SUPERFAMILY 1.75 HMM library and genome assignments server

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YacF-like superfamily domain assignments
in
Uniprot 2018_03 genome

Assignment details

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Showing sequences 1 to 3000 of 3126
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Uniprot 2018_03 genome has 3126 significant domains in 3126 proteins.

     

Sequence ID   Evalue   Region   Family  
A0A010Q7H2   5.62e-81   3-250   YacF-like  
A0A011N0Y9   2.75e-88   1-253   YacF-like  
A0A011NZA0   1.09e-88   1-249   YacF-like  
A0A011PI10   1.28e-88   1-253   YacF-like  
A0A011QKV7   5.75e-89   1-249   YacF-like  
A0A011QM75   1.07e-87   1-250   YacF-like  
A0A014M1W4   1.09e-88   5-247   YacF-like  
A0A014M7R1   0.0000235   417-603   YacF-like  
A0A014QCS2   1.83e-83   1-250   YacF-like  
A0A016XE99   4.05e-83   1-250   YacF-like  
A0A017IRD9   3.01e-93   4-247   YacF-like  
A0A022FRC0   3.27e-84   1-250   YacF-like  
A0A022PNH7   7.45e-85   7-251   YacF-like  
A0A023REI6   4.84e-83   2-240   YacF-like  
A0A023V8Y7   3.92e-93   3-247   YacF-like  
A0A023YS78   7.45e-93   4-247   YacF-like  
A0A024KLA2   1.57e-92   4-247   YacF-like  
A0A025CLD6   7.45e-93   4-247   YacF-like  
A0A026V7J9   7.72e-93   4-247   YacF-like  
A0A027U2E7   7.72e-93   4-247   YacF-like  
A0A027ZZ03   7.72e-93   4-247   YacF-like  
A0A028E809   7.72e-93   4-247   YacF-like  
A0A029IDB9   4.97e-93   4-247   YacF-like  
A0A029J205   4.97e-93   4-247   YacF-like  
A0A031GVX1   4.97e-88   1-249   YacF-like  
A0A031HZB7   8.89e-85   1-250   YacF-like  
A0A034T302   7.06e-90   7-250   YacF-like  
A0A034TCM1   2.62e-93   1-245   YacF-like  
A0A034TR89   1.57e-93   1-245   YacF-like  
A0A038GME4   2.09e-87   1-249   YacF-like  
A0A059ICX2   1.16e-90   4-247   YacF-like  
A0A059KMU5   3.66e-71   1-250   YacF-like  
A0A059ZYL9   1.96e-53   17-263   YacF-like  
A0A060NKY4   9.94e-79   14-263   YacF-like  
A0A060NM34   1.31e-80   1-250   YacF-like  
A0A060P081   2.22e-88   1-249   YacF-like  
A0A060UJK7   6.15e-58   1-246   YacF-like  
A0A060UWC2   2.88e-92   4-247   YacF-like  
A0A060VGZ3   7.72e-91   4-247   YacF-like  
A0A061PG03   1.31e-93   1-245   YacF-like  
A0A061Q895   5.62e-82   2-223   YacF-like  
A0A062YE46   4.58e-93   4-247   YacF-like  
A0A063BFT8   1.44e-88   1-249   YacF-like  
A0A063UAL1   7.06e-84   1-248   YacF-like  
A0A064DGR1   3.79e-93   3-247   YacF-like  
A0A064TX81   5.75e-93   4-247   YacF-like  
A0A066PAY6   1.27e-92   3-247   YacF-like  
A0A066RQX0   1.31e-89   1-250   YacF-like  
A0A066TBP9   5.1e-59   4-215   YacF-like  
A0A066TEZ1   1.22e-79   1-245   YacF-like  
A0A066UU45   3.4e-93   3-245   YacF-like  
A0A067B410   4.45e-93   1-245   YacF-like  
A0A068H960   2.09e-92   4-247   YacF-like  
A0A068QVP8   1.27e-85   10-256   YacF-like  
A0A068QZI3   9.55e-84   6-252   YacF-like  
A0A068RAD5   2.62e-90   8-250   YacF-like  
A0A068YQV2   1.96e-87   23-272   YacF-like  
A0A068Z032   1.96e-90   8-250   YacF-like  
A0A069B4I7   6.67e-89   1-249   YacF-like  
A0A069CN87   1.06e-91   8-250   YacF-like  
A0A069I1P8   5.89e-86   1-250   YacF-like  
A0A069NYV8   1.96e-87   1-249   YacF-like  
A0A069PZK1   1.44e-87   1-249   YacF-like  
A0A069XVC4   1.07e-92   4-247   YacF-like  
A0A070FHK9   7.72e-93   4-247   YacF-like  
A0A070T1F5   7.72e-93   4-247   YacF-like  
A0A070V8M1   7.72e-93   4-247   YacF-like  
A0A071LXM4   1.44e-87   4-247   YacF-like  
A0A071MJ87   4.58e-89   1-249   YacF-like  
A0A072TAD4   3.79e-85   1-250   YacF-like  
A0A072TBM3   1.57e-88   1-250   YacF-like  
A0A073GEF2   7.72e-93   4-247   YacF-like  
A0A073HVZ9   1.57e-93   4-247   YacF-like  
A0A073KU11   6.8e-85   2-243   YacF-like  
A0A073ULU3   1.57e-93   4-247   YacF-like  
A0A074I9W8   7.72e-93   4-247   YacF-like  
A0A074W1M5   1.03e-69   3-246   YacF-like  
A0A075P8V4   4.18e-78   2-250   YacF-like  
A0A076LQ97   7.06e-90   7-250   YacF-like  
A0A076PNT3   1.05e-86   1-250   YacF-like  
A0A077DIM3   4.18e-57   1-249   YacF-like  
A0A077N9I5   2.22e-86   6-252   YacF-like  
A0A077NJ52   2.22e-86   6-252   YacF-like  
A0A077NPQ5   2.35e-86   6-252   YacF-like  
A0A077NT34   3.4e-86   6-252   YacF-like  
A0A077P4A0   1.96e-86   6-252   YacF-like  
A0A077PXX1   1.31e-85   6-252   YacF-like  
A0A077QMG4   6.02e-87   6-252   YacF-like  
A0A077ZIS2   2.75e-85   1-233   YacF-like  
A0A078BD39   6.93e-87   1-249   YacF-like  
A0A078KZI7   6.54e-38   16-246   YacF-like  
A0A078LLC1   3.01e-93   3-247   YacF-like  
A0A080G9L6   7.72e-93   4-247   YacF-like  
A0A080JFR2   7.72e-93   4-247   YacF-like  
A0A080JXK1   3.14e-69   3-246   YacF-like  
A0A080K3Y1   1.31e-28   4-136   YacF-like  
A0A080LUZ7   9.02e-89   1-249   YacF-like  
A0A080M7S4   2.35e-89   1-249   YacF-like  
A0A080NWY8   7.98e-85   1-250   YacF-like  
A0A081JA75   3.79e-85   1-250   YacF-like  
A0A081RWV9   9.29e-86   7-251   YacF-like  
A0A084A502   3.14e-92   7-250   YacF-like  
A0A084CP84   5.23e-85   3-244   YacF-like  
A0A084DHT2   6.15e-90   1-249   YacF-like  
A0A084IP39   4.05e-66   7-254   YacF-like  
A0A084TG86   9.42e-94   4-245   YacF-like  
A0A084Y1P5   4.58e-89   1-249   YacF-like  
