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Lambda phage gpU-like family domain assignments
in
Uniprot 2018_03 genome

Assignment details

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Uniprot 2018_03 genome has 775 significant domains in 775 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
A0A021X5X1   2.78e-49   0.000000168   2-130   1z1z A:2-130  
A0A023KGB6   1.67e-48   0.000000192   2-130   1z1z A:2-130  
A0A023YTW2   2.78e-49   0.000000168   2-130   1z1z A:2-130  
A0A023YV25   3.4e-50   0.000000699   2-130   1z1z A:2-130  
A0A023YWR3   1.54e-48   0.000000181   2-130   1z1z A:2-130  
A0A023YXF3   1.52e-50   0.000012   2-131   1z1z A:2-130  
A0A023Z796   8.11e-51   0.0000118   3-132   1z1z A:2-130  
A0A024KV55   7.85e-48   0.0000174   3-132   1z1z A:2-130  
A0A024L3K3   2.12e-48   0.00000019   2-130   1z1z A:2-130  
A0A025BMZ6   8.11e-51   0.0000118   3-132   1z1z A:2-130  
A0A025BR53   1.52e-50   0.000012   2-131   1z1z A:2-130  
A0A025BS11   2.78e-49   0.000000168   2-130   1z1z A:2-130  
A0A025BWV8   3.4e-50   0.000000699   2-130   1z1z A:2-130  
A0A026UIE9   2.78e-49   0.000000168   2-130   1z1z A:2-130  
A0A026UIQ8   1.94e-50   0.0000126   2-131   1z1z A:2-130  
A0A026UPK8   6.02e-51   0.000000844   2-130   1z1z A:2-130  
A0A027SYU4   7.85e-47   0.000015   2-129   1z1z A:2-130  
A0A027T8E8   2.88e-49   0.00000019   2-130   1z1z A:2-130  
A0A027TEB2   4.71e-50   0.000000509   2-130   1z1z A:2-130  
A0A027TEK5   3.4e-51   0.000000768   2-130   1z1z A:2-130  
A0A027Z2E0   1.41e-41   0.00000162   1-107   1z1z A:2-130  
A0A027ZG47   1.1e-49   0.000000307   2-130   1z1z A:2-130  
A0A027ZGU4   2.56e-49   0.000000176   2-130   1z1z A:2-130  
A0A028DUR5   2.56e-49   0.000000176   2-130   1z1z A:2-130  
A0A028DW26   4.71e-50   0.000000509   2-130   1z1z A:2-130  
A0A029H8L3   3.4e-51   0.000000768   2-130   1z1z A:2-130  
A0A029H9K1   1.83e-36   0.00000548   1-96   1z1z A:2-130  
A0A029JTU3   3.4e-51   0.000000768   2-130   1z1z A:2-130  
A0A061L0K8   2.62e-51   0.0000111   3-132   1z1z A:2-130  
A0A061YFL6   5.75e-49   0.000000202   2-130   1z1z A:2-130  
A0A062YCG6   2.88e-48   0.000000192   2-130   1z1z A:2-130  
A0A064E718   2.04e-48   0.00000172   2-131   1z1z A:2-130  
A0A064SKV6   3.4e-51   0.000000768   2-130   1z1z A:2-130  
A0A064U068   1.54e-48   0.000000181   2-130   1z1z A:2-130  
A0A066R5N2   2.78e-49   0.000000168   2-130   1z1z A:2-130  
A0A066RCL2   1.52e-50   0.000012   2-131   1z1z A:2-130  
A0A066T0V8   3.4e-51   0.000000768   2-130   1z1z A:2-130  
A0A068HFS0   3.4e-48   0.0000114   2-130   1z1z A:2-130  
A0A069XQ45   1.46e-48   0.000000183   2-130   1z1z A:2-130  
A0A070F8L0   2.12e-48   0.00000019   2-130   1z1z A:2-130  
A0A070FAJ6   1.94e-50   0.0000126   2-131   1z1z A:2-130  
A0A070FIR4   3.4e-51   0.000000768   2-130   1z1z A:2-130  
A0A070SII3   6.8e-29   0.0000165   2-78   1z1z A:2-130  
A0A070UDL7   4.18e-49   0.000000174   2-130   1z1z A:2-130  
A0A070URG9   2.62e-51   0.0000111   3-132   1z1z A:2-130  
A0A073F2F2   1.2e-35   0.00000167   1-96   1z1z A:2-130  
A0A073F2U2   6.8e-49   0.000000202   2-130   1z1z A:2-130  
A0A073F3Z6   3.66e-46   0.000000254   1-125   1z1z A:2-130  
A0A073FMF1   3.4e-51   0.000000768   2-130   1z1z A:2-130  
A0A073FSD0   4.45e-17   0.0000569   2-56   1z1z A:2-130  
