SUPERFAMILY 1.75 HMM library and genome assignments server

SUPERFAMILY 2 can be accessed from supfam.org. Please contact us if you experience any problems.


PKD domain family domain assignments
in
all archaeal genomes

Assignment details

(show help)

4 selected genomes have 16 significant domains in 12 proteins.


Methanosarcina acetivorans C2A has 4 significant domains in 3 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
gi|20090688|ref|NP_616763.1|   3.4e-26   0.0000876   419-504   1l0q A:302-391  
  1.44e-23   0.00015   792-903   1l0q A:302-391  
  9.81e-23   0.00088   334-422   1l0q A:302-391  
  7.85e-27   0.0000785   760-846   1l0q A:302-391  
  1.2e-25   0.00031   1445-1528   1l0q A:302-391  
  1.31e-25   0.00033   1360-1442   1l0q A:302-391  
  1.44e-25   0.00051   1180-1263   1l0q A:302-391  
  6.54e-25   0.0007   1012-1093   1l0q A:302-391  
  3.01e-24   0.00033   1273-1357   1l0q A:302-391  
  1.28e-23   0.00079   847-923   1l0q A:302-391  
  1.83e-23   0.0000381   369-450   1l0q A:302-391  
gi|20091708|ref|NP_617783.1|   8.11e-27   0.0000926   483-576   1l0q A:302-391  
  1.19e-19   0.00055   587-667   1l0q A:302-391  
 