A0A085ABT3   5.36e-91   3-247   YacF-like  
A0A085FKY8   4.97e-89   1-249   YacF-like  
A0A085GJT4   1.14e-89   3-247   YacF-like  
A0A085GN13   1.96e-90   6-250   YacF-like  
A0A085GQ16   8.24e-92   6-250   YacF-like  
A0A085HGL9   1.83e-89   7-250   YacF-like  
A0A085IDF4   1.2e-91   3-247   YacF-like  
A0A085JJL0   1.7e-86   3-247   YacF-like  
A0A085SFH1   1.57e-92   1-245   YacF-like  
A0A085TMB6   1.03e-92   1-245   YacF-like  
A0A085UBC3   3.66e-91   6-250   YacF-like  
A0A086EF16   2.35e-91   6-250   YacF-like  
A0A086G883   3.14e-90   7-250   YacF-like  
A0A086INA4   2.09e-91   4-247   YacF-like  
A0A086WBL4   1.83e-89   1-249   YacF-like  
A0A086WK04   6.41e-92   1-245   YacF-like  
A0A087ID64   8.76e-93   1-245   YacF-like  
A0A087L7T1   1.7e-91   8-250   YacF-like  
A0A087NPG4   3.66e-89   1-249   YacF-like  
A0A088ABU0   6.8e-22   2-99   YacF-like  
A0A088TKK0   9.55e-89   1-249   YacF-like  
A0A088UP71   5.23e-90   1-249   YacF-like  
A0A088WUU9   3.53e-89   1-249   YacF-like  
A0A089HF98   8.63e-93   3-247   YacF-like  
A0A089Q0F0   2.22e-89   4-247   YacF-like  
A0A089VB96   2.35e-86   7-249   YacF-like  
A0A090AGG8   3.27e-72   4-254   YacF-like  
A0A090IIX4   1.02e-86   7-248   YacF-like  
A0A090NK64   2.48e-93   4-247   YacF-like  
A0A090P4B6   9.81e-32   2-102   YacF-like  
A0A090P7C1   2.48e-33   1-110   YacF-like  
A0A090QW81   8.63e-89   2-243   YacF-like  
A0A090R4V2   2.75e-67   2-195   YacF-like  
A0A090S163   0.000000000000068   1-53   YacF-like  
A0A090SAN0   0.00000000000484   2-40   YacF-like  
A0A090SBI8   1.7e-66   4-184   YacF-like  
A0A090SPJ0   2.48e-58   4-161   YacF-like  
A0A090TBZ9   1.83e-78   4-218   YacF-like  
A0A090U2C0   3.92e-93   3-247   YacF-like  
A0A090UZ62   1.15e-90   3-247   YacF-like  
A0A093SSN9   2.88e-91   6-250   YacF-like  
A0A093SVK6   5.36e-91   6-250   YacF-like  
A0A094IPK6   1.16e-75   9-253   YacF-like  
A0A094IU85   1.44e-74   7-252   YacF-like  
A0A094JDQ7   1.26e-75   2-237   YacF-like  
A0A094S509   1.44e-91   6-250   YacF-like  
A0A094SGH6   2.09e-91   6-250   YacF-like  
A0A094TI94   3.66e-84   6-250   YacF-like  
A0A095DUN9   1.44e-88   1-249   YacF-like  
A0A095E4M5   5.62e-89   1-249   YacF-like  
A0A095U7L1   9.68e-90   4-247   YacF-like  
A0A095UXU1   2.75e-84   1-248   YacF-like  
A0A095VZV9   1.24e-89   1-249   YacF-like  
A0A095Z6W9   3.27e-62   1-251   YacF-like  
A0A096F690   1.44e-85   1-250   YacF-like  
A0A096FNR8   1.57e-86   1-250   YacF-like  
A0A096YLT8   4.58e-89   1-249   YacF-like  
A0A097R5X0   1.96e-90   6-250   YacF-like  
A0A098G4C4   3.01e-47   16-246   YacF-like  
A0A098GFX7   5.36e-36   17-246   YacF-like  
A0A098UEB2   8.37e-89   1-249   YacF-like  
A0A099KMU7   1.07e-74   1-250   YacF-like  
A0A099KXG6   4.18e-74   1-250   YacF-like  
A0A099LE63   1.83e-72   3-248   YacF-like  
A0A099LP16   9.94e-92   1-245   YacF-like  
A0A0A0BJE5   3.66e-69   1-234   YacF-like  
A0A0A0CPY2   7.32e-85   6-250   YacF-like  
A0A0A0DVH4   3.4e-81   1-251   YacF-like  
A0A0A0F4Q3   7.72e-93   4-247   YacF-like  
A0A0A0XSF1   7.45e-84   3-251   YacF-like  
A0A0A0Z1K4   3.79e-91   3-247   YacF-like  
A0A0A1B2U6   1.03e-90   4-247   YacF-like  
A0A0A1FL45   6.67e-89   1-249   YacF-like  
A0A0A1GZ74   0.000000000275   2-49   YacF-like  
A0A0A1H799   1.57e-84   10-258   YacF-like  
A0A0A1RB67   3.27e-92   3-247   YacF-like  
A0A0A1VI01   1.57e-85   16-265   YacF-like  
A0A0A2N7K5   6.41e-79   1-248   YacF-like  
A0A0A2RTR3   2.09e-83   7-250   YacF-like  
A0A0A2STJ1   2.09e-49   5-246   YacF-like  
A0A0A3YQA8   7.85e-90   3-247   YacF-like  
A0A0A3YS49   6.28e-88   3-247   YacF-like  
A0A0A4ANH5   2.35e-86   7-249   YacF-like  
A0A0A5I738   1.24e-90   1-245   YacF-like  
A0A0A5JK16   5.23e-91   1-245   YacF-like  
A0A0A5KPN9   2.35e-90   7-250   YacF-like  
A0A0A6F0I5   9.29e-93   3-247   YacF-like  
A0A0A6Q782   9.55e-90   1-249   YacF-like  
A0A0A6QQ88   4.71e-91   1-245   YacF-like  
A0A0A6W514   5.49e-90   3-247   YacF-like  
A0A0A6ZM92   8.89e-86   1-233   YacF-like  
A0A0A7RYC6   5.1e-78   6-253   YacF-like  
A0A0A8BXX4   9.29e-87   1-249   YacF-like  
A0A0A8FGW3   1.12e-86   7-249   YacF-like  
A0A0A8NUA7   5.62e-84   6-252   YacF-like  
A0A0A8UB70   7.72e-93   4-247   YacF-like  
A0A0A8UT84   1.96e-37   18-246   YacF-like  
A0A0B0H7S6   3.14e-72   4-254   YacF-like  
A0A0B1R6X5   2.22e-90   3-247   YacF-like  
A0A0B1XZB9   2.09e-88   1-250   YacF-like  
A0A0B1YVS6   3.53e-89   1-249   YacF-like  
A0A0B1ZG05   1.83e-88   1-250   YacF-like  
A0A0B2BHM4   1.44e-89   1-249   YacF-like  
A0A0B2T8D8   9.68e-92   6-250   YacF-like  
A0A0B3T2S2   2.22e-86   1-249   YacF-like  
A0A0B3YI36   2.75e-82   3-250   YacF-like  
A0A0B5FDG8   3.27e-86   1-249   YacF-like  
A0A0B5ICN1   4.97e-91   4-247   YacF-like  
A0A0B6FHW6   1.96e-91   6-250   YacF-like  
A0A0B6RVA5   7.19e-90   1-249   YacF-like  
A0A0B6XCJ2   2.22e-86   6-252   YacF-like  
A0A0B7GE91   2.62e-91   4-247   YacF-like  
A0A0B7J1A2   9.55e-83   1-248   YacF-like  
A0A0B7J9H9   5.36e-87   1-245   YacF-like  
A0A0B8NWT9   4.05e-88   15-258   YacF-like  
A0A0B8P616   1.18e-54   5-150   YacF-like  
A0A0B8PAU2   7.45e-24   2-82   YacF-like  