A0A073G5S1   8.11e-51   0.0000122   3-132   1z1z A:2-130  
A0A073GV86   4.18e-49   0.000000174   2-130   1z1z A:2-130  
A0A073HTD7   2.62e-51   0.0000111   3-132   1z1z A:2-130  
A0A073U4U7   6.54e-48   0.000000205   2-130   1z1z A:2-130  
A0A073UQN4   2.62e-51   0.0000111   3-132   1z1z A:2-130  
A0A074H7U7   4.45e-17   0.0000569   2-56   1z1z A:2-130  
A0A074HAI0   1.2e-35   0.00000167   1-96   1z1z A:2-130  
A0A074HB32   3.4e-51   0.000000768   2-130   1z1z A:2-130  
A0A074HH23   1.39e-35   0.00000128   2-103   1z1z A:2-130  
A0A074HWM7   8.11e-51   0.0000122   3-132   1z1z A:2-130  
A0A080FPK9   8.11e-51   0.0000122   3-132   1z1z A:2-130  
A0A080G9D2   6.8e-49   0.000000202   2-130   1z1z A:2-130  
A0A080GHB9   3.4e-51   0.000000768   2-130   1z1z A:2-130  
A0A080GIH8   3.92e-28   0.00000638   2-80   1z1z A:2-130  
A0A083ZYS7   2.78e-49   0.000000168   2-130   1z1z A:2-130  
A0A085G106   2.88e-49   0.00000802   3-131   1z1z A:2-130  
A0A085GWD4   3.14e-48   0.00000565   3-131   1z1z A:2-130  
A0A085NVG4   8.89e-50   0.000000596   2-130   1z1z A:2-130  
A0A085P3E5   5.49e-50   0.000000566   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0A0FFS2   1.28e-48   0.000000192   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0A0G3M8   0.0000000000000175   0.0000773   1-50   1z1z A:2-130  
A0A0A0GXX8   3.14e-49   0.000000176   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0A3YNX7   5.23e-45   0.0000127   3-132   1z1z A:2-130  
A0A0A6R8T2   1.07e-50   0.0000122   3-132   1z1z A:2-130  
A0A0A8U8B2   1.07e-50   0.0000122   3-132   1z1z A:2-130  
A0A0A8UAI9   1.52e-36   0.00000231   2-106   1z1z A:2-130  
A0A0A8UD58   6.54e-50   0.000000821   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0A8UMT0   1.52e-50   0.000012   2-131   1z1z A:2-130  
A0A0A8UNZ1   2.56e-49   0.000000176   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0B1FLY6   1.33e-49   0.000000185   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0B1JIG5   4.18e-51   0.000000738   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0B1K633   1.54e-50   0.000012   3-132   1z1z A:2-130  
A0A0B1M9H4   2.3e-50   0.0000132   3-132   1z1z A:2-130  
A0A0B8XMB4   2.78e-49   0.000000168   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0D1N5S7   1.44e-46   0.00000867   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0D1QUY7   2.78e-49   0.000000168   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0D1R919   0.0000000000000225   0.0000759   1-50   1z1z A:2-130  
A0A0D6IGF3   6.8e-49   0.000000202   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0D7LU86   2.88e-46   0.00000966   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0D7M043   1.8e-48   0.00000721   3-131   1z1z A:2-130  
A0A0D8W6M4   9.42e-49   0.000000213   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0E0TYX7   4.71e-49   0.000000195   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0E0V4X1   3.4e-51   0.000000768   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0E0V4Y8   2.12e-48   0.00000019   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0E0VF20   4.71e-51   0.000012   3-132   1z1z A:2-130  
