SUPERFAMILY 1.75 HMM library and genome assignments server

SUPERFAMILY 2 can be accessed from supfam.org. Please contact us if you experience any problems.


Somatomedin B domain family domain assignments
in
all genomes

Assignment details

(show help)

25 selected genomes have 29 significant domains in 29 proteins.

Showing genomes 1 to 25 of 81
  1 2 3 4   Next Last

Homo sapiens 76_38 has 2 significant domains in 2 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
ENSP00000226218   0.0000000000183   0.0000471   21-67   1ssu A:  
ENSP00000440439   0.00000000000157   0.0000471   21-67   1ssu A:  
 
Weak hits:
ENSP00000075322   0.0000000527   0.0017   57-103   1ssu A:  
  0.000000278   0.0028   105-145   1ssu A:  
ENSP00000229003   0.000000000366   0.0018   47-86   1ssu A:  
ENSP00000259486   0.0000000562   0.0017   57-103   1ssu A:  
  0.000000301   0.0028   105-145   1ssu A:  
ENSP00000259782   0.000432   0.0045   75-109   1ssu A:  
ENSP00000297354   0.000000432   0.0047   35-76   1ssu A:  
ENSP00000350265   0.000000034   0.0031   51-99   1ssu A:  
  0.000000157   0.0047   101-141   1ssu A:  
ENSP00000350964   0.0000000235   0.0031   51-99   1ssu A:  
  0.00000011   0.0047   101-141   1ssu A:  
ENSP00000351075   0.0000000235   0.0028   28-70   1ssu A:  
ENSP00000354238   0.00000000523   0.002   105-150   1ssu A:  
  0.00000085   0.0054   151-191   1ssu A:  
ENSP00000356452   0.000000000445   0.0011   27-66   1ssu A:  
ENSP00000356453   0.000000000432   0.0011   27-67   1ssu A:  
ENSP00000356455   0.00000000301   0.0011   68-107   1ssu A:  
  0.0000000111   0.0012   27-67   1ssu A:  
ENSP00000359901   0.00017   0.0045   59-91   1ssu A:  
ENSP00000359906   0.00017   0.0045   73-105   1ssu A:  
ENSP00000397679   0.0000000000209   0.0011   21-63   1ssu A:  
  0.000000000432   0.0018   88-127   1ssu A:  
ENSP00000399679   0.00000000248   0.0011   68-108   1ssu A:  
  0.0000000123   0.0012   27-67   1ssu A:  
ENSP00000403315   0.0000000536   0.0017   53-99   1ssu A:  
  0.000000288   0.0028   101-141   1ssu A:  
ENSP00000406261   0.000000034   0.0031   51-99   1ssu A:  
  0.000000157   0.0047   101-141   1ssu A:  
ENSP00000422424   0.00000000157   0.002   105-150   1ssu A:  
  0.000000353   0.0054   151-192   1ssu A:  
ENSP00000428291   0.0000000536   0.0017   57-103   1ssu A:  
  0.000000288   0.0028   105-145   1ssu A:  
ENSP00000428304   0.000000068   0.0028   87-128   1ssu A:  
ENSP00000429447   0.00000000471   0.0017   57-103   1ssu A:  
  0.0000000353   0.0028   105-146   1ssu A:  
ENSP00000431330   0.00000000000811   0.0011   27-70   1ssu A:  
ENSP00000445004   0.00000000034   0.0018   25-64   1ssu A:  

Pan troglodytes 76_2.1.4 has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
ENSPTRP00000015217   0.0000000000196   0.0000505   21-67   1ssu A:  
 
Weak hits:
ENSPTRP00000008312   0.0000000000209   0.0011   21-63   1ssu A:  
  0.000000000353   0.0018   88-128   1ssu A:  
ENSPTRP00000034815   0.000000353   0.0053   35-76   1ssu A:  
ENSPTRP00000035117   0.0000000562   0.0017   57-103   1ssu A:  
  0.000000301   0.0028   105-145   1ssu A:  
ENSPTRP00000041745   0.000000034   0.0031   51-99   1ssu A:  
  0.000000157   0.0047   101-141   1ssu A:  
ENSPTRP00000049619   0.00000000523   0.002   105-150   1ssu A:  
  0.000000824   0.0053   151-191   1ssu A:  
ENSPTRP00000049798   0.000693   0.0032   2-36   1ssu A:  
ENSPTRP00000049961   0.000432   0.0045   75-109   1ssu A:  

Gorilla gorilla 76_3.1 has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
ENSGGOP00000010821   0.0000000000196   0.0000505   21-67   1ssu A:  
 
