SUPERFAMILY 1.75 HMM library and genome assignments server

SUPERFAMILY 2 can be accessed from supfam.org. Please contact us if you experience any problems.


GARP response regulators family domain assignments
in
all eukaryotic genomes

Assignment details

(show help)

5 selected genomes have 5 significant domains in 5 proteins.


Thellungiella halophila v173 has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
Thhalv10024866m|PACid:20193933   3.14e-19   0.0001   185-244   1irz A:  
 
Weak hits:
Thhalv10000098m|PACid:20208560   1.97e-19   0.00024   193-252   1irz A:  
Thhalv10000498m|PACid:20208598   2.69e-17   0.0025   48-104   1irz A:  
Thhalv10000980m|PACid:20202929   6.45e-18   0.0026   14-69   1irz A:  
Thhalv10000981m|PACid:20202927   6.45e-18   0.0026   14-69   1irz A:  
Thhalv10000982m|PACid:20202928   6.45e-18   0.0026   14-69   1irz A:  
Thhalv10001175m|PACid:20202642   1.97e-16   0.0034   7-64   1irz A:  
Thhalv10001986m|PACid:20200500   1.16e-17   0.001   167-225   1irz A:  
Thhalv10002005m|PACid:20200467   4.84e-18   0.0036   233-289   1irz A:  
Thhalv10002605m|PACid:20196779   1.74e-19   0.00057   151-211   1irz A:  
Thhalv10002625m|PACid:20196597   6.09e-17   0.0024   39-95   1irz A:  
Thhalv10002873m|PACid:20196809   0.000000000000932   0.0049   98-153   1irz A:  
Thhalv10003223m|PACid:20208029   2.6e-19   0.00079   142-201   1irz A:  
Thhalv10003256m|PACid:20208018   0.00000000000000179   0.0022   106-162   1irz A:  
Thhalv10004257m|PACid:20199040   2.57e-17   0.0037   231-291   1irz A:  
Thhalv10004351m|PACid:20199506   3.58e-17   0.0032   214-270   1irz A:  
Thhalv10004402m|PACid:20199069   6.81e-18   0.0004   193-252   1irz A:  
Thhalv10004475m|PACid:20198919   9.56e-18   0.0034   204-264   1irz A:  
Thhalv10004791m|PACid:20199217   0.0000000000000122   0.0032   35-87   1irz A:  
Thhalv10005377m|PACid:20199105   0.00000000000000197   0.001   198-255   1irz A:  
Thhalv10006452m|PACid:20190085   7.35e-16   0.00081   210-274   1irz A:  
Thhalv10007844m|PACid:20188222   0.00000000000000197   0.0025   216-272   1irz A:  
Thhalv10008054m|PACid:20188277   4.35e-17   0.0025   186-245   1irz A:  
Thhalv10008069m|PACid:20188278   1.62e-18   0.0023   186-244   1irz A:  
Thhalv10008115m|PACid:20186522   7.89e-18   0.003   208-268   1irz A:  
Thhalv10008235m|PACid:20186578   0.000000000000043   0.0021   10-68   1irz A:  
Thhalv10008620m|PACid:20186810   0.00000000000000914   0.0036   25-77   1irz A:  
Thhalv10011605m|PACid:20184973   1.08e-17   0.0027   216-276   1irz A:  
Thhalv10012052m|PACid:20184974   0.00000000000233   0.0022   244-306   1irz A:  
Thhalv10013675m|PACid:20203564   0.00000000000000233   0.0022   227-283   1irz A:  
Thhalv10013729m|PACid:20206216   2.51e-17   0.0029   44-100   1irz A:  