A0A0E0Y1K4   3.4e-51   0.000000768   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0E0Y3G7   1.67e-48   0.000000192   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0E1LW84   4.18e-49   0.000000176   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0E1M5D5   5.49e-49   0.000000178   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0E1T3E9   1.26e-50   0.0000128   3-132   1z1z A:2-130  
A0A0E2L648   3.4e-51   0.000000768   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0E2L8D6   8.89e-49   0.000000218   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0E2TGE2   4.45e-50   0.000000728   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0E2TIU6   2.62e-51   0.0000111   3-132   1z1z A:2-130  
A0A0E2TIV7   1.54e-48   0.000000181   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0E2TRZ4   1.52e-50   0.000012   2-131   1z1z A:2-130  
A0A0F0VD42   1.86e-48   0.00000167   2-131   1z1z A:2-130  
A0A0F0XAX3   3.14e-48   0.00000252   2-131   1z1z A:2-130  
A0A0F1M9S9   6.54e-47   0.00000743   3-131   1z1z A:2-130  
A0A0F3SCG2   1.96e-50   0.0000124   2-131   1z1z A:2-130  
A0A0F3TIH4   3.4e-50   0.000000699   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0F3U2P3   8.11e-51   0.0000118   3-132   1z1z A:2-130  
A0A0F3UBN0   1.1e-49   0.000000307   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0F3UZ25   2.56e-49   0.000000176   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0F3V8J5   4.71e-50   0.000000509   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0F4BEQ3   8.89e-46   0.00000362   2-131   1z1z A:2-130  
A0A0F4HL98   4.45e-50   0.000000728   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0F5BDI9   4.71e-50   0.0000174   3-132   1z1z A:2-130  
A0A0F6AZJ7   2.62e-47   0.00000802   3-131   1z1z A:2-130  
A0A0F6B521   2.25e-50   0.0000163   3-132   1z1z A:2-130  
A0A0F6C0V3   1.36e-50   0.0000138   3-132   1z1z A:2-130  
A0A0F6C321   2.78e-49   0.000000168   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0F6C4B1   4.71e-50   0.000000758   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0F6C6C3   1.52e-50   0.000012   2-131   1z1z A:2-130  
A0A0F6F301   1.36e-50   0.0000138   3-132   1z1z A:2-130  
A0A0F6F533   2.78e-49   0.000000168   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0F6F5I5   4.71e-50   0.000000758   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0F6F937   1.52e-50   0.000012   2-131   1z1z A:2-130  
A0A0F6MDS2   1.73e-49   0.0000128   3-132   1z1z A:2-130  
A0A0G2NMT8   1.15e-47   0.00000802   3-131   1z1z A:2-130  
A0A0G3Q6F0   2.62e-47   0.00000785   3-132   1z1z A:2-130  
A0A0G3S8X8   5.49e-47   0.00000732   3-131   1z1z A:2-130  
A0A0G4Q7V3   2.12e-43   0.00000509   3-130   1z1z A:2-130  
A0A0H0DR30   2.14e-51   0.0000113   3-132   1z1z A:2-130  
A0A0H0ERE1   6.28e-51   0.000012   3-132   1z1z A:2-130  
A0A0H0F7Y9   4.71e-51   0.0000132   3-132   1z1z A:2-130  
A0A0H0FFN4   7.85e-48   0.0000174   3-132   1z1z A:2-130  
A0A0H2UY29   5.49e-51   0.000012   3-132   1z1z A:2-130  
A0A0H2V7H6   3.4e-51   0.000000768   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0H2V8Z3   5.75e-48   0.00000021   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0H2V9N6   1.78e-49   0.000000197   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0H2YXW1   6.8e-49   0.000000202   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0H2YYK0   3.4e-51   0.000000768   2-130   1z1z A:2-130  
A0A0H3BJY9   2.25e-50   0.0000163   3-132   1z1z A:2-130  
