SUPERFAMILY 1.75 HMM library and genome assignments server

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PMT central region-like family domain assignments
in
Uniprot 2018_03 genome

Assignment details

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Uniprot 2018_03 genome has 36 significant domains in 36 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
A0A1E3XK14   1.44e-113   0.0000000000297   579-874   2ebf X:575-874  
A0A1Q1PRR1   3.01e-37   0.00000187   1-99   2ebf X:575-874  
A0A290YYM9   8.24e-96   0.000000000364   3-246   2ebf X:575-874  
A0A2I0F883   2.48e-95   0.0001   3289-3561   2ebf X:575-874  
  1.28e-42   0.0059   2455-2676   2ebf X:575-874  
A0A2I6QA96   8.89e-96   0.000000000364   3-246   2ebf X:575-874  
A0A2K2Z3V4   1.44e-113   0.0000000000297   577-872   2ebf X:575-874  
A7TVT6   1.44e-113   0.0000000000297   577-872   2ebf X:575-874  
B5AGW0   2.35e-82   0.00000000189   1-211   2ebf X:575-874  
B5AGW1   2.35e-82   0.00000000189   1-211   2ebf X:575-874  
B5AGW2   2.35e-82   0.00000000189   1-211   2ebf X:575-874  
B5AGW3   6.93e-95   0.000000000386   3-246   2ebf X:575-874  
B5AGW4   8.89e-95   0.000000000386   3-246   2ebf X:575-874  
B5AU18   4.05e-113   0.000000000034   577-872   2ebf X:575-874  
C5J9U8   1.44e-113   0.0000000000297   577-872   2ebf X:575-874  
C5J9U9   1.44e-113   0.0000000000297   562-857   2ebf X:575-874  
P17452   1.44e-113   0.0000000000297   577-872   2ebf X:575-874  
Q06ZS9   6.54e-53   0.000000257   1-125   2ebf X:575-874  
Q06ZT0   7.98e-54   0.000000227   2-128   2ebf X:575-874  
Q06ZT2   1.01e-52   0.000000278   1-124   2ebf X:575-874  
Q06ZT3   4.32e-54   0.000000218   1-128   2ebf X:575-874  
Q06ZT4   3.4e-55   0.00000017   2-132   2ebf X:575-874  
Q06ZT5   1.24e-53   0.000000244   2-127   2ebf X:575-874  
Q06ZT6   2.22e-57   0.000000105   1-138   2ebf X:575-874  
Q06ZT7   6.15e-57   0.000000113   1-137   2ebf X:575-874  
Q06ZT9   8.89e-58   0.0000000993   1-139   2ebf X:575-874  
Q06ZU1   7.59e-52   0.000000315   1-122   2ebf X:575-874  
Q06ZU4   9.29e-53   0.000000278   2-125   2ebf X:575-874  
Q06ZU6   1.83e-56   0.00000012   1-136   2ebf X:575-874  
Q06ZU7   1.96e-56   0.000000125   2-136   2ebf X:575-874  
Q06ZU8   1.57e-55   0.000000141   1-133   2ebf X:575-874  
Q06ZU9   3.92e-55   0.00000015   1-132   2ebf X:575-874  
Q06ZV2   1.44e-58   0.0000000946   2-141   2ebf X:575-874  
Q06ZV9   3.53e-52   0.000000296   1-123   2ebf X:575-874  
Q56D14   1.44e-113   0.0000000000297   577-872   2ebf X:575-874  
Q5G1R4   1.44e-113   0.000000000031   577-872   2ebf X:575-874  
Q70LP2   1.44e-113   0.0000000000297   577-872   2ebf X:575-874  
 
Weak hits:
A0A009G7Q0   0.017   0.032   159-252   2ebf X:575-874  
A0A009HTZ1   0.000863   0.016   191-257   2ebf X:575-874  
A0A009LN22   0.0405   0.034   6-43   2ebf X:575-874  
A0A015K9E5   0.0353   0.032   114-203   2ebf X:575-874  
A0A015V178   0.017   0.032   407-505   2ebf X:575-874  
A0A017H3W1   0.0432   0.029   5-56   2ebf X:575-874  
A0A017N749   0.0314   0.041   137-200   2ebf X:575-874  
A0A022GPQ6   0.0222   0.026   3-46   2ebf X:575-874  