Thhalv10013850m|PACid:20205333   3.05e-17   0.0027   192-249   1irz A:  
Thhalv10014387m|PACid:20203575   2.33e-20   0.00061   81-141   1irz A:  
Thhalv10015296m|PACid:20204158   2.24e-20   0.0004   182-242   1irz A:  
Thhalv10015308m|PACid:20203612   0.0000000000000167   0.00091   168-218   1irz A:  
Thhalv10015618m|PACid:20204427   0.00251   0.0095   79-104   1irz A:  
Thhalv10016040m|PACid:20204968   1.27e-16   0.0006   226-284   1irz A:  
Thhalv10016733m|PACid:20180518   3.94e-16   0.0038   84-142   1irz A:  
Thhalv10016890m|PACid:20181059   0.0000000000000197   0.0039   51-107   1irz A:  
Thhalv10017090m|PACid:20179918   0.000000000000159   0.0038   55-108   1irz A:  
Thhalv10017945m|PACid:20179583   1.06e-19   0.00064   99-159   1irz A:  
Thhalv10018396m|PACid:20191490   3.4e-16   0.00056   189-249   1irz A:  
Thhalv10018737m|PACid:20192094   9.86e-18   0.003   221-282   1irz A:  
Thhalv10018760m|PACid:20191502   1.77e-16   0.003   33-89   1irz A:  
Thhalv10018902m|PACid:20191479   0.0000000000000043   0.0035   9-64   1irz A:  
Thhalv10019466m|PACid:20190955   0.00145   0.01   228-267   1irz A:  
Thhalv10019755m|PACid:20192187   0.00000000305   0.0054   234-287   1irz A:  
Thhalv10019799m|PACid:20191065   0.00000000681   0.0053   234-287   1irz A:  
Thhalv10020213m|PACid:20183188   0.00000000000000179   0.00052   234-285   1irz A:  
Thhalv10020738m|PACid:20182215   0.00000000000000113   0.0033   230-286   1irz A:  
Thhalv10020739m|PACid:20182216   0.00000000000000113   0.0033   230-286   1irz A:  
Thhalv10020861m|PACid:20183249   4.66e-17   0.0027   45-101   1irz A:  
Thhalv10020941m|PACid:20181697   5.02e-17   0.0034   177-233   1irz A:  
Thhalv10020942m|PACid:20181696   5.02e-17   0.0034   177-233   1irz A:  
Thhalv10021133m|PACid:20183502   6.45e-20   0.0006   99-159   1irz A:  
Thhalv10021440m|PACid:20182989   8.96e-17   0.0017   22-78   1irz A:  
Thhalv10022243m|PACid:20183766   1.7e-18   0.00055   205-265   1irz A:  
Thhalv10024686m|PACid:20192788   6.63e-20   0.00037   208-267   1irz A:  
Thhalv10024919m|PACid:20195144   1.97e-18   0.0012   294-352   1irz A:  
Thhalv10025327m|PACid:20194365   6.27e-17   0.003   231-285   1irz A:  
Thhalv10025330m|PACid:20194364   6.27e-17   0.003   231-285   1irz A:  
Thhalv10025593m|PACid:20195927   4.18e-17   0.0025   206-267   1irz A:  
Thhalv10025808m|PACid:20194366   3.94e-17   0.003   231-285   1irz A:  
Thhalv10025876m|PACid:20196016   4.84e-17   0.0024   36-93   1irz A:  
Thhalv10025891m|PACid:20196018   4.66e-17   0.0024   36-93   1irz A:  
Thhalv10025898m|PACid:20196017   4.66e-17   0.0024   36-93   1irz A:  
Thhalv10026166m|PACid:20193553   0.00000000000000269   0.0028   72-129   1irz A:  

