SUPERFAMILY 1.75 HMM library and genome assignments server

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PMT domain-like family domain assignments
in
Uniprot 2018_03 genome

Assignment details

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Uniprot 2018_03 genome has 13 significant domains in 13 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
A0A1E3XK14   3.09e-76   0.00000000112   877-1094   2ebf X:875-1093  
A0A2K2Z3V4   3.09e-76   0.00000000112   875-1092   2ebf X:875-1093  
A7TVT6   3.09e-76   0.00000000112   875-1092   2ebf X:875-1093  
B5AGW0   4.71e-70   0.00000000387   214-409   2ebf X:875-1093  
B5AGW1   5.75e-71   0.00000000387   214-409   2ebf X:875-1093  
B5AGW2   3.09e-71   0.00000000368   214-409   2ebf X:875-1093  
B5AU18   6.8e-76   0.00000000113   875-1092   2ebf X:875-1093  
C5J9U8   2.98e-76   0.00000000112   875-1092   2ebf X:875-1093  
C5J9U9   3.03e-76   0.00000000112   860-1077   2ebf X:875-1093  
P17452   3.09e-76   0.00000000112   875-1092   2ebf X:875-1093  
Q56D14   3.09e-76   0.00000000112   875-1092   2ebf X:875-1093  
Q5G1R4   3.3e-75   0.00000000127   875-1092   2ebf X:875-1093  
Q70LP2   3.09e-76   0.00000000112   875-1092   2ebf X:875-1093  
 
Weak hits:
A0A010SH42   1.05e-51   0.029   659-882   2ebf X:875-1093  
A0A014N9I8   0.00889   0.065   36-163   2ebf X:875-1093  
A0A015MRV4   0.0288   0.029   130-180   2ebf X:875-1093  
A0A022PWW4   0.0251   0.017   156-194   2ebf X:875-1093  
A0A022RQP5   0.0523   0.02   156-192   2ebf X:875-1093  
A0A023C9T8   2.35e-41   0.033   1586-1785   2ebf X:875-1093  
  3.4e-22   0.0059   1262-1488   2ebf X:875-1093  
A0A023C9U4   6.28e-35   0.016   686-900   2ebf X:875-1093  
A0A024EGQ2   1.99e-32   0.0065   704-911   2ebf X:875-1093  
A0A031G4A5   2.56e-53   0.0095   641-865   2ebf X:875-1093  
A0A031IQ05   4.45e-40   0.097   1578-1791   2ebf X:875-1093  
  7.59e-25   0.0042   1299-1492   2ebf X:875-1093  
A0A031J3L8   6.8e-20   0.011   946-1142   2ebf X:875-1093  
A0A059AA39   0.0272   0.017   156-194   2ebf X:875-1093  
A0A059BHD4   0.0251   0.017   156-194   2ebf X:875-1093  
A0A059KVL5   1.78e-51   0.01   671-890   2ebf X:875-1093  
A0A066YKU7   1.78e-24   0.012   250-428   2ebf X:875-1093  
A0A066YQ34   1.52e-23   0.016   192-380   2ebf X:875-1093  
A0A067AA57   5.23e-52   0.029   650-869   2ebf X:875-1093  
A0A067AGG7   1.26e-47   0.011   621-830   2ebf X:875-1093  
A0A067TGX9   0.0251   0.027   222-340   2ebf X:875-1093  
A0A075PGL5   7.59e-39   0.039   1576-1793   2ebf X:875-1093  
  1.33e-27   0.0072   1267-1480   2ebf X:875-1093  
A0A077LJN1   6.28e-47   0.0074   1695-1910   2ebf X:875-1093  
  5.23e-44   0.029   1297-1523   2ebf X:875-1093  
A0A078L3D7   0.0000000000487   0.032   144-255   2ebf X:875-1093  
A0A081S1J1   7.32e-70   0.0053   324-546   2ebf X:875-1093  
