SUPERFAMILY 1.75 HMM library and genome assignments server

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PMT central region-like family domain assignments
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all genomes

Assignment details

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6 selected genomes have 61 significant domains in 61 proteins.


Pasteurella multocida subsp. multocida str. HN06 has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
gi|383311704|ref|YP_005364514.1|   1.44e-113   0.0000000000297   577-872   2ebf X:575-874  
 
Weak hits:
gi|383311457|ref|YP_005364267.1|   0.0523   0.037   187-265   2ebf X:575-874  

NCBI 2017_08 genome has 3 significant domains in 3 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
WP_015691094.1.41297   1.44e-113   0.0000000000297   577-872   2ebf X:575-874  
WP_017223230.1.9323   7.32e-96   0.0001   3289-3561   2ebf X:575-874  
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Weak hits:
NP_231094.1.72393   1.31e-56   0.0067   2561-2804   2ebf X:575-874  
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Uniprot 2018_03 genome has 36 significant domains in 36 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
A0A1E3XK14   1.44e-113   0.0000000000297   579-874   2ebf X:575-874  
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