SUPERFAMILY 1.75 HMM library and genome assignments server

SUPERFAMILY 2 can be accessed from supfam.org. Please contact us if you experience any problems.


PAE0736-like family domain assignments
in
Uniprot 2018_03 genome

Assignment details

(show help)


Uniprot 2018_03 genome has 4 significant domains in 4 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
A3MS24   4.03e-46   0.0000232   5-97   1rki A:1-98  
A4WGV4   3.66e-46   0.0000304   2-99   1rki A:1-98  
B1YC70   8.37e-49   0.0000314   1-96   1rki A:1-98  
Q8ZYK2   4.81e-49   0.00000123   1-97   1rki A:1-98  
 
Weak hits:
A0A015JTM0   0.0785   0.01   7-50   1rki A:1-98  
A0A015SWA8   0.0837   0.0047   264-309   1rki A:1-98  
A0A015UTC7   0.0439   0.011   9-25   1rki A:1-98  
A0A016EQU6   0.0837   0.0047   264-309   1rki A:1-98  
A0A076IN77   0.0785   0.0044   264-309   1rki A:1-98  
A0A0D3EWQ0   0.0131   0.0085   77-100   1rki A:1-98  
A0A0D9YHX2   0.0455   0.0085   527-550   1rki A:1-98  
A0A0E0CAS8   0.0225   0.0091   144-166   1rki A:1-98  
A0A0E0CAS9   0.00324   0.0058   117-150   1rki A:1-98  
A0A0E2AM72   0.0785   0.0044   264-309   1rki A:1-98  
A0A0E2RTJ9   0.0628   0.0044   263-309   1rki A:1-98  
A0A0F2L8W9   1.31e-19   0.00035   4-93   1rki A:1-98  
A0A0K1E4V7   0.00000000000408   0.0017   1-40   1rki A:1-98  
A0A101X4D6   1.36e-21   0.00038   4-96   1rki A:1-98  
A0A117SSX6   6.8e-22   0.00039   4-96   1rki A:1-98  
A0A130MGI7   0.0361   0.0046   50-133   1rki A:1-98  
A0A1C0X3N8   0.0628   0.0044   263-309   1rki A:1-98  
A0A1V8WWE6   0.068   0.007   10-44   1rki A:1-98  
A0A219BBN8   0.0785   0.0073   10-42   1rki A:1-98  
A0A219BIR1   0.0785   0.0073   10-42   1rki A:1-98  
A0A219BNU1   0.068   0.007   10-44   1rki A:1-98  
A0A219BTW4   0.068   0.007   10-44   1rki A:1-98  
A0A219C1J1   0.068   0.007   10-44   1rki A:1-98  
A0A2I1F2F5   0.0785   0.01   7-50   1rki A:1-98  
A0A2J2H895   1.36e-21   0.00038   4-96   1rki A:1-98  
A0A2J4G6D8   0.0000319   0.0039   4-44   1rki A:1-98  
A0A2J8NFC3   0.0356   0.0062   43-107   1rki A:1-98  
A0A2J9HYE3   0.0837   0.0047   262-307   1rki A:1-98  
A0A2J9NGG1   0.0241   0.0035   50-134   1rki A:1-98  
A1RSA4   1.94e-41   0.00015   1-88   1rki A:1-98  
A1RWU4   0.00382   0.012   9-51   1rki A:1-98  
A6LAD4   0.0837   0.0047   262-307   1rki A:1-98  
A7AF56   0.0785   0.0044   265-310   1rki A:1-98  
A7SQI1   0.0178   0.0088   19-72   1rki A:1-98  
A7TBW4   0.068   0.015   12-51   1rki A:1-98  
A8R815   0.0246   0.006   3-41   1rki A:1-98  
A9CDC1   0.0267   0.0055   123-151   1rki A:1-98  
A9CDC2   0.0267   0.0055   122-150   1rki A:1-98  
B0EHT6   0.0356   0.0057   152-199   1rki A:1-98  
B0NZC9   0.068   0.01   24-48   1rki A:1-98  
B3C6A0   0.0481   0.011   9-25   1rki A:1-98  
B5CV26   0.0481   0.011   9-25   1rki A:1-98  
B5CV28   0.0356   0.011   9-25   1rki A:1-98  
B5SRD9   0.0418   0.0055   120-148   1rki A:1-98  
B7K2S7   0.0575   0.01   33-61   1rki A:1-98  
B9EUU6   0.0424   0.0085   488-511   1rki A:1-98  
C3MM69   0.068   0.0075   198-235   1rki A:1-98  
C3Y9N7   0.0162   0.0049   93-120   1rki A:1-98  
C3ZW86   0.035   0.0047   70-97   1rki A:1-98  
C9JBL0   0.035   0.0062   43-107   1rki A:1-98  
D1K9N0   0.0785   0.0044   264-309   1rki A:1-98  
D4HZV6   0.0288   0.0073   286-316   1rki A:1-98  
D4VDX1   0.0785   0.0047   264-309   1rki A:1-98  
D5BD16   0.0575   0.0073   19-51   1rki A:1-98  
D7J5U5   0.0523   0.011   9-25   1rki A:1-98  
D7J5V8   0.0518   0.011   9-25   1rki A:1-98  
D8L141   0.0628   0.0052   298-336   1rki A:1-98  
E0VVD0   0.0575   0.0085   33-53   1rki A:1-98  
E1YVY9   0.0889   0.0047   262-307   1rki A:1-98  
E8QQV5   0.0732   0.0088   1-19   1rki A:1-98  
E9IP63   0.0518   0.007   29-82   1rki A:1-98  
F0Z719   0.00732   0.0063   9-49   1rki A:1-98  
F0ZZM3   0.0356   0.0079   9-49   1rki A:1-98  
F2L2Z0   1.46e-23   0.00028   4-96   1rki A:1-98  
F3QSL4   0.0324   0.0049   261-307   1rki A:1-98  
F8MHU2   0.0502   0.0088   67-139   1rki A:1-98  
F8X527   0.00497   0.0041   261-320   1rki A:1-98  
G4RLL7   2.72e-18   0.00051   4-91   1rki A:1-98  
G4UM18   0.0502   0.0088   67-139   1rki A:1-98  
G5CR70   0.0136   0.0085   19-62   1rki A:1-98  
G7VBC7   2.56e-27   0.00021   3-66   1rki A:1-98  
G8UX99   0.0241   0.0035   50-134   1rki A:1-98  
H0EYS5   0.0837   0.0052   103-138   1rki A:1-98  
H2E9Y0   0.0152   0.008   19-62   1rki A:1-98  
H6QDP4   1.15e-25   0.00029   1-66   1rki A:1-98  
I0EXZ4   0.0732   0.0088   1-19   1rki A:1-98  
I0IQV9   0.068   0.012   18-55   1rki A:1-98  
I6SZ65   0.068   0.007   10-44   1rki A:1-98  
I8VZG5   0.0785   0.0047   264-309   1rki A:1-98  
I9TWS0   0.0785   0.0047   264-309   1rki A:1-98  
J9G3G7   0.0366   0.0075   158-203   1rki A:1-98  
J9IPL5   0.0837   0.006   330-357   1rki A:1-98  
J9JM04   0.0293   0.0088   587-618   1rki A:1-98  
J9LWE4   0.068   0.0077   81-126   1rki A:1-98  
K5CPN7   0.0575   0.0043   263-309   1rki A:1-98  
K6A1W1   0.0942   0.0047   264-309   1rki A:1-98  
K7Z7D4   0.0136   0.008   18-62   1rki A:1-98  
L7XX37   0.0157   0.008   36-80   1rki A:1-98  
N6SZ50   0.0837   0.012   209-249   1rki A:1-98  
N8QUH8   0.0628   0.009   278-329   1rki A:1-98  
Q22W97   0.0502   0.008   526-572   1rki A:1-98  
Q30KJ8   0.068   0.0083   13-47   1rki A:1-98  
Q5ZSJ3   0.0241   0.0035   50-134   1rki A:1-98  
Q7RCH5   0.0889   0.0064   13-47   1rki A:1-98  
Q8AYX6   0.00262   0.01   8-55   1rki A:1-98  
R5CK21   0.0272   0.0045   260-309   1rki A:1-98  
R6ZP27   0.0575   0.0054   261-309   1rki A:1-98  
R6ZW59   0.0282   0.0083   47-85   1rki A:1-98  
R7F3F6   0.0434   0.0074   151-204   1rki A:1-98  
R7TU32   0.0732   0.0042   106-145   1rki A:1-98  
S1N8X4   0.0068   0.0063   13-65   1rki A:1-98  
S5ZUW9   0.000194   0.0053   5-61   1rki A:1-98  
S5ZXK5   0.00837   0.0085   7-52   1rki A:1-98  
U2P232   0.035   0.0083   68-105   1rki A:1-98  
U4KDB6   0.0889   0.0083   38-61   1rki A:1-98  
U5TX18   0.0732   0.006   78-106   1rki A:1-98  
U9THY2   0.0785   0.01   7-50   1rki A:1-98  
U9UAS1   0.0785   0.011   47-70   1rki A:1-98  
V4A0W8   0.0889   0.0097   49-87   1rki A:1-98  
W1BDI7   0.0837   0.01   15-38   1rki A:1-98  
W7Y1N9   0.0167   0.0073   24-45   1rki A:1-98  
X1XMX8   0.00173   0.0088   40-72   1rki A:1-98  