A0A0B8PW08   4.05e-88   15-258   YacF-like  
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A1TRY0   0.0314   68-133   YacF-like  
A3D4G3   0.0275   11-54   YacF-like  
A3T2I0   0.0288   176-262   YacF-like  
A3Z3E2   0.051   176-256   YacF-like  
A4CT89   0.0458   244-307   YacF-like  
A4HHJ7   0.0196   151-296   YacF-like  
A4HVL0   0.0314   79-136   YacF-like  
A4WCZ6   0.000196   374-560   YacF-like  
A5KA45   0.0602   1070-1224   YacF-like  
A5KR42   0.0288   29-127   YacF-like  
A5TT22   0.0157   187-230   YacF-like  
A6QXC4   0.0275   59-114   YacF-like  
A6X3N7   0.0706   48-139   YacF-like  
A6ZPZ2   0.00549   456-539   YacF-like  
A7GVR0   0.0102   160-207   YacF-like  
A7SQM2   0.00131   138-213   YacF-like  
A7XFB0   0.000432   67-114   YacF-like  
A8J2N7   0.00837   91-154   YacF-like  
A8T3P7   0.0314   30-118   YacF-like  
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A9UTG6   0.0549   128-254   YacF-like  
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B2J3N6   0.0549   31-155   YacF-like  
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B4X3K6   0.0051   206-284   YacF-like  
B5VLI8   0.0248   456-539   YacF-like  
B5W5U0   0.0575   285-344   YacF-like  
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B6ACX9   0.0458   196-248   YacF-like  
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B7KCM4   0.017   31-92   YacF-like  
B7PB19   0.0405   232-306   YacF-like  
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C0QRV7   0.0902   13-79   YacF-like  
C0RBQ2   0.0209   169-228   YacF-like  
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C2N4J2   0.00209   84-161   YacF-like  
C2PPS7   0.0288   245-320   YacF-like  
C2RBP7   0.00122   46-123   YacF-like  
C2SCJ0   0.0157   69-149   YacF-like  
C2SDZ4   0.0288   245-320   YacF-like  
C2T4F4   0.000366   84-159   YacF-like  
C2UYT7   0.0745   91-169   YacF-like  
C2XN00   0.0209   245-320   YacF-like  
C2Z1S9   0.0719   245-319   YacF-like  
C3DN82   0.0641   14-100   YacF-like  
C3E6U8   0.00262   92-159   YacF-like  
C3ED21   0.000811   84-162   YacF-like  
C3H4L1   0.000484   81-159   YacF-like  
C3RZ93   0.0327   302-406   YacF-like  
C3RZ94   0.0392   302-406   YacF-like  
C3YWC4   0.0955   209-296   YacF-like  
C4FLD4   0.0366   223-293   YacF-like  
C4L824   0.0732   424-488   YacF-like  
C4M398   0.0275   33-99   YacF-like  
C4MYX4   0.000432   67-114   YacF-like  
C4WRC3   0.00719   48-141   YacF-like  
C5B4F3   0.0667   273-338   YacF-like  
C5B7B6   0.0248   70-142   YacF-like  
C5CU09   0.0248   177-235   YacF-like  
C5M8K7   0.0929   264-297   YacF-like  
C5XU02   0.0209   6-77   YacF-like  
C5ZW04   0.0222   208-283   YacF-like  
C5ZXP6   0.0314   143-221   YacF-like  
C7D7K0   0.0209   30-90   YacF-like  
C7GKY3   0.0248   456-539   YacF-like  
C7LS02   0.0458   212-313   YacF-like  
C7RQV6   0.0288   15-85   YacF-like  
C8ZBI2   0.0248   456-539   YacF-like  
C9A2J5   0.0471   41-86   YacF-like  
C9AMN2   0.0432   250-279   YacF-like  
C9B503   0.0445   253-282   YacF-like  
C9BB27   0.0445   253-282   YacF-like  
D0IQF9   0.0109   20-65   YacF-like  
D0N4Y1   0.034   225-267   YacF-like  
D0NWK8   0.085   225-261   YacF-like  
D1A5L0   0.0654   202-279   YacF-like  
D1C5H7   0.0405   23-93   YacF-like  
D1JQM7   0.0772   15-104   YacF-like  
D1JX81   0.0523   254-316   YacF-like  
D1W4J4   0.00209   59-128   YacF-like  
D1W6H7   0.0759   46-160   YacF-like  
D2VYY2   0.0772   266-311   YacF-like  
D2XDZ0   0.0112   2-47   YacF-like  
D4A444   0.0144   27-78   YacF-like  
D4QLD5   0.0458   253-282   YacF-like  
D4WM54   0.0562   160-189   YacF-like  
D4X9H7   0.085   50-94   YacF-like  
D5A3R8   0.0157   436-494   YacF-like  
D6AYA0   0.0693   289-392   YacF-like  
D6X0I2   0.0262   164-242   YacF-like  
D6YUC5   0.0327   213-268   YacF-like  
D7GPC7   0.0732   266-335   YacF-like  
D7WPI8   0.00915   45-139   YacF-like  
D9S2J0   0.0196   83-160   YacF-like  
E0PZ49   0.0144   24-95   YacF-like  
E1JH56   0.0588   85-149   YacF-like  
E1WK72   0.0772   15-104   YacF-like  
E1WLY5   0.0523   254-316   YacF-like  
E2AIL8   0.0497   101-201   YacF-like  
E3M184   0.00432   195-256   YacF-like  
E3QVK1   0.0693   141-198   YacF-like  
E4SI28   0.0327   16-75   YacF-like  
E4VV10   0.0458   253-316   YacF-like  
E5ARP7   0.0889   6-89   YacF-like  
E5WR05   0.0523   48-103   YacF-like  
E6PFH4   0.00602   89-161   YacF-like  
E6Q4R5   0.0116   90-161   YacF-like  
E7EV89   0.0144   435-534   YacF-like  
E7GU75   0.017   29-105   YacF-like  
E7KQH4   0.0235   456-539   YacF-like  
E8U0I2   0.00562   68-130   YacF-like  
E9BBE5   0.0471   79-134   YacF-like  
E9HKB2   0.00288   188-258   YacF-like  
E9QJ98   0.0366   231-342   YacF-like  
E9QVQ0   0.0955   57-108   YacF-like  
F0QRB4   0.0549   146-211   YacF-like  
F0SNG7   0.0405   60-107   YacF-like  
F0TDV8   0.0314   16-75   YacF-like  
F0WWJ1   0.0235   28-88   YacF-like  
F1QB52   0.00693   68-201   YacF-like  
F2AZG8   0.0288   324-409   YacF-like  
F2LYX8   0.0327   16-75   YacF-like  
F2QYN0   0.0549   91-178   YacF-like  
F2RFA3   0.0288   136-200   YacF-like  
F2UPJ6   0.0034   91-134   YacF-like  