A0A085UT58   1.67e-53   0.016   1726-1943   2ebf X:875-1093  
  2.3e-42   0.024   1327-1552   2ebf X:875-1093  
A0A085VD62   2.67e-53   0.015   1690-1906   2ebf X:875-1093  
  7.85e-40   0.025   1323-1532   2ebf X:875-1093  
A0A085VFA5   2.43e-50   0.019   647-868   2ebf X:875-1093  
A0A087IM28   6.8e-75   0.0018   3855-4077   2ebf X:875-1093  
A0A089YRU1   4.81e-38   0.047   1188-1398   2ebf X:875-1093  
A0A089YS35   4.08e-31   0.019   617-830   2ebf X:875-1093  
A0A089Z1L6   5.75e-47   0.021   571-793   2ebf X:875-1093  
A0A098G247   1.41e-26   0.016   143-342   2ebf X:875-1093  
A0A098SVL0   5.23e-52   0.023   1695-1909   2ebf X:875-1093  
  4.13e-38   0.025   1297-1524   2ebf X:875-1093  
A0A098T2Y8   7.85e-53   0.016   656-879   2ebf X:875-1093  
A0A099SUA0   5.49e-28   0.024   150-318   2ebf X:875-1093  
A0A099SXB0   7.06e-60   0.037   1706-1928   2ebf X:875-1093  
  3.77e-52   0.012   1331-1561   2ebf X:875-1093  
A0A0A0LA99   0.0209   0.022   155-194   2ebf X:875-1093  
A0A0A2T5Y3   0.0000000000000162   0.02   69-276   2ebf X:875-1093  
A0A0A6DCA7   5.75e-31   0.014   713-926   2ebf X:875-1093  
A0A0A6DDL9   5.75e-31   0.03   696-909   2ebf X:875-1093  
A0A0A6FQT2   1.52e-22   0.0053   1322-1508   2ebf X:875-1093  
A0A0A8NXZ4   1.44e-70   0.0015   3211-3433   2ebf X:875-1093  
A0A0B1Z1D8   6.28e-36   0.044   412-631   2ebf X:875-1093  
  7.32e-24   0.023   113-334   2ebf X:875-1093  
A0A0B7DDF1   2.41e-30   0.039   712-912   2ebf X:875-1093  
A0A0B7DHE6   9.42e-31   0.017   708-919   2ebf X:875-1093  
A0A0C1X3G2   2.98e-34   0.022   710-925   2ebf X:875-1093  
A0A0C1ZRM5   8.89e-33   0.0053   709-922   2ebf X:875-1093  
A0A0C2AAY4   2.88e-24   0.01   1291-1477   2ebf X:875-1093  
A0A0C2EYL9   5.13e-25   0.019   1456-1638   2ebf X:875-1093  
A0A0C2F259   7.32e-47   0.061   173-375   2ebf X:875-1093  
A0A0C2I6M8   1.99e-37   0.014   516-742   2ebf X:875-1093  
  2.41e-37   0.011   217-423   2ebf X:875-1093  
A0A0C2MXA5   1.78e-50   0.014   1231-1458   2ebf X:875-1093  
  2.98e-39   0.014   704-906   2ebf X:875-1093  
A0A0C3KV45   0.0785   0.02   222-340   2ebf X:875-1093  
A0A0C7K6J4   0.00994   0.051   23-56   2ebf X:875-1093  
A0A0D0ILM0   1.05e-28   0.012   712-923   2ebf X:875-1093  
A0A0D0KAW4   1.57e-27   0.025   1574-1779   2ebf X:875-1093  
  8.89e-21   0.014   1250-1471   2ebf X:875-1093  
A0A0D0PX07   1.78e-25   0.0041   1798-1968   2ebf X:875-1093  
A0A0D0RWK7   5.75e-19   0.097   1178-1368   2ebf X:875-1093  
A0A0D0TK77   4.08e-38   0.019   682-890   2ebf X:875-1093  
A0A0D0TLP7   2.41e-48   0.026   1232-1460   2ebf X:875-1093  
  7.32e-31   0.0096   685-889   2ebf X:875-1093  
A0A0D0Y8L0   0.0335   0.019   220-333   2ebf X:875-1093  
A0A0D1PF01   2.62e-52   0.021   647-867   2ebf X:875-1093  
A0A0D1PMP7   5.49e-48   0.028   640-858   2ebf X:875-1093  