Weak hits:
ENSGGOP00000000971   0.0000000131   0.0031   51-99   1ssu A:  
  0.0000000915   0.0036   101-141   1ssu A:  
ENSGGOP00000001872   0.0000000458   0.003   28-70   1ssu A:  
ENSGGOP00000002331   0.000432   0.0045   75-109   1ssu A:  
ENSGGOP00000002831   0.0000000562   0.0017   57-103   1ssu A:  
  0.000000301   0.0028   105-145   1ssu A:  
ENSGGOP00000015032   0.000000353   0.0053   35-76   1ssu A:  
ENSGGOP00000016024   0.000000000301   0.0018   47-87   1ssu A:  
ENSGGOP00000017286   0.0000000523   0.0017   57-103   1ssu A:  
  0.000000275   0.0028   105-145   1ssu A:  
ENSGGOP00000017418   0.00000000157   0.0011   69-108   1ssu A:  
  0.0000000131   0.0013   27-67   1ssu A:  
ENSGGOP00000027670   0.0000000000196   0.0012   21-63   1ssu A:  
  0.000000000353   0.0018   88-128   1ssu A:  

Pongo abelii 76_2 has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
ENSPPYP00000009099   0.0000000000157   0.0000505   21-67   1ssu A:  
 
Weak hits:
ENSPPYP00000000468   0.00000000196   0.0011   69-108   1ssu A:  
  0.0000000144   0.0012   27-67   1ssu A:  
ENSPPYP00000005071   0.000000000262   0.0018   47-86   1ssu A:  
ENSPPYP00000013427   0.0000000248   0.0025   28-70   1ssu A:  
ENSPPYP00000018712   0.000432   0.0045   71-105   1ssu A:  
ENSPPYP00000018713   0.00131   0.0044   69-105   1ssu A:  
ENSPPYP00000019047   0.0000000301   0.0031   51-99   1ssu A:  
  0.000000144   0.0047   101-141   1ssu A:  
ENSPPYP00000019048   0.00000000523   0.002   105-150   1ssu A:  
  0.000000824   0.0053   151-191   1ssu A:  
ENSPPYP00000020942   0.000000301   0.0053   30-71   1ssu A:  
ENSPPYP00000021141   0.0000000536   0.0017   53-99   1ssu A:  
  0.000000288   0.0028   101-141   1ssu A:  
ENSPPYP00000024382   0.00000000484   0.002   53-98   1ssu A:  
  0.000000759   0.0053   99-139   1ssu A:  

Nomascus leucogenys 76_1.0 has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
ENSNLEP00000002550   0.0000000000144   0.0000604   21-67   1ssu A:  
 
Weak hits:
ENSNLEP00000001535   0.000000301   0.0053   35-76   1ssu A:  
ENSNLEP00000005967   0.0000000562   0.0017   57-103   1ssu A:  
  0.00000034   0.0029   105-145   1ssu A:  
ENSNLEP00000017639   0.000000034   0.0031   51-99   1ssu A:  
  0.000000157   0.0047   101-141   1ssu A:  
ENSNLEP00000017656   0.00000000471   0.002   25-70   1ssu A:  
  0.000000876   0.0048   71-111   1ssu A:  
ENSNLEP00000018693   0.0000000248   0.0034   25-67   1ssu A:  
ENSNLEP00000021758   0.0000000000144   0.0012   21-63   1ssu A:  
  0.000000000301   0.0018   88-128   1ssu A:  
ENSNLEP00000021908   0.00000000235   0.0011   69-108   1ssu A:  
  0.0000000222   0.0013   27-67   1ssu A:  
ENSNLEP00000023528   0.00000000327   0.0034   36-78   1ssu A:  

Papio anubis 76 has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
ENSPANP00000019813   0.0000000000196   0.0000505   21-67   1ssu A:  
 
Weak hits:
ENSPANP00000004809   0.00000000119   0.0011   69-108   1ssu A:  
  0.00000000824   0.0012   27-67   1ssu A:  
ENSPANP00000009242   0.0000000000196   0.0012   21-63   1ssu A:  
  0.000000000353   0.0018   88-128   1ssu A:  
ENSPANP00000011062   0.0000000615   0.0017   151-197   1ssu A:  
  0.000000327   0.0028   199-239   1ssu A:  
ENSPANP00000013063   0.000994   0.0045   62-98   1ssu A:  
ENSPANP00000016445   0.0000000275   0.003   27-69   1ssu A:  
ENSPANP00000016446   0.0000000288   0.003   53-95   1ssu A:  
ENSPANP00000018582   0.000000314   0.0053   35-76   1ssu A:  
ENSPANP00000018722   0.00000000484   0.002   53-98   1ssu A:  
  0.000000759   0.0053   99-139   1ssu A:  
ENSPANP00000018723   0.00000000471   0.002   30-75   1ssu A:  
  0.000000732   0.0053   76-116   1ssu A:  
ENSPANP00000018726   0.0000000209   0.0031   51-99   1ssu A:  
  0.000000085   0.0044   100-141   1ssu A:  

Macaca mulatta 76_1 has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
ENSMMUP00000025171   0.0000000000196   0.0000505   21-67   1ssu A:  
 