Weak hits:
gi|20089145|ref|NP_615220.1|   0.0000706   0.0078   362-448   1l0q A:302-391  
gi|20089234|ref|NP_615309.1|   6.8e-31   0.00015   283-385   1l0q A:302-391  
  2.75e-28   0.00018   390-471   1l0q A:302-391  
  1.1e-23   0.00026   473-557   1l0q A:302-391  
  1.7e-19   0.00037   562-641   1l0q A:302-391  
gi|20089377|ref|NP_615452.1|   2.22e-22   0.00034   601-686   1l0q A:302-391  
gi|20089734|ref|NP_615809.1|   4.45e-31   0.00021   1884-1977   1l0q A:302-391  
  1.57e-30   0.00026   1980-2062   1l0q A:302-391  
  5.49e-30   0.0003   310-394   1l0q A:302-391  
  6.93e-29   0.00024   835-925   1l0q A:302-391  
  2.35e-28   0.00025   924-1010   1l0q A:302-391  
  6.41e-27   0.00028   1094-1179   1l0q A:302-391  
  1.01e-26   0.00024   752-839   1l0q A:302-391  
  2.62e-26   0.00031   1013-1095   1l0q A:302-391  
  8.24e-21   0.00064   1183-1268   1l0q A:302-391  
gi|20089735|ref|NP_615810.1|   6.28e-31   0.0003   2270-2353   1l0q A:302-391  
  3.01e-30   0.0003   2067-2184   1l0q A:302-391  
  6.67e-30   0.00022   1777-1861   1l0q A:302-391  
  2.22e-29   0.0002   1333-1415   1l0q A:302-391  
  3.53e-29   0.00018   2180-2265   1l0q A:302-391  
  2.09e-28   0.00024   1221-1330   1l0q A:302-391  
  3.14e-27   0.00046   1416-1501   1l0q A:302-391  
  3.92e-26   0.00036   677-791   1l0q A:302-391  
  9.94e-22   0.00047   795-878   1l0q A:302-391  
gi|20089785|ref|NP_615860.1|   2.88e-21   0.0016   17-101   1l0q A:302-391  
gi|20089835|ref|NP_615910.1|   6.93e-32   0.00025   516-603   1l0q A:302-391  
gi|20090061|ref|NP_616136.1|   1.57e-23   0.0004   156-273   1l0q A:302-391  
gi|20090156|ref|NP_616231.1|   2.35e-24   0.00055   622-708   1l0q A:302-391  
  3.66e-24   0.00051   330-433   1l0q A:302-391  
  1.57e-23   0.00058   433-523   1l0q A:302-391  
  3.4e-18   0.0023   527-622   1b4r A:  
gi|20090157|ref|NP_616232.1|   8.11e-25   0.00032   600-686   1l0q A:302-391  
  1.14e-24   0.00048   411-502   1l0q A:302-391  
  4.97e-21   0.00045   329-416   1l0q A:302-391  
  1.31e-16   0.0028   508-601   1b4r A:  
gi|20090369|ref|NP_616444.1|   0.0000000000000103   0.0015   1957-2041   1l0q A:302-391  
gi|20090582|ref|NP_616657.1|   1.09e-27   0.00051   321-409   1l0q A:302-391  
gi|20090590|ref|NP_616665.1|   1.1e-25   0.00039   876-962   1l0q A:302-391  
  0.00000000000000119   0.00035   469-546   1l0q A:302-391  
gi|20090605|ref|NP_616680.1|   3.14e-33   0.00024   844-936   1l0q A:302-391  
  1.83e-30   0.00029   355-439   1l0q A:302-391  
gi|20090606|ref|NP_616681.1|   1.24e-28   0.00024   427-513   1l0q A:302-391  
  2.09e-17   0.00098   518-603   1l0q A:302-391  
gi|20090607|ref|NP_616682.1|   1.26e-33   0.00022   893-975   1l0q A:302-391  
  4.45e-28   0.00021   272-385   1l0q A:302-391  
  8.24e-26   0.00036   389-474   1l0q A:302-391  
gi|20090612|ref|NP_616687.1|   3.14e-32   0.00023   770-862   1l0q A:302-391  
  1.31e-29   0.00011   21-106   1l0q A:302-391  
  2.88e-29   0.00026   274-365   1l0q A:302-391  
  1.57e-24   0.0004   110-195   1l0q A:302-391  
  0.00000000000144   0.00081   192-265   1l0q A:302-391  
gi|20090613|ref|NP_616688.1|   2.49e-29   0.00024   1817-1901   1l0q A:302-391  
  7.85e-29   0.00019   3020-3101   1l0q A:302-391  
  1.44e-28   0.00018   3663-3775   1l0q A:302-391  
  1.96e-28   0.00022   1983-2067   1l0q A:302-391  
  3.14e-28   0.00022   791-874   1l0q A:302-391  
  5.49e-28   0.0002   1904-1984   1l0q A:302-391  
  4.05e-27   0.00039   1181-1262   1l0q A:302-391  
  4.58e-27   0.00028   1738-1818   1l0q A:302-391  
  1.96e-26   0.00037   1262-1345   1l0q A:302-391  
  2.22e-26   0.00014   22-108   1l0q A:302-391  
  7.19e-26   0.00037   709-792   1l0q A:302-391  
  4.05e-25   0.00026   2924-3016   1l0q A:302-391  
  5.36e-25   0.00036   455-541   1l0q A:302-391  
  7.06e-25   0.00033   2388-2473   1l0q A:302-391  
  1.02e-24   0.00023   1349-1427   1l0q A:302-391  
  1.2e-23   0.00042   540-625   1l0q A:302-391  
  2.75e-23   0.00031   625-709   1l0q A:302-391  
  1.07e-22   0.0005   3102-3187   1l0q A:302-391  
gi|20090615|ref|NP_616690.1|   9.16e-33   0.00024   266-390   1l0q A:302-391  
  4.19e-29   0.00033   487-570   1l0q A:302-391  
  8.11e-28   0.00026   396-481   1l0q A:302-391  
  1.11e-27   0.00035   577-661   1l0q A:302-391  
gi|20090617|ref|NP_616692.1|   3.92e-32   0.00028   878-970   1l0q A:302-391  
  8.5e-31   0.00026   1453-1534   1l0q A:302-391  
  2.09e-28   0.00012   1357-1447   1l0q A:302-391  
  3.14e-27   0.00028   384-473   1l0q A:302-391  
gi|20090618|ref|NP_616693.1|   1.57e-28   0.00032   894-988   1l0q A:302-391  
  1.83e-27   0.00028   400-489   1l0q A:302-391  
gi|20090753|ref|NP_616828.1|   3.66e-29   0.00044   926-1008   1l0q A:302-391  
  4.32e-29   0.00032   1532-1614   1l0q A:302-391  
  1.05e-27   0.00026   1096-1178   1l0q A:302-391  
  2.62e-27   0.00043   1617-1696   1l0q A:302-391  
gi|20091122|ref|NP_617197.1|   7.85e-20   0.00023   687-767   1l0q A:302-391  
gi|20091170|ref|NP_617245.1|   4.05e-29   0.00028   393-479   1l0q A:302-391  
  3.4e-27   0.00021   475-559   1l0q A:302-391  
  2.88e-20   0.00065   304-395   1l0q A:302-391  
gi|20091338|ref|NP_617413.1|   7.32e-25   0.00029   522-604   1l0q A:302-391  
gi|20091347|ref|NP_617422.1|   0.00275   0.0069   52-96   1l0q A:302-391  
gi|20091530|ref|NP_617605.1|   1.57e-23   0.00064   351-436   1l0q A:302-391  
  3.4e-23   0.00082   433-525   1l0q A:302-391  
  2.09e-19   0.00047   529-610   1l0q A:302-391  
gi|20091531|ref|NP_617606.1|   5.49e-18   0.001   16-73   1l0q A:302-391  
gi|20091548|ref|NP_617623.1|   1.83e-23   0.00035   301-377   1l0q A:302-391  
gi|20091616|ref|NP_617691.1|   2.88e-31   0.00022   1548-1644   1l0q A:302-391  
  1.96e-27   0.00024   536-618   1l0q A:302-391  
  2.88e-27   0.00047   455-537   1l0q A:302-391  
  2.75e-24   0.00044   365-453   1l0q A:302-391  
  9.68e-24   0.00055   985-1089   1l0q A:302-391  
gi|20091736|ref|NP_617811.1|   8.37e-25   0.00024   235-317   1l0q A:302-391  
  5.36e-19   0.00059   323-405   1l0q A:302-391  
gi|20091745|ref|NP_617820.1|   1.07e-19   0.00024   586-658   1l0q A:302-391  
gi|20091819|ref|NP_617894.1|   4.32e-25   0.00057   4-83   1l0q A:302-391  
gi|20091919|ref|NP_617994.1|   6.02e-19   0.001   801-906   1l0q A:302-391  
gi|20091951|ref|NP_618026.1|   1.83e-23   0.00021   279-374   1l0q A:302-391  
  1.83e-22   0.0003   551-632   1l0q A:302-391  
  9.42e-20   0.00056   379-460   1l0q A:302-391  
