162	0.063	421-498	1uww A:
A0A2K2A854	0.0000561	0.063	368-414	1uww A:
A0A2K2A859	0.0000000000247	0.071	368-445	1uww A:
A0A2K2AH38	0.0000000000000119	0.071	437-512	1uww A:
A0A2K2AH43	0.00000000000000417	0.071	437-513	1uww A:
A0A2K2CZ61	0.0000000000527	0.083	454-533	1uww A:
A0KHZ7	0.0000578	0.069	1434-1573	1uww A:
A1SSE8	0.0000000000000123	0.069	557-697	1uww A:
A3DD30	0.000655	0.07	1452-1598	1uww A:
A5IL08	0.000609	0.021	141-166	1uww A:
A7UG69	0.000425	0.072	626-797	1uww A:
A8T1U1	0.0000000000085	0.095	42-217	1uww A:
A9YWS8	0.000451	0.063	473-501	1uww A:
B2AQ94	0.00247	0.061	20-121	1uww A:
B4CVS9	0.000000567	0.097	43-158	1uww A:
B4CWF9	0.000000132	0.067	73-214	1uww A:
B7G892	0.00302	0.068	776-857	1uww A:
B7K4V6	0.000397	0.094	25-114	1uww A:
B8C4W0	0.000111	0.067	1657-1812	1uww A:
C5XQT1	0.0000000000000179	0.086	28-54,85-204	1uww A:
C6D229	6.52e-16	0.025	921-1118	1uww A:
C6W5X9	0.000023	0.082	343-480	1uww A:
	0.00207	0.041	186-321	1uww A:
C7PTQ7	0.0204	0.034	90-144	1uww A:
D1Z1N4	0.000000000184	0.079	629-781	1uww A:
	0.000000000184	0.079	826-978	1uww A:
D2C751	0.000609	0.021	141-166	1uww A:
D3R0F2	0.00000187	0.045	221-362	1uww A:
E6PHR1	0.00553	0.091	247-352	1uww A:
E6R7N7	0.0000000000315	0.086	389-602	1uww A:
E7G963	0.00000255	0.051	45-196	1uww A:
F4H2C6	0.0132	0.044	517-635	1uww A:
F5LDQ1	0.00162	0.079	574-731	1uww A:
G5SWR9	0.0202	0.071	286-428	1uww A:
G7M768	0.000000213	0.069	647-782	1uww A:
G8S853	0.0000234	0.097	48-190	1uww A:
G9NS05	0.000451	0.093	22-119	1uww A:
H1XXX6	0.00162	0.095	20-119	1uww A:
H2BNN7	1.15e-21	0.00075	561-618	1uww A:
I1I3R2	0.00000000085	0.083	439-513	1uww A:
I4EDW0	0.000085	0.096	374-535	1uww A:
I6AY61	0.00000000786	0.036	187-328	1uww A:
J2W5T9	0.0000538	0.072	822-944	1uww A:
J3KW61	1.79e-19	0.076	10-175	1uww A:
K2Q7I2	0.000238	0.039	42-185	1uww A:
K3VHI4	0.000234	0.062	910-1063	1uww A:
K4B2R7	0.00000000000765	0.074	49-190	1uww A:
K9XSW6	0.034	0.056	912-1027	1uww A:
	0.034	0.066	1109-1223	1uww A:
M1AJI3	0.000238	0.056	304-329	1uww A:
M1B5Z3	0.00000000000281	0.063	485-561	1uww A:
M9TUP3	0.000833	0.058	38-148	1uww A:
O04511	0.000162	0.048	409-447	1uww A:
P71140	0.000578	0.07	1452-1598	1uww A:
P87211	0.000149	0.071	626-795	1uww A:
Q08X64	0.00204	0.066	427-569	1uww A:
Q094B1	0.00723	0.066	321-463	1uww A:
Q21HB6	0.00124	0.074	355-435	1uww A:
Q21NC7	0.000842	0.085	17-86	1uww A:
Q21PK3	0.000000000133	0.072	894-1021	1uww A:
Q2SPD5	0.000293	0.037	167-318	1uww A:
Q479K7	0.00000000255	0.086	25-165	1uww A:
Q69VM1	0.00000791	0.048	181-218	1uww A:
Q9WXR7	0.000255	0.024	141-166	1uww A:
R4NML7	0.000255	0.024	141-166	1uww A:
R5NW69	0.0272	0.071	280-422	1uww A:
R5P6L0	0.00638	0.075	276-387	1uww A:
R7DLH0	0.00604	0.075	20-65	1uww A:
R7R2P5	9.14e-21	0.068	292-450	1uww A:
R7UC43	0.00000023	0.073	28-121	1uww A:
S9P186	0.00234	0.089	363-505	1uww A:
S9Q4H4	0.00113	0.066	432-571	1uww A:
U4KQT8	0.0706	0.029	439-513	1uww A:
U5D7K5	0.00935	0.041	337-382	1uww A:
U5FRM5	0.0000655	0.063	421-467	1uww A:
U5GD53	0.00000000000000476	0.071	489-565	1uww A:
V4NSW5	0.00816	0.083	19-133	1uww A:
W4BXH7	1.93e-27	0.082	1451-1594	1uww A:
W5YH05	0.000434	0.095	86-217	1uww A:
W9R3R7	0.00162	0.063	290-317	1uww A:
W9SN52	7.99e-24	0.094	400-516	1uww A:
X0RR59	0.000442	0.064	2-136	1uww A:
X0UEY7	0.000000387	0.08	108-246	1uww A:
X1M215	0.0519	0.026	27-108	1uww A:

---

Add assignments from individual genomes

Genome		Domains	Proteins
ALL		151	151
Clostridium cellulolyticum H10		1	1
Clostridium sp. BNL1100		1	1
Clostridium cellulovorans 743B		1	1
Caldicellulosiruptor kronotskyensis 2002		1	1
Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108		1	1
Caldicellulosiruptor lactoaceticus 6A		1	1
Caldicellulosiruptor kristjanssonii 177R1B		1	1
Caldicellulosiruptor saccharolyticus DSM 8903		1	1
Caldicellulosiruptor bescii DSM 6725		1	1
Bacillus cellulosilyticus DSM 2522		2	2
Deinococcus peraridilitoris DSM 19664		1	1
Thermoanaerobacterium saccharolyticum JW/SL-YS485		1	1
NCBI 2017_08 genome		53	53
STRING v9.0.5 (STRING)		3	3
Uniprot 2018_03 genome		52	52
NCBI viral sequences (Viral)		1	1
PDB chains (SCOP 1.75) (PDB)		1	1
Protein Data Bank (all PDB sequenc)		2	2
SCOP2 SCOPe CATH ECOD (all domain sequ)		17	17