Weak hits:
ENSMMUP00000006514   0.0000000562   0.0017   57-103   1ssu A:  
  0.000000301   0.0028   105-145   1ssu A:  
ENSMMUP00000006516   0.0000000523   0.0017   57-103   1ssu A:  
  0.000000275   0.0028   105-145   1ssu A:  
ENSMMUP00000016796   0.000654   0.0045   73-109   1ssu A:  
ENSMMUP00000018595   0.00000000523   0.002   105-150   1ssu A:  
  0.000000981   0.0048   151-191   1ssu A:  
ENSMMUP00000023101   0.0000000183   0.0031   51-99   1ssu A:  
  0.000000068   0.0044   100-141   1ssu A:  
ENSMMUP00000024195   0.000000000301   0.0018   47-87   1ssu A:  
ENSMMUP00000025453   0.0000000000327   0.0011   27-67   1ssu A:  
ENSMMUP00000027624   0.0000000262   0.003   3-45   1ssu A:  
ENSMMUP00000033099   0.0000000275   0.0031   51-99   1ssu A:  
  0.0000000915   0.0044   100-141   1ssu A:  
ENSMMUP00000033101   0.00000000523   0.002   105-150   1ssu A:  
  0.000000824   0.0053   151-191   1ssu A:  
ENSMMUP00000039887   0.0000000000196   0.0012   21-63   1ssu A:  
  0.000000000353   0.0018   88-128   1ssu A:  

Callithrix jacchus 76_3.2.1 has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
ENSCJAP00000023190   0.0000000000301   0.0000867   21-67   1ssu A:  
 
Weak hits:
ENSCJAP00000005499   0.00000000301   0.002   48-93   1ssu A:  
  0.000000745   0.0048   94-135   1ssu A:  
ENSCJAP00000005516   0.00000000497   0.002   53-98   1ssu A:  
  0.00000131   0.0053   99-140   1ssu A:  
ENSCJAP00000005525   0.00000000484   0.003   17-65   1ssu A:  
  0.0000000275   0.0035   63-107   1ssu A:  
ENSCJAP00000005532   0.000000017   0.003   51-99   1ssu A:  
  0.0000000889   0.0035   97-141   1ssu A:  
ENSCJAP00000010541   0.000000051   0.0017   46-92   1ssu A:  
  0.000000288   0.0028   94-134   1ssu A:  
ENSCJAP00000010558   0.0000000471   0.0017   2-47   1ssu A:  
  0.000000157   0.0028   49-90   1ssu A:  
ENSCJAP00000010768   0.00000000366   0.0012   69-108   1ssu A:  
  0.0000000085   0.0012   27-67   1ssu A:  
ENSCJAP00000014274   0.00000034   0.0053   68-109   1ssu A:  
ENSCJAP00000014279   0.000000275   0.0053   35-76   1ssu A:  
ENSCJAP00000020137   0.00103   0.0045   73-109   1ssu A:  
ENSCJAP00000023509   0.000000000405   0.0018   46-85   1ssu A:  
ENSCJAP00000027379   0.0000000000262   0.0012   21-63   1ssu A:  
  0.000000000418   0.0018   88-127   1ssu A:  
ENSCJAP00000027384   0.000000000366   0.0018   47-86   1ssu A:  
ENSCJAP00000049525   0.0000000248   0.003   51-99   1ssu A:  
  0.000000127   0.0035   97-141   1ssu A:  

Otolemur garnettii 76_3 has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
ENSOGAP00000002983   0.0000000000183   0.0000806   21-67   1ssu A:  
 
Weak hits:
ENSOGAP00000001430   0.00000000111   0.0011   68-108   1ssu A:  
  0.00000000942   0.0012   27-67   1ssu A:  
ENSOGAP00000004884   0.0000000000458   0.0012   21-61   1ssu A:  
  0.000000000392   0.0019   92-131   1ssu A:  
ENSOGAP00000005235   0.000000085   0.0051   34-76   1ssu A:  
ENSOGAP00000006851   0.0000000314   0.0015   57-103   1ssu A:  
  0.00000034   0.0026   105-145   1ssu A:  
ENSOGAP00000012648   0.0000000301   0.0044   51-99   1ssu A:  
  0.0000000732   0.0033   97-141   1ssu A:  
ENSOGAP00000012658   0.0000000112   0.002   25-70   1ssu A:  
  0.000000562   0.0048   71-111   1ssu A:  
ENSOGAP00000015478   0.0000000405   0.0048   54-102   1ssu A:  
  0.0000000759   0.004   103-144   1ssu A:  
ENSOGAP00000017353   0.0000654   0.0032   49-76   1ssu A:  
ENSOGAP00000020730   0.0000000693   0.0034   28-69   1ssu A:  

Microcebus murinus 76_1 has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
ENSMICP00000004649   0.0000000000109   0.0000614   21-67   1ssu A:  
 
Weak hits:
ENSMICP00000002689   0.0000000549   0.0037   51-99   1ssu A:  
  0.00000012   0.0042   97-141   1ssu A:  
ENSMICP00000002698   0.000000183   0.0018   47-85   1ssu A:  
ENSMICP00000007076   0.000000549   0.0053   30-68   1ssu A:  
ENSMICP00000008141   0.00000000017   0.0016   50-89   1ssu A:  
ENSMICP00000008908   0.0000000745   0.0031   28-69   1ssu A:  
ENSMICP00000015752   0.000000131   0.0018   57-103   1ssu A:  
  0.0000116   0.0026   105-141   1ssu A:  