  3.27e-19   0.00033   635-717   1l0q A:302-391  
  3.92e-19   0.00039   463-546   1l0q A:302-391  
gi|20092045|ref|NP_618120.1|   1.06e-23   0.00031   519-596   1l0q A:302-391  
  9.29e-21   0.00054   333-419   1l0q A:302-391  
  2.09e-17   0.001   594-682   1l0q A:302-391  
  8.37e-16   0.00088   428-508   1l0q A:302-391  
gi|20092242|ref|NP_618317.1|   2.49e-22   0.00015   508-597   1l0q A:302-391  
gi|20092399|ref|NP_618474.1|   0.0863   0.0094   430-466   1l0q A:302-391  
gi|20092498|ref|NP_618573.1|   2.75e-31   0.00022   1721-1803   1l0q A:302-391  
  3.66e-29   0.00039   1166-1258   1l0q A:302-391  
  4.58e-29   0.00026   738-819   1l0q A:302-391  
  5.1e-28   0.00031   649-735   1l0q A:302-391  
  3.92e-27   0.00046   112-196   1l0q A:302-391  
  4.32e-27   0.00035   561-649   1l0q A:302-391  
  3.92e-26   0.00016   1637-1720   1l0q A:302-391  
  1.57e-22   0.00017   27-108   1l0q A:302-391  
  0.0000000602   0.0022   1267-1356   1l0q A:302-391  
gi|20092499|ref|NP_618574.1|   5.49e-31   0.00016   1357-1466   1l0q A:302-391  
  2.09e-30   0.00026   2218-2310   1l0q A:302-391  
  7.46e-30   0.00031   1876-1962   1l0q A:302-391  
  1.83e-27   0.00036   421-506   1l0q A:302-391  
  4.45e-27   0.00039   507-592   1l0q A:302-391  
  6.15e-27   0.00057   336-421   1l0q A:302-391  
  1.14e-23   0.00031   1034-1118   1l0q A:302-391  
  2.22e-23   0.00071   950-1029   1l0q A:302-391  
gi|20092500|ref|NP_618575.1|   3.27e-33   0.00016   1582-1668   1l0q A:302-391  
  3.43e-32   0.00029   958-1082   1l0q A:302-391  
  1.57e-31   0.0002   1087-1171   1l0q A:302-391  
  5.49e-28   0.00017   457-543   1l0q A:302-391  
  2.09e-27   0.00031   542-622   1l0q A:302-391  
  1.7e-26   0.00032   371-457   1l0q A:302-391  
gi|20092638|ref|NP_618713.1|   2.35e-26   0.00045   401-478   1l0q A:302-391  
  4.19e-25   0.00017   307-395   1l0q A:302-391  
gi|20092827|ref|NP_618902.1|   1.83e-25   0.00014   618-702   1l0q A:302-391  
gi|20093073|ref|NP_619148.1|   1.23e-29   0.00023   1172-1257   1l0q A:302-391  
  2.75e-28   0.00021   604-689   1l0q A:302-391  
  7.59e-28   0.00031   514-598   1l0q A:302-391  
  5.76e-25   0.00041   421-509   1l0q A:302-391  
  3.01e-24   0.00029   1077-1166   1l0q A:302-391  
gi|20093074|ref|NP_619149.1|   2.09e-26   0.00035   1446-1530   1l0q A:302-391  
  7.59e-24   0.00027   1353-1441   1l0q A:302-391  
  3.14e-20   0.00038   418-500   1l0q A:302-391  
  1.01e-17   0.0007   946-1051   1l0q A:302-391  
  1.83e-17   0.00068   664-751   1l0q A:302-391  
gi|20093076|ref|NP_619151.1|   2.22e-30   0.00023   1872-1952   1l0q A:302-391  
  9.68e-30   0.00036   922-1003   1l0q A:302-391  
  5.62e-27   0.00036   832-918   1l0q A:302-391  
  1.96e-25   0.00032   421-507   1l0q A:302-391  
  5.62e-22   0.00035   1363-1467   1l0q A:302-391  
  2.62e-21   0.00026   516-598   1l0q A:302-391  
gi|20093078|ref|NP_619153.1|   7.32e-27   0.0004   1438-1521   1l0q A:302-391  
  3.4e-26   0.00015   1344-1432   1l0q A:302-391  
  1.19e-20   0.00044   388-464   1l0q A:302-391  
gi|20093080|ref|NP_619155.1|   2.22e-26   0.00035   1601-1685   1l0q A:302-391  
  2.35e-26   0.00035   1514-1596   1l0q A:302-391  
  4.32e-25   0.00033   805-890   1l0q A:302-391  
gi|20093081|ref|NP_619156.1|   5.36e-27   0.00036   1697-1782   1l0q A:302-391  
  9.03e-26   0.00027   573-659   1l0q A:302-391  
  6.93e-25   0.0007   400-490   1l0q A:302-391  
  1.23e-23   0.00017   1605-1693   1l0q A:302-391  
  1.09e-22   0.0005   491-569   1l0q A:302-391  
  9.42e-17   0.0006   1247-1327   1l0q A:302-391  
gi|20093086|ref|NP_619161.1|   4.84e-30   0.00029   1523-1604   1l0q A:302-391  
  1.31e-27   0.00039   1433-1517   1l0q A:302-391  
  1.83e-26   0.00046   1000-1083   1l0q A:302-391  
  4.19e-26   0.00021   1341-1429   1l0q A:302-391  
  7.59e-25   0.00031   430-518   1l0q A:302-391  
  2.09e-23   0.00026   907-995   1l0q A:302-391  
gi|20093088|ref|NP_619163.1|   1.96e-30   0.00024   874-960   1l0q A:302-391  
  2.88e-29   0.00027   965-1051   1l0q A:302-391  
  8.5e-29   0.00024   266-392   1l0q A:302-391  
  9.29e-25   0.00027   781-869   1l0q A:302-391  
gi|20093090|ref|NP_619165.1|   2.49e-26   0.00024   1059-1142   1l0q A:302-391  
  3.79e-23   0.00029   23-105   1l0q A:302-391  
  5.62e-22   0.00066   524-606   1l0q A:302-391  
  8.37e-20   0.00072   610-695   1l0q A:302-391  
gi|20093094|ref|NP_619169.1|   3.4e-30   0.0003   1652-1735   1l0q A:302-391  
  4.97e-28   0.00035   366-456   1l0q A:302-391  
  3.92e-26   0.00033   1566-1648   1l0q A:302-391  
  1.31e-23   0.00038   856-939   1l0q A:302-391  
gi|20093098|ref|NP_619173.1|   1.19e-30   0.00021   968-1049   1l0q A:302-391  
  2.09e-25   0.00039   336-421   1l0q A:302-391  
  4.05e-24   0.0003   425-508   1l0q A:302-391  
  4.05e-22   0.00034   512-597   1l0q A:302-391  
gi|20093101|ref|NP_619176.1|   4.71e-31   0.00024   353-447   1l0q A:302-391  
  1.26e-27   0.00022   1645-1727   1l0q A:302-391  
  1.83e-27   0.00037   1731-1816   1l0q A:302-391  
  9.94e-27   0.00025   454-536   1l0q A:302-391  
  3.66e-24   0.00041   933-1018   1l0q A:302-391  
gi|20093104|ref|NP_619179.1|   2.49e-31   0.00027   894-986   1l0q A:302-391  
  4.71e-31   0.00028   1336-1419   1l0q A:302-391  
  8.89e-29   0.00035   1247-1332   1l0q A:302-391  
  2.49e-27   0.00032   1151-1244   1l0q A:302-391  
  3.53e-27   0.00026   316-400   1l0q A:302-391  
  2.22e-26   0.00053   405-488   1l0q A:302-391  
  1.96e-24   0.00034   989-1075   1l0q A:302-391  
  0.0000000000222   0.00088   1073-1143   1l0q A:302-391  
gi|20093372|ref|NP_619447.1|   1.7e-31   0.00023   2656-2738   1l0q A:302-391  
  2.62e-30   0.00016   2030-2118   1l0q A:302-391  
  4.45e-30   0.00023   2565-2651   1l0q A:302-391  
  2.22e-28   0.00029   2121-2203   1l0q A:302-391  
  3.4e-28   0.00026   1102-1186   1l0q A:302-391  
  1.83e-27   0.00026   464-545   1l0q A:302-391  
  5.49e-27   0.00043   1021-1103   1l0q A:302-391  
  1.16e-26   0.00029   545-628   1l0q A:302-391  
  1.83e-26   0.0003   940-1020   1l0q A:302-391  
  2.22e-26   0.00029   351-462   1l0q A:302-391  
  1.12e-24   0.00025   1505-1584   1l0q A:302-391  
  1.83e-24   0.00037   2203-2288   1l0q A:302-391  
gi|20093373|ref|NP_619448.1|   2.88e-33   0.00023   1061-1144   1l0q A:302-391  
  1.44e-30   0.00022   364-447   1l0q A:302-391  
  3.92e-30   0.00023   945-1057   1l0q A:302-391  
  8.5e-30   0.00025   531-611   1l0q A:302-391  
  1.7e-28   0.00028   444-532   1l0q A:302-391  