F2Z670   0.0124   221-333   YacF-like  
F3AWY4   0.0288   29-127   YacF-like  
F3C4S0   0.0745   292-375   YacF-like  

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Select to display   Genome       Domains   Proteins
No Yes ALL   33263 33263
No Yes Rhodnius prolixus 22   1 1
No Yes Solanum lycopersicum v.2.3 Tomato 1 1
No Yes Acidithiobacillus ferrivorans SS3   1 1
No Yes Acidithiobacillus caldus SM-1   1 1
No Yes Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993   1 1
No Yes Dechloromonas aromatica RCB   1 1
No Yes Thauera sp. MZ1T   1 1
No Yes Azoarcus sp. KH32C   1 1
No Yes Azoarcus sp. BH72   1 1
No Yes Aromatoleum aromaticum EbN1   1 1
No Yes Dechlorosoma suillum PS   1 1
No Yes Pseudogulbenkiania sp. NH8B   1 1
No Yes Laribacter hongkongensis HLHK9   1 1
No Yes Chromobacterium violaceum ATCC 12472   1 1
No Yes Candidatus Accumulibacter phosphatis clade IIA str. UW-1   1 1
No Yes beta proteobacterium CB   1 1
No Yes Methylibium petroleiphilum PM1   1 1
No Yes Thiomonas arsenitoxydans   1 1
No Yes Thiomonas intermedia K12   1 1
No Yes Rubrivivax gelatinosus IL144   1 1
No Yes Leptothrix cholodnii SP-6   1 1
No Yes Burkholderia rhizoxinica HKI 454   1 1
No Yes Burkholderia phytofirmans PsJN   1 1
No Yes Burkholderia phymatum STM815   1 1
No Yes Burkholderia xenovorans LB400   1 1
No Yes Ralstonia eutropha JMP134   1 1
No Yes Cupriavidus taiwanensis LMG 19424   1 1
No Yes Cupriavidus metallidurans CH34   1 1
No Yes Cupriavidus necator N-1   1 1
No Yes Ralstonia eutropha H16   1 1
No Yes Ralstonia pickettii 12D   1 1
No Yes Ralstonia solanacearum CFBP2957   1 1
No Yes Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1   1 1
No Yes Burkholderia sp. RPE64   1 1
No Yes Burkholderia sp. CCGE1002   1 1
No Yes Burkholderia thailandensis E264   1 1
No Yes Burkholderia pseudomallei 1106a   1 1
No Yes Burkholderia mallei SAVP1   1 1
No Yes Burkholderia ambifaria AMMD   1 1
No Yes Burkholderia cenocepacia HI2424   1 1
No Yes Burkholderia multivorans ATCC 17616   1 1
No Yes Burkholderia vietnamiensis G4   1 1
No Yes Burkholderia gladioli BSR3   1 1
No Yes Burkholderia glumae BGR1   1 1
No Yes Verminephrobacter eiseniae EF01-2   1 1
No Yes Alicycliphilus denitrificans K601   1 1
No Yes Ramlibacter tataouinensis TTB310   1 1
No Yes Delftia sp. Cs1-4   1 1
No Yes Delftia acidovorans SPH-1   1 1
No Yes Polaromonas sp. JS666   1 1
No Yes Polaromonas naphthalenivorans CJ2   1 1
No Yes Variovorax paradoxus S110   1 1
No Yes Rhodoferax ferrireducens T118   1 1
No Yes Acidovorax ebreus TPSY   1 1
No Yes Acidovorax sp. KKS102   1 1
No Yes Acidovorax sp. JS42   1 1
No Yes Acidovorax citrulli AAC00-1   1 1
No Yes Acidovorax avenae subsp. avenae ATCC 19860   1 1
No Yes Comamonas testosteroni CNB-2   1 1
No Yes Herminiimonas arsenicoxydans   1 1
No Yes Collimonas fungivorans Ter331   1 1
No Yes Janthinobacterium sp. Marseille   1 1
No Yes Herbaspirillum seropedicae SmR1   1 1
No Yes Pusillimonas sp. T7-7   1 1
No Yes Advenella kashmirensis WT001   1 1
No Yes Taylorella asinigenitalis MCE3   1 1
No Yes Taylorella equigenitalis MCE9   1 1
No Yes Bordetella petrii DSM 12804   1 1
No Yes Bordetella avium 197N   1 1
No Yes Bordetella pertussis Tohama I   1 1
No Yes Bordetella parapertussis 12822   1 1
No Yes Bordetella bronchiseptica RB50   1 1
No Yes Achromobacter xylosoxidans A8   1 1
No Yes Achromobacter xylosoxidans   1 1
No Yes Thiobacillus denitrificans ATCC 25259   1 1
No Yes Nitrosospira multiformis ATCC 25196   1 1
No Yes Nitrosomonas sp. Is79A3   1 1
No Yes Nitrosomonas eutropha C91   1 1
No Yes Nitrosomonas europaea ATCC 19718   1 1
No Yes Sideroxydans lithotrophicus ES-1   1 1
No Yes Gallionella capsiferriformans ES-2   1 1
No Yes Methylotenera versatilis 301   1 1
No Yes Methylotenera mobilis JLW8   1 1
No Yes Methylovorus sp. MP688   1 1
No Yes Methylovorus glucosetrophus SIP3-4   1 1
No Yes Methylobacillus flagellatus KT   1 1
No Yes Oceanimonas sp. GK1   1 1
No Yes Aeromonas veronii B565   1 1
No Yes Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449   1 1
No Yes Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966   1 1
No Yes Aliivibrio salmonicida LFI1238   1 1
No Yes Vibrio fischeri MJ11   1 1
No Yes Vibrio sp. Ex25   1 1
No Yes Vibrio harveyi ATCC BAA-1116   1 1
No Yes Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633   1 1
No Yes Vibrio splendidus LGP32   1 1
No Yes Vibrio anguillarum 775   1 1
No Yes Vibrio furnissii NCTC 11218   1 1
No Yes Vibrio vulnificus MO6-24/O   1 1
No Yes Vibrio cholerae O395   1 1
No Yes Photobacterium profundum SS9   1 1
No Yes Psychromonas ingrahamii 37   1 1
No Yes Psychromonas sp. CNPT3   1 1
No Yes Idiomarina loihiensis L2TR   1 1
No Yes Ferrimonas balearica DSM 9799   1 1
No Yes Shewanella piezotolerans WP3   1 1
No Yes Shewanella loihica PV-4   1 1
No Yes Shewanella halifaxensis HAW-EB4   1 1
No Yes Shewanella sediminis HAW-EB3   1 1
No Yes Shewanella denitrificans OS217   1 1
No Yes Shewanella pealeana ATCC 700345   1 1
No Yes Shewanella oneidensis MR-1   1 1
No Yes Shewanella baltica OS185   1 1
No Yes Shewanella woodyi ATCC 51908   1 1
No Yes Shewanella sp. MR-4   1 1
No Yes Shewanella amazonensis SB2B   1 1
No Yes Shewanella violacea DSS12   1 1