A0A022ISG2   0.0405   0.034   6-43   2ebf X:575-874  
A0A022PMZ7   6.28e-36   0.0063   2351-2554   2ebf X:575-874  
A0A022RNW7   0.0209   0.025   110-188   2ebf X:575-874  
A0A023G6L6   0.00301   0.02   50-101   2ebf X:575-874  
A0A023NA98   4.71e-62   0.0081   2364-2607   2ebf X:575-874  
A0A044TN20   0.0379   0.03   399-494   2ebf X:575-874  
A0A067S2G1   0.00209   0.018   161-248   2ebf X:575-874  
A0A067T458   0.00889   0.019   116-202   2ebf X:575-874  
A0A068QPN0   2.35e-43   0.0067   2354-2597   2ebf X:575-874  
A0A068R543   1.96e-19   0.0047   2370-2468   2ebf X:575-874  
A0A072TGZ0   0.0101   0.025   251-302   2ebf X:575-874  
A0A072VGA8   0.0209   0.024   87-166   2ebf X:575-874  
A0A075RWY0   0.0706   0.024   396-456   2ebf X:575-874  
A0A077N206   1.31e-42   0.0076   2386-2628   2ebf X:575-874  
A0A077NNN3   1.96e-42   0.0074   2386-2628   2ebf X:575-874  
A0A077NP98   1.18e-42   0.0076   2386-2628   2ebf X:575-874  
A0A077P158   3.53e-41   0.011   2386-2628   2ebf X:575-874  
A0A077P4A9   1.83e-39   0.009   2386-2628   2ebf X:575-874  
A0A077PP56   1.96e-42   0.0074   2386-2628   2ebf X:575-874  
A0A077Q410   1.12e-39   0.0093   2386-2628   2ebf X:575-874  
A0A077TFT5   0.0811   0.01   72-145   2ebf X:575-874  
A0A077X6G0   0.0122   0.019   115-226   2ebf X:575-874  
A0A077YEE0   0.0602   0.014   64-135   2ebf X:575-874  
A0A081S1J1   6.67e-94   0.00011   49-322   2ebf X:575-874  
A0A081S2S5   1.44e-35   0.0061   2350-2554   2ebf X:575-874  
A0A085T4S8   4.84e-57   0.0067   2548-2791   2ebf X:575-874  
A0A087IM28   5.36e-106   0.00016   3580-3853   2ebf X:575-874  
  2.88e-61   0.0084   2364-2607   2ebf X:575-874  
A0A087M7X6   0.0471   0.022   7-45   2ebf X:575-874  
A0A090IH64   8.11e-19   0.0024   2774-2856   2ebf X:575-874  
A0A094TBY3   8.11e-46   0.0073   663-933   2ebf X:575-874  
A0A097A1L4   1.83e-81   0.00067   2-214   2ebf X:575-874  
A0A097A1L5   2.09e-75   0.00075   2-213   2ebf X:575-874  
A0A097A1L9   1.44e-79   0.00072   2-214   2ebf X:575-874  
A0A097A1M1   3.01e-81   0.00067   2-214   2ebf X:575-874  
A0A097A1M2   2.62e-73   0.00099   2-213   2ebf X:575-874  
A0A097A1M4   2.35e-81   0.00067   2-214   2ebf X:575-874  
A0A097A1M8   2.09e-82   0.00073   2-214   2ebf X:575-874  
A0A097A1N1   1.02e-80   0.00073   2-214   2ebf X:575-874  
A0A097A1N5   7.59e-82   0.00073   2-214   2ebf X:575-874  
A0A097A1Q0   7.32e-82   0.00073   2-214   2ebf X:575-874  
A0A097A1R0   3.53e-82   0.0008   2-214   2ebf X:575-874  
A0A097A1R5   0.000000000000366   0.062   2-91   2ebf X:575-874  
A0A097A1S1   0.00000000000102   0.062   2-91   2ebf X:575-874  
A0A097A1S7   0.00000000000144   0.062   2-91   2ebf X:575-874  
A0A097A1T2   0.0000000000000876   0.062   2-91   2ebf X:575-874  
A0A097A1T3   0.00000000000102   0.062   2-91   2ebf X:575-874  
A0A097A1U5   0.00000000000102   0.062   2-91   2ebf X:575-874  
A0A097A1W6   0.000000000000288   0.062   2-91   2ebf X:575-874  
A0A0A1UGQ2   0.0112   0.027   62-118   2ebf X:575-874  
A0A0A2YDC6   0.00418   0.013   52-144   2ebf X:575-874  
A0A0A2ZN17   0.00418   0.013   52-144   2ebf X:575-874  
A0A0A3AHC1   0.00418   0.013   52-144   2ebf X:575-874  