Jump to [ Top of page · Assignment details · Add assignments from individual genomes ]


Add assignments from groups of genomes

View all assignments containing a PAE0736-like domain in each group of genomes.

Jump to [ Top of page · Assignment details · Add assignments from groups of genomes ]


Add assignments from individual genomes

Select additional genomes you would like to see domain assignments for, then click 'Submit'.

Select to display   Genome       Domains   Proteins
No Yes ALL   27 27
No Yes Pyrobaculum calidifontis JCM 11548   1 1
No Yes Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514   1 1
No Yes Thermoproteus neutrophilus V24Sta   1 1
No Yes Pyrobaculum aerophilum str. IM2   1 1
No Yes 1_050719N (meta-genome)   1 1
No Yes Bath Hot Springs, filamentous community (meta-genome)   1 1
No Yes Bath Hot Springs, planktonic community (meta-genome)   1 1
No Yes Hot spring microbial community from Yellowstone Hot Springs, sample YNP18 from Washburn Springs #1 (meta-genome)   1 1
No Yes STRING v9.0.5 (STRING)   4 4
No Yes Uniprot 2018_03 genome   4 4
No Yes PDB chains (SCOP 1.75) (PDB)   1 1
No Yes Protein Data Bank (all PDB sequenc)   2 2
No Yes SCOP2 SCOPe CATH ECOD (all domain sequ)   4 4

Jump to [ Top of page · Assignment details · Add assignments from groups of genomes · Add assignments from individual genomes ]