Capsella rubella v183 has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
Carubv10004554m|PACid:20895707   1e-18   0.0000786   181-240   1irz A:  
 
Weak hits:
Carubv10001064m|PACid:20909808   3.23e-16   0.003   232-288   1irz A:  
Carubv10001104m|PACid:20909599   0.00000000000000233   0.0022   219-275   1irz A:  
Carubv10001129m|PACid:20908178   2.51e-17   0.0029   44-100   1irz A:  
Carubv10001148m|PACid:20908179   2.51e-17   0.0029   44-100   1irz A:  
Carubv10002022m|PACid:20908104   3.23e-16   0.0044   19-75   1irz A:  
Carubv10003097m|PACid:20909782   0.00000000000000215   0.0022   13-68   1irz A:  
Carubv10003130m|PACid:20910244   2.33e-20   0.00061   78-138   1irz A:  
Carubv10003217m|PACid:20907968   1.49e-17   0.0024   194-251   1irz A:  
Carubv10003421m|PACid:20910614   3.4e-17   0.00061   226-285   1irz A:  
Carubv10003825m|PACid:20909049   0.00000000000000466   0.0056   15-71   1irz A:  
Carubv10004540m|PACid:20897050   1.97e-18   0.001   295-353   1irz A:  
Carubv10004940m|PACid:20894559   4.3e-17   0.0024   259-320   1irz A:  
Carubv10005261m|PACid:20896457   0.00000000000000502   0.0028   161-218   1irz A:  
Carubv10005268m|PACid:20896458   0.00000000000000484   0.0028   161-218   1irz A:  
Carubv10005375m|PACid:20894195   4.84e-17   0.0024   36-93   1irz A:  
Carubv10005378m|PACid:20894560   0.00645   0.026   259-285   1irz A:  
Carubv10005390m|PACid:20894196   4.66e-17   0.0024   36-93   1irz A:  
Carubv10005605m|PACid:20896459   0.00000000000000305   0.0028   161-218   1irz A:  
Carubv10006317m|PACid:20895933   4.84e-17   0.0006   225-284   1irz A:  
Carubv10007581m|PACid:20896090   7.17e-20   0.00037   208-267   1irz A:  
Carubv10007858m|PACid:20895170   4.66e-17   0.00067   206-265   1irz A:  
Carubv10009328m|PACid:20891640   0.00000000000000215   0.0025   225-281   1irz A:  
Carubv10009492m|PACid:20893120   4.61e-18   0.0027   229-289   1irz A:  
Carubv10009677m|PACid:20890523   5.82e-18   0.0034   191-251   1irz A:  
Carubv10010057m|PACid:20892977   0.00000000000000358   0.0032   24-76   1irz A:  
Carubv10011077m|PACid:20891549   0.0000000000095   0.0015   379-441   1irz A:  
Carubv10011925m|PACid:20889315   1.88e-16   0.0028   179-238   1irz A:  
Carubv10012777m|PACid:20911214   0.00000968   0.023   19-52   1irz A:  
Carubv10013107m|PACid:20899210   1.67e-19   0.00033   235-294   1irz A:  
Carubv10013614m|PACid:20900665   3.05e-17   0.0036   304-359   1irz A:  
Carubv10013697m|PACid:20900666   2.69e-17   0.0036   280-335   1irz A:  
Carubv10013698m|PACid:20897549   9.5e-16   0.0029   235-290   1irz A:  
Carubv10013706m|PACid:20897550   9.5e-16   0.0029   234-289   1irz A:  
Carubv10013867m|PACid:20898363   4.66e-16   0.003   196-252   1irz A:  