Rattus norvegicus 76_5.0 has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
ENSRNOP00000046415   0.00000000000641   0.0001   21-67   1ssu A:  
 
Weak hits:
ENSRNOP00000009416   0.0000000000837   0.0012   21-62   1ssu A:  
  0.000000000484   0.0023   87-126   1ssu A:  
ENSRNOP00000009530   0.000000327   0.0053   35-76   1ssu A:  
ENSRNOP00000018695   0.0000000366   0.0044   52-100   1ssu A:  
  0.00000017   0.0033   98-142   1ssu A:  
ENSRNOP00000019519   0.00000000536   0.0021   87-132   1ssu A:  
  0.00000116   0.0053   133-174   1ssu A:  
ENSRNOP00000059900   0.00000000275   0.0011   68-108   1ssu A:  
  0.00000000824   0.0012   27-67   1ssu A:  
ENSRNOP00000062972   0.000000392   0.004   27-65   1ssu A:  
ENSRNOP00000065384   0.0575   0.016   59-83   1ssu A:  

Mus musculus 76_38 has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
ENSMUSP00000017488   0.00000000000798   0.0001   21-67   1ssu A:  
 
Weak hits:
ENSMUSP00000006171   0.0000000012   0.0011   68-107   1ssu A:  
  0.00000000275   0.0012   27-67   1ssu A:  
ENSMUSP00000020169   0.0000000248   0.004   51-99   1ssu A:  
  0.000000248   0.005   100-141   1ssu A:  
ENSMUSP00000023105   0.000000000484   0.0019   129-169   1ssu A:  
ENSMUSP00000036180   0.0000000262   0.0017   56-102   1ssu A:  
  0.000000262   0.0028   104-144   1ssu A:  
ENSMUSP00000046090   0.00000000157   0.0021   87-132   1ssu A:  
  0.000000379   0.0053   133-174   1ssu A:  
ENSMUSP00000047730   0.000000327   0.0053   35-76   1ssu A:  
ENSMUSP00000093197   0.000000157   0.0038   26-66   1ssu A:  
ENSMUSP00000097820   0.0000000000693   0.0012   21-61   1ssu A:  
  0.000000000418   0.0019   87-127   1ssu A:  
ENSMUSP00000101159   0.00000000549   0.0021   87-132   1ssu A:  
  0.00000115   0.0053   133-174   1ssu A:  
ENSMUSP00000107532   0.0000000034   0.0011   68-107   1ssu A:  
  0.00000000798   0.0012   27-67   1ssu A:  
ENSMUSP00000107533   0.00000000034   0.0011   27-67   1ssu A:  
ENSMUSP00000114273   0.00000000549   0.0021   87-132   1ssu A:  
  0.00000116   0.0053   133-174   1ssu A:  
ENSMUSP00000124410   0.00000000000837   0.0011   27-68   1ssu A:  
ENSMUSP00000124801   0.0000000000654   0.0011   27-66   1ssu A:  
ENSMUSP00000125551   0.0000000012   0.0011   68-107   1ssu A:  
  0.00000000275   0.0012   27-67   1ssu A:  
ENSMUSP00000125677   0.00000000248   0.0011   68-108   1ssu A:  
  0.0000000107   0.0012   27-67   1ssu A:  
ENSMUSP00000128941   0.0000000301   0.0017   56-102   1ssu A:  
  0.000000288   0.0028   104-144   1ssu A:  
ENSMUSP00000128943   0.00000000248   0.0011   68-108   1ssu A:  
  0.0000000107   0.0012   27-67   1ssu A:  
ENSMUSP00000132640   0.0000000288   0.0017   56-102   1ssu A:  
  0.000000275   0.0028   104-144   1ssu A:  
ENSMUSP00000133877   0.0000000288   0.0017   56-102   1ssu A:  
  0.000000288   0.0028   104-144   1ssu A:  
ENSMUSP00000134900   0.0334   0.0046   53-94   1ssu A:  
ENSMUSP00000135453   0.00085   0.0045   54-95   1ssu A:  
ENSMUSP00000137187   0.00641   0.0053   39-66   1ssu A:  
ENSMUSP00000139155   0.000732   0.0051   71-105   1ssu A:  

Dipodomys ordii 76_1 has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
ENSDORP00000002413   0.000000000017   0.0000791   21-67   1ssu A:  
 
Weak hits:
ENSDORP00000000066   0.0000000811   0.0031   27-66   1ssu A:  
ENSDORP00000003421   0.000418   0.0074   30-70   1ssu A:  
ENSDORP00000004444   0.0000000235   0.0016   57-103   1ssu A:  
  0.000000327   0.0028   105-145   1ssu A:  
ENSDORP00000004480   0.00000000115   0.0014   68-108   1ssu A:  
ENSDORP00000008184   0.0000000275   0.0031   51-99   1ssu A:  
  0.0000327   0.0053   101-136   1ssu A:  
ENSDORP00000008185   0.0000000144   0.0022   89-134   1ssu A:  
  0.000000275   0.0048   135-175   1ssu A:  
ENSDORP00000015300   0.00000000017   0.0017   43-82   1ssu A:  