No Yes Shewanella frigidimarina NCIMB 400   1 1
No Yes Shewanella putrefaciens CN-32   1 1
No Yes Colwellia psychrerythraea 34H   1 1
No Yes Pseudoalteromonas atlantica T6c   1 1
No Yes Glaciecola sp. 4H-3-7+YE-5   1 1
No Yes Glaciecola nitratireducens FR1064   1 1
No Yes Alteromonas sp. SN2   1 1
No Yes Alteromonas macleodii str. 'Deep ecotype'   1 1
No Yes Kangiella koreensis DSM 16069   1 1
No Yes Methylomicrobium alcaliphilum   1 1
No Yes Methylomonas methanica MC09   1 1
No Yes Methylococcus capsulatus str. Bath   1 1
No Yes Dichelobacter nodosus VCS1703A   1 1
No Yes Halothiobacillus neapolitanus c2   1 1
No Yes Spiribacter sp. UAH-SP71   1 1
No Yes Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1   1 1
No Yes Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7   1 1
No Yes Thioalkalivibrio sp. K90mix   1 1
No Yes Halorhodospira halophila SL1   1 1
No Yes Allochromatium vinosum DSM 180   1 1
No Yes Thiocystis violascens DSM 198   1 1
No Yes Nitrosococcus halophilus Nc4   1 1
No Yes Coxiella burnetii Dugway 5J108-111   1 1
No Yes Legionella pneumophila str. Corby   1 1
No Yes Photorhabdus asymbiotica   1 1
No Yes Photorhabdus luminescens subsp. laumondii TTO1   1 1
No Yes Xenorhabdus bovienii SS-2004   1 1
No Yes Xenorhabdus nematophila ATCC 19061   1 1
No Yes Providencia stuartii MRSN 2154   1 1
No Yes Proteus mirabilis HI4320   1 1
No Yes Edwardsiella ictaluri 93-146   1 1
No Yes Edwardsiella tarda EIB202   1 1
No Yes Rahnella sp. Y9602   1 1
No Yes Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071   1 1
No Yes Yersinia pseudotuberculosis IP 31758   1 1
No Yes Yersinia pestis Pestoides F   1 1
No Yes Yersinia enterocolitica subsp. enterocolitica 8081   1 1
No Yes Serratia sp. AS12   1 1
No Yes Serratia sp. ATCC 39006   1 1
No Yes Serratia plymuthica AS9   1 1
No Yes Serratia proteamaculans 568   1 1
No Yes Dickeya dadantii Ech703   1 1
No Yes Dickeya zeae Ech1591   1 1
No Yes Pectobacterium wasabiae WPP163   1 1
No Yes Pectobacterium sp. SCC3193   1 1
No Yes Pectobacterium atrosepticum SCRI1043   1 1
No Yes Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1   1 1
No Yes Sodalis glossinidius str. 'morsitans'   1 1
No Yes Halyomorpha halys symbiont   1 1
No Yes Pantoea sp. At-9b   1 1
No Yes Pantoea vagans C9-1   1 1
No Yes Pantoea ananatis LMG 20103   1 1
No Yes Erwinia tasmaniensis Et1/99   1 1
No Yes Erwinia sp. Ejp617   1 1
No Yes Erwinia billingiae Eb661   1 1
No Yes Erwinia pyrifoliae Ep1/96   1 1
No Yes Erwinia amylovora ATCC 49946   1 1
No Yes Escherichia blattae DSM 4481   1 1
No Yes Cronobacter turicensis z3032   1 1
No Yes Cronobacter sakazakii ES15   1 1
No Yes secondary endosymbiont of Ctenarytaina eucalypti   1 1
No Yes Candidatus Hamiltonella defensa 5AT (Acyrthosiphon pisum)   1 1
No Yes Enterobacteriaceae bacterium strain FGI 57   1 1
No Yes Shigella sonnei Ss046   1 1
No Yes Shigella flexneri 5 str. 8401   1 1
No Yes Shigella dysenteriae Sd197   1 1
No Yes Shigella boydii CDC 3083-94   1 1
No Yes Salmonella bongori NCTC 12419   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594   1 1
No Yes Klebsiella oxytoca E718   1 1
No Yes Klebsiella variicola At-22   1 1
No Yes Klebsiella pneumoniae NTUH-K2044   1 1
No Yes Enterobacter aerogenes KCTC 2190   1 1
No Yes Escherichia fergusonii ATCC 35469   1 1
No Yes Escherichia coli 'BL21-Gold(DE3)pLysS AG'   1 1
No Yes Enterobacter sp. R4-368   1 1
No Yes Enterobacter sp. 638   1 1
No Yes Enterobacter asburiae LF7a   1 1
No Yes Enterobacter cloacae subsp. dissolvens SDM   1 1
No Yes Citrobacter rodentium ICC168   1 1
No Yes Citrobacter koseri ATCC BAA-895   1 1
No Yes Methylophaga sp. JAM1   1 1
No Yes Cycloclasticus sp. P1   1 1
No Yes Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270   1 1
No Yes Candidatus Kinetoplastibacterium oncopeltii TCC290E   1 1
No Yes Candidatus Kinetoplastibacterium galatii TCC219   1 1
No Yes Candidatus Kinetoplastibacterium desouzaii TCC079E   1 1
No Yes Kinetoplastibacterium blastocrithidii Candidatus (ex Strigomonas culicis)   1 1
No Yes Kinetoplastibacterium blastocrithidii Candidatus TCC012E   1 1
No Yes Candidatus Kinetoplastibacterium crithidii (ex Angomonas deanei ATCC 30255)   1 1
No Yes Candidatus Kinetoplastibacterium crithidii TCC036E   1 1
No Yes Burkholderia phenoliruptrix BR3459a   1 1
No Yes Pandoraea pnomenusa 3kgm   1 1
No Yes Ralstonia pickettii 12J   1 1
No Yes Ralstonia solanacearum FQY_4   1 1
No Yes Ralstonia solanacearum Po82   1 1
No Yes Ralstonia solanacearum PSI07   1 1
No Yes Ralstonia solanacearum CMR15   1 1
No Yes Ralstonia solanacearum GMI1000   1 1
No Yes Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1   1 1
No Yes Burkholderia sp. YI23   1 1
No Yes Burkholderia sp. CCGE1003   1 1
No Yes Burkholderia sp. CCGE1001   1 1
No Yes Burkholderia sp. KJ006   1 1
No Yes Burkholderia thailandensis MSMB121   1 1
No Yes Burkholderia pseudomallei MSHR305   1 1
No Yes Burkholderia pseudomallei NCTC 13179   1 1
No Yes Burkholderia pseudomallei BPC006   1 1
No Yes Burkholderia pseudomallei 1026b   1 1
No Yes Burkholderia pseudomallei MSHR346   1 1
No Yes Burkholderia pseudomallei 668   1 1
No Yes Burkholderia pseudomallei 1710b   1 1