Carubv10013932m|PACid:20900328   4.48e-17   0.0027   27-83   1irz A:  
Carubv10014114m|PACid:20901005   6.81e-19   0.001   153-212   1irz A:  
Carubv10014134m|PACid:20898980   6.81e-20   0.0006   98-158   1irz A:  
Carubv10014180m|PACid:20900329   0.0149   0.033   2-24   1irz A:  
Carubv10014213m|PACid:20900330   0.0145   0.033   2-24   1irz A:  
Carubv10014526m|PACid:20900566   5.02e-17   0.0022   22-78   1irz A:  
Carubv10015062m|PACid:20899402   5.73e-17   0.0026   40-96   1irz A:  
Carubv10016382m|PACid:20898776   0.0000000000000269   0.0037   77-132   1irz A:  
Carubv10017308m|PACid:20887957   2.54e-17   0.0037   228-288   1irz A:  
Carubv10017538m|PACid:20885765   0.0000000000000167   0.0042   99-151   1irz A:  
Carubv10017553m|PACid:20885766   0.0000000000000167   0.0042   99-151   1irz A:  
Carubv10017603m|PACid:20885763   1.72e-19   0.00057   144-204   1irz A:  
Carubv10017606m|PACid:20885764   1.72e-19   0.00057   144-204   1irz A:  
Carubv10017769m|PACid:20888236   6.27e-18   0.0026   14-69   1irz A:  
Carubv10018465m|PACid:20886933   4.66e-18   0.00051   274-333   1irz A:  
Carubv10018983m|PACid:20888158   1.03e-17   0.0033   189-249   1irz A:  
Carubv10019443m|PACid:20885866   0.00000000215   0.0016   210-279   1irz A:  
Carubv10020133m|PACid:20906326   3.4e-16   0.00056   191-251   1irz A:  
Carubv10020551m|PACid:20906668   1.74e-16   0.003   33-89   1irz A:  
Carubv10020552m|PACid:20906062   1.61e-17   0.003   212-273   1irz A:  
Carubv10020610m|PACid:20906819   0.00000000000000717   0.0029   33-88   1irz A:  
Carubv10022138m|PACid:20904595   0.000000000000069   0.0028   226-282   1irz A:  
Carubv10022837m|PACid:20904137   2.87e-19   0.00027   188-247   1irz A:  
Carubv10023302m|PACid:20904135   5.02e-16   0.0036   83-141   1irz A:  
Carubv10023575m|PACid:20903487   0.0000000000000197   0.0039   51-107   1irz A:  
Carubv10024503m|PACid:20902125   0.0000000000000717   0.0043   53-107   1irz A:  
Carubv10024859m|PACid:20903875   1.06e-19   0.00064   107-167   1irz A:  
Carubv10024931m|PACid:20901173   3.05e-16   0.001   13-73   1irz A:  
Carubv10026052m|PACid:20911706   2.06e-20   0.00036   198-258   1irz A:  
Carubv10026054m|PACid:20911707   2.06e-20   0.00036   195-255   1irz A:  
Carubv10026091m|PACid:20911708   1.88e-20   0.00036   160-220   1irz A:  
Carubv10026528m|PACid:20911734   6.54e-20   0.00066   156-215   1irz A:  
Carubv10026895m|PACid:20913396   9.85e-19   0.00052   134-194   1irz A:  
Carubv10026920m|PACid:20913697   0.00000000000000179   0.0022   109-165   1irz A:  
Carubv10027834m|PACid:20912113   1.97e-16   0.0034   7-64   1irz A:  
Carubv10027854m|PACid:20914061   0.0000000000000466   0.00099   228-283   1irz A:  
Carubv10028086m|PACid:20912466   0.00000000000269   0.0021   90-144   1irz A:  