A0A0H3BQ28   2.62e-47   0.00000802   3-131   1z1z A:2-130  
A0A0H3CH90   3.4e-45   0.0000109   2-130   1z1z A:2-130  
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B1X1H6   0.0549   0.013   15-53   1z1z A:2-130  
B3GXL5   1.62e-33   0.0007   3-130   1z1z A:2-130  
B3H0Y5   1.1e-41   0.00066   3-131   1z1z A:2-130  
B8F4K3   6.28e-44   0.0006   3-135   1z1z A:2-130  
B8N8S8   0.0366   0.024   15-89   1z1z A:2-130  
C0VLS7   0.0628   0.0076   207-244   1z1z A:2-130  
C2ESM5   0.068   0.013   68-105   1z1z A:2-130  
C5S5B7   7.32e-40   0.001   3-129   1z1z A:2-130  
C6M4F7   0.000175   0.0094   6-93   1z1z A:2-130  
C6S6G8   0.000225   0.01   6-92   1z1z A:2-130  
C7HTI0   0.0706   0.018   70-120   1z1z A:2-130  
C8UEJ3   1.83e-16   0.00063   1-52   1z1z A:2-130  
D2RGG3   0.0759   0.021   29-68   1z1z A:2-130  
D2S3J2   0.0144   0.0089   8-58   1z1z A:2-130  
D6PFE0   0.0471   0.0058   4-98   1z1z A:2-130  
D6PGA7   0.0497   0.0058   4-98   1z1z A:2-130  
D7N2X5   0.00837   0.014   8-75   1z1z A:2-130  
D8QZU2   0.034   0.028   107-170   1z1z A:2-130  
D8TC45   0.034   0.028   107-170   1z1z A:2-130  
D9YLE3   0.0863   0.0098   93-155   1z1z A:2-130  
E0E712   1.49e-39   0.0007   3-132   1z1z A:2-130  
E0EWW7   2.35e-27   0.0028   3-86   1z1z A:2-130  
E0F7M4   0.0000000000000602   0.0044   2-74   1z1z A:2-130  
E0F9B9   2.35e-27   0.0028   3-86   1z1z A:2-130  
E0FM93   1.62e-33   0.0007   3-130   1z1z A:2-130  
E1X9M5   1.44e-40   0.001   3-135   1z1z A:2-130  
E5T957   0.016   0.02   72-115   1z1z A:2-130  
E6BU86   6.8e-26   0.00036   3-72   1z1z A:2-130  
E6BUJ3   0.000000000366   0.0024   3-31   1z1z A:2-130  
E6R6X0   0.0785   0.017   372-412   1z1z A:2-130  
E7S587   0.0118   0.02   23-74   1z1z A:2-130  
F0X078   0.0759   0.017   100-148   1z1z A:2-130  
F4AE32   0.0471   0.016   560-600   1z1z A:2-130  
F4G825   0.034   0.015   8-137   1z1z A:2-130  
F4H9F6   7.32e-34   0.0013   3-132   1z1z A:2-130  
F5MZA7   0.0000000217   0.0051   3-36   1z1z A:2-130  
F5R8A5   0.00366   0.013   6-92   1z1z A:2-130  
F6DTF8   0.0235   0.015   38-116   1z1z A:2-130  
F8E8Y0   0.0471   0.011   10-58   1z1z A:2-130  
F9GT60   1.75e-36   0.00033   3-130   1z1z A:2-130  
F9H4X0   2.88e-30   0.001   3-129   1z1z A:2-130  
F9H5Z7   6.02e-40   0.0011   3-135   1z1z A:2-130  
G0ER30   0.0000115   0.0026   6-144   1z1z A:2-130  
G5NB33   1.78e-29   0.00013   1-79   1z1z A:2-130  
G5SAQ9   1.78e-29   0.00013   1-79   1z1z A:2-130  
G8CLB1   0.0732   0.0067   6-99   1z1z A:2-130  
G8GDS4   0.0549   0.007   66-128   1z1z A:2-130  
G9WJ04   0.068   0.012   5-52   1z1z A:2-130  
H2BCQ9   0.0178   0.015   6-71   1z1z A:2-130  
H2IG40   0.0000000000968   0.0051   3-126   1z1z A:2-130  
H4UTZ3   4.45e-18   0.00011   2-55   1z1z A:2-130  
H6WXN8   0.011   0.022   6-121   1z1z A:2-130  
H8W9C1   0.0497   0.016   2-61   1z1z A:2-130  
I2NPU0   4.18e-31   0.00059   2-120   1z1z A:2-130  
I2S6C7   0.00000000000000162   0.00016   1-50   1z1z A:2-130  
I2URI8   0.000000000183   0.0028   2-42   1z1z A:2-130  
I2X3J2   0.00000000000000194   0.00019   1-50   1z1z A:2-130  
I3C4H6   0.0246   0.013   400-487   1z1z A:2-130  
I6F8H8   0.00000000000314   0.00011   1-45   1z1z A:2-130  
I6FV89   7.59e-20   0.00069   3-63   1z1z A:2-130  
I6HDW3   1.52e-16   0.0014   3-51   1z1z A:2-130  