Ictidomys tridecemlineatus 76_2 has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
ENSSTOP00000015058   0.0000000000144   0.0000763   21-67   1ssu A:  
 
Weak hits:
ENSSTOP00000000858   0.00000000017   0.0017   6-45   1ssu A:  
ENSSTOP00000010074   0.00131   0.0045   74-109   1ssu A:  
ENSSTOP00000010619   0.0000000615   0.0038   25-64   1ssu A:  
ENSSTOP00000012821   0.000000222   0.0026   96-141   1ssu A:  
  0.000000641   0.0026   52-98   1ssu A:  
ENSSTOP00000015894   0.000000235   0.0026   96-141   1ssu A:  
  0.000000641   0.0026   52-98   1ssu A:  
ENSSTOP00000016720   0.00000000497   0.0017   57-103   1ssu A:  
  0.0000000706   0.0027   105-146   1ssu A:  
ENSSTOP00000021330   0.00000000484   0.0012   69-108   1ssu A:  
  0.0000000102   0.0013   27-67   1ssu A:  
ENSSTOP00000021449   0.000000275   0.0051   35-76   1ssu A:  

Heterocephalus glaber v1.7-2 has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
HGL_H00000226218   0.0000000000458   0.0000697   21-66   1ssu A:  
 
Weak hits:
HGL_H00000259486   0.0000000641   0.0016   54-100   1ssu A:  
  0.000000314   0.003   102-142   1ssu A:  
HGL_H00000350265   0.0000000798   0.003   52-99   1ssu A:  
  0.000000114   0.0047   102-142   1ssu A:  
HGL_H00000351075   0.0000000693   0.0045   31-69   1ssu A:  
HGL_H00000354238   0.00000000759   0.0018   32-77   1ssu A:  
  0.000000693   0.0048   78-119   1ssu A:  
HGL_H00000356452   0.00000000366   0.0012   15-55   1ssu A:  
HGL_H00000397679   0.000000000366   0.0013   21-62   1ssu A:  
  0.00000000126   0.0021   87-125   1ssu A:  

Cavia porcellus 76_3 has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
ENSCPOP00000002860   0.0000000000602   0.0000867   21-66   1ssu A:  
 
Weak hits:
ENSCPOP00000005416   0.000000000131   0.0015   21-61   1ssu A:  
  0.000000000405   0.0018   89-128   1ssu A:  
ENSCPOP00000009824   0.000000484   0.0053   35-76   1ssu A:  
ENSCPOP00000011553   0.0000000366   0.0038   28-69   1ssu A:  
ENSCPOP00000013731   0.0000000458   0.0017   57-103   1ssu A:  
  0.000000418   0.0031   105-145   1ssu A:  
ENSCPOP00000013732   0.00000000628   0.0018   25-70   1ssu A:  
  0.00000106   0.0043   71-111   1ssu A:  
ENSCPOP00000020114   0.00000000129   0.0012   68-107   1ssu A:  
  0.00000000536   0.0012   27-67   1ssu A:  

Oryctolagus cuniculus 76_2 has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
ENSOCUP00000024132   0.000000000034   0.0000791   21-67   1ssu A:  
 
Weak hits:
ENSOCUP00000006366   0.00000000034   0.0017   97-136   1ssu A:  
ENSOCUP00000006478   0.0000000929   0.0026   24-64   1ssu A:  
ENSOCUP00000010737   0.000000523   0.0051   35-74   1ssu A:  
ENSOCUP00000012418   0.0000000785   0.0026   51-99   1ssu A:  
  0.000000288   0.0032   97-141   1ssu A:  
ENSOCUP00000015751   0.00000000235   0.0012   69-108   1ssu A:  
  0.0000000085   0.0012   27-66   1ssu A:  
ENSOCUP00000017346   0.00000000811   0.0021   25-70   1ssu A:  
  0.000000589   0.0051   71-112   1ssu A:  
ENSOCUP00000021045   0.0000000366   0.0017   53-99   1ssu A:  
  0.000000275   0.0028   101-141   1ssu A:  

Ochotona princeps 76 has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
ENSOPRP00000005411   0.0000000000641   0.0000806   21-67   1ssu A:  
 
Weak hits:
ENSOPRP00000001478   0.000000000549   0.0017   28-67   1ssu A:  
ENSOPRP00000002439   0.000000124   0.0031   50-98   1ssu A:  
  0.0000968   0.0053   99-131   1ssu A:  
ENSOPRP00000007050   0.000275   0.0047   74-106   1ssu A:  
ENSOPRP00000011797   0.000000000968   0.0012   69-108   1ssu A:  
  0.00000000549   0.0013   27-67   1ssu A:  
ENSOPRP00000014213   0.0000000366   0.0017   57-103   1ssu A:  
  0.000000127   0.0029   105-146   1ssu A:  
ENSOPRP00000015404   0.000000144   0.0034   31-72   1ssu A:  
ENSOPRP00000015642   0.00000000837   0.0021   108-153   1ssu A:  
  0.000000615   0.0051   154-195   1ssu A:  