Arabidopsis lyrata has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
jgi|Araly1|857408|Al_scaffold_0007_907   4.66e-19   0.0000613   181-240   1irz A:  
 
Weak hits:
jgi|Araly1|315838|fgenesh1_pm.C_scaffold_2000871   0.0502   0.017   225-259   1irz A:  
jgi|Araly1|317308|fgenesh1_pm.C_scaffold_3000324   1.09e-17   0.003   236-292   1irz A:  
jgi|Araly1|319110|fgenesh1_pm.C_scaffold_3002126   6.09e-17   0.0026   40-96   1irz A:  
jgi|Araly1|319343|fgenesh1_pm.C_scaffold_3002359   0.000000000000136   0.0036   93-148   1irz A:  
jgi|Araly1|321718|fgenesh1_pm.C_scaffold_4001775   5.02e-16   0.0036   81-139   1irz A:  
jgi|Araly1|321945|fgenesh1_pm.C_scaffold_4002002   0.0000000000000233   0.005   53-107   1irz A:  
jgi|Araly1|322721|fgenesh1_pm.C_scaffold_5000265   1.1e-16   0.0028   191-251   1irz A:  
jgi|Araly1|325337|fgenesh1_pm.C_scaffold_6000557   2.87e-17   0.00063   228-287   1irz A:  
jgi|Araly1|343166|fgenesh1_pg.C_scaffold_3002929   0.0000147   0.0088   44-80   1irz A:  
jgi|Araly1|352378|fgenesh1_pg.C_scaffold_6002971   0.000000000000163   0.0079   13-72   1irz A:  
jgi|Araly1|352380|fgenesh1_pg.C_scaffold_6002973   0.0000000000000133   0.005   13-71   1irz A:  
jgi|Araly1|352381|fgenesh1_pg.C_scaffold_6002974   0.000000233   0.013   14-48   1irz A:  
jgi|Araly1|356449|fgenesh1_pg.C_scaffold_8000236   2.15e-16   0.0034   23-80   1irz A:  
jgi|Araly1|357174|fgenesh1_pg.C_scaffold_8000961   1.16e-17   0.00077   219-274   1irz A:  
jgi|Araly1|471638|fgenesh2_kg.1__1592__AT1G14600.1   0.00000000000000358   0.0032   24-76   1irz A:  
jgi|Araly1|473414|fgenesh2_kg.1__3368__AT1G32240.1   0.00000000000000197   0.0025   210-266   1irz A:  
jgi|Araly1|474061|fgenesh2_kg.1__4015__AT1G49190.1   0.00000000000151   0.0012   332-394   1irz A:  
jgi|Araly1|474091|fgenesh2_kg.1__4045__AT1G49560.1   9.86e-17   0.0038   184-244   1irz A:  
jgi|Araly1|475994|fgenesh2_kg.2__1124__AT1G68670.1   1.61e-17   0.003   211-272   1irz A:  
jgi|Araly1|476093|fgenesh2_kg.2__1223__AT1G69580.2   0.00000000000000466   0.0026   28-83   1irz A:  
jgi|Araly1|477109|fgenesh2_kg.2__2239__AT1G79430.2   1.63e-16   0.003   24-80   1irz A:  
jgi|Araly1|478672|fgenesh2_kg.3__1373__AT3G13040.1   0.00000000000000111   0.0035   235-290   1irz A:  
jgi|Araly1|479152|fgenesh2_kg.3__1853__AT3G16857.2   4.66e-17   0.0005   233-291   1irz A:  
jgi|Araly1|480887|fgenesh2_kg.3__3588__AT2G20570.1   1.16e-18   0.001   151-209   1irz A:  
jgi|Araly1|481375|fgenesh2_kg.4__435__AT2G25180.1   2.33e-19   0.00024   192-251   1irz A:  
jgi|Araly1|482841|fgenesh2_kg.4__1901__AT2G38300.1   0.0000000000000197   0.0039   48-104   1irz A:  
jgi|Araly1|484011|fgenesh2_kg.5__3__AT2G01060.1   6.27e-18   0.0026   14-69   1irz A:  
jgi|Araly1|484129|fgenesh2_kg.5__121__AT2G02060.1   0.00000000000000538   0.0042   35-87   1irz A:  
jgi|Araly1|485038|fgenesh2_kg.5__1030__AT3G46640.2   1.65e-19   0.00057   142-202   1irz A:  