Methanosarcina mazei Go1 has 3 significant domains in 2 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
gi|21227779|ref|NP_633701.1|   1.33e-23   0.0000876   314-396   1l0q A:302-391  
  1.57e-24   0.0000909   716-822   1l0q A:302-391  
  3.79e-24   0.0000054   313-425   1l0q A:302-391  
  4.45e-24   0.00048   1075-1154   1l0q A:302-391  
  9.16e-22   0.0012   823-899   1l0q A:302-391  
 
Weak hits:
gi|21226145|ref|NP_632067.1|   1.2e-24   0.00012   774-859   1l0q A:302-391  
  6.02e-23   0.00026   381-464   1l0q A:302-391  
gi|21226165|ref|NP_632087.1|   1.96e-18   0.00053   314-395   1l0q A:302-391  
gi|21226168|ref|NP_632090.1|   4.19e-26   0.00012   638-725   1l0q A:302-391  
  5.23e-19   0.0005   733-812   1l0q A:302-391  
gi|21226313|ref|NP_632235.1|   5.62e-23   0.00032   485-580   1l0q A:302-391  
gi|21226367|ref|NP_632289.1|   1.01e-30   0.00036   14-109   1l0q A:302-391  
  5.23e-27   0.00037   113-196   1l0q A:302-391  
  1.01e-26   0.00031   201-273   1l0q A:302-391  
  2.09e-26   0.0007   365-445   1l0q A:302-391  
  1.31e-24   0.00035   536-612   1l0q A:302-391  
  1.83e-23   0.00031   449-531   1l0q A:302-391  
  7.19e-23   0.0004   280-363   1l0q A:302-391  
gi|21226486|ref|NP_632408.1|   8.76e-21   0.00025   343-428   1l0q A:302-391  
  1.31e-18   0.00042   434-515   1l0q A:302-391  
gi|21226493|ref|NP_632415.1|   1.06e-25   0.00012   611-701   1l0q A:302-391  
gi|21227466|ref|NP_633388.1|   0.00824   0.0073   217-297   1l0q A:302-391  
gi|21227690|ref|NP_633612.1|   2.75e-31   0.00024   296-388   1l0q A:302-391  
  2.75e-31   0.00033   480-561   1l0q A:302-391  
  4.58e-26   0.00095   395-475   1l0q A:302-391  
  7.19e-26   0.00087   568-648   1l0q A:302-391  
gi|21227691|ref|NP_633613.1|   1.05e-29   0.00015   293-379   1l0q A:302-391  
  6.93e-22   0.00032   387-468   1l0q A:302-391  
  5.89e-20   0.00025   473-555   1l0q A:302-391  
  1.14e-16   0.00055   556-637   1l0q A:302-391  
gi|21228085|ref|NP_634007.1|   1.7e-23   0.00025   341-456   1l0q A:302-391  
  4.58e-23   0.00042   860-944   1l0q A:302-391  
  6.41e-22   0.00046   618-701   1l0q A:302-391  
  1.7e-21   0.00056   1021-1109   1l0q A:302-391  
  1.96e-21   0.00035   536-620   1l0q A:302-391  
  2.09e-20   0.00039   779-863   1l0q A:302-391  
  2.09e-19   0.00061   454-537   1l0q A:302-391  
  2.49e-19   0.00047   943-1023   1l0q A:302-391  
  5.49e-19   0.0007   700-784   1l0q A:302-391  
gi|21228220|ref|NP_634142.1|   0.00451   0.01   25-57   1b4r A:  
gi|21228335|ref|NP_634257.1|   7.72e-25   0.00075   157-249   1l0q A:302-391  
gi|21228397|ref|NP_634319.1|   3.53e-25   0.00052   329-431   1l0q A:302-391  
  1.83e-19   0.00046   436-520   1l0q A:302-391  
gi|21228572|ref|NP_634494.1|   7.06e-29   0.00041   903-984   1l0q A:302-391  
  9.29e-28   0.00033   1338-1419   1l0q A:302-391  
  6.67e-27   0.00052   1251-1334   1l0q A:302-391  
  8.37e-27   0.0005   989-1069   1l0q A:302-391  
  4.71e-26   0.00038   1510-1589   1l0q A:302-391  
  1.28e-25   0.0004   1424-1504   1l0q A:302-391  
  1.83e-25   0.00063   1160-1240   1l0q A:302-391  
  1.07e-24   0.00054   1592-1671   1l0q A:302-391  
gi|21228689|ref|NP_634611.1|   1.27e-20   0.00028   360-443   1l0q A:302-391  
gi|21228732|ref|NP_634654.1|   6.93e-27   0.0004   844-931   1l0q A:302-391  
  1.83e-18   0.00024   418-521   1l0q A:302-391  
gi|21228970|ref|NP_634892.1|   0.000000000000379   0.0017   48-114   1l0q A:302-391  
gi|21229039|ref|NP_634961.1|   3.66e-27   0.00035   382-469   1l0q A:302-391  
  7.85e-27   0.00023   465-548   1l0q A:302-391  
  1.44e-18   0.00081   292-383   1l0q A:302-391  
  3.14e-18   0.00062   556-637   1l0q A:302-391  
gi|21229175|ref|NP_635097.1|   4.45e-25   0.00033   488-568   1l0q A:302-391  
gi|21229184|ref|NP_635106.1|   0.00314   0.0065   71-109   1l0q A:302-391  
gi|21229270|ref|NP_635192.1|   2.49e-28   0.00016   10-114   1l0q A:302-391  
  7.19e-27   0.00023   123-211   1l0q A:302-391  
  1.31e-26   0.00018   221-308   1l0q A:302-391  
gi|21229271|ref|NP_635193.1|   4.71e-28   0.00025   13-105   1l0q A:302-391  
  0.000017   0.006   121-154   1l0q A:302-391  
gi|21229273|ref|NP_635195.1|   1.7e-21   0.00021   349-422   1l0q A:302-391  
gi|21229280|ref|NP_635202.1|   1.7e-20   0.00045   237-314   1l0q A:302-391  
  1.44e-16   0.00072   322-402   1l0q A:302-391  
gi|21229305|ref|NP_635227.1|   7.72e-24   0.0003   544-624   1l0q A:302-391  
  6.15e-21   0.00022   448-542   1l0q A:302-391  
gi|21229382|ref|NP_635304.1|   2.09e-28   0.00042   544-632   1l0q A:302-391  

Methanosarcina barkeri str. Fusaro has 6 significant domains in 5 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
gi|73670594|ref|YP_306609.1|   1.7e-25   0.0000997   425-509   1l0q A:302-391  
  1.44e-20   0.001   333-427   1l0q A:302-391  
  3.66e-26   0.0000756   709-815   1l0q A:302-391  
  7.46e-26   0.00046   1242-1328   1l0q A:302-391  
  5.49e-24   0.0000362   338-419   1l0q A:302-391  
  1.19e-22   0.00077   816-892   1l0q A:302-391  
  1.03e-25   0.0001   458-539   1l0q A:302-391  
  5.1e-25   0.00016   285-368   1l0q A:302-391  
  1.83e-29   0.0000844   557-639   1l0q A:302-391  
  1.7e-28   0.00028   895-977   1l0q A:302-391  
  3.01e-28   0.00022   441-551   1l0q A:302-391  
  9.81e-28   0.00024   815-895   1l0q A:302-391  
  2.49e-27   0.0003   645-727   1l0q A:302-391  
  2.22e-28   0.0000892   1179-1261   1l0q A:302-391  
  2.49e-28   0.00027   1600-1681   1l0q A:302-391  
  3.01e-27   0.00021   1078-1173   1l0q A:302-391  
  4.19e-27   0.00028   1268-1349   1l0q A:302-391  
 