Tupaia belangeri 76 has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
ENSTBEP00000007385   0.0000000000235   0.0000648   21-67   1ssu A:  
 
Weak hits:
ENSTBEP00000002234   0.000000222   0.0051   71-111   1ssu A:  
ENSTBEP00000005041   0.000000379   0.003   105-145   1ssu A:  
ENSTBEP00000008153   0.0000000418   0.0035   97-140   1ssu A:  
  0.0000000772   0.0045   52-99   1ssu A:  
ENSTBEP00000010338   0.000000111   0.0053   30-71   1ssu A:  
ENSTBEP00000014004   0.000575   0.005   47-80   1ssu A:  
ENSTBEP00000014575   0.000000000222   0.002   43-82   1ssu A:  

Sus scrofa 76_10.2 has 4 significant domains in 4 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
ENSSSCP00000019489   0.0000000000641   0.0001   21-65   1ssu A:  
ENSSSCP00000020610   0.0000000000458   0.0000917   21-66   1ssu A:  
ENSSSCP00000020670   0.000000000051   0.0001   21-65   1ssu A:  
ENSSSCP00000025875   0.0000000000589   0.0000917   21-66   1ssu A:  
 
Weak hits:
ENSSSCP00000001614   0.000719   0.0044   74-109   1ssu A:  
ENSSSCP00000004526   0.0000000122   0.0021   25-70   1ssu A:  
  0.000000392   0.0056   71-112   1ssu A:  
ENSSSCP00000006410   0.0000000458   0.0017   57-103   1ssu A:  
  0.000000575   0.0026   105-145   1ssu A:  
ENSSSCP00000007949   0.000157   0.0042   38-67   1ssu A:  
ENSSSCP00000019444   0.00000000745   0.0014   68-108   1ssu A:  
  0.0000000144   0.0013   27-67   1ssu A:  
ENSSSCP00000022178   0.000000562   0.0039   28-69   1ssu A:  
ENSSSCP00000023107   0.0000772   0.0045   72-105   1ssu A:  
ENSSSCP00000023230   0.00000000366   0.0043   51-99   1ssu A:  
  0.0000000112   0.0043   100-141   1ssu A:  
ENSSSCP00000026630   0.000157   0.0042   38-67   1ssu A:  
ENSSSCP00000026921   0.000000235   0.0043   8-49   1ssu A:  

Bos taurus 76_3.1 has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
ENSBTAP00000021497   0.0000000000183   0.0000791   21-67   1ssu A:  
 
Weak hits:
ENSBTAP00000015839   0.0000000144   0.0013   68-107   1ssu A:  
  0.0000000262   0.0011   26-66   1ssu A:  
ENSBTAP00000016790   0.00119   0.0038   73-108   1ssu A:  
ENSBTAP00000022924   0.000000889   0.0051   35-76   1ssu A:  
ENSBTAP00000026900   0.0000000301   0.0043   51-99   1ssu A:  
  0.000000115   0.0034   97-141   1ssu A:  
ENSBTAP00000029404   0.000000314   0.0049   29-70   1ssu A:  
ENSBTAP00000036974   0.0000000562   0.0016   57-103   1ssu A:  
  0.00000034   0.0026   105-145   1ssu A:  
ENSBTAP00000043168   0.0000000000301   0.0013   21-62   1ssu A:  
  0.00000000034   0.0019   90-129   1ssu A:  
ENSBTAP00000053402   0.00000000641   0.002   105-150   1ssu A:  
  0.00000549   0.0069   151-191   1ssu A:  
ENSBTAP00000054664   0.000000011   0.0013   68-107   1ssu A:  
  0.0000000196   0.0011   26-66   1ssu A:  

Tursiops truncatus 76_1 has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
ENSTTRP00000009640   0.00000000112   0.0001   21-63   1ssu A:  
 
Weak hits:
ENSTTRP00000000701   0.000981   0.0047   74-108   1ssu A:  
ENSTTRP00000001935   0.000000418   0.0042   28-69   1ssu A:  
ENSTTRP00000009401   0.0000000103   0.0021   105-150   1ssu A:  
  0.00000732   0.0069   151-191   1ssu A:  
ENSTTRP00000010785   0.0000000235   0.0042   51-99   1ssu A:  
  0.000000209   0.0043   100-140   1ssu A:  
ENSTTRP00000011554   0.00000000589   0.0011   68-108   1ssu A:  
  0.0000000157   0.0013   27-66   1ssu A:  
ENSTTRP00000011930   0.000000000314   0.0019   47-86   1ssu A:  
ENSTTRP00000013217   0.0000000445   0.0017   56-102   1ssu A:  
  0.000000432   0.0025   104-144   1ssu A:  

Mustela putorius furo 76_1.0 has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
ENSMPUP00000014197   0.0000000000196   0.0000648   21-67   1ssu A:  
 