A0A0D9B113   6.28e-36   0.044   412-631   2ebf X:875-1093  
  4.19e-25   0.023   113-334   2ebf X:875-1093  
A0A0D9Z3L9   0.0262   0.035   52-110   2ebf X:875-1093  
A0A0E0GIH6   0.00994   0.035   52-110   2ebf X:875-1093  
A0A0E0NR69   0.0068   0.035   52-110   2ebf X:875-1093  
A0A0E2UGV7   3.4e-60   0.032   1704-1925   2ebf X:875-1093  
  8.37e-56   0.01   1331-1560   2ebf X:875-1093  
A0A0E3GYF4   1.05e-18   0.029   1154-1344   2ebf X:875-1093  
A0A0E3MKL6   1.78e-48   0.034   1233-1461   2ebf X:875-1093  
  1.46e-31   0.0064   685-885   2ebf X:875-1093  
A0A0E3MQF6   1.05e-39   0.018   681-889   2ebf X:875-1093  
A0A0F0FC03   8.37e-47   0.013   610-819   2ebf X:875-1093  
A0A0F0YPZ7   0.00994   0.051   23-56   2ebf X:875-1093  
A0A0F4IEI8   2.56e-20   0.015   223-424   2ebf X:875-1093  
A0A0F4SY21   2.14e-52   0.013   679-901   2ebf X:875-1093  
A0A0F4TQ32   5.75e-51   0.01   639-858   2ebf X:875-1093  
A0A0F4V7I6   1.2e-50   0.01   675-894   2ebf X:875-1093  
A0A0F5AVH8   2.17e-68   0.07   36-284   2ebf X:875-1093  
A0A0F6ZYD7   1.7e-65   0.019   1692-1913   2ebf X:875-1093  
  5.23e-55   0.014   1319-1547   2ebf X:875-1093  
A0A0G3LSB6   0.0167   0.018   33-69   2ebf X:875-1093  
A0A0G4Q7V9   0.000000942   0.011   973-1125   2ebf X:875-1093  
A0A0G4Q8P8   0.00000000628   0.0029   968-1134   2ebf X:875-1093  
A0A0H0Y272   2.98e-75   0.0018   3856-4077   2ebf X:875-1093  
A0A0H1AH46   6.8e-21   0.02   224-420   2ebf X:875-1093  
A0A0H5AET9   7.32e-43   0.063   1588-1774   2ebf X:875-1093  
  3.56e-22   0.013   1254-1481   2ebf X:875-1093  
A0A0J2GQ94   0.00994   0.051   23-56   2ebf X:875-1093  
A0A0J6G3M5   3.4e-49   0.021   1100-1313   2ebf X:875-1093  
A0A0J6HS42   9.68e-50   0.027   1101-1314   2ebf X:875-1093  
A0A0J6IAN6   9.94e-49   0.016   1104-1322   2ebf X:875-1093  
A0A0J9ST69   0.0314   0.04   91-196   2ebf X:875-1093  
A0A0J9TC17   0.0314   0.04   91-196   2ebf X:875-1093  
A0A0J9TUD1   0.0314   0.04   91-196   2ebf X:875-1093  
A0A0K1DW52   3.14e-60   0.032   1704-1925   2ebf X:875-1093  
  7.85e-56   0.01   1331-1560   2ebf X:875-1093  
A0A0K1QM64   1.05e-34   0.0084   680-889   2ebf X:875-1093  
A0A0L0AGF7   1.41e-31   0.015   607-820   2ebf X:875-1093  
A0A0L0AY19   3.92e-48   0.017   599-823   2ebf X:875-1093  
A0A0L0JRP1   7.85e-18   0.019   212-405   2ebf X:875-1093  
A0A0L0L630   1.73e-22   0.015   154-357   2ebf X:875-1093  
A0A0L1MBQ3   3.77e-35   0.011   693-907   2ebf X:875-1093  
  4.81e-33   0.012   1242-1451   2ebf X:875-1093  
A0A0L8INH4   4.19e-69   0.016   1715-1936   2ebf X:875-1093  
  1.62e-56   0.014   1342-1574   2ebf X:875-1093  
A0A0L8QGR2   1.1e-18   0.017   2-193   2ebf X:875-1093  
A0A0M9AVF5   2.09e-40   0.052   1587-1806   2ebf X:875-1093  
  4.81e-24   0.0088   1272-1489   2ebf X:875-1093  
A0A0M9D203   6.02e-70   0.0028   310-532   2ebf X:875-1093  