Weak hits:
gi|73663838|ref|YP_300084.1|   7.06e-28   0.00019   1055-1137   1l0q A:302-391  
  1.47e-19   0.00077   313-409   1l0q A:302-391  
gi|73668241|ref|YP_304256.1|   3.14e-21   0.00028   221-297   1l0q A:302-391  
  1.31e-18   0.00051   139-217   1l0q A:302-391  
  0.000000235   0.0049   45-130   1l0q A:302-391  
gi|73668267|ref|YP_304282.1|   1.57e-30   0.00035   543-626   1l0q A:302-391  
  1.83e-30   0.00034   379-462   1l0q A:302-391  
  2.88e-29   0.0004   629-711   1l0q A:302-391  
  3.14e-29   0.00026   463-544   1l0q A:302-391  
gi|73668268|ref|YP_304283.1|   3.01e-16   0.0014   9-57   1l0q A:302-391  
gi|73668269|ref|YP_304284.1|   1.57e-30   0.00047   376-462   1l0q A:302-391  
  3.92e-29   0.00051   463-544   1l0q A:302-391  
gi|73668351|ref|YP_304366.1|   2.09e-30   0.00032   301-389   1l0q A:302-391  
  6.8e-30   0.00039   550-648   1l0q A:302-391  
  1.7e-29   0.00032   651-733   1l0q A:302-391  
  2.35e-29   0.00032   390-471   1l0q A:302-391  
  2.35e-29   0.00032   471-553   1l0q A:302-391  
gi|73668352|ref|YP_304367.1|   3.01e-31   0.00033   307-419   1l0q A:302-391  
  2.09e-30   0.00037   503-586   1l0q A:302-391  
  6.8e-30   0.0004   841-923   1l0q A:302-391  
  6.93e-30   0.00037   927-1008   1l0q A:302-391  
  1.96e-29   0.00035   590-671   1l0q A:302-391  
  2.09e-29   0.00035   423-504   1l0q A:302-391  
  2.49e-29   0.00046   754-838   1l0q A:302-391  
  6.8e-29   0.0004   675-756   1l0q A:302-391  
  7.06e-29   0.00044   1012-1093   1l0q A:302-391  
gi|73668567|ref|YP_304582.1|   0.00981   0.0087   216-293   1l0q A:302-391  
gi|73668772|ref|YP_304787.1|   7.59e-22   0.00025   389-474   1l0q A:302-391  
  0.0249   0.0066   756-806   1l0q A:302-391  
gi|73668993|ref|YP_305008.1|   5.76e-31   0.00035   342-434   1l0q A:302-391  
  7.06e-30   0.00043   601-683   1l0q A:302-391  
  1.83e-29   0.00034   516-598   1l0q A:302-391  
  4.58e-29   0.00046   435-516   1l0q A:302-391  
gi|73668994|ref|YP_305009.1|   2.22e-31   0.00038   304-408   1l0q A:302-391  
  1.83e-30   0.00035   490-571   1l0q A:302-391  
  2.49e-30   0.00044   406-489   1l0q A:302-391  
  4.05e-29   0.00043   574-656   1l0q A:302-391  
gi|73668995|ref|YP_305010.1|   1.44e-31   0.00031   337-429   1l0q A:302-391  
  3.66e-30   0.00037   429-510   1l0q A:302-391  
  4.58e-30   0.00035   511-592   1l0q A:302-391  
  8.89e-30   0.00036   596-677   1l0q A:302-391  
gi|73668996|ref|YP_305011.1|   1.44e-31   0.00045   313-417   1l0q A:302-391  
  1.22e-30   0.00037   497-580   1l0q A:302-391  
  6.41e-30   0.00033   417-498   1l0q A:302-391  
gi|73668999|ref|YP_305014.1|   6.41e-32   0.00031   319-425   1l0q A:302-391  
  2.22e-30   0.00035   427-506   1l0q A:302-391  
  5.1e-30   0.00042   591-673   1l0q A:302-391  
  5.89e-30   0.00034   506-588   1l0q A:302-391  
gi|73669000|ref|YP_305015.1|   6.02e-32   0.00031   418-502   1l0q A:302-391  
  1.2e-30   0.00056   314-419   1l0q A:302-391  
  3.79e-30   0.00033   500-582   1l0q A:302-391  
  4.71e-30   0.00042   585-667   1l0q A:302-391  
gi|73669005|ref|YP_305020.1|   2.35e-32   0.00032   13-99   1l0q A:302-391  
  2.75e-30   0.0003   99-181   1l0q A:302-391  
gi|73669136|ref|YP_305151.1|   1.03e-30   0.00031   457-549   1l0q A:302-391  
  2.22e-28   0.00041   548-631   1l0q A:302-391  
gi|73669137|ref|YP_305152.1|   2.09e-29   0.00034   441-525   1l0q A:302-391  
  1.7e-25   0.00067   522-606   1l0q A:302-391  
gi|73669300|ref|YP_305315.1|   3.79e-25   0.00025   425-509   1l0q A:302-391  
  4.58e-25   0.00027   994-1081   1l0q A:302-391  
  9.94e-25   0.00027   517-598   1l0q A:302-391  
gi|73669304|ref|YP_305319.1|   8.24e-31   0.00034   1134-1217   1l0q A:302-391  
  1.07e-30   0.00034   1218-1298   1l0q A:302-391  
  1.24e-30   0.00018   968-1049   1l0q A:302-391  
  3.14e-30   0.00039   1056-1135   1l0q A:302-391  
  2.62e-27   0.00032   335-421   1l0q A:302-391  
  1.83e-22   0.00029   512-596   1l0q A:302-391  
  2.09e-22   0.00036   424-508   1l0q A:302-391  
gi|73669306|ref|YP_305321.1|   7.72e-31   0.00025   1592-1675   1l0q A:302-391  
  4.84e-30   0.00033   1945-2025   1l0q A:302-391  
  5.23e-30   0.00022   336-422   1l0q A:302-391  
  6.93e-29   0.00035   2027-2107   1l0q A:302-391  
  8.63e-29   0.00027   2190-2271   1l0q A:302-391  
  9.42e-29   0.00025   2109-2189   1l0q A:302-391  
  6.93e-28   0.00032   1767-1851   1l0q A:302-391  
  1.96e-27   0.00026   1506-1588   1l0q A:302-391  
  1.01e-26   0.00023   1680-1763   1l0q A:302-391  
  7.98e-26   0.00029   1856-1939   1l0q A:302-391  
  1.96e-23   0.00029   819-901   1l0q A:302-391  
gi|73669308|ref|YP_305323.1|   5.23e-31   0.0003   1871-1953   1l0q A:302-391  
  9.55e-31   0.00032   1954-2034   1l0q A:302-391  
  1.44e-30   0.00018   1702-1785   1l0q A:302-391  
  1.57e-29   0.00039   1792-1871   1l0q A:302-391  
  2.49e-26   0.00023   1616-1698   1l0q A:302-391  
  3.53e-26   0.00035   421-507   1l0q A:302-391  
  1.57e-23   0.00032   910-993   1l0q A:302-391  
gi|73669420|ref|YP_305435.1|   1.05e-22   0.00032   119-196   1l0q A:302-391  
  8.11e-21   0.00025   197-273   1l0q A:302-391  
  0.0000000000445   0.0034   31-111   1l0q A:302-391  
gi|73669432|ref|YP_305447.1|   6.41e-22   0.00086   157-237   1l0q A:302-391  
gi|73669458|ref|YP_305473.1|   1.24e-28   0.00034   138-222   1l0q A:302-391  
  1.44e-28   0.00042   1042-1128   1l0q A:302-391  
  2.09e-28   0.00035   818-914   1l0q A:302-391  
  2.35e-28   0.00039   528-612   1l0q A:302-391  
  2.75e-28   0.00039   334-417   1l0q A:302-391  
  5.23e-28   0.00025   619-701   1l0q A:302-391  
  3.27e-27   0.00028   424-505   1l0q A:302-391  
  1.31e-26   0.00029   229-310   1l0q A:302-391  
  8.76e-26   0.00038   32-115   1l0q A:302-391  
gi|73669488|ref|YP_305503.1|   4.97e-30   0.00027   1159-1239   1l0q A:302-391  
  1.57e-29   0.00024   1076-1158   1l0q A:302-391  
  2.35e-29   0.00038   996-1076   1l0q A:302-391  
  1.7e-24   0.00024   425-509   1l0q A:302-391  
  2.22e-24   0.00031   905-990   1l0q A:302-391  
gi|73669489|ref|YP_305504.1|   1.44e-30   0.0002   1508-1591   1l0q A:302-391  
  1.96e-30   0.00028   1422-1504   1l0q A:302-391  
  5.1e-30   0.00032   1760-1840   1l0q A:302-391  
  2.75e-29   0.00039   1598-1677   1l0q A:302-391  
  1.1e-28   0.00027   1677-1759   1l0q A:302-391  
  1.24e-24   0.00017   1329-1417   1l0q A:302-391  
  4.97e-19   0.00037   417-499   1l0q A:302-391  
  2.62e-17   0.001   645-750   1l0q A:302-391  
  1.57e-16   0.00094   922-1027   1l0q A:302-391  
gi|73669490|ref|YP_305505.1|   3.53e-24   0.00026   985-1069   1l0q A:302-391  
  3.14e-21   0.0011   454-535   1l0q A:302-391  
  1.7e-20   0.00046   533-621   1l0q A:302-391  