A0A0A8NXZ4   4.71e-89   0.00013   2939-3209   2ebf X:575-874  
  3.79e-39   0.01   2389-2631   2ebf X:575-874  
A0A0B4XLI9   0.0314   0.024   436-506   2ebf X:575-874  
A0A0B6XCI5   7.06e-43   0.0074   2386-2628   2ebf X:575-874  
A0A0C2SCM7   0.017   0.023   2-62   2ebf X:575-874  
A0A0C2SRA7   0.00497   0.024   319-384   2ebf X:575-874  
A0A0C2WW57   0.00562   0.031   40-88   2ebf X:575-874  
A0A0C9U2L7   0.00196   0.019   109-185   2ebf X:575-874  
A0A0C9VQ84   0.0471   0.014   105-186   2ebf X:575-874  
A0A0C9Z9E2   0.0157   0.025   21-86   2ebf X:575-874  
A0A0D2MZL1   0.034   0.016   508-625   2ebf X:575-874  
A0A0D2PDE2   0.0301   0.016   508-625   2ebf X:575-874  
A0A0D2QZ72   0.0327   0.016   472-589   2ebf X:575-874  
A0A0D2S172   0.0222   0.016   309-426   2ebf X:575-874  
A0A0D4CCX2   1.31e-56   0.0067   2548-2791   2ebf X:575-874  
A0A0D9NFV3   0.00562   0.017   121-234   2ebf X:575-874  
A0A0E0UUT0   0.0012   0.019   163-235   2ebf X:575-874  
A0A0E2Q3S1   0.0432   0.03   91-126   2ebf X:575-874  
A0A0E2REN0   0.0471   0.03   91-126   2ebf X:575-874  
A0A0E3W5B6   2.62e-57   0.0065   2548-2791   2ebf X:575-874  
A0A0F5BG00   0.0445   0.032   30-96   2ebf X:575-874  
A0A0F6NGE3   1.83e-62   0.0081   464-707   2ebf X:575-874  
A0A0F6NGH3   1.83e-62   0.0081   464-707   2ebf X:575-874  
A0A0F6NGV0   1.83e-62   0.0081   464-707   2ebf X:575-874  
A0A0F7RFI5   0.0131   0.04   54-126   2ebf X:575-874  
A0A0G0RWY6   0.0000615   0.012   62-139   2ebf X:575-874  
A0A0G0U461   0.0000379   0.012   41-118   2ebf X:575-874  
A0A0G0UV52   0.0000615   0.012   62-139   2ebf X:575-874  
A0A0G4Q7V9   1.7e-71   0.0049   663-934   2ebf X:575-874  
A0A0G4Q8P8   1.31e-22   0.0073   700-930   2ebf X:575-874  
A0A0H0Y272   1.57e-106   0.00018   3580-3853   2ebf X:575-874  
  1.44e-63   0.0061   2364-2607   2ebf X:575-874  
A0A0H3AGH9   6.8e-57   0.0067   651-894   2ebf X:575-874  
A0A0H3PYX6   6.67e-57   0.0067   633-876   2ebf X:575-874  
A0A0H6H481   3.92e-57   0.0067   662-905   2ebf X:575-874  
A0A0H6HC79   6.8e-57   0.0067   651-894   2ebf X:575-874  
A0A0H6R1E4   4.71e-57   0.0067   382-625   2ebf X:575-874  
A0A0H6TEA6   8.5e-57   0.0067   1402-1645   2ebf X:575-874  
A0A0H6ZXX3   8.76e-58   0.0067   382-625   2ebf X:575-874  
A0A0H7BZA5   1.31e-56   0.0067   2548-2791   2ebf X:575-874  
A0A0J5IQ67   1.44e-19   0.0048   2258-2350   2ebf X:575-874  
A0A0J9XRA1   0.0248   0.03   33-130   2ebf X:575-874  
A0A0K9V0R8   1.31e-56   0.0067   2548-2791   2ebf X:575-874  
A0A0L0FM91   0.0301   0.023   496-553   2ebf X:575-874  
A0A0L0GEK3   0.00366   0.018   107-147   2ebf X:575-874  
A0A0M0T8Y6   2.35e-20   0.0043   2387-2486   2ebf X:575-874  
A0A0M1YPV5   0.0471   0.023   198-228   2ebf X:575-874  
A0A0M9D203   1.44e-92   0.00015   35-308   2ebf X:575-874  
A0A0N8GWI2   4.58e-105   0.00016   3242-3515   2ebf X:575-874  
A0A0P6ZGK8   2.35e-98   0.00014   2578-2851   2ebf X:575-874  
A0A0Q0YVY3   0.00288   0.013   251-333   2ebf X:575-874  
A0A0R4CX20   4.71e-89   0.00013   2939-3209   2ebf X:575-874  
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F1CLH4   6.8e-63   0.0061   567-810   2ebf X:575-874  
