SUPERFAMILY 1.75 HMM library and genome assignments server

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Fibritin superfamily domain assignments
in
all genomes

Network of domain occurrence in all genomes


Assignment details

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16 selected genomes have 1190 significant domains in 935 proteins.


Geobacter bemidjiensis Bem has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Evalue   Region   Family  
gi|197117547|ref|YP_002137974.1|   0.00000314   345-371   Fibritin  

Sinorhizobium meliloti SM11 has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Evalue   Region   Family  
gi|384535350|ref|YP_005719435.1|   0.0000157   328-361   Fibritin  
  0.000235   282-319   Fibritin  
  0.0103   51-74   Fibritin  
  0.0353   222-244   Fibritin  

Activated sludge plasmid pool Morges-2009 (Newbler) (meta-genome) has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Evalue   Region   Family  
2036059771   0.00000255   28-70   Fibritin  
 
Weak hits:
2036058929   0.0745   9-43   Fibritin  

Dendroctonus ponderosae beetle community (MPB hybrid beetle) (Lodgepole pine) (meta-genome) has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Evalue   Region   Family  
2035172699   0.0000706   45-67   Fibritin  
  0.00216   73-94   Fibritin  

Dump bottom (Dump bottom) (meta-genome) has 2 significant domains in 2 proteins.

     

Sequence ID   Evalue   Region   Family  
2034702039   0.0000589   9-42   Fibritin  
2035091490   0.0000141   2-23   Fibritin  
 
Weak hits:
2034685501   0.000334   32-56   Fibritin  
2034829800   0.0589   43-67   Fibritin  
2034862045   0.00384   15-81   Fibritin  
2034875124   0.0149   9-63   Fibritin  
2034913210   0.0549   12-46   Fibritin  
2034943722   0.0902   9-46   Fibritin  
2035098510   0.0326   22-75   Fibritin  
2035136817   0.0549   15-73   Fibritin  

Fungus garden microbial communities from Atta colombica in Panama, sample from fungus garden bottom (Fungus garden bottom) (meta-genome) has 2 significant domains in 2 proteins.

     

Sequence ID   Evalue   Region   Family  
2030721091   0.0000392   96-113   Fibritin  
  0.000235   41-63   Fibritin  
  0.00144   66-87   Fibritin  
  0.0122   17-42   Fibritin  
2030796840   0.0000706   2-45   Fibritin  
 
Weak hits:
2030682165   0.0131   1000-1022   Fibritin  
  0.0169   975-998   Fibritin  
2030702102   0.0126   4-37   Fibritin  
2030763498   0.0667   4-52   Fibritin  
2030785293   0.0204   42-100   Fibritin  
2030835039   0.0608   87-128   Fibritin  
2030878968   0.00235   17-67   Fibritin  

Macropus eugenii forestomach microbiome from Canberra, Australia, sample Macropus_eugenii_combined (meta-genome) has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Evalue   Region   Family  
2013447662   0.000022   16-92   Fibritin  
 
Weak hits:
2013470553   0.0259   93-152   Fibritin  
2013492313   0.0314   98-113   Fibritin  

NCBI 2017_08 genome has 463 significant domains in 388 proteins.

     

Sequence ID   Evalue   Region   Family  
NP_049771.1.34590   2.78e-40   372-484   Fibritin  
  1.54e-37   4-108   Fibritin  
NP_861864.1.41520   7.85e-38   369-479   Fibritin  
  1.96e-36   2-107   Fibritin  
NP_891719.1.85104   2.94e-35   5-110   Fibritin  
  0.000785   373-449   Fibritin  
NP_899595.1.10495   1.29e-27   8-110   Fibritin  
NP_932503.1.7886   2.94e-37   5-110   Fibritin  
NP_944095.1.33347   6.47e-27   7-93   Fibritin  
WP_005495371.1.100143   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_005495371.1.100951   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_005495371.1.101108   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_005495371.1.102109   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_005495371.1.10270   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_005495371.1.10558   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_005495371.1.108   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_005495371.1.10872   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_005495371.1.12933   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_005495371.1.13595   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_005495371.1.15887   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_005495371.1.16091   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_005495371.1.16138   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_005495371.1.17331   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_005495371.1.22903   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_005495371.1.234   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_005495371.1.24359   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_005495371.1.24486   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_005495371.1.25315   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_005495371.1.25430   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_005495371.1.26160   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_005495371.1.26203   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_005495371.1.26685   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_005495371.1.26700   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_005495371.1.26870   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_005495371.1.27033   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_005495371.1.27735   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_005495371.1.28753   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_005495371.1.29877   0.0000902   157-196   Fibritin  
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WP_005495371.1.31646   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_005495371.1.31765   0.0000902   157-196   Fibritin  
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WP_005495371.1.35267   0.0000902   157-196   Fibritin  
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WP_005495371.1.3696   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_005495371.1.36970   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_005495371.1.36990   0.0000902   157-196   Fibritin  
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WP_005495371.1.89122   0.0000902   157-196   Fibritin  
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WP_005495371.1.97659   0.0000902   157-196   Fibritin  
WP_009331128.1.59445   0.0000589   35-108   Fibritin  
WP_009331128.1.65381   0.0000589   35-108   Fibritin  
WP_009331128.1.8709   0.0000589   35-108   Fibritin  
WP_010762087.1.20117   0.0000118   130-166   Fibritin  
WP_010762087.1.202   0.0000118   130-166   Fibritin  
WP_010762087.1.24920   0.0000118   130-166   Fibritin  
WP_010770316.1.11153   0.0000667   131-170   Fibritin  
WP_010770316.1.48525   0.0000667   131-170   Fibritin  
WP_010770316.1.93241   0.0000667   131-170   Fibritin  
WP_012529591.1.31571   0.00000314   345-371   Fibritin  
WP_014529182.1.30341   0.0000157   328-361   Fibritin  
  0.000235   282-319   Fibritin  
  0.0103   51-74   Fibritin  
  0.0353   222-244   Fibritin  
WP_014529182.1.48083   0.0000157   328-361   Fibritin  
  0.000235   282-319   Fibritin  
  0.0103   51-74   Fibritin  
  0.0353   222-244   Fibritin  
WP_014529182.1.50755   0.0000157   328-361   Fibritin  
  0.000235   282-319   Fibritin  
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