gi|73669492|ref|YP_305507.1|   6.15e-31   0.00024   347-438   1l0q A:302-391  
  4.97e-30   0.00035   1805-1886   1l0q A:302-391  
  1.44e-29   0.00035   1725-1804   1l0q A:302-391  
  3.92e-29   0.00029   1887-1967   1l0q A:302-391  
  1.44e-27   0.00021   1636-1718   1l0q A:302-391  
  6.28e-26   0.00027   445-527   1l0q A:302-391  
  1.44e-23   0.00032   930-1013   1l0q A:302-391  
gi|73669494|ref|YP_305509.1|   7.46e-31   0.0002   1549-1631   1l0q A:302-391  
  5.36e-30   0.00032   1800-1880   1l0q A:302-391  
  7.59e-30   0.00031   1717-1799   1l0q A:302-391  
  2.62e-29   0.00039   1638-1717   1l0q A:302-391  
  4.71e-27   0.00056   412-501   1l0q A:302-391  
  1.83e-25   0.00016   1456-1544   1l0q A:302-391  
  1.57e-24   0.0003   585-671   1l0q A:302-391  
  1.06e-23   0.00049   499-586   1l0q A:302-391  
gi|73669609|ref|YP_305624.1|   2.35e-23   0.00017   489-581   1l0q A:302-391  
gi|73669630|ref|YP_305645.1|   1.12e-30   0.00028   1034-1118   1l0q A:302-391  
  1.31e-30   0.00031   874-954   1l0q A:302-391  
  7.72e-30   0.0003   955-1036   1l0q A:302-391  
  2.09e-29   0.00039   274-381   1l0q A:302-391  
  4.05e-27   0.00025   784-868   1l0q A:302-391  
gi|73669663|ref|YP_305678.1|   6.28e-21   0.00055   322-404   1l0q A:302-391  
  8.11e-19   0.00055   226-319   1l0q A:302-391  
gi|73670046|ref|YP_306061.1|   2.22e-20   0.00033   294-388   1l0q A:302-391  
gi|73670161|ref|YP_306176.1|   3.92e-29   0.00036   611-694   1l0q A:302-391  
  1.24e-28   0.00033   775-858   1l0q A:302-391  
  3.01e-28   0.00039   528-612   1l0q A:302-391  
  3.66e-28   0.00043   693-776   1l0q A:302-391  
gi|73670162|ref|YP_306177.1|   0.0000144   0.013   5-37   1l0q A:302-391  
gi|73670248|ref|YP_306263.1|   9.03e-31   0.00018   1697-1783   1l0q A:302-391  
  1.83e-29   0.00023   1162-1250   1l0q A:302-391  
  2.22e-29   0.00033   1252-1335   1l0q A:302-391  
  2.35e-29   0.00036   1877-1957   1l0q A:302-391  
  1.44e-28   0.00028   2040-2121   1l0q A:302-391  
  5.89e-28   0.00025   1959-2039   1l0q A:302-391  
  1.96e-26   0.00034   204-285   1l0q A:302-391  
  2.09e-26   0.00027   1788-1871   1l0q A:302-391  
  2.09e-25   0.00043   634-715   1l0q A:302-391  
  4.84e-25   0.0003   115-197   1l0q A:302-391  
  1.31e-24   0.00036   1335-1417   1l0q A:302-391  
  5.23e-24   0.00024   21-109   1l0q A:302-391  
gi|73670249|ref|YP_306264.1|   1.96e-31   0.00023   961-1085   1l0q A:302-391  
  1.57e-29   0.00033   1755-1835   1l0q A:302-391  
  4.71e-29   0.00037   542-622   1l0q A:302-391  
  7.19e-29   0.00032   1919-1999   1l0q A:302-391  
  1.7e-28   0.0003   460-544   1l0q A:302-391  
  5.1e-28   0.00033   1665-1749   1l0q A:302-391  
  5.49e-27   0.00023   1575-1661   1l0q A:302-391  
  9.03e-27   0.00033   1836-1917   1l0q A:302-391  
  9.42e-27   0.0003   375-458   1l0q A:302-391  
  6.67e-26   0.00038   1090-1173   1l0q A:302-391  
gi|73670260|ref|YP_306275.1|   7.19e-29   0.00039   300-386   1l0q A:302-391  
  3.01e-28   0.00048   388-468   1l0q A:302-391  
  1.06e-27   0.00045   469-550   1l0q A:302-391  
gi|73670309|ref|YP_306324.1|   1.14e-25   0.0006   914-997   1l0q A:302-391  
  9.94e-21   0.00038   429-514   1l0q A:302-391  
  1.01e-18   0.0007   520-600   1l0q A:302-391  
gi|73670310|ref|YP_306325.1|   1.44e-21   0.00037   472-560   1l0q A:302-391  
  6.15e-20   0.00024   562-643   1l0q A:302-391  
gi|73670317|ref|YP_306332.1|   4.58e-22   0.0015   25-112   1l0q A:302-391  
gi|73670318|ref|YP_306333.1|   2.62e-30   0.00041   382-464   1l0q A:302-391  
  6.93e-30   0.00039   297-382   1l0q A:302-391  
  1.44e-29   0.00025   466-546   1l0q A:302-391  
gi|73670340|ref|YP_306355.1|   0.0000000000000458   0.0017   54-116   1l0q A:302-391  
gi|73670378|ref|YP_306393.1|   1.7e-30   0.00051   523-626   1l0q A:302-391  
  3.01e-30   0.00028   629-709   1l0q A:302-391  
  2.88e-28   0.00047   709-790   1l0q A:302-391  
gi|73670389|ref|YP_306404.1|   1.12e-22   0.00022   353-434   1l0q A:302-391  
gi|73670391|ref|YP_306406.1|   6.15e-27   0.00015   616-696   1l0q A:302-391  
  1.23e-25   0.00021   518-613   1l0q A:302-391  
gi|73670595|ref|YP_306610.1|   8.63e-26   0.00024   585-668   1l0q A:302-391  
  4.58e-23   0.00071   312-410   1l0q A:302-391  
  3.01e-22   0.00063   434-499   1l0q A:302-391  
  0.000000000000017   0.0018   510-585   1l0q A:302-391  
gi|73670596|ref|YP_306611.1|   3.14e-18   0.00059   779-859   1l0q A:302-391  
gi|73670730|ref|YP_306745.1|   0.000000000000353   0.0017   58-124   1l0q A:302-391  
gi|73670768|ref|YP_306783.1|   4.84e-24   0.00066   352-437   1l0q A:302-391  
  1.07e-22   0.001   433-535   1l0q A:302-391  
  1.29e-19   0.00046   539-620   1l0q A:302-391  
gi|73670769|ref|YP_306784.1|   2.22e-16   0.0016   12-74   1l0q A:302-391  
gi|73670899|ref|YP_306914.1|   2.62e-31   0.0003   1415-1498   1l0q A:302-391  
  2.88e-28   0.00051   895-977   1l0q A:302-391  
  4.32e-28   0.00023   1066-1147   1l0q A:302-391  
  6.54e-28   0.00034   1501-1583   1l0q A:302-391  
  3.27e-27   0.00051   980-1062   1l0q A:302-391  
  3.53e-27   0.00044   1153-1236   1l0q A:302-391  
  4.45e-27   0.00044   1587-1665   1l0q A:302-391  
  3.14e-26   0.00046   1330-1413   1l0q A:302-391  
gi|73670930|ref|YP_306945.1|   1.7e-26   0.00029   193-283   1l0q A:302-391  
  4.58e-26   0.00021   372-454   1l0q A:302-391  
gi|73671008|ref|YP_307023.1|   5.1e-30   0.00035   315-396   1l0q A:302-391  
  1.19e-29   0.00034   234-314   1l0q A:302-391  
  1.96e-29   0.00041   396-478   1l0q A:302-391  
  3.27e-29   0.00055   96-230   1l0q A:302-391  
  1.44e-28   0.00037   479-560   1l0q A:302-391  
  0.000000000000119   0.0017   36-127   1l0q A:302-391  
gi|73671050|ref|YP_307065.1|   2.49e-31   0.00035   501-585   1l0q A:302-391  
  2.49e-30   0.00032   420-503   1l0q A:302-391  
  5.36e-30   0.00032   666-748   1l0q A:302-391  
  4.58e-29   0.00039   586-668   1l0q A:302-391  
  1.96e-28   0.00028   321-418   1l0q A:302-391  
gi|73671134|ref|YP_307149.1|   3.53e-20   0.001   346-429   1l0q A:302-391  
  1.83e-19   0.00065   437-516   1l0q A:302-391  
gi|73671163|ref|YP_307178.1|   7.72e-31   0.00033   734-813   1l0q A:302-391  
gi|73671164|ref|YP_307179.1|   3.14e-30   0.00021   591-670   1l0q A:302-391  
  3.66e-30   0.00033   1356-1435   1l0q A:302-391  
  9.03e-30   0.00033   1436-1517   1l0q A:302-391  
  1.31e-29   0.00029   1518-1599   1l0q A:302-391  
gi|73671165|ref|YP_307180.1|   3.4e-32   0.00018   150-236   1l0q A:302-391  
  7.46e-31   0.00036   331-410   1l0q A:302-391  
  1.57e-29   0.00024   411-492   1l0q A:302-391  
  7.19e-29   0.0003   493-574   1l0q A:302-391  
  1.31e-26   0.00024   240-324   1l0q A:302-391  