Weak hits:
ENSMPUP00000000403   0.0000000000641   0.0015   21-61   1ssu A:  
  0.000000000196   0.0017   90-129   1ssu A:  
ENSMPUP00000001026   0.0000000497   0.0017   57-103   1ssu A:  
  0.000000301   0.0026   105-146   1ssu A:  
ENSMPUP00000002885   0.000000068   0.0029   31-72   1ssu A:  
ENSMPUP00000010170   0.000000392   0.0051   35-76   1ssu A:  
ENSMPUP00000011918   0.00000000222   0.0014   68-107   1ssu A:  
  0.0000000109   0.0012   26-65   1ssu A:  
ENSMPUP00000014562   0.0000000471   0.003   55-102   1ssu A:  
  0.000000101   0.0044   103-144   1ssu A:  
ENSMPUP00000014565   0.00000000955   0.0021   25-70   1ssu A:  
  0.000000562   0.0051   71-112   1ssu A:  

Ailuropoda melanoleuca 76_1 has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
ENSAMEP00000005353   0.0000000000275   0.0000722   21-67   1ssu A:  
 
Weak hits:
ENSAMEP00000004563   0.0000000405   0.0017   57-103   1ssu A:  
  0.000000379   0.0025   105-146   1ssu A:  
ENSAMEP00000004571   0.0000000471   0.0017   46-92   1ssu A:  
  0.000000353   0.0025   94-135   1ssu A:  
ENSAMEP00000006346   0.0000000523   0.0051   8-49   1ssu A:  
ENSAMEP00000011003   0.0000000196   0.003   51-99   1ssu A:  
  0.0000000562   0.0045   100-140   1ssu A:  
ENSAMEP00000011068   0.00000000955   0.0021   35-80   1ssu A:  
  0.000000732   0.0054   81-122   1ssu A:  
ENSAMEP00000014302   0.000000000327   0.0024   90-129   1ssu A:  
  0.00000000114   0.0018   21-61   1ssu A:  
ENSAMEP00000014308   0.000000000314   0.0024   87-126   1ssu A:  
  0.00000000157   0.0018   21-61   1ssu A:  
ENSAMEP00000014598   0.000000105   0.0037   31-72   1ssu A:  
ENSAMEP00000016259   0.00000000314   0.0013   67-106   1ssu A:  
  0.00000000693   0.0012   26-66   1ssu A:  

Canis familiaris 76_3.1 has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
ENSCAFP00000027547   0.000000000017   0.0000648   21-67   1ssu A:  
 
Weak hits:
ENSCAFP00000000001   0.0000000111   0.0021   96-141   1ssu A:  
  0.000000248   0.0058   142-183   1ssu A:  
ENSCAFP00000000528   0.0000000288   0.0031   51-99   1ssu A:  
  0.0000000575   0.0039   100-140   1ssu A:  
ENSCAFP00000001237   0.0000000405   0.0017   57-103   1ssu A:  
  0.000000536   0.0025   105-146   1ssu A:  
ENSCAFP00000003367   0.00103   0.005   74-109   1ssu A:  
ENSCAFP00000013534   0.0000000000902   0.0012   21-61   1ssu A:  
  0.000000000706   0.002   90-129   1ssu A:  
ENSCAFP00000013541   0.0000000000379   0.0012   21-62   1ssu A:  
  0.000000000693   0.002   88-127   1ssu A:  
ENSCAFP00000020163   0.0000000017   0.0014   68-107   1ssu A:  
  0.0000000131   0.0012   26-66   1ssu A:  
ENSCAFP00000020517   0.0000000589   0.0031   28-70   1ssu A:  
ENSCAFP00000035786   0.00000017   0.0048   35-76   1ssu A:  

  1 2 3 4   Next Last
Showing genomes 1 to 25 of 81

Jump to [ Top of page · Assignment details · Add assignments from individual genomes ]


Add assignments from groups of genomes

View all assignments containing a Somatomedin B domain domain in each group of genomes.

Jump to [ Top of page · Assignment details · Add assignments from groups of genomes ]


Add assignments from individual genomes

Select additional genomes you would like to see domain assignments for, then click 'Submit'.