I6WKU2   0.0418   0.012   87-175   1z1z A:2-130  
J0PW58   0.0126   0.019   5-133   1z1z A:2-130  
J0QIJ2   0.0167   0.018   6-133   1z1z A:2-130  
J1J740   0.000759   0.019   5-133   1z1z A:2-130  
J1JRA6   0.0392   0.02   6-133   1z1z A:2-130  
J5HIV1   1.07e-32   0.00082   3-131   1z1z A:2-130  
J8ZWB5   0.012   0.027   34-115   1z1z A:2-130  
K0G509   2.09e-30   0.0015   4-136   1z1z A:2-130  
K0GAS0   4.97e-33   0.0007   3-130   1z1z A:2-130  
K1U7K8   0.00654   0.0081   81-126   1z1z A:2-130  
K2GEY6   0.0497   0.0075   160-231   1z1z A:2-130  
K4F6E0   0.0392   0.015   83-149   1z1z A:2-130  
K4VRC6   0.000000000183   0.0028   2-42   1z1z A:2-130  
K4VT23   0.00000000288   0.0033   2-36   1z1z A:2-130  
K7XZ90   0.00188   0.0097   6-116   1z1z A:2-130  
L0PFK6   0.0654   0.02   14-79   1z1z A:2-130  
L1PRN8   0.0445   0.02   104-185   1z1z A:2-130  
M0H2Q4   0.0811   0.014   83-117   1z1z A:2-130  
M0HDU9   0.0811   0.014   83-117   1z1z A:2-130  
M0IM45   0.0811   0.012   83-117   1z1z A:2-130  
M1PJR0   0.000392   0.0063   37-103   1z1z A:2-130  
M1PL26   0.000392   0.0063   37-103   1z1z A:2-130  
M2ZAF8   0.000248   0.0071   8-95   1z1z A:2-130  
M4PNS6   0.000392   0.0063   37-103   1z1z A:2-130  
M9WYC9   9.15e-43   0.00052   3-131   1z1z A:2-130  
M9X114   7.59e-43   0.00056   3-131   1z1z A:2-130  
M9X3W2   3.14e-40   0.00084   4-129   1z1z A:2-130  
N0BHL7   0.0262   0.023   22-67   1z1z A:2-130  
N6U5W4   0.0157   0.0075   81-137   1z1z A:2-130  
N6VNK9   0.0392   0.011   12-109   1z1z A:2-130  
N6VQS9   0.0523   0.011   12-109   1z1z A:2-130  
N9BVA4   0.0497   0.016   16-106   1z1z A:2-130  
N9XI37   0.0288   0.02   18-92   1z1z A:2-130  
Q1AF23   0.0863   0.012   87-144   1z1z A:2-130  
Q1WRD9   0.0199   0.018   27-93   1z1z A:2-130  
Q4Z926   0.0785   0.016   78-125   1z1z A:2-130  
Q687F7   1.83e-16   0.00063   1-52   1z1z A:2-130  
Q687G0   0.000000000183   0.0028   2-42   1z1z A:2-130  
Q6FC68   0.034   0.027   17-106   1z1z A:2-130  
Q727J4   0.0222   0.0089   6-82   1z1z A:2-130  
Q72FK5   0.0191   0.01   6-82   1z1z A:2-130  
Q74J81   0.0183   0.016   227-267   1z1z A:2-130  
Q97YG3   0.0102   0.022   79-131   1z1z A:2-130  
R0E814   0.034   0.015   8-137   1z1z A:2-130  
R5BC80   0.0759   0.012   24-46   1z1z A:2-130  
R6IET3   0.0915   0.0076   9-107   1z1z A:2-130  
R6J7J9   0.0115   0.0063   11-91   1z1z A:2-130  
R6XGA9   0.0199   0.015   4-36   1z1z A:2-130  
R7MA08   0.0418   0.013   15-88   1z1z A:2-130  
R7ULC4   0.0732   0.024   240-289   1z1z A:2-130  
R9ZX96   0.000392   0.0063   37-103   1z1z A:2-130  
S0A0Z9   0.000392   0.0063   37-103   1z1z A:2-130  
S0Z1U1   0.00000000000000105   0.00025   2-47   1z1z A:2-130  
S1NIT4   0.0471   0.018   15-103   1z1z A:2-130  
S3JI13   0.0165   0.014   14-85   1z1z A:2-130  
S5MMH2   0.016   0.03   4-69   1z1z A:2-130  
S5MMX1   0.016   0.03   4-69   1z1z A:2-130  
S9Y3V1   1.18e-42   0.0005   3-131   1z1z A:2-130  
T0YUR6   0.0251   0.013   19-53   1z1z A:2-130  
T9SMP3   0.0000366   0.0028   1-20   1z1z A:2-130  
T9SPC9   0.000000759   0.0014   2-29   1z1z A:2-130  
U1H402   9.42e-34   0.0015   3-132   1z1z A:2-130  
U3GD94   0.034   0.015   8-137   1z1z A:2-130  
U4LEL0   0.0523   0.017   12-58   1z1z A:2-130  
U4RUS4   1.26e-41   0.00071   3-132   1z1z A:2-130  
U4RYA2   6.28e-44   0.0006   3-135   1z1z A:2-130  
