Alpha-hemoglobin stabilizing protein AHSP family domain assignments
in
Uniprot 2018_03 genome

Assignment details

Uniprot 2018_03 genome has 62 significant domains in 62 proteins.

     

Sequence ID	Superfamily evalue	Family evalue	Region	Closest structure
A0A091D6K8	1.57e-46	0.0000124	1-96	1w0b A:
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Weak hits:
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V5XRM5	0.0288	0.0076	38-73	1w0b A:
V6DJ11	0.051	0.0076	15-60	1w0b A:
V7CCG6	0.0288	0.0081	231-267	1w0b A:
V7IA85	0.0575	0.0078	193-219	1w0b A:
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W6R1Q7	0.0366	0.0089	111-164	1w0b A:
W7AR42	0.0497	0.0081	329-377	1w0b A:
W7AVT3	0.0929	0.0069	77-110	1w0b A:
W7B7C2	0.0000615	0.0035	261-311	1w0b A:
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W7FJ66	0.00654	0.0039	573-625	1w0b A:
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W7FMT2	0.00353	0.0039	576-629	1w0b A:
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W7JVH5	0.00353	0.0039	574-627	1w0b A:
W7KL47	0.0418	0.012	68-124	1w0b A:
W7XIM0	0.0759	0.0093	132-198	1w0b A:
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X0RL14	0.0379	0.011	35-75	1w0b A:
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X1JTT9	0.0157	0.013	5-37	1w0b A:
X1M8H2	0.0222	0.0088	11-52	1w0b A:
X1QWC5	0.00222	0.0064	30-82	1w0b A:
X1RR52	0.034	0.007	60-97	1w0b A:
X1VBL3	0.0523	0.005	7-44	1w0b A:
X1WGA6	0.00824	0.0067	117-151	1w0b A:
X6LCA3	0.0811	0.0089	143-185	1w0b A:
X6LQS2	0.00955	0.0098	143-174	1w0b A:
X6P897	0.085	0.0081	65-118	1w0b A:
X7XY80	0.0837	0.01	79-131	1w0b A:
X8F028	0.0405	0.013	4-33	1w0b A:
X8H1H0	0.00902	0.0066	24-82	1w0b A:
Z2E1M6	0.0497	0.011	26-51	1w0b A:

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Add assignments from individual genomes

Genome		Domains	Proteins
ALL		433	433
Homo sapiens 76_38	Human	2	2
Pan troglodytes 76_2.1.4	Chimpanzee	1	1
Gorilla gorilla 76_3.1	Western gorilla	1	1
Pongo abelii 76_2	Sumatran orangutan	1	1
Nomascus leucogenys 76_1.0	Northern white-cheeked gibbon	1	1
Papio anubis 76	Olive baboon	1	1
Macaca mulatta 76_1	Rhesus monkey	1	1
Callithrix jacchus 76_3.2.1	White-tufted-ear marmoset	1	1
Otolemur garnettii 76_3	Small-eared galago	1	1
Microcebus murinus 76_1	Gray mouse lemur	1	1
Rattus norvegicus 76_5.0	Norway rat	1	1
Dipodomys ordii 76_1	Ord's kangaroo rat	1	1
Ictidomys tridecemlineatus 76_2	Thirteen-lined ground squirrel	1	1
Heterocephalus glaber v1.7-2	Naked mole-rat	1	1
Cavia porcellus 76_3	Domestic guinea pig	1	1
Oryctolagus cuniculus 76_2	Rabbit	1	1
Ochotona princeps 76	American pika	1	1
Sus scrofa 76_10.2	Pig	1	1
Bos taurus 76_3.1	Cattle	1	1
Ovis aries 76_3.1	Sheep	1	1
Vicugna pacos 76_1	Alpaca	1	1
Mustela putorius furo 76_1.0	Domestic ferret	1	1
Ailuropoda melanoleuca 76_1	Giant panda	1	1
Canis familiaris 76_3.1	Dog	1	1
Felis catus 76_6.2	Domestic cat	1	1
Equus caballus 76_2	Horse	1	1
Myotis lucifugus 76_2.0	Little brown bat	1	1
Pteropus vampyrus 76_1	Large flying fox	1	1
Erinaceus europaeus 76	Western European hedgehog	1	1
Loxodonta africana 76_3	African savanna elephant	1	1
Dasypus novemcinctus 76_2	Nine-banded armadillo	3	3
Choloepus hoffmanni 76_1	Hoffmann's two-fingered sloth	1	1
Macropus eugenii 76_1.0	Tammar wallaby	1	1
Sarcophilus harrisii 76_7.0	Tasmanian devil	1	1
Monodelphis domestica 76_5	Gray short-tailed opossum	1	1
Homo sapiens 75_37 (old version GRC)	Human	2	2
Homo sapiens (NCBI version)	Human	1	1
Homo sapiens 69_37	Human	1	1
Pan troglodytes 69_2.1.4	Chimpanzee	1	1
Gorilla gorilla 69_3.1	Western gorilla	1	1
Pongo abelii 69_2	Sumatran orangutan	1	1
Nomascus leucogenys 69_1.0	Northern white-cheeked gibbon	1	1
Macaca mulatta 69_1	Rhesus monkey	1	1
Callithrix jacchus 69_3.2.1	White-tufted-ear marmoset	1	1
Otolemur garnettii 69_3	Small-eared galago	1	1
Microcebus murinus 69_1	Gray mouse lemur	1	1
Rattus norvegicus 69_3.4	Norway rat	1	1
Dipodomys ordii 69_1	Ord's kangaroo rat	1	1
Ictidomys tridecemlineatus 69_2	Thirteen-lined ground squirrel	1	1
Cavia porcellus 69_3	Domestic guinea pig	1	1
Oryctolagus cuniculus 69_2	Rabbit	1	1
Ochotona princeps 69	American pika	1	1
Sus scrofa 69_10.2	Pig	1	1
Bos taurus 69_3.1	Cattle	1	1
Vicugna pacos 69_1	Alpaca	1	1
Mustela putorius furo 69_1.0	Domestic ferret	1	1
Ailuropoda melanoleuca 69_1	Giant panda	1	1
Canis familiaris 69_3.1	Dog	1	1
Felis catus 69	Domestic cat	1	1
Equus caballus 69_2	Horse	1	1
Myotis lucifugus 69_2.0	Little brown bat	1	1
Pteropus vampyrus 69_1	Large flying fox	1	1
Erinaceus europaeus 69	Western European hedgehog	1	1
Loxodonta africana 69_3	African savanna elephant	1	1
Dasypus novemcinctus 69_2	Nine-banded armadillo	1	1
Choloepus hoffmanni 69_1	Hoffmann's two-fingered sloth	1	1
Macropus eugenii 69_1.0	Tammar wallaby	1	1
Sarcophilus harrisii 69_7.0	Tasmanian devil	1	1
Monodelphis domestica 69_5	Gray short-tailed opossum	1	1
NCBI 2017_08 genome		214	214
STRING v9.0.5 (STRING)		13	13
Uniprot 2018_03 genome		62	62
PDB chains (SCOP 1.75) (PDB)		4	4
Protein Data Bank (all PDB sequenc)		10	10
SCOP2 SCOPe CATH ECOD (all domain sequ)		28	28