A0A0M9GH63   1.67e-26   0.029   1423-1631   2ebf X:875-1093  
A0A0N0F2N3   3.4e-64   0.029   1447-1666   2ebf X:875-1093  
  2.82e-55   0.014   1075-1298   2ebf X:875-1093  
A0A0N0F8I4   3.14e-60   0.032   1668-1889   2ebf X:875-1093  
  5.75e-48   0.014   1293-1517   2ebf X:875-1093  
A0A0N0FQM5   7.06e-60   0.037   1706-1928   2ebf X:875-1093  
  3.77e-52   0.012   1331-1561   2ebf X:875-1093  
A0A0N0FWZ5   3.92e-64   0.029   1649-1868   2ebf X:875-1093  
  3.24e-55   0.014   1277-1500   2ebf X:875-1093  
A0A0N0G2C8   5.75e-34   0.011   207-390   2ebf X:875-1093  
A0A0N0G2D6   0.0413   0.038   8-54   2ebf X:875-1093  
A0A0N0G5P4   4.97e-64   0.032   1701-1920   2ebf X:875-1093  
  1.15e-55   0.012   1329-1553   2ebf X:875-1093  
A0A0N0GCQ8   1.12e-60   0.032   1668-1890   2ebf X:875-1093  
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A0A0N0GL95   5.49e-64   0.032   1701-1920   2ebf X:875-1093  
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Q7N4E0   3.4e-74   0.0019   334-558   2ebf X:875-1093  
Q7PC42   6.54e-69   0.02   1712-1933   2ebf X:875-1093  
  1.26e-56   0.013   1339-1571   2ebf X:875-1093  
Q7R9P6   0.00889   0.038   31-112   2ebf X:875-1093  
Q7X1R1   4.97e-36   0.014   252-448   2ebf X:875-1093  
Q7X1T2   0.0000000000361   0.021   256-318   2ebf X:875-1093  
Q87VE3   3.14e-60   0.039   638-860   2ebf X:875-1093  
  1.46e-52   0.013   263-493   2ebf X:875-1093  
Q885V6   0.0413   0.038   8-54   2ebf X:875-1093  
Q9FZR0   0.0382   0.038   99-189   2ebf X:875-1093  
Q9JG49   0.0497   0.035   52-99   2ebf X:875-1093  
Q9L6W4   7.59e-34   0.011   256-439   2ebf X:875-1093  
R1H0Q2   0.0575   0.024   92-169   2ebf X:875-1093  
R5N880   0.0000732   0.046   26-113   2ebf X:875-1093  
R6YCD2   0.0575   0.01   51-88   2ebf X:875-1093  
R7AB95   0.0146   0.0079   42-114   2ebf X:875-1093  
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R7VJ98   0.0471   0.042   243-312   2ebf X:875-1093  
R9I9S2   0.0575   0.025   25-64   2ebf X:875-1093  
R9MXL7   0.00136   0.0075   69-151   2ebf X:875-1093  
S3MB49   1.36e-64   0.019   1713-1932   2ebf X:875-1093  
  2.09e-55   0.015   1338-1566   2ebf X:875-1093  
S3NXH3   0.00523   0.0099   15-92   2ebf X:875-1093  
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S6H3Y6   2.43e-50   0.019   647-868   2ebf X:875-1093  
S6HYZ3   1.96e-49   0.029   1101-1314   2ebf X:875-1093  
S6UU44   2.88e-61   0.032   479-700   2ebf X:875-1093  
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S7JS98   0.0575   0.024   98-175   2ebf X:875-1093  
S9P554   5.75e-17   0.091   42-196   2ebf X:875-1093  
T0P9P3   9.16e-71   0.005   324-546   2ebf X:875-1093  
T0PP68   2.72e-71   0.0024   3322-3544   2ebf X:875-1093  
U1SXF3   7.32e-42   0.017   1565-1777   2ebf X:875-1093  
  3.09e-31   0.013   1251-1472   2ebf X:875-1093  