No Yes Burkholderia pseudomallei K96243   1 1
No Yes Burkholderia mallei NCTC 10229   1 1
No Yes Burkholderia mallei NCTC 10247   1 1
No Yes Burkholderia mallei ATCC 23344   1 1
No Yes Burkholderia lata   1 1
No Yes Burkholderia ambifaria MC40-6   1 1
No Yes Burkholderia cenocepacia MC0-3   1 1
No Yes Burkholderia cenocepacia AU 1054   1 1
No Yes Burkholderia cenocepacia J2315   1 1
No Yes Burkholderia multivorans ATCC 17616   1 1
No Yes Burkholderia cepacia GG4   1 1
No Yes Candidatus Symbiobacter mobilis Comamonadaceae bacterium CR   1 1
No Yes Alicycliphilus denitrificans BC   1 1
No Yes Variovorax paradoxus B4   1 1
No Yes Variovorax paradoxus EPS   1 1
No Yes Taylorella asinigenitalis 14/45   1 1
No Yes Taylorella equigenitalis 14/56   1 1
No Yes Taylorella equigenitalis ATCC 35865   1 1
No Yes Bordetella pertussis CS   1 1
No Yes Bordetella parapertussis 18323   1 1
No Yes Bordetella parapertussis Bpp5   1 1
No Yes Bordetella bronchiseptica MO149   1 1
No Yes Bordetella bronchiseptica 253   1 1
No Yes Achromobacter xylosoxidans NBRC 15126 = ATCC 27061   1 1
No Yes Nitrosomonas sp. AL212   1 1
No Yes Sulfuricella denitrificans skB26   1 1
No Yes Aeromonas hydrophila ML09-119   1 1
No Yes Vibrio fischeri ES114   1 1
No Yes Vibrio sp. EJY3   1 1
No Yes Vibrio parahaemolyticus BB22OP   1 1
No Yes Vibrio alginolyticus NBRC 15630 = ATCC 17749   1 1
No Yes Vibrio anguillarum Listonella anguillarum M3   1 1
No Yes Vibrio nigripulchritudo VibrioScope   1 1
No Yes Vibrio vulnificus CMCP6   1 1
No Yes Vibrio vulnificus YJ016   1 1
No Yes Vibrio cholerae LMA3984-4   1 1
No Yes Vibrio cholerae M66-2   1 1
No Yes Vibrio cholerae O395   1 1
No Yes Vibrio cholerae IEC224   1 1
No Yes Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786   1 1
No Yes Vibrio cholerae MJ-1236   1 1
No Yes Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961   1 1
No Yes Idiomarina loihiensis GSL 199   1 1
No Yes Shewanella sp. W3-18-1   1 1
No Yes Shewanella sp. ANA-3   1 1
No Yes Shewanella baltica BA175   1 1
No Yes Shewanella baltica OS678   1 1
No Yes Shewanella baltica OS117   1 1
No Yes Shewanella baltica OS223   1 1
No Yes Shewanella baltica OS195   1 1
No Yes Shewanella baltica OS155   1 1
No Yes Shewanella sp. MR-7   1 1
No Yes Shewanella putrefaciens 200   1 1
No Yes Glaciecola psychrophila 170   1 1
No Yes Alteromonas macleodii str. 'Ionian Sea UM4b'   1 1
No Yes Alteromonas macleodii str. 'Ionian Sea UM7'   1 1
No Yes Alteromonas macleodii str. 'Ionian Sea U8'   1 1
No Yes Alteromonas macleodii str. 'Ionian Sea U7'   1 1
No Yes Alteromonas macleodii str. 'Ionian Sea U4'   1 1
No Yes Alteromonas macleodii str. 'Aegean Sea MED64'   1 1
No Yes Alteromonas macleodii str. 'English Channel 615'   1 1
No Yes Alteromonas macleodii AltDE1   1 1
No Yes Alteromonas macleodii str. 'English Channel 673'   1 1
No Yes Alteromonas macleodii str. 'Balearic Sea AD45'   1 1
No Yes Alteromonas macleodii str. 'Black Sea 11'   1 1
No Yes Alteromonas macleodii ATCC 27126   1 1
No Yes Spiribacter salinus M19-40   1 1
No Yes Thioalkalivibrio nitratireducens DSM 14787   1 1
No Yes Thioflavicoccus mobilis 8321   1 1
No Yes Coxiella burnetii CbuK_Q154   1 1
No Yes Coxiella burnetii CbuG_Q212   1 1
No Yes Coxiella burnetii RSA 331   1 1
No Yes Coxiella burnetii RSA 493   1 1
No Yes Legionella pneumophila str. Paris   1 1
No Yes Legionella pneumophila str. Lens   1 1
No Yes Legionella pneumophila subsp. pneumophila LPE509   1 1
No Yes Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Thunder Bay   1 1
No Yes Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1   1 1
No Yes Legionella pneumophila subsp. pneumophila   1 1
No Yes Legionella pneumophila subsp. pneumophila   1 1
No Yes Legionella pneumophila subsp. pneumophila ATCC 43290   1 1
No Yes Legionella pneumophila 2300/99 Alcoy   1 1
No Yes Proteus mirabilis BB2000   1 1
No Yes Morganella morganii subsp. morganii KT   1 1
No Yes Edwardsiella tarda C07-087   1 1
No Yes Edwardsiella tarda FL6-60   1 1
No Yes Rahnella aquatilis HX2   1 1
No Yes Yersinia pseudotuberculosis PB1/+   1 1
No Yes Yersinia pseudotuberculosis YPIII   1 1
No Yes Yersinia pseudotuberculosis IP 32953   1 1
No Yes Yersinia pestis biovar Microtus str. 91001   1 1
No Yes Yersinia pestis A1122   1 1
No Yes Yersinia pestis Z176003   1 1
No Yes Yersinia pestis D182038   1 1
No Yes Yersinia pestis D106004   1 1
No Yes Yersinia pestis biovar Medievalis str. Harbin 35   1 1
No Yes Yersinia pestis Nepal516   1 1
No Yes Yersinia pestis Antiqua   1 1
No Yes Yersinia pestis Angola   1 1
No Yes Yersinia pestis CO92   1 1
No Yes Yersinia pestis KIM10+   1 1
No Yes Yersinia enterocolitica subsp. palearctica 105.5R(r)   1 1
No Yes Yersinia enterocolitica subsp. palearctica Y11   1 1
No Yes Serratia sp. AS13   1 1
No Yes Serratia plymuthica S13   1 1
No Yes Serratia plymuthica 4Rx13   1 1
No Yes Serratia marcescens FGI94   1 1
No Yes Serratia marcescens WW4   1 1
No Yes Serratia liquefaciens ATCC 27592   1 1
No Yes Dickeya dadantii Ech586   1 1
No Yes Dickeya dadantii 3937   1 1
No Yes Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PCC21   1 1
No Yes Pantoea ananatis LMG 5342   1 1
No Yes Pantoea ananatis PA13   1 1