Select to display   Genome       Domains   Proteins
No Yes ALL   329 329
No Yes Homo sapiens 76_38 Human 2 2
No Yes Pan troglodytes 76_2.1.4 Chimpanzee 1 1
No Yes Gorilla gorilla 76_3.1 Western gorilla 1 1
No Yes Pongo abelii 76_2 Sumatran orangutan 1 1
No Yes Nomascus leucogenys 76_1.0 Northern white-cheeked gibbon 1 1
No Yes Papio anubis 76 Olive baboon 1 1
No Yes Macaca mulatta 76_1 Rhesus monkey 1 1
No Yes Callithrix jacchus 76_3.2.1 White-tufted-ear marmoset 1 1
No Yes Otolemur garnettii 76_3 Small-eared galago 1 1
No Yes Microcebus murinus 76_1 Gray mouse lemur 1 1
No Yes Rattus norvegicus 76_5.0 Norway rat 1 1
No Yes Mus musculus 76_38 House mouse 1 1
No Yes Dipodomys ordii 76_1 Ord's kangaroo rat 1 1
No Yes Ictidomys tridecemlineatus 76_2 Thirteen-lined ground squirrel 1 1
No Yes Heterocephalus glaber v1.7-2 Naked mole-rat 1 1
No Yes Cavia porcellus 76_3 Domestic guinea pig 1 1
No Yes Oryctolagus cuniculus 76_2 Rabbit 1 1
No Yes Ochotona princeps 76 American pika 1 1
No Yes Tupaia belangeri 76 Northern tree shrew 1 1
No Yes Sus scrofa 76_10.2 Pig 4 4
No Yes Bos taurus 76_3.1 Cattle 1 1
No Yes Tursiops truncatus 76_1 Bottlenose dolphin 1 1
No Yes Mustela putorius furo 76_1.0 Domestic ferret 1 1
No Yes Ailuropoda melanoleuca 76_1 Giant panda 1 1
No Yes Canis familiaris 76_3.1 Dog 1 1
No Yes Felis catus 76_6.2 Domestic cat 1 1
No Yes Equus caballus 76_2 Horse 1 1
No Yes Myotis lucifugus 76_2.0 Little brown bat 1 1
No Yes Pteropus vampyrus 76_1 Large flying fox 1 1
No Yes Sorex araneus 76_1 European shrew 1 1
No Yes Erinaceus europaeus 76 Western European hedgehog 1 1
No Yes Loxodonta africana 76_3 African savanna elephant 1 1
No Yes Echinops telfairi 76 Small Madagascar hedgehog 1 1
No Yes Dasypus novemcinctus 76_2 Nine-banded armadillo 1 1
No Yes Choloepus hoffmanni 76_1 Hoffmann's two-fingered sloth 1 1
No Yes Macropus eugenii 76_1.0 Tammar wallaby 1 1
No Yes Ornithorhynchus anatinus 76_5 Platypus 1 1
No Yes Homo sapiens 75_37 (old version GRC) Human 4 4
No Yes Homo sapiens (NCBI version) Human 1 1
No Yes Mus musculus 63_37 (longest transcript per gene) (Duplicate) House mouse 1 1
No Yes Homo sapiens 69_37 Human 2 2
No Yes Pan troglodytes 69_2.1.4 Chimpanzee 1 1
No Yes Gorilla gorilla 69_3.1 Western gorilla 1 1
No Yes Pongo abelii 69_2 Sumatran orangutan 1 1
No Yes Nomascus leucogenys 69_1.0 Northern white-cheeked gibbon 1 1
No Yes Macaca mulatta 69_1 Rhesus monkey 1 1
No Yes Callithrix jacchus 69_3.2.1 White-tufted-ear marmoset 1 1
No Yes Otolemur garnettii 69_3 Small-eared galago 1 1
No Yes Microcebus murinus 69_1 Gray mouse lemur 1 1
No Yes Rattus norvegicus 69_3.4 Norway rat 1 1
No Yes Mus musculus 69_38 House mouse 1 1
No Yes Dipodomys ordii 69_1 Ord's kangaroo rat 1 1
No Yes Ictidomys tridecemlineatus 69_2 Thirteen-lined ground squirrel 1 1
No Yes Cavia porcellus 69_3 Domestic guinea pig 1 1
No Yes Oryctolagus cuniculus 69_2 Rabbit 1 1
No Yes Ochotona princeps 69 American pika 1 1
No Yes Tupaia belangeri 69 Northern tree shrew 1 1
No Yes Sus scrofa 69_10.2 Pig 2 2
No Yes Bos taurus 69_3.1 Cattle 1 1
No Yes Tursiops truncatus 69_1 Bottlenose dolphin 1 1
No Yes Mustela putorius furo 69_1.0 Domestic ferret 1 1
No Yes Ailuropoda melanoleuca 69_1 Giant panda 1 1
No Yes Canis familiaris 69_3.1 Dog 1 1
No Yes Felis catus 69 Domestic cat 1 1
No Yes Equus caballus 69_2 Horse 1 1
No Yes Myotis lucifugus 69_2.0 Little brown bat 1 1
No Yes Pteropus vampyrus 69_1 Large flying fox 1 1
No Yes Sorex araneus 69_1 European shrew 1 1
No Yes Erinaceus europaeus 69 Western European hedgehog 1 1
No Yes Loxodonta africana 69_3 African savanna elephant 1 1
No Yes Echinops telfairi 69 Small Madagascar hedgehog 1 1
No Yes Dasypus novemcinctus 69_2 Nine-banded armadillo 1 1
No Yes Choloepus hoffmanni 69_1 Hoffmann's two-fingered sloth 1 1
No Yes Macropus eugenii 69_1.0 Tammar wallaby 1 1
No Yes Ornithorhynchus anatinus 69_5 Platypus 1 1
No Yes NCBI 2017_08 genome   115 115
No Yes STRING v9.0.5 (STRING)   14 14
No Yes Uniprot 2018_03 genome   70 70
No Yes PDB chains (SCOP 1.75) (PDB)   2 2
No Yes Protein Data Bank (all PDB sequenc)   4 4
No Yes SCOP2 SCOPe CATH ECOD (all domain sequ)   6 6

Jump to [ Top of page · Assignment details · Add assignments from groups of genomes · Add assignments from individual genomes ]