F1CLH5   6.28e-63   0.0061   458-701   2ebf X:575-874  
F1CLH6   6.8e-63   0.0061   567-810   2ebf X:575-874  
F1CLH7   3.66e-62   0.0061   568-810   2ebf X:575-874  
F1CLH8   6.28e-63   0.0061   458-701   2ebf X:575-874  
F1CLH9   6.8e-63   0.0061   567-810   2ebf X:575-874  
F1CLI0   6.28e-63   0.0061   458-701   2ebf X:575-874  
F1CLI1   2.62e-106   0.00016   1674-1947   2ebf X:575-874  
  3.4e-61   0.0061   458-701   2ebf X:575-874  
F1CLI2   1.1e-105   0.00017   1783-2056   2ebf X:575-874  
  3.66e-61   0.0084   567-810   2ebf X:575-874  
F1CLI3   6.28e-106   0.00015   1674-1947   2ebf X:575-874  
  2.35e-61   0.0084   458-701   2ebf X:575-874  
F1CLI4   1.27e-105   0.00015   996-1269   2ebf X:575-874  
F1CLI5   5.89e-106   0.00016   1783-2056   2ebf X:575-874  
  1.83e-61   0.0079   567-810   2ebf X:575-874  
F1CLI6   2.09e-106   0.00016   1783-2056   2ebf X:575-874  
  1.57e-61   0.0084   567-810   2ebf X:575-874  
F1CLI7   2.75e-106   0.00013   1674-1947   2ebf X:575-874  
  4.58e-61   0.0093   458-701   2ebf X:575-874  
F1CLI8   1.96e-61   0.0084   460-701   2ebf X:575-874  
F1CLI9   2.62e-106   0.00016   1674-1947   2ebf X:575-874  
  4.45e-60   0.0084   460-701   2ebf X:575-874  
F1CLJ0   2.48e-106   0.00016   1674-1947   2ebf X:575-874  
  2.75e-61   0.0084   460-701   2ebf X:575-874  
F1CLJ1   9.94e-106   0.00017   1674-1947   2ebf X:575-874  
  2.62e-61   0.0084   458-701   2ebf X:575-874  
F1CLJ2   1.96e-106   0.00016   1674-1947   2ebf X:575-874  
  3.27e-63   0.0056   458-701   2ebf X:575-874  
F1CLJ3   3.14e-106   0.00016   1674-1947   2ebf X:575-874  
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F1CLJ4   5.49e-106   0.00015   1674-1947   2ebf X:575-874  
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F1LAT6   0.0144   0.0098   105-185   2ebf X:575-874  
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F3UVR5   0.0654   0.021   127-166   2ebf X:575-874  
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L2EHH2   0.0235   0.02   3-45   2ebf X:575-874  
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V5XTC9   0.0641   0.012   82-154   2ebf X:575-874  
V7FLH8   0.0615   0.011   14-82   2ebf X:575-874  
V7PDH2   0.00628   0.017   203-251   2ebf X:575-874  
V7PK52   0.0327   0.027   104-169   2ebf X:575-874  
V8C0X6   0.0432   0.025   16-82   2ebf X:575-874  
V9HP74   0.00327   0.037   48-125   2ebf X:575-874  
V9ZWL2   0.0144   0.03   388-481   2ebf X:575-874  
W0BIS0   0.0549   0.041   2-34   2ebf X:575-874  
W0TII0   0.000523   0.018   114-198   2ebf X:575-874  
W1EHC0   0.051   0.03   177-338   2ebf X:575-874  
W1ILT7   1.07e-42   0.0079   2302-2545   2ebf X:575-874  
W1IWB2   1.06e-34   0.009   2170-2410   2ebf X:575-874  
W1J126   3.4e-39   0.0041   2284-2527   2ebf X:575-874  
W1J8A6   1.57e-32   0.0047   626-867   2ebf X:575-874  
W1QEH2   0.0432   0.041   507-534   2ebf X:575-874  
W1VTG8   0.0144   0.027   6-70   2ebf X:575-874  
W1WSB2   0.0128   0.013   68-120   2ebf X:575-874  
W2BZH7   0.0122   0.024   40-62   2ebf X:575-874  
W2DKS9   0.0575   0.03   28-92   2ebf X:575-874  
W3V298   1.57e-38   0.004   2358-2592   2ebf X:575-874  