jgi|Araly1|486765|fgenesh2_kg.5__2757__AT3G62670.1   0.00000000000000484   0.0011   211-274   1irz A:  
jgi|Araly1|487493|fgenesh2_kg.6__627__AT5G06800.1   2.51e-17   0.0026   181-238   1irz A:  
jgi|Araly1|488696|fgenesh2_kg.6__1830__AT5G18240.4   2.33e-17   0.0029   27-83   1irz A:  
jgi|Araly1|489672|fgenesh2_kg.6__2806__AT5G29000.2   1.09e-17   0.0032   230-286   1irz A:  
jgi|Araly1|490936|fgenesh2_kg.7__369__AT4G37180.2   1.08e-17   0.0025   202-263   1irz A:  
jgi|Araly1|491902|fgenesh2_kg.7__1335__AT4G28610.1   5.91e-17   0.003   228-283   1irz A:  
jgi|Araly1|493070|fgenesh2_kg.7__2503__AT4G18020.2   8.36e-19   0.0011   293-351   1irz A:  
jgi|Araly1|493108|fgenesh2_kg.7__2541__AT4G17695.1   0.00000000000000502   0.0028   162-219   1irz A:  
jgi|Araly1|494575|fgenesh2_kg.8__391__AT5G44190.1   5.73e-20   0.00066   127-186   1irz A:  
jgi|Araly1|494773|fgenesh2_kg.8__589__AT5G42630.1   0.00000000000000179   0.0022   104-160   1irz A:  
jgi|Araly1|496092|fgenesh2_kg.8__1908__AT5G59570.1   1.45e-19   0.00057   128-188   1irz A:  
jgi|Araly1|859493|Al_scaffold_0007_2992   4.84e-17   0.0024   36-93   1irz A:  
jgi|Araly1|862056|Al_scaffold_0006_1565   0.0116   0.02   226-253   1irz A:  
jgi|Araly1|871711|Al_scaffold_0003_352   4.66e-17   0.0027   44-100   1irz A:  
jgi|Araly1|880939|Al_scaffold_0001_2706   7.17e-18   0.0027   207-267   1irz A:  
jgi|Araly1|883222|Al_scaffold_0001_4989   0.000000305   0.014   54-86   1irz A:  
jgi|Araly1|886012|Al_scaffold_0008_2276   4.3e-20   0.00037   198-258   1irz A:  
jgi|Araly1|888696|scaffold_101490.1   1.93e-16   0.0023   182-241   1irz A:  
jgi|Araly1|893617|scaffold_200691.1   2.06e-17   0.00089   22-80   1irz A:  
jgi|Araly1|894522|scaffold_201596.1   3.4e-16   0.00056   191-251   1irz A:  
jgi|Araly1|897268|scaffold_301238.1   6.81e-20   0.0006   98-158   1irz A:  
jgi|Araly1|897483|scaffold_301453.1   4.3e-17   0.0021   22-78   1irz A:  
jgi|Araly1|899405|scaffold_303375.1   0.0000000000591   0.0056   43-95   1irz A:  
jgi|Araly1|900392|scaffold_304362.1   6.09e-18   0.0042   237-292   1irz A:  
jgi|Araly1|903400|scaffold_402901.1   1e-19   0.00064   101-161   1irz A:  
jgi|Araly1|904389|scaffold_500093.1   8.96e-18   0.00056   197-256   1irz A:  
jgi|Araly1|904629|scaffold_500333.1   1.93e-17   0.0037   231-291   1irz A:  
jgi|Araly1|908412|scaffold_600469.1   2.24e-20   0.00061   77-137   1irz A:  
jgi|Araly1|911716|scaffold_603773.1   0.00129   0.015   13-57   1irz A:  
jgi|Araly1|915160|scaffold_702902.1   7.35e-20   0.00037   214-273   1irz A:  
jgi|Araly1|915615|scaffold_703357.1   0.0394   0.033   159-183   1irz A:  
jgi|Araly1|915820|scaffold_703562.1   0.0376   0.017   48-77   1irz A:  
jgi|Araly1|916384|scaffold_704126.1   0.0233   0.033   61-85   1irz A:  
jgi|Araly1|918997|scaffold_802397.1   8.25e-17   0.00077   340-395   1irz A:  
  0.00000000000000156   0.0018   44-104   1irz A:  