Methanosarcina mazei Tuc01 has 3 significant domains in 2 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
gi|452210260|ref|YP_007490374.1|   9.16e-24   0.0000876   341-423   1l0q A:302-391  
  3.4e-24   0.0000979   684-790   1l0q A:302-391  
  4.58e-24   0.00048   1043-1122   1l0q A:302-391  
  9.42e-23   0.00000465   313-395   1l0q A:302-391  
  3.53e-22   0.001   792-867   1l0q A:302-391  
 
Weak hits:
gi|452208665|ref|YP_007488779.1|   1.2e-24   0.00012   774-859   1l0q A:302-391  
  6.02e-23   0.00026   381-464   1l0q A:302-391  
gi|452208686|ref|YP_007488800.1|   1.96e-18   0.00053   314-395   1l0q A:302-391  
gi|452208688|ref|YP_007488802.1|   5.62e-26   0.00012   617-703   1l0q A:302-391  
  8.11e-19   0.00062   712-791   1l0q A:302-391  
gi|452208882|ref|YP_007488996.1|   1.83e-29   0.00046   19-114   1l0q A:302-391  
  1.23e-26   0.00031   205-278   1l0q A:302-391  
  1.57e-26   0.0007   369-450   1l0q A:302-391  
  6.93e-26   0.00038   118-201   1l0q A:302-391  
  1.28e-24   0.00035   541-617   1l0q A:302-391  
  1.7e-23   0.00031   454-536   1l0q A:302-391  
  6.15e-23   0.0004   285-367   1l0q A:302-391  
gi|452208991|ref|YP_007489105.1|   8.11e-21   0.00025   326-411   1l0q A:302-391  
  1.31e-18   0.00042   417-498   1l0q A:302-391  
gi|452208998|ref|YP_007489112.1|   1.06e-25   0.00012   609-699   1l0q A:302-391  
gi|452210168|ref|YP_007490282.1|   7.32e-32   0.00021   295-387   1l0q A:302-391  
  0.000249   0.02   394-426   1l0q A:302-391  
gi|452210169|ref|YP_007490283.1|   1.05e-29   0.00015   293-379   1l0q A:302-391  
  6.93e-22   0.00032   387-468   1l0q A:302-391  
  5.89e-20   0.00025   473-555   1l0q A:302-391  
  1.14e-16   0.00055   556-637   1l0q A:302-391  
gi|452210553|ref|YP_007490667.1|   1.05e-22   0.00041   924-1008   1l0q A:302-391  
  1.06e-21   0.00031   433-520   1l0q A:302-391  
  3.4e-21   0.00046   522-602   1l0q A:302-391  
  6.15e-21   0.0004   683-764   1l0q A:302-391  
  1.7e-20   0.00042   764-846   1l0q A:302-391  
  2.22e-20   0.0006   1085-1174   1l0q A:302-391  
  5.62e-20   0.00033   601-684   1l0q A:302-391  
  3.66e-19   0.00059   1006-1088   1l0q A:302-391  
  1.57e-18   0.0004   845-925   1l0q A:302-391  
gi|452210657|ref|YP_007490771.1|   0.00451   0.01   25-57   1b4r A:  
gi|452210764|ref|YP_007490878.1|   2.88e-25   0.00075   156-250   1l0q A:302-391  
gi|452210816|ref|YP_007490930.1|   3.4e-26   0.00051   101-203   1l0q A:302-391  
  7.06e-19   0.0006   213-292   1l0q A:302-391  
gi|452210990|ref|YP_007491104.1|   6.8e-29   0.00041   871-952   1l0q A:302-391  
  9.29e-28   0.00033   1306-1387   1l0q A:302-391  
  6.41e-27   0.00052   1219-1302   1l0q A:302-391  
  7.85e-27   0.0005   957-1037   1l0q A:302-391  
  4.97e-26   0.00038   1478-1557   1l0q A:302-391  
  1.28e-25   0.0004   1392-1472   1l0q A:302-391  
  1.57e-25   0.00063   1128-1208   1l0q A:302-391  
  1.06e-24   0.00054   1560-1639   1l0q A:302-391  
gi|452211138|ref|YP_007491252.1|   9.29e-27   0.00055   776-869   1l0q A:302-391  
  3.14e-18   0.00032   357-459   1l0q A:302-391  
gi|452211446|ref|YP_007491560.1|   9.81e-28   0.00018   647-730   1l0q A:302-391  
  4.58e-27   0.00035   564-651   1l0q A:302-391  
  1.96e-18   0.00081   480-565   1l0q A:302-391  
  4.05e-18   0.00062   738-819   1l0q A:302-391  
gi|452211568|ref|YP_007491682.1|   1.83e-25   0.00032   514-594   1l0q A:302-391  
gi|452211579|ref|YP_007491693.1|   0.00222   0.0065   53-109   1l0q A:302-391  
gi|452211677|ref|YP_007491791.1|   5.49e-28   0.00019   185-273   1l0q A:302-391  
  7.85e-28   0.00016   86-176   1l0q A:302-391  
  0.0000000000955   0.0022   35-80   1l0q A:302-391  
  0.00000129   0.0026   283-319   1l0q A:302-391  
gi|452211680|ref|YP_007491794.1|   1.83e-21   0.00021   361-434   1l0q A:302-391  
gi|452211688|ref|YP_007491802.1|   1.7e-20   0.00045   237-314   1l0q A:302-391  
  1.44e-16   0.00072   322-402   1l0q A:302-391  
gi|452211714|ref|YP_007491828.1|   3.66e-24   0.00031   581-661   1l0q A:302-391  
  9.16e-21   0.00022   485-579   1l0q A:302-391  

Jump to [ Top of page · Assignment details · Add assignments from individual genomes ]


Add assignments from groups of genomes

View all assignments containing a PKD domain domain in each group of genomes.

Jump to [ Top of page · Assignment details · Add assignments from groups of genomes ]


Add assignments from individual genomes

Select additional genomes you would like to see domain assignments for, then click 'Submit'.