U4RZS7   1.05e-43   0.00063   3-135   1z1z A:2-130  
V4NDJ7   9.15e-28   0.00059   3-130   1z1z A:2-130  
V4TCK6   0.0418   0.0078   250-307   1z1z A:2-130  
V5P2T7   0.0471   0.016   560-600   1z1z A:2-130  
V7AXP3   0.0418   0.019   207-324   1z1z A:2-130  
V7B0D9   0.0418   0.019   206-323   1z1z A:2-130  
W0I3G6   0.00706   0.0098   19-60   1z1z A:2-130  
W0Q453   2.88e-36   0.00085   3-132   1z1z A:2-130  
W0RD62   2.04e-41   0.00089   3-131   1z1z A:2-130  
W4A1A9   0.0759   0.022   22-112   1z1z A:2-130  
W4HGW2   0.0811   0.0086   133-166   1z1z A:2-130  
W6M3K2   0.0366   0.017   42-81   1z1z A:2-130  
W8CTZ9   0.0628   0.012   6-60   1z1z A:2-130  
X0U3K3   0.0152   0.012   36-72   1z1z A:2-130  
X1IVH3   0.0314   0.026   57-144   1z1z A:2-130  
X1KXX7   0.0366   0.021   55-137   1z1z A:2-130  
X1QY15   0.0314   0.013   9-43   1z1z A:2-130  
X4YW01   0.0575   0.007   66-127   1z1z A:2-130  

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Select to display   Genome       Domains   Proteins
No Yes ALL   21039 21039
No Yes Rahnella sp. Y9602   1 1
No Yes Serratia sp. AS12   1 1
No Yes Serratia plymuthica AS9   1 1
No Yes Shigella sonnei Ss046   1 1
No Yes Shigella flexneri 5 str. 8401   2 2
No Yes Shigella boydii CDC 3083-94   3 3
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594   1 1
No Yes Escherichia fergusonii ATCC 35469   1 1
No Yes Escherichia coli 'BL21-Gold(DE3)pLysS AG'   1 1
No Yes Rahnella aquatilis HX2   2 2
No Yes Serratia sp. AS13   1 1
No Yes Shigella sonnei 53G   2 2
No Yes Shigella flexneri 2002017   2 2
No Yes Shigella flexneri 2a str. 2457T   1 1
No Yes Shigella flexneri 2a str. 301   2 2
No Yes Shigella boydii Sb227   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar 4,[5],12:i:- str. 08-1736   2 2
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254   2 2
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288   2 2
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1   2 2
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74   2 2
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240   2 2
No Yes Salmonella enterica The genome of subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2   2 2
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. D23580   2 2
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344   2 2
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S   3 3
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2   3 3
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium Definitive Type 104   2 2
No Yes Salmonella enterica serovar Bovismorbificans genomics   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1   2 2
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. B182   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91   1 1
No Yes Klebsiella oxytoca KCTC 1686   1 1
No Yes Enterobacter aerogenes EA1509E   1 1
No Yes Escherichia coli E. coli PMV-1   3 3
No Yes Escherichia coli JJ1886   2 2
No Yes Escherichia coli LY180   1 1
No Yes Escherichia coli O7:K1 str. CE10   4 4
No Yes Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050   3 3
No Yes Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2071   4 4
No Yes Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493   3 3
No Yes Escherichia coli NA114   1 1
No Yes Escherichia coli str. 'clone D i2'   2 2