U2JJB4   0.0246   0.027   42-88   2ebf X:875-1093  
U2JMH6   0.035   0.026   43-105   2ebf X:875-1093  
U4DU70   0.0575   0.042   6-51   2ebf X:875-1093  
U5QL02   0.011   0.022   60-125   2ebf X:875-1093  
U7QWC8   1.83e-70   0.0048   324-546   2ebf X:875-1093  
U9TKW8   0.0262   0.0086   259-339   2ebf X:875-1093  
U9TP07   0.0288   0.029   130-180   2ebf X:875-1093  
V0BB30   0.00994   0.051   23-56   2ebf X:875-1093  
V2TBQ5   0.00167   0.013   41-101   2ebf X:875-1093  
V5ZBK2   4.71e-75   0.03   1274-1497   2ebf X:875-1093  
V6TEQ0   0.0408   0.015   143-236   2ebf X:875-1093  
V7DYI3   1.18e-37   0.049   1582-1796   2ebf X:875-1093  
  2.35e-26   0.015   1269-1462   2ebf X:875-1093  
V7E2M6   2.14e-27   0.021   497-696   2ebf X:875-1093  
V7E6G2   2.46e-43   0.022   680-890   2ebf X:875-1093  
V7EEB1   1.05e-23   0.019   850-1050   2ebf X:875-1093  
V8R0L4   4.71e-33   0.0048   709-922   2ebf X:875-1093  
V8R9B1   5.49e-38   0.044   1587-1791   2ebf X:875-1093  
  2.46e-24   0.029   1259-1478   2ebf X:875-1093  
V9QX69   0.00000000000251   0.026   954-1151   2ebf X:875-1093  
V9RAK6   0.0785   0.0092   170-247   2ebf X:875-1093  
W0H395   1.54e-58   0.016   1699-1914   2ebf X:875-1093  
  6.54e-46   0.029   1319-1547   2ebf X:875-1093  
W0H529   8.89e-52   0.012   634-858   2ebf X:875-1093  
W0MV24   8.89e-37   0.014   181-377   2ebf X:875-1093  
W0N173   8.63e-61   0.021   1705-1924   2ebf X:875-1093  
  9.42e-54   0.013   1329-1554   2ebf X:875-1093  
W1V1S4   0.0785   0.016   18-50   2ebf X:875-1093  
W2DLH6   1.12e-38   0.04   1600-1793   2ebf X:875-1093  
  9.42e-29   0.0028   1267-1479   2ebf X:875-1093  
W2DNI9   8.89e-19   0.021   1169-1340   2ebf X:875-1093  
W2E3M8   5.13e-44   0.025   1592-1781   2ebf X:875-1093  
  1.1e-18   0.015   1262-1479   2ebf X:875-1093  
W4QNC7   0.0575   0.028   3-43   2ebf X:875-1093  
W6UWR4   1.46e-50   0.015   679-896   2ebf X:875-1093  
W6VFR3   1.67e-37   0.0029   708-923   2ebf X:875-1093  
W6VQC4   2.88e-53   0.017   349-573   2ebf X:875-1093  
W6VWZ0   6.28e-27   0.013   674-840   2ebf X:875-1093  
W8THW6   0.0398   0.013   19-121   2ebf X:875-1093  
X1E7A4   0.0178   0.032   45-85   2ebf X:875-1093  
X1M6H2   0.0408   0.022   4-58   2ebf X:875-1093  
X1QPU2   0.0732   0.019   4-58   2ebf X:875-1093  
X6PVW5   0.0178   0.027   43-89   2ebf X:875-1093  
X7S957   0.0439   0.015   27-73   2ebf X:875-1093  

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Select to display   Genome       Domains   Proteins
No Yes ALL   31 31
No Yes Pasteurella multocida subsp. multocida str. HN06   1 1
No Yes NCBI 2017_08 genome   2 2
No Yes Uniprot 2018_03 genome   13 13
No Yes PDB chains (SCOP 1.75) (PDB)   3 3
No Yes Protein Data Bank (all PDB sequenc)   4 4
No Yes SCOP2 SCOPe CATH ECOD (all domain sequ)   8 8

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