No Yes Pantoea ananatis AJ13355   1 1
No Yes Erwinia pyrifoliae DSM 12163   1 1
No Yes Erwinia amylovora CFBP1430   1 1
No Yes Cronobacter sakazakii CMCC 45402   1 1
No Yes Cronobacter sakazakii SP291   1 1
No Yes Cronobacter sakazakii ATCC BAA-894   1 1
No Yes Raoultella ornithinolytica B6   1 1
No Yes Shigella sonnei 53G   1 1
No Yes Shigella flexneri 2002017   1 1
No Yes Shigella flexneri 2a str. 2457T   1 1
No Yes Shigella flexneri 2a str. 301   1 1
No Yes Shigella dysenteriae 1617   1 1
No Yes Shigella boydii Sb227   1 1
No Yes Salmonella bongori N268-08   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. arizonae serovar 62:z4,z23:-- str. RSK2980   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar 4,[5],12:i:- str. 08-1736   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. P125109   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240   1 1
No Yes Salmonella enterica The genome of subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. D23580   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium Definitive Type 104   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2   1 1
No Yes Salmonella enterica serovar Bovismorbificans genomics   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. 24249   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B str. SPB7   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. B182   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836   1 1
No Yes Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91   1 1
No Yes Klebsiella oxytoca KCTC 1686   1 1
No Yes Klebsiella pneumoniae JM45   1 1
No Yes Klebsiella pneumoniae CG43   1 1
No Yes Klebsiella pneumoniae KCTC 2242   1 1
No Yes Klebsiella pneumoniae 342   1 1
No Yes Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae 1084   1 1
No Yes Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286   1 1
No Yes Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578   1 1
No Yes Klebsiella pneumoniae subsp. rhinoscleromatis SB3432   1 1
No Yes Enterobacter aerogenes EA1509E   1 1
No Yes Escherichia coli E24377A   1 1
No Yes Escherichia coli E. coli PMV-1   1 1
No Yes Escherichia coli JJ1886   1 1
No Yes Escherichia coli LY180   1 1
No Yes Escherichia coli APEC O78   1 1
No Yes Escherichia coli O7:K1 str. CE10   1 1
No Yes Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050   1 1
No Yes Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2071   1 1
No Yes Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493   1 1
No Yes Escherichia coli NA114   1 1
No Yes Escherichia coli P12b   1 1
No Yes Escherichia coli str. 'clone D i2'   1 1
No Yes Escherichia coli str. 'clone D i14'   1 1
No Yes Escherichia coli UM146   1 1
No Yes Escherichia coli 042   1 1
No Yes Escherichia coli Xuzhou21   1 1
No Yes Escherichia coli IHE3034   1 1
No Yes Escherichia coli UMNK88   1 1
No Yes Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C   1 1
No Yes Escherichia coli ABU 83972   1 1
No Yes Escherichia coli KO11FL   1 1
No Yes Escherichia coli KO11FL   1 1
No Yes Escherichia coli LF82   1 1
No Yes Escherichia coli ED1a   1 1
No Yes Escherichia coli IAI39   1 1
No Yes Escherichia coli UMN026   1 1
No Yes Escherichia coli 55989   1 1
No Yes Escherichia coli S88   1 1
No Yes Escherichia coli IAI1   1 1
No Yes Escherichia coli W   1 1
No Yes Escherichia coli W   1 1
No Yes Escherichia coli DH1   1 1
No Yes Escherichia coli DH1   1 1
No Yes Escherichia coli ATCC 8739   1 1
No Yes Escherichia coli BL21(DE3)   1 1
No Yes Escherichia coli BL21(DE3)   1 1
No Yes Escherichia coli SMS-3-5   1 1
No Yes Escherichia coli SE15   1 1
No Yes Escherichia coli SE11   1 1
No Yes Escherichia coli APEC O1   1 1
No Yes Escherichia coli O103:H2 str. 12009   1 1
No Yes Escherichia coli UTI89   1 1
No Yes Escherichia coli 536   1 1
No Yes Escherichia coli HS   1 1
No Yes Escherichia coli ETEC H10407   1 1
No Yes Escherichia coli O55:H7 str. RM12579   1 1
No Yes Escherichia coli O55:H7 str. CB9615   1 1
No Yes Escherichia coli O26:H11 str. 11368   1 1
No Yes Escherichia coli CFT073   1 1
No Yes Escherichia coli O111:H- str. 11128   1 1
No Yes Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69   1 1
No Yes Escherichia coli O157:H7 str. TW14359   1 1
No Yes Escherichia coli O157:H7 str. EC4115   1 1
No Yes Escherichia coli O157:H7 str. Sakai   1 1
No Yes Escherichia coli O157:H7 str. EDL933   1 1
No Yes Escherichia coli str. K-12 substr. MDS42   1 1
No Yes Escherichia coli BW2952   1 1
No Yes Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655   1 1
No Yes Escherichia coli str. K-12 substr. W3110   1 1
No Yes Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B   1 1
No Yes Escherichia coli B str. REL606   1 1
No Yes Enterobacter cloacae SCF1   1 1
No Yes Enterobacter cloacae EcWSU1   1 1
No Yes Enterobacter cloacae subsp. cloacae ENHKU01   1 1
No Yes Enterobacter cloacae subsp. cloacae NCTC 9394   1 1
No Yes Enterobacter cloacae subsp. cloacae ATCC 13047   1 1
No Yes Methylophaga sp. JAM7   1 1
No Yes Cycloclasticus zancles 7-ME   1 1
No Yes Solanum pimpinellifolium A-1.0 (Early draft) Currant tomato 1 1
No Yes Solanum lycopersicum v2.3 (Early assembly) Tomato 1 1