Arabidopsis thaliana 10 has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
AT4G31920.1   5.91e-19   0.0000579   181-240   1irz A:  
 
Weak hits:
AT1G13300.1   1.79e-16   0.0028   180-239   1irz A:  
AT1G14600.1   0.00000000000000358   0.0032   24-76   1irz A:  
AT1G25550.1   4.35e-18   0.0027   207-267   1irz A:  
AT1G32240.1   0.00000000000000197   0.0025   211-267   1irz A:  
AT1G49190.1   0.00000000000000645   0.0022   418-476   1irz A:  
AT1G49190.2   0.000000000197   0.0037   418-474   1irz A:  
AT1G49560.1   9.86e-17   0.0038   190-250   1irz A:  
AT1G67710.1   5.2e-16   0.00054   191-251   1irz A:  
AT1G68210.1   0.0000000000251   0.0033   222-277   1irz A:  
AT1G68670.1   1.52e-17   0.003   212-273   1irz A:  
AT1G69580.1   0.00000000000000466   0.0026   33-88   1irz A:  
AT1G69580.2   0.00000000000000466   0.0026   33-88   1irz A:  
AT1G79430.1   0.0323   0.024   2-24   1irz A:  
AT1G79430.2   1.77e-16   0.003   33-89   1irz A:  
AT2G01060.1   6.27e-18   0.0026   14-69   1irz A:  
AT2G01060.2   0.0115   0.03   1-20   1irz A:  
AT2G01760.1   1.24e-18   0.00053   198-257   1irz A:  
AT2G02060.1   0.00000000000000502   0.0042   30-82   1irz A:  
AT2G03500.1   1.93e-17   0.0037   231-291   1irz A:  
AT2G06020.1   0.000000000000269   0.0039   85-140   1irz A:  
AT2G20400.1   1.97e-17   0.0047   230-285   1irz A:  
AT2G20570.1   2.51e-18   0.001   152-210   1irz A:  
AT2G20570.2   1.33e-17   0.0012   172-226   1irz A:  
AT2G25180.1   1.97e-19   0.00024   193-252   1irz A:  
AT2G27070.1   8.42e-17   0.00082   223-282   1irz A:  
AT2G38300.1   0.0000000000000197   0.0039   53-109   1irz A:  
AT2G40260.1   4.3e-16   0.0036   80-138   1irz A:  
AT2G40970.1   1e-19   0.00064   102-162   1irz A:  
AT2G42660.1   0.0000000000000215   0.005   51-105   1irz A:  
AT3G04030.1   4.48e-17   0.0027   44-100   1irz A:  
AT3G04030.2   6.27e-17   0.0037   44-99   1irz A:  
AT3G04030.3   4.66e-17   0.0027   44-100   1irz A:  
AT3G04450.1   7.17e-17   0.0035   236-292   1irz A:  
AT3G04450.2   6.09e-17   0.0035   196-252   1irz A:  
AT3G10585.1   0.00134   0.065   95-123   1irz A:  
AT3G10760.1   6.81e-20   0.0006   102-162   1irz A:  
AT3G12730.1   8.96e-17   0.0017   22-78   1irz A:  
AT3G13040.1   3.23e-16   0.004   240-295   1irz A:  
AT3G13040.2   3.23e-16   0.004   240-295   1irz A:  
AT3G16857.1   1.59e-19   0.00033   235-294   1irz A:  
AT3G16857.2   1.67e-19   0.00033   235-294   1irz A:  
AT3G19070.1   0.00000000215   0.0089   278-337   1irz A:  
AT3G24120.1   5.91e-17   0.0026   40-96   1irz A:  
AT3G24120.2   6.09e-17   0.0026   40-96   1irz A:  
AT3G25790.1   6.57e-17   0.0028   194-253   1irz A:  
AT3G46640.1   1.63e-19   0.00057   141-201   1irz A:  
AT3G46640.2   1.63e-19   0.00057   141-201   1irz A:  
AT3G46640.3   1.63e-19   0.00057   141-201   1irz A:  
AT3G62670.1   0.00000000000000269   0.00099   135-199   1irz A:  
AT4G04580.1   0.00000000000000179   0.0043   13-72   1irz A:  
AT4G13640.1   4.66e-17   0.0024   36-93   1irz A:  
AT4G13640.2   4.84e-17   0.0024   36-93   1irz A:  
AT4G16110.1   7.17e-20   0.00037   214-273   1irz A:  
AT4G17695.1   0.00000000000000502   0.0028   162-219   1irz A:  
AT4G18020.1   8.36e-19   0.0011   295-353   1irz A:  
AT4G18020.2   8.36e-19   0.0011   295-353   1irz A:  
AT4G18020.3   8.36e-19   0.0011   295-353   1irz A:  
AT4G18020.4   7.17e-19   0.0011   295-353   1irz A:  
AT4G18020.5   7.17e-19   0.0011   295-353   1irz A:  
AT4G18020.6   8.36e-19   0.0011   295-353   1irz A:  
AT4G28610.1   5.91e-17   0.003   224-279   1irz A:  
AT4G37180.1   9.47e-18   0.0025   207-268   1irz A:  
AT4G37180.2   9.73e-18   0.0025   214-275   1irz A:  
AT5G05090.1   2.33e-20   0.00061   78-138   1irz A:  
AT5G06800.1   4.48e-17   0.0026   189-246   1irz A:  
AT5G06800.2   3.05e-17   0.0026   189-246   1irz A:  
AT5G07210.1   2.87e-17   0.00073   228-287   1irz A:  
AT5G16560.1   0.00000000000000233   0.0022   217-273   1irz A:  
AT5G18240.1   2.51e-17   0.0029   44-100   1irz A:  
AT5G18240.2   2.51e-17   0.0029   44-100   1irz A:  
AT5G18240.3   2.51e-17   0.0029   44-100   1irz A:  
AT5G18240.4   2.51e-17   0.0029   44-100   1irz A:  
AT5G18240.5   2.51e-17   0.0029   44-100   1irz A:  
AT5G29000.1   2.51e-17   0.0032   186-242   1irz A:  
AT5G29000.2   3.05e-17   0.0032   229-285   1irz A:  
AT5G29000.3   2.51e-17   0.0032   186-242   1irz A:  
AT5G29000.4   1.97e-17   0.0032   229-285   1irz A:  
AT5G42630.1   0.00000000000000179   0.0022   103-159   1irz A:  
AT5G42630.2   0.00000000000000122   0.0022   103-159   1irz A:  
AT5G44190.1   6.18e-20   0.00066   145-204   1irz A:  
AT5G45580.1   1.97e-16   0.0034   7-64   1irz A:  
AT5G49240.1   0.000000000000118   0.00054   221-278   1irz A:  
AT5G58080.1   4.12e-20   0.00037   174-234   1irz A:  
AT5G59570.1   1.7e-19   0.00057   138-198   1irz A:  
AT5G62110.1   0.00609   0.015   1-24   1irz A:  

