SUPERFAMILY 1.75 HMM library and genome assignments server

SUPERFAMILY 2 can be accessed from supfam.org. Please contact us if you experience any problems.

Domain assignment for gi|339633513|ref|YP_004725155.1| from Mycobacterium africanum GM041182

Domain architecture


Domain assignment details

(
show help)
Strong hits

Sequence:  gi|339633513|ref|YP_004725155.1|
Domain Number 1 Region: 8-84
Classification Level Classification E-value
Superfamily PE/PPE dimer-like 1.91e-25
Family PE 0.0052
Further Details:      
 

Gene Ontology term assignment details

The top 10 most specific Gene Ontology terms for each namespace assigned to this domain architecture as determined by dcGO Predictor

(show help)

Biological Process IC (bits) H-Score
Molecular Function IC (bits) H-Score
Cellular Component IC (bits) H-Score

Protein sequence

External link(s) gi|339633513|ref|YP_004725155.1|
Sequence length 1817
Comment PE-PGRS family protein [Mycobacterium africanum GM041182]
Sequence
MSFVLISPEVVSAAAGDLANVGSTISAANKAAAAATTQVLAAGADEVSARIAALFGMYGL
EYQAISAQVAAYHQQFVQTLRTGAASYMLAEATNVEQNLLNLINAPTQTLLGRPLIGDGA
NATTPGGAGGDGGLLFGSGGNGAPGAPGQAGGAGGSAGLLGNGGSGGAGGTGAPGGNGGN
AGWLYGRGGVGGAGGIGGGTGGAGGHAWLFGHGGTGGIGGGPGGNGGWLLGNGGHGGAGG
IGGGSGGAGGNGGWLLGNGGIGGAGGTGGGAGGTGGNAAWLLGGGGTGGAGGIGGGNGGH
GGNGGWLLGNGGNGGLGGDGDGGTGGGHGGNGGNPGWLLGTAGGGGNGGAGSTGTAGGGS
GGTGGDGGTGGRGGLLMGAGAGGHGGTGGAGGAGVDGGGAGGAGGAGGNGGAGGQAALLF
GRGGTGGAGGYGGDGGGGGDGFDGTMAGLGGTGGSGGTGGDGGAPGNGGAGGAGQLLSHS
GVAGASGKGGAGGTGGNGGAGSAGADAPAGSGAMGSTGFAGGAGGDGGNGGGSGASQGNG
GNGGNGGTGGKGGTGGAGMNSLDPLLAAQDGGQGGTGGTGGNAGAGGTGFTQGADGNAGN
GGDGGVGGNGGNGADNTTTAAAGTTGGDGGAGGAGGTGGTGGAAGTGTGGQQGNGGNGGN
GGTGGKGGTGGAGVNSLDPLLAAQDGGQGGTGGTGGNAGAGGTGFTQGADGNAGNGGDGG
VGGNGGNGADNTTTAAAGTTGGDGGAGGAGGTGGTGGAAGTGTGGQQGNGGNGGNGGTGG
KGGTGGDGALAGSSGGAGGKGGNGGDAGKAGTGSAPGTAGTGGDGGKGGNGGIGAAGTTG
PVGTGASGGTGGSGGAGGTGGDGGAANGGTAGAGGAGGNGGKGGDGGAGVTSSTAGNSGG
AGGSGGKGGDAGAGGAGATPGANGIAGNGGDGGDGAAGAVGISGATGAGDGGHGGTGGAG
GNGGTGGAGGSGIDGVGGGTGGTGGNGGNGAIGGAGGDAGGSGNSGGNGGTGGKGGNAGA
GGAAGSNSGTVGANGTGGDGGNGGAAGAATAGSNGGAGTGSAGGNGGTGGRGGSGGAGGD
GIGGVGGGKGGNGADGEVGGAGGAGGSGPNTSPGGNGGQGGQGGSGGAGGAAGAGGAGGG
ANGTAGNGGQGGAGGTGGAGAASSATNGGSGGAGGTGGAGGTGGAGGDGVGGAGGGNGGH
GGDAGDGGNGANGNNRSSGSFLAAGGTGGAAGDGGQGGQGGAGGGAGGQGGAGGAGGTGG
NGGNITGGTAGTAGAAGNGGAAGKGGAGGQGGTGGGTGGQGGAGGDGGAGGTGGDRTVGG
GTVPAGSGGQGGNAGGGGAGGQGGADGGSGGDGGDAGTGGNGGNGGNRNSGNGTGGAGGN
GGGGANGGAGGAGGSGGGTGGNGGAGGDAGDAGNGGNGNGTGNGGNGGNGGIAGMGGNGG
AGTGSGNGGNGGSGGNGGNGGMGGNSGTGSGDGGAGGNGGAAGTGGTGGDGGLTGTGGTG
GSGGTGGDGGNGGNGADNTANMTAQAGGDGGNGGDGGFGGGAGAGGGGLTAGANGTGGQG
GAGGDGGNGAIGGHGPLTDDPGGNGGTGGNGGTGGTGGAGIGSLGGGTGGDGGNGGNGGT
GGEGGEVGGAGGTGGAAGNGGDGGTGGTGGGDGGAGGTGGTGGTGGLGDPRVGGSGGDGG
TGGSGGAAGNGGNGGNAGAGGNGNGGTGGAGGIGGTGGNGGDAEPGVPPGAGGAGGAGTT
GGKGGTGGNGSGTGSGGTGGDGGTGGGGGNGGTGWNGGKGDTGSGGGAGDGGKAPAGGTG
GAGGDGGAGGKGGSGGV
Download sequence
Identical sequences F8M7U6
WP_013989009.1.99379 gi|339633513|ref|YP_004725155.1|

Jump to [ Top of page · Domain architecture · Domain assignment details · Most Informative Gene Ontologies ]