No Yes Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 (Duplicate of NC)   1 1
No Yes 4_050719Q (meta-genome)   1 1
No Yes 4_Deep_abyss (meta-genome)   2 2
No Yes Activated sludge plasmid pool Morges-2009 (Newbler) (meta-genome)   1 1
No Yes Atta cephalotes fungus garden (ACEF) (meta-genome)   11 11
No Yes Combined (meta-genome)   20 20
No Yes Cyphomyrmex longiscapus fungus garden (meta-genome)   24 24
No Yes Dendroctonus ponderosae beetle community (MPB hybrid beetle) (Lodgepole pine) (meta-genome)   5 5
No Yes Dendroctonus ponderosae fungus gallery (Hybrid pine) (MPB hybrid gallery) (meta-genome)   4 4
No Yes Dump bottom (Dump bottom) (meta-genome)   15 15
No Yes Dump top (Dump top) (meta-genome)   25 25
No Yes Endophytic microbiome from Rice (meta-genome)   2 2
No Yes Fossil microbial community from Whale Fall at Santa Cruz Basin of the Pacific Ocean Sample #1 (meta-genome)   1 1
No Yes Fossil microbial community from Whale Fall at Santa Cruz Basin of the Pacific Ocean Sample #2 (meta-genome)   1 1
No Yes Freshwater propionate enrichment of Brocadia fulgida (meta-genome)   3 3
No Yes Fungus garden combined (combined) (meta-genome)   14 14
No Yes Fungus garden microbial communities from Atta colombica in Panama, sample from fungus garden bottom (Fungus garden bottom) (meta-genome)   20 20
No Yes Fungus garden microbial communities from Atta colombica in Panama, sample from fungus garden top (meta-genome)   27 27
No Yes Guerrero Negro salt ponds hypersaline mat 01(G) (meta-genome)   1 1
No Yes Hot spring microbial community from Yellowstone Hot Springs, sample YNP18 from Washburn Springs #1 (meta-genome)   1 1
No Yes Hot spring microbial community from Yellowstone Hot Springs, sample YNP20 from Bath Lake Vista Annex - Purple-Sulfur Mats (meta-genome)   1 1
No Yes Maize field bulk soil microbial communities from University of Illinois Energy Farm, Urbana, IL (Bulk soil sample from field growing corn (Zea may (meta-genome)   2 2
No Yes Maize rhizosphere soil microbial communities from University of Illinois Energy Farm, Urbana, IL (Soil sample from rhizosphere of corn (Zea mays))< (meta-genome)   2 2
No Yes Methylotrophic community from Lake Washington sediment combined (v2) (meta-genome)   23 23
No Yes Methylotrophic community from Lake Washington sediment Formaldehyde enrichment (meta-genome)   4 4
No Yes Methylotrophic community from Lake Washington sediment Formate enrichment (meta-genome)   1 1
No Yes Methylotrophic community from Lake Washington sediment Methane enrichment (meta-genome)   5 5
No Yes Methylotrophic community from Lake Washington sediment Methanol enrichment (meta-genome)   3 3
No Yes Methylotrophic community from Lake Washington sediment Methylamine enrichment (meta-genome)   11 11
No Yes Miscanthus field bulk soil microbial communities from University of Illinois Energy Farm, Urbana, IL (Bulk soil sample from field growing Miscanthu (meta-genome)   1 1
No Yes Miscanthus rhizosphere soil microbial communities from University of Illinois Energy Farm, Urbana, IL (Rhizosphere soil sample of Miscanthus x giga (meta-genome)   2 2
No Yes Mountain Pine Beetle microbial communities from Grand Prairie, Alberta, sample from Hybrid pine (MPB hybrid beetle) (meta-genome)   1 1
No Yes NCBI 2017_08 genome   28765 28764
No Yes Oak Ridge Pristine Groundwater FRC FW301 (meta-genome)   3 3
No Yes Olavius algarvensis endosymbiont metagenome Gamma1 (meta-genome)   1 1
No Yes Olavius algarvensis endosymbiont metagenome Gamma3 (meta-genome)   1 1
No Yes simHC - Simulated High Complexity Metagenome (meta-genome)   4 4
No Yes simLC - Simulated Low Complexity Metagenome (meta-genome)   4 4
No Yes simMC - Simulated Medium Complexity Metagenome (meta-genome)   2 2
No Yes Sludge/Australian, Phrap Assembly (meta-genome)   3 3
No Yes Sludge/US, Jazz Assembly (meta-genome)   2 2
No Yes Sludge/US, Phrap Assembly (meta-genome)   4 4
No Yes Soil microbial communities from Minnesota Farm (meta-genome)   4 4
No Yes Soil microbial communities from sample at FACE Site 1 Maryland Estuary CO2- (Maryland Estuary ambient) (meta-genome)   9 9
No Yes Soil microbial communities from sample at FACE Site 3 Nevada Test Site Creosote CO2+ (meta-genome)   3 3
No Yes Soil microbial communities from sample at FACE Site 3 Nevada Test Site Creosote CO2- (meta-genome)   2 2
No Yes Soil microbial communities from sample at FACE Site 5 Oak Ridge CO2+ (Oak Ridge elevated CO2) (meta-genome)   6 6
No Yes Soil microbial communities from sample at FACE Site 5 Oak Ridge CO2- (Oak Ridge ambient) (meta-genome)   6 6
No Yes STRING v9.0.5 (STRING)   210 210
No Yes Switchgrass rhizosphere microbial community from Michigan, US, sample from East Lansing bulk soil (meta-genome)   4 4
No Yes Uniprot 2018_03 genome   3126 3126
No Yes Uranium Contaminated Groundwater FW106 (meta-genome)   1 1
No Yes Global Ocean Sampling Expedition (GOS)   108 108
No Yes PDB chains (SCOP 1.75) (PDB)   1 1
No Yes Protein Data Bank (all PDB sequenc)   8 8
No Yes SCOP2 SCOPe CATH ECOD (all domain sequ)   22 22
No Yes TargetDB (Targets)   14 14
No Yes The Salmonella enterica Pan-genome (meta-genome)   31 31

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