No Yes Escherichia coli str. 'clone D i14'   2 2
No Yes Escherichia coli UM146   2 2
No Yes Escherichia coli 042   2 2
No Yes Escherichia coli Xuzhou21   4 4
No Yes Escherichia coli IHE3034   4 4
No Yes Escherichia coli UMNK88   1 1
No Yes Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C   2 2
No Yes Escherichia coli ABU 83972   1 1
No Yes Escherichia coli KO11FL   1 1
No Yes Escherichia coli KO11FL   1 1
No Yes Escherichia coli LF82   2 2
No Yes Escherichia coli ED1a   2 2
No Yes Escherichia coli IAI39   3 3
No Yes Escherichia coli UMN026   4 4
No Yes Escherichia coli 55989   4 4
No Yes Escherichia coli S88   4 4
No Yes Escherichia coli IAI1   2 2
No Yes Escherichia coli W   1 1
No Yes Escherichia coli W   1 1
No Yes Escherichia coli ATCC 8739   1 1
No Yes Escherichia coli BL21(DE3)   1 1
No Yes Escherichia coli BL21(DE3)   1 1
No Yes Escherichia coli SE15   1 1
No Yes Escherichia coli SE11   3 3
No Yes Escherichia coli APEC O1   2 2
No Yes Escherichia coli O103:H2 str. 12009   6 6
No Yes Escherichia coli UTI89   3 3
No Yes Escherichia coli 536   1 1
No Yes Escherichia coli ETEC H10407   1 1
No Yes Escherichia coli O55:H7 str. RM12579   7 7
No Yes Escherichia coli O55:H7 str. CB9615   7 7
No Yes Escherichia coli O26:H11 str. 11368   6 6
No Yes Escherichia coli CFT073   3 3
No Yes Escherichia coli O111:H- str. 11128   4 4
No Yes Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69   2 2
No Yes Escherichia coli O157:H7 str. TW14359   5 5
No Yes Escherichia coli O157:H7 str. EC4115   6 6
No Yes Escherichia coli O157:H7 str. Sakai   4 4
No Yes Escherichia coli O157:H7 str. EDL933   3 3
No Yes Escherichia coli BW2952   1 1
No Yes Enterobacter cloacae SCF1   1 1
No Yes Enterobacter cloacae subsp. cloacae ATCC 13047   1 1
No Yes Combined (meta-genome)   2 2
No Yes Cyphomyrmex longiscapus fungus garden (meta-genome)   2 2
No Yes Fungus garden combined (combined) (meta-genome)   1 1
No Yes Fungus garden microbial communities from Atta colombica in Panama, sample from fungus garden bottom (Fungus garden bottom) (meta-genome)   1 1
No Yes Fungus garden microbial communities from Atta colombica in Panama, sample from fungus garden top (meta-genome)   2 2
No Yes Hot spring microbial community from Yellowstone Hot Springs, sample YNP20 from Bath Lake Vista Annex - Purple-Sulfur Mats (meta-genome)   1 1
No Yes NCBI 2017_08 genome   19790 19789
No Yes Soil microbial communities from Minnesota Farm (meta-genome)   1 1
No Yes STRING v9.0.5 (STRING)   92 92
No Yes Uniprot 2018_03 genome   775 775
No Yes Global Ocean Sampling Expedition (GOS)   1 1
No Yes NCBI plasmid sequences (Plasmids)   2 2
No Yes NCBI viral sequences (Viral)   13 13
No Yes PDB chains (SCOP 1.75) (PDB)   1 1
No Yes Protein Data Bank (all PDB sequenc)   23 23
No Yes SCOP2 SCOPe CATH ECOD (all domain sequ)   46 46
No Yes TargetDB (Targets)   3 3
No Yes The Salmonella enterica Pan-genome (meta-genome)   28 28
No Yes UniProt viral sequences (Viral)   5 5

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Please cite: Gough, J., Karplus, K., Hughey, R. and Chothia, C. (2001). "Assignment of Homology to Genome Sequences using a Library of Hidden Markov Models that Represent all Proteins of Known Structure." J. Mol. Biol., 313(4), 903-919.

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