Select to display   Genome       Domains   Proteins
No Yes ALL   1646 1646
No Yes Homo sapiens 76_38 Human 5 5
No Yes Pan troglodytes 76_2.1.4 Chimpanzee 1 1
No Yes Gorilla gorilla 76_3.1 Western gorilla 3 3
No Yes Pongo abelii 76_2 Sumatran orangutan 2 2
No Yes Papio anubis 76 Olive baboon 2 2
No Yes Macaca mulatta 76_1 Rhesus monkey 2 2
No Yes Callithrix jacchus 76_3.2.1 White-tufted-ear marmoset 1 1
No Yes Otolemur garnettii 76_3 Small-eared galago 2 2
No Yes Microcebus murinus 76_1 Gray mouse lemur 1 1
No Yes Rattus norvegicus 76_5.0 Norway rat 2 2
No Yes Mus musculus 76_38 House mouse 2 2
No Yes Dipodomys ordii 76_1 Ord's kangaroo rat 1 1
No Yes Ictidomys tridecemlineatus 76_2 Thirteen-lined ground squirrel 2 2
No Yes Heterocephalus glaber v1.7-2 Naked mole-rat 2 2
No Yes Cavia porcellus 76_3 Domestic guinea pig 2 2
No Yes Oryctolagus cuniculus 76_2 Rabbit 1 1
No Yes Ochotona princeps 76 American pika 1 1
No Yes Sus scrofa 76_10.2 Pig 1 1
No Yes Bos taurus 76_3.1 Cattle 2 2
No Yes Ovis aries 76_3.1 Sheep 2 2
No Yes Tursiops truncatus 76_1 Bottlenose dolphin 2 2
No Yes Mustela putorius furo 76_1.0 Domestic ferret 2 2
No Yes Ailuropoda melanoleuca 76_1 Giant panda 2 2
No Yes Canis familiaris 76_3.1 Dog 2 2
No Yes Felis catus 76_6.2 Domestic cat 2 2
No Yes Equus caballus 76_2 Horse 4 4
No Yes Myotis lucifugus 76_2.0 Little brown bat 1 1
No Yes Pteropus vampyrus 76_1 Large flying fox 2 2
No Yes Erinaceus europaeus 76 Western European hedgehog 1 1
No Yes Dasypus novemcinctus 76_2 Nine-banded armadillo 2 2
No Yes Macropus eugenii 76_1.0 Tammar wallaby 1 1
No Yes Monodelphis domestica 76_5 Gray short-tailed opossum 1 1
No Yes Meleagris gallopavo 76_2 Turkey 1 1
No Yes Gallus gallus 76_4 Chicken 1 1
No Yes Anas platyrhynchos 76_1.0 Mallard 1 1
No Yes Taeniopygia guttata 76_3.2.4 Zebra finch 1 1
No Yes Ficedula albicollis 76_1.0 Collared flycatcher 1 1
No Yes Pelodiscus sinensis 76_1.0 Chinese soft-shelled turtle 2 2
No Yes Anolis carolinensis 76_2.0 Green anole 1 1
No Yes Xenopus tropicalis 76_4.2 Tropical clawed frog 1 1
No Yes Latimeria chalumnae 76_1 Coelacanth 1 1
No Yes Lepisosteus oculatus 76 Spotted gar 1 1
No Yes Gadus morhua 76_1 Atlantic cod 1 1
No Yes Takifugu rubripes 76_4 Torafugu 2 2
No Yes Gasterosteus aculeatus 76_1 Three-spined stickleback 1 1
No Yes Xiphophorus maculatus 76_4.4.2 Southern platyfish 1 1
No Yes Poecilia formosa 76 Amazon molly 1 1
No Yes Oreochromis niloticus 76_1.0 Nile tilapia 1 1
No Yes Astyanax mexicanus 76 Mexican tetra 2 2
No Yes Danio rerio 76_9 Zebrafish 1 1
No Yes Methanosarcina acetivorans C2A   4 3
No Yes Methanosarcina mazei Go1   3 2
No Yes Methanosarcina barkeri str. Fusaro   6 5
No Yes Xenopus (Silurana) tropicalis v7.1 (annotation v7.2) Tropical clawed frog 1 1
No Yes Methanosarcina mazei Tuc01   3 2
No Yes Homo sapiens 75_37 (old version GRC) Human 5 5
No Yes Homo sapiens (NCBI version) Human 3 3
No Yes Mus musculus 63_37 (longest transcript per gene) (Duplicate) House mouse 2 2
No Yes Homo sapiens 69_37 Human 2 2
No Yes Pan troglodytes 69_2.1.4 Chimpanzee 1 1
No Yes Gorilla gorilla 69_3.1 Western gorilla 2 2
No Yes Pongo abelii 69_2 Sumatran orangutan 2 2
No Yes Macaca mulatta 69_1 Rhesus monkey 1 1
No Yes Callithrix jacchus 69_3.2.1 White-tufted-ear marmoset 1 1
No Yes Otolemur garnettii 69_3 Small-eared galago 2 2
No Yes Microcebus murinus 69_1 Gray mouse lemur 1 1
No Yes Rattus norvegicus 69_3.4 Norway rat 2 2
No Yes Mus musculus 69_38 House mouse 2 2
No Yes Dipodomys ordii 69_1 Ord's kangaroo rat 1 1
No Yes Ictidomys tridecemlineatus 69_2 Thirteen-lined ground squirrel 2 2
No Yes Cavia porcellus 69_3 Domestic guinea pig 2 2
No Yes Ochotona princeps 69 American pika 1 1
No Yes Sus scrofa 69_10.2 Pig 1 1
No Yes Bos taurus 69_3.1 Cattle 2 2
No Yes Tursiops truncatus 69_1 Bottlenose dolphin 2 2
No Yes Mustela putorius furo 69_1.0 Domestic ferret 2 2
No Yes Ailuropoda melanoleuca 69_1 Giant panda 2 2
No Yes Canis familiaris 69_3.1 Dog 2 2
No Yes Felis catus 69 Domestic cat 1 1
No Yes Equus caballus 69_2 Horse 2 2
No Yes Myotis lucifugus 69_2.0 Little brown bat 1 1
No Yes Pteropus vampyrus 69_1 Large flying fox 2 2
No Yes Erinaceus europaeus 69 Western European hedgehog 1 1
No Yes Macropus eugenii 69_1.0 Tammar wallaby 1 1
No Yes Monodelphis domestica 69_5 Gray short-tailed opossum 1 1
No Yes Meleagris gallopavo 69_2 Turkey 1 1
No Yes Gallus gallus 69_2 Chicken 1 1
No Yes Taeniopygia guttata 69_3.2.4 Zebra finch 1 1
No Yes Pelodiscus sinensis 69_1.0 Chinese soft-shelled turtle 1 1
No Yes Anolis carolinensis 69_2.0 Green anole 1 1
No Yes Xenopus tropicalis 69_4.2 Tropical clawed frog 1 1
No Yes Latimeria chalumnae 69_1 Coelacanth 1 1
No Yes Gadus morhua 69_1 Atlantic cod 1 1
No Yes Takifugu rubripes 69_4 Torafugu 1 1
No Yes Gasterosteus aculeatus 69_1 Three-spined stickleback 1 1
No Yes Xiphophorus maculatus 69_4.4.2 Southern platyfish 1 1
No Yes Oreochromis niloticus 69_1.0 Nile tilapia 1 1
No Yes Danio rerio 69_9 Zebrafish 1 1
No Yes NCBI 2017_08 genome   875 791
No Yes STRING v9.0.5 (STRING)   40 37
No Yes Uniprot 2018_03 genome   450 399
No Yes PDB chains (SCOP 1.75) (PDB)   3 3
No Yes Protein Data Bank (all PDB sequenc)   9 9
No Yes SCOP2 SCOPe CATH ECOD (all domain sequ)   18 18
No Yes TargetDB (Targets)   7 7

Jump to [ Top of page · Assignment details · Add assignments from groups of genomes · Add assignments from individual genomes ]