W3Y9D7   0.00772   0.016   21-82   2ebf X:575-874  
W3YBF4   0.0314   0.012   33-95   2ebf X:575-874  
W4CL62   0.0732   0.021   80-149   2ebf X:575-874  
W4EL04   0.0353   0.028   111-235   2ebf X:575-874  
W4H564   0.0196   0.052   20-109   2ebf X:575-874  
W4Q5L8   0.0275   0.052   38-125   2ebf X:575-874  
W4UWU9   0.0114   0.039   424-528   2ebf X:575-874  
W4UYG4   0.0288   0.043   379-444   2ebf X:575-874  
W4V5W2   0.00628   0.014   203-238   2ebf X:575-874  
W5LKQ8   0.0458   0.018   51-82   2ebf X:575-874  
W5SW56   0.00641   0.016   10-108   2ebf X:575-874  
W5T243   0.00575   0.016   2-100   2ebf X:575-874  
W5T3U3   0.0471   0.041   30-133   2ebf X:575-874  
W6AN97   9.68e-19   0.0025   2772-2854   2ebf X:575-874  
W6EB26   0.0471   0.022   7-45   2ebf X:575-874  
W6EII4   0.051   0.043   58-126   2ebf X:575-874  
W6LF02   0.0405   0.019   79-141   2ebf X:575-874  
W6Q292   0.0118   0.016   54-121   2ebf X:575-874  
W6ZAY4   0.0785   0.017   202-257   2ebf X:575-874  
W7AK34   0.0327   0.01   322-400   2ebf X:575-874  
W7KLS3   0.0536   0.027   15-65   2ebf X:575-874  
W7NVR5   0.0654   0.018   23-78   2ebf X:575-874  
W7PES8   0.0602   0.013   3-35   2ebf X:575-874  
W7R4X0   0.0144   0.058   38-122   2ebf X:575-874  
W7R9B1   0.0106   0.032   43-101   2ebf X:575-874  
W7X5P1   0.0000994   0.013   62-129   2ebf X:575-874  
W7XF22   0.0301   0.016   37-136   2ebf X:575-874  
W7YUM2   0.0196   0.012   16-53   2ebf X:575-874  
W7ZIK5   0.0116   0.012   16-53   2ebf X:575-874  
W9QFX7   0.000785   0.032   5-54   2ebf X:575-874  
W9UV96   0.0157   0.02   21-49   2ebf X:575-874  
X0R3A9   0.051   0.019   152-220   2ebf X:575-874  
X0WIB8   0.051   0.028   9-61   2ebf X:575-874  
X0XLH9   0.0222   0.012   22-86   2ebf X:575-874  
X0Y6W4   0.0536   0.043   40-100   2ebf X:575-874  
X0YB62   0.0667   0.02   19-118   2ebf X:575-874  
X0Z5Y3   0.0615   0.015   71-190   2ebf X:575-874  
X1HX90   0.0379   0.02   56-137   2ebf X:575-874  
X1JXL9   0.0445   0.015   64-111   2ebf X:575-874  
X1PBC1   0.0405   0.01   20-67   2ebf X:575-874  
X1QQ09   0.00124   0.031   3-43   2ebf X:575-874  
X2GHD8   0.0719   0.019   73-162   2ebf X:575-874  
X2H2R9   0.0693   0.023   16-120   2ebf X:575-874  
X2H586   0.0235   0.029   357-403   2ebf X:575-874  
X5JR87   0.0432   0.043   14-37   2ebf X:575-874  
X6MG41   0.0536   0.023   74-159   2ebf X:575-874  
X6MQ10   0.0222   0.013   1479-1565   2ebf X:575-874  
X6MXI9   0.0706   0.028   518-595   2ebf X:575-874  
X6P2G8   0.0314   0.037   207-298   2ebf X:575-874  
X7S9E7   0.0497   0.02   12-120   2ebf X:575-874  
X8HK35   0.0654   0.022   19-82   2ebf X:575-874  

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Select to display   Genome       Domains   Proteins
No Yes ALL   61 61
No Yes Pasteurella multocida subsp. multocida str. HN06   1 1
No Yes NCBI 2017_08 genome   3 3
No Yes Uniprot 2018_03 genome   36 36
No Yes PDB chains (SCOP 1.75) (PDB)   3 3
No Yes Protein Data Bank (all PDB sequenc)   5 5
No Yes SCOP2 SCOPe CATH ECOD (all domain sequ)   13 13

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