Arabidopsis thaliana 10 has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
AT4G31920.1   5.91e-19   0.0000579   181-240   1irz A:  
 
Weak hits:
AT1G13300.1   1.79e-16   0.0028   180-239   1irz A:  
AT1G14600.1   0.00000000000000358   0.0032   24-76   1irz A:  
AT1G25550.1   4.35e-18   0.0027   207-267   1irz A:  
AT1G32240.1   0.00000000000000197   0.0025   211-267   1irz A:  
AT1G49190.2   0.000000000197   0.0037   418-474   1irz A:  
AT1G49560.1   9.86e-17   0.0038   190-250   1irz A:  
AT1G67710.1   5.2e-16   0.00054   191-251   1irz A:  
AT1G68210.1   0.0000000000251   0.0033   222-277   1irz A:  
AT1G68670.1   1.52e-17   0.003   212-273   1irz A:  
AT1G69580.2   0.00000000000000466   0.0026   33-88   1irz A:  
AT1G79430.2   1.77e-16   0.003   33-89   1irz A:  
AT2G01060.1   6.27e-18   0.0026   14-69   1irz A:  
AT2G01760.1   1.24e-18   0.00053   198-257   1irz A:  
AT2G02060.1   0.00000000000000502   0.0042   30-82   1irz A:  
AT2G03500.1   1.93e-17   0.0037   231-291   1irz A:  
AT2G06020.1   0.000000000000269   0.0039   85-140   1irz A:  
AT2G20400.1   1.97e-17   0.0047   230-285   1irz A:  
AT2G20570.2   1.33e-17   0.0012   172-226   1irz A:  
AT2G25180.1   1.97e-19   0.00024   193-252   1irz A:  
AT2G27070.1   8.42e-17   0.00082   223-282   1irz A:  
AT2G38300.1   0.0000000000000197   0.0039   53-109   1irz A:  
AT2G40260.1   4.3e-16   0.0036   80-138   1irz A:  
AT2G40970.1   1e-19   0.00064   102-162   1irz A:  
AT2G42660.1   0.0000000000000215   0.005   51-105   1irz A:  
AT3G04030.3   4.66e-17   0.0027   44-100   1irz A:  
AT3G04450.1   7.17e-17   0.0035   236-292   1irz A:  
AT3G10585.1   0.00134   0.065   95-123   1irz A:  
AT3G10760.1   6.81e-20   0.0006   102-162   1irz A:  
AT3G12730.1   8.96e-17   0.0017   22-78   1irz A:  
AT3G13040.1   3.23e-16   0.004   240-295   1irz A:  
AT3G16857.2   1.67e-19   0.00033   235-294   1irz A:  
AT3G19070.1   0.00000000215   0.0089   278-337   1irz A:  
AT3G24120.2   6.09e-17   0.0026   40-96   1irz A:  
AT3G25790.1   6.57e-17   0.0028   194-253   1irz A:  
AT3G46640.3   1.63e-19   0.00057   141-201   1irz A:  
AT3G62670.1   0.00000000000000269   0.00099   135-199   1irz A:  
AT4G04580.1   0.00000000000000179   0.0043   13-72   1irz A:  
AT4G13640.2   4.84e-17   0.0024   36-93   1irz A:  
AT4G16110.1   7.17e-20   0.00037   214-273   1irz A:  
AT4G17695.1   0.00000000000000502   0.0028   162-219   1irz A:  
AT4G18020.1   8.36e-19   0.0011   295-353   1irz A:  
AT4G28610.1   5.91e-17   0.003   224-279   1irz A:  
AT4G37180.2   9.73e-18   0.0025   214-275   1irz A:  
AT5G05090.1   2.33e-20   0.00061   78-138   1irz A:  
AT5G06800.1   4.48e-17   0.0026   189-246   1irz A:  
AT5G07210.1   2.87e-17   0.00073   228-287   1irz A:  
AT5G16560.1   0.00000000000000233   0.0022   217-273   1irz A:  
AT5G18240.1   2.51e-17   0.0029   44-100   1irz A:  
AT5G29000.2   3.05e-17   0.0032   229-285   1irz A:  
AT5G42630.1   0.00000000000000179   0.0022   103-159   1irz A:  
AT5G44190.1   6.18e-20   0.00066   145-204   1irz A:  
AT5G45580.1   1.97e-16   0.0034   7-64   1irz A:  
AT5G49240.1   0.000000000000118   0.00054   221-278   1irz A:  
AT5G58080.1   4.12e-20   0.00037   174-234   1irz A:  
AT5G59570.1   1.7e-19   0.00057   138-198   1irz A:  
AT5G62110.1   0.00609   0.015   1-24   1irz A:  

Jump to [ Top of page · Assignment details · Add assignments from individual genomes ]


Add assignments from groups of genomes

View all assignments containing a GARP response regulators domain in each group of genomes.

Jump to [ Top of page · Assignment details · Add assignments from groups of genomes ]


Add assignments from individual genomes

Select additional genomes you would like to see domain assignments for, then click 'Submit'.

Select to display   Genome       Domains   Proteins
No Yes ALL   35 35
No Yes Thellungiella halophila v173   1 1
No Yes Capsella rubella v183   1 1
No Yes Arabidopsis lyrata Lyrate rockcress 1 1
No Yes Arabidopsis thaliana 10 Thale cress 1 1
No Yes Arabidopsis thaliana 10 Thale cress 1 1
No Yes NCBI 2017_08 genome   8 8
No Yes STRING v9.0.5 (STRING)   2 2
No Yes Uniprot 2018_03 genome   12 12
No Yes PDB chains (SCOP 1.75) (PDB)   1 1
No Yes Protein Data Bank (all PDB sequenc)   1 1
No Yes SCOP2 SCOPe CATH ECOD (all domain sequ)   4 4

Jump to [ Top of page · Assignment details · Add assignments from groups of genomes · Add